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Accueil > Recherche > Axe 6 : Biomarqueurs, Biotechnologies, Ecotoxicologie et Santé Humaine > EQ 6.3 : Ecotechnologies et Bioremediation (E&B) > L’équipe E&B

L’équipe E&B

Aix Marseille Université, CNRS, IRD, Avignon Université, IMBE UMR 7263, 13397, Marseille, France

Implantations : Marseille St Charles ; Marseille St Jerome ; Martinique ; Mexique

Membres

Membres de l’équipe

Chercheurs, enseignants chercheurs et personnel technique Doctorants Post-Doctorants, Accueil
Hélène FOLZER (MCF)
Isabelle GAIME-PERRAUD (CR1-IRD)
Yoan LABROUSSE (AI-IRD) Fanny DESBIOLLES (Cotutelle avec LCE) Florence GRANGE M2 France-Mexique
Isabelle LAFFONT-SCHWOB (MCF) Alhem ELLILI (Tunisie) Theo KYPRIOTIS M2 (France)
Hervé MACARIE (CR1-IRD) Marie-Eléonore PETIT (France) Camille MELINE M2 (France)
Martine MARTINEZ (AJT-IRD) Quentin CARBOUE (France) Rayane HAMROUNI master (Tunisie Erasmus)
Véronique MASOTTI(MCF)
Jacques RABIER (MCF) Luis Fernando JIMENEZ SANTIAGO (Mexique)
Luc RANGON (TCN-IRD) Rosalia Ruth FERNANDEZ SOTO (Mexique)
Sevastianos ROUSSOS (DR2-IRD) Nohemi LOPEZ RAMIREZ (Mexique)
Marie-Dominique SALDUCCI (TCE) Yaixa BELTRAN DELGADO (Cuba)
Thierry WOIGNIER (DR1-CNRS) Barhoum KHARBOUCH (Maroc)

Thèmes

Thèmes de recherche

  • Sélection de souches fongiques issues d’une banque d’espèces pour des études de biotransformation en fermenteurs, la production de biopesticides etc.
  • Compréhension de mécanismes de dégradation de polluants organiques et de métabolites de type mycotoxines, ricine, pesticides par des micro-organismes
  • Connaissance des mécanismes de phytostabilisation et phytoextraction des métaux lourds par les plantes et leurs micro-organismes associés
  • Evaluation de l’écotoxicité de phytométabolites et des produits de dégradation microbien des polluants organiques
  • Mécanismes de rétention, de dégradation et de transfert de pesticides dans les sols tropicaux

Programmes

Projets de Recherche en cours

Internationaux Nationaux Industriels
2016-2019 Projet ANR-CONACYT ANGELICA Utilisation des bactéries lactiques pour le contrôle du niveau d’ochratoxine A sur les grains de café Partenaires UMR Qualisud, UAM-I Mexique (Coord : I. Perraud-Gaime) 2014-2016 Programme ANR A*MIDEX (SynTerCalM) Synergies sur le Territoire des Calanques marseillaises. Investissement d’Avenir A*MIDEX n°ANR-11-IDEX-0001-02 (Coord : I. Laffont-Schowb) 2014-2016 Epicure, Région Midi-Pyrénées Vinosulfite-2 Utilisation de la Fermentation en Milieu Solide pour la production de Naphtho-g-pyrones (NGP) par Aspergillus niger (Coord : S. Roussos)
2016-2018 Projet CONACYT LIRMEX Gestion durable de la jacinthe d’eau pour l’assainissement et la protection des plans d’eau. Partenaires UAM-I Mexique (I. Perraud-Gaime) 2015-2016 Projet Spartium 2 :Spartium junceum une espèce à fort potentiel pour la restauration de technosols issus de l’extraction du charbon (Coord : H. Folzer, I. Laffont-Schwob) 2014-2016 CVT AIRD FMS-unique. Mise au point d’un fermenteur à usage unique (Coord : S. Roussos)
2015-2017 Hubert Curien TOUBKAL15/03 Vermolive. Etude de valorisation des déchets oléicoles par vermicompostage (S. Roussos) 2015-2016 Projet ValoRB : Mécanismes et solutions réalistes de stabilisation de déchets industriels et de sols contaminés en milieu méditerranéen par l’utilisation de résidus de bauxite (boues rouges) (I. Laffont-Schwob)
2014-2018 ECOS Nord M13A02 Prétraitement biologique de matériaux lignocellulosique et fermentation-saccharification simultanées pour une production optimisée de bioéthanol. Partenaires Université Veracruzana Mexique ; IMBE éq 6.3 et éq 3.3 ; ISM2 AMU (I. Perraud-Gaime, S. Roussos) 2015-2016 ECCOREV : POPMETABOTOX
2014-2017 JEAI-BHS CUBA Projet CariSETA : Diversification de la technologie de culture de Pleurotus sp à Cuba et sa diffusion dans la zone Caraïbe » avec l’équipe Biotechnologie des Champignons Supérieurs au CEBI de l’Université de Oriente à Santiago de Cuba. Partenaires IMBE équipes 6.3 et 3.3, CEBI Université de Oriente Cuba, Laboratoire de Toxicologie Université Bordeaux, UAM-I, COLPOS et INECOL Mexique (Coord : I. Perraud-Gaime)

Projets de Recherche cloturés

Internationaux Nationaux Industriels
(2013-2015) Projet PRAD 13-09 Campus France 28050PE. Mise au point des Biocompost contre les nématodes. (S. Roussos) Partenaires INRA Agadir Maroc (2010-2014) CHLORDECONE Martinique. Recherche d’agents microbiens susceptibles de transformer ou minéraliser la chlordécone. (Coord :H. Macarie) (2012-2015) Projet industriel IDYL-IRD : Production de spores de champignons nématophages pour la culture de tomate sous serre au Maroc. (Coord :S. Roussos)
(2013-2015) Projet BioNeMar, Volubilis N° MA/13/295CAMPUS N° 28664RF. Antagonistes microbiens utilisés en control biologique. (S.Roussos) Partenaires Université d’Agadir (2013) Projet EsPoLi-Med. Etude comparative de plantes alimentaires et risques pour la santé. (I. Laffont-Schwob) (2014-2015) Projet Européen EPICURE 2013 : Vinosulfite. Une alternative à l’addition de SO2 en vinification. Convention de Recherche avec Société Vinovalie (Coord :S. Roussos)
(2013-2016) FRAB-Jathropha Détoxification des tourteaux de Jatropha curcas. (Coord : S. Roussos) Projet OHM BMP Influences de la Phénologie et des Particules Atmosphériques Sédimentables sur les Signaux phytochimiques et spectraux du couvert Végétal d’un terril du Bassin Minier de Provence (J. Rabier) (2013-2014) Projet Européen NOSHAN “Sustainable production of functional and safe feed from food waste”. FP7-KBBE-2012. Convention avec societé VERTECH group réalisation tâche 3.3 Moisture control and stabilization via biotechnological strategies (I. Perraud-Gaime)
2013-2015 Projet FSP Cuba 2013 (n°29952SH) Biotechnologie de Pleurotus sp à cuba et diversification de sa culture pour des applications environnementales et nutraceutiques (Coord : I. Perraud-Gaime) Partenaires IMBE équipes 6.3 et 3.3, CEBI-Université de Oriente Santiago de Cuba Université de Oriente Cuba) (2011-2013) ECO-PHYT Filtres plantés Conception et réalisation d’éco-filtres. (Coord : A. Guittonny-Philippe, V. Masotti) (2015) Société Soufflet : Etude comparative de différents couples substrats-souche sur le dispositif de colonnes de Raimbault et formation d’une personne à l’utilisation de ce dispositif . (Coord : S. Roussos)
(2012-2014) Projet Maturation Projet Innovant FMS-UNIQUE. Mise en place d’un dispositif de Fermentation en Milieu solide à Usage Unique. (Coord : S. Roussos) (2013-2014) Projet Industriel Agrauxine. Production d’inoculum pour l’homologation de nouveaux biopesticides en France (Coord : S. Roussos)

Collaborations

Collaborations universitaires

Mexique  :
Universidad Autonoma Metropolitana d’Iztapalapa (UAM-I) ;
Universidad de Coahuila ;
Universidad de Guadalajara ;
Centro de Investigación y Estudios Avanzados del Instituto Politecnico Nacional (Cinvestav-IPN)

Brésil  :
Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) ;

Vénézuela  :
Universidad del Zulia

Tunisie  :
Université de Tunis ;
Université de Manouba-Centre Supérieur de Biotechnologie de Sidi Thabet ;
Université de Sfax ;

Maroc  :
Université IbnouZohr-Agadir ;
Université de Tanger ;

Algérie  :
Universités de Mostaganem et Djilali Liabes

Australie  :
Charles Sturt University

Roumanie  :
Université de Timisoara ;

Italie  :
University of Tuscia ;

Grande Bretagne :
Newcastle University ;

Lituanie  :
Université de Vilnius ;

France  :
Université de Nouvelle Calédonie,
Université de Strasbourg,
Société RECYCL’EAU,
Société IDYL,
Vinovalie,
ORTEC OGD,
Bureau d’études Eco-Med,
Société Seakalia,
Campus Agro-environnemental Caraïbe (CAEC),
UMR ISM2,
CRCMM,
Laboratoire de Chimie de l’Environnement,
Université de Montpellier 2,
INRA Guadeloupe,
BRGM (Bureau de Recherche Géologique et Minière),
UA (Université des Antilles),
UMR AMU-CNRS-IRD MIO,

Publications

2016

DEVAULT D.A., LAPLANCHE C., PASCALINE H., BRISTEAU S., MOUVET C., MACARIE H. (2016) Natural transformation of chlordecone into 5b-hydrochlordecone in French West Indies soils : statistical evidence for investigating long-term persistence of organic pollutants. Environmental Science and Pollution Research, 23, 81-97.
DOI 10.1007/s11356-015-4865-0.
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010066130

DEVAULT D. A., MACARIE H., LEMOINE S. (2016) Crop protection and environmental health : legacy management and new concepts. Environmental Science and Pollution Research, 23, 1-2.
DOI 10.1007/s11356-015-5714-x.
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010066129

GARCIA ODUARDO N., BERMUDEZ SAVON R.C., CASTILLO-ROJAS I., PERRAUD-GAIME I., SERRANO-ALBERNI M. (2016). Evaluación de la producción de lacasa de Pleurotus spp, Tecnología Química, 36(1), 100-105.
SCIELO:S2224-61852016000100007
http://ojs.uo.edu.cu/index.php/tq/article/view/599/574

NEHMTOW J., RABIER J., GIGUEL R., COULOMB B., FARNET A.-M., PERISSOL C., ALARY A., LAFFONT-SCHWOB I. (2016) Evaluation of an integrated constructed wetland to manage pig manure under Mediterranean climate, Environmental Science and Pollution Research, in press.

WOIGNIER T., CLOSTRE F., FERNANDES P., RANGON L., SOLER A., LESUEUR JANNOYER M. (2016) Compost addition reduces porosity and chlordecone transfer in soil microstructure. Environmental Science and Pollution Research, 23(1), 98-108
DOI 10.1007/s11356-015-5111-5

2015

ANGEL-CUAPIO R.A., FIGUEROA-MONTERO A., FAVELA-TORRES E., VINIEGRA-GONZALEZ G., PERRAUD-GAIME I., LOERA O. (2015) Critical values of porosity in rice cultures of Isaria fumorosea by adding water hyacinth : effect on conidial yields and quality. Applied Biochemistry and Biotechnology, 177(2), 446-457.
doi:10.1007/s12010-015-1754-4
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010064956

BOUKHRIS A., LAFFONT-SCHWOB I., MEZGHANI I., EL KADRI L., PRUDENT P., PRICOP A., TATONI T., CHAIEB M. (2015) Screening biological traits and fluoride contents of native vegetations in arid environments to select efficiently fluoride-tolerant native plant species for in-situ phytoremediation, Chemosphere, 119, 217-223.
DOI : 10.1016/j.chemosphere.2014.06.007

BOUKHRIS A., LAFFONT-SCHWOB I., RABIER J., SALDUCCI M.-D., EL KADRI L., TONETTO A., TATONI T., CHAIEB M. (2015) Changes in mesophyll element distribution and phytometabolite contents involved in fluoride tolerance of the arid gypsum-tolerant plant species Atractylis serratuloides Sieber ex Cass. (Asteraceae), Environmental Science and Pollution Research, 22(10), 7918-7929.
DOI : 10.1007/s11356-014-3957-6

DE LA CRUZ QUIROZ R., ROUSSOS S., HERNÁNDEZ D., RODRÍGUEZ R., CASTILLO F., AGUILAR C.N. (2015) Challenges and opportunities of the bio-pesticides production solid-state fermentation : filamentous fungi as a model. Critical Reviews in Biotechnology, 35(3), 326-333.
DOI : 10.3109/07388551.2013.857292

DJOSSOU O., ROUSSOS S., PERRAUD-GAIMEI., MACARIE H., GERMAIN K., LABROUSSE Y. (2015) Fungal population, including ochratoxin A producing Aspergillus section nigri strains from Ivory Coast coffee bean. African Journal of Agricultural Research, 10(26), 2576-2589. DOI:10.5897/AJAR2015.949

HERNANDEZ C.A., SANDOVAL N., MALLERMAN J., GARCIA-PEREZ J.A., FARNET A.M., PERRAUD-GAIME I., ALARCON E. (2015) Ethanol induction of laccase depends on nitrogen conditions of Pycnoporus sanguineus. Electronic Journal of Biotechnology, 18, 327-332.
doi:10.1016/j.ejbt.2015.05.008
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010065250

GUITTONNY-PHILIPPE A., MASOTTI V., COMBROUX I., MALLERET L., BOUDENNE J.-L., PETIT M.-E., MONNIER Y., COULOMB B., VIGLIONE J., LAFFONT-SCHWOB I. (2015) Proposal of a new ecotoxicity evaluation tool based on morphological responses of five helophytes to mixtures of pollutants : The Helophyte development Index. Ecological Engineering, 77, 180–188.
DOI : 10.1016/j.ecoleng.2015.01.022

GUITTONNY-PHILIPPE A., MASOTTI V., CLAEYS-BRUNO M., MALLERET L., COULOMB B., PRUDENT P., HÖHENER P., PETIT M.-E., SERGENT M., LAFFONT-SCHWOB I. (2015) Impact of organic pollutants on metal and As uptake by helophyte species and consequences for constructed wetlands design and management, Water Research, 68, 328-341.
DOI : 10.1016/j.watres.2014.10.014

GUITTONNY-PHILIPPE A., MASOTTI V., RABIER J., PETIT M.-E., MALLERET L., COULOMB B., LAFFONT-SCHWOB I. (2015) Biomonitoring of Epilobium hirsutum L. health status to assess water ecotoxicity in constructed wetlands treating mixtures of contaminants, Water,7, 697-715.
DOI : 10.3390/w7020697

GUITTONNY-PHILIPPE A., PETIT M-E., MASOTTI V., MONNIER Y., MALLERET L., COULOMB B., COMBROUX I., BAUMBERGER T., VIGLIONE J., LAFFONT-SCHWOB I. (2015) Selection of wild macrophytes for use in constructed wetlands for phytoremediation of contaminant mixtures. Journal of Environmental Management, 147, 108-123.
DOI : 10.1016/j.jenvman.2014.09.009

HAMZA M.A., FERJI Z., ALI N., TAVOILLOT J., CHAPUIS E., EL OUALKADI A., MOUKHLI A., KHADARI B., BOUBAKER H., LAKHTAR H., ROUSSOS S., MATEILLE T., EL MOUSADIK A. (2015) Plant-parasitic nematodes associated with olive tree in Southern Morocco. International Journal of Agriculture and Biology, 17(4), 719-726.
DOI : 10.17957/IJAB/14.0004.
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010064826

LAFFONT-SCHWOB I., TRIBOIT F., PRUDENT P., SOULIÉ-MÄRSCHE I., RABIER J., DESPRÉAUX M., THIÉRY A. (2015) Trace metal extraction and biomass production by spontaneous vegetation in temporary Mediterranean stormwater highway retention ponds : freshwater macroalgae (Chara spp.) vs. cattails (Typha spp.). Ecological Engineering, 81, 173–181.
DOI : 10.1016/j.ecoleng.2015.04.052

WOIGNIER T., DUFFOURS L., COLOMBEL P., DIEUDONNE P. (2015) Nanoporous clay with carbon sink and pesticide trapping properties. The European Physical Journal Special Topics, 224 (9), 1945-1962.
DOI : 10.1140/epjst/e2015-02512-x

2014
AFFHOLDER M.-C., PRICOP A.-D., LAFFONT-SCHWOB I., COULOMB B., RABIER J., BORLA A., DEMELAS C., PRUDENT P. (2014) As, Pb, Sb and Zn transfers from soil to root of wild rosemary : do native symbionts matter ? Plant and Soil, 382, 219-236.
DOI : 10.1007/s11104-014-2135-4

ANEZ L., CALAS-ETIENNE S., PRIMERA J., WOIGNIER T. (2014) Gas and liquid permeability in nano composites gels : Comparison of Knudsen and Klinkenberg correction factors. Microporous and Mesoporous Materials, 200, 79-85.
DOI : 10.1016/j.micromeso.2014.07.049

BELKACEM-HANFI N., FHOULA I., SEMMAR N., GUESMI A., PERRAUD-GAIME I., OUZARI H.I., BOUDABOUS A., ROUSSOS S. (2014) Lactic acid bacteria against post-harvest moulds and ochratoxin A isolated from stored wheat. Biological Control, 76, 52-59.
doi:10.1016/j.biocontrol.2014.05.001
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010062400

CLOSTRE F., WOIGNIER T., RANGON L., FERNANDES P., SOLER A., LESUEUR-JANNOYER M. (2014) Field validation of chlordecone soil sequestration by organic matter addition. Journal of Soils and Sediments, 14(1), 23-33.
Doi : 10.1007/s11368-013-0790-3

FARNET A.M., QASEMIAN L., PETER-VALENCE F., RUAUDEL F., SAVOIE J.M., ROUSSOS S., GAIME-PERRAUD I., ZIARELLI F., FERRE E. (2014) Do spawn storage conditions influence the colonization capacity of a wheat-straw based substrate by Agaricus subrufescens ? Comptes Rendus Biologies, 337(7-8), 443-450.
doi:10.1016/j.crvi.2014.06.002
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010062519

GUITTONNY-PHILIPPE A., MASOTTI V., HÖHENER P., BOUDENNE J-L., VIGLIONE J., LAFFONT-SCHWOB I. (2014) Constructed wetlands to reduce metal pollution from industrial catchments in aquatic Mediterranean ecosystems : a meta-analysis to overcome obstacles and suggest potential solutions. Environment International, 64, 1-16.
DOI : 10.1016/j.envint.2013.11.016

RABIER J., LAFFONT-SCHWOB I., PRICOP A., ELLILI A., D’ENJOY-WEINKAMMERER G., SALDUCCI M.D., PRUDENT P., LOTMANI B., TONETTO A., MASOTTI V. (2014) Heavy metal and arsenic resistance of the halophyte Atriplex halimus L. along a gradient of contamination in a French Mediterranean spray-zone. Water, Air and Soil Pollution, 225(7), 1993.
DOI : 10.1007/s11270-014-1993-y

SOLER A., CALBA A., LABROUSSE Y., WOIGNIER T. (2014) Solid-phase microextraction and gas chromatography-mass spectrometry for quantitative determination of chlordecone in water, plant and soil samples. Fruits, 69(4), 325–339.
DOI : 10.1051/fruits/2014021

TRANIER M.S., POGNANT-GROS Y., AGUILAR C.N., MATEILLE T., ROUSSOS S. (2014) Commercial biological control agents targeted against plant-parasitic root-knot nematodes. Brazilian Archives of Biology and Technology, 57(6), 831-841.
doi:10.1590/s1516-8913201402540
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010063143

WOIGNIER T., ETCHEVERRIA P., BORIE F., QUIQUAMPOIX H., STAUNTON S. (2014) Role of allophanes in the accumulation of glomalin-related soil protein in tropical soils (Martinique, FrenchWest Indies). European Journal of Soil Science, 65, 531-538.
DOI : 10.1111/ejss.12151

2013

AFFHOLDER M.C., PRUDENT P., MASOTTI V., COULOMB B., RABIER J., NGUYEN-THE B., LAFFONT-SCHWOB I. (2013) Transfer of metals and metalloids from soil to shoots in wild rosemary (Rosmarinus officinalis L.) growing on a former lead smelter site : Human exposition risk. Science of the Total Environment, 454-455, 219–229.
DOI : 10.1016/j.scitotenv.2013.02.086

BELKACEM-HANFI N., SEMMAR N., PERRAUD-GAIME I., GUESMI A., CHEMI M., CHERIF I., BOUDABOUS A., ROUSSOS S. (2013) Spatio-temporal analysis of post-harvest moulds genera distribution on stored durum wheat cultivated in Tunisia. Journal of Stored Products Research, 55, 116-123.
doi:10.1016/j.jspr.2013.08.008
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010061390

GUENON R., VENNETIER M., DUPUY N., ROUSSOS S., PAILLER A., GROS R. (2013) Trends in recovery of Mediterranean soil chemical properties and microbial activities after infrequent and frequent wildfires. Land Degradation and Development, 24(2), 115-128.
doi:10.1002/ldr.1109 http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010060822 Citation WOS 25

GUTIERREZ-SANCHEZ G., ROUSSOS S., AUGUR C. (2013) Effect of caffeine concentration on biomass production, caffeine degradation, and morphology of Aspergillus tamarii. Folia Microbiologica, 58(3), 195-200.
doi:10.1007/s12223-012-0197-3
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010060866

LLAURADO G., MORRIS H.J., LEBEQUE Y., GUTIERREZ A., FONTAINE R., BERMUDEZ R.C., PERRAUD-GAIME I. (2013) Phytochemical screening and effects on cell-mediated immune response of Pleurotus fruiting bodies powder. Food and Agricultural Immunology, 24(3), 295-304.
doi:10.1080/09540105.2012.686988
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010061240

ONDO J.A., PRUDENT P., MASSIANI C., MENYE BIYOGO R., DOMEIZEL M., RABIER J., EBA F. (2013) Impact of urban gardening in equatorial zone on soils and metal transfer to vegetables. Journal of the Serbian Chemical Society, 78(7), 1045-1053.
DOI : 10.2298/JSC120915116O

SOULIE-MÄRSCHE I., TRIBOIT F., DESPREAUX M., REY-BOISSEZON A., LAFFONT-SCHWOB I., THIERY A. (2013) Evidence of Chara fibrosa Agardh ex Bruzelius, an alien species in South France. Acta Botanica Gallica, 160(2), 157-163.
DOI : 10.1080/12538078.2013.806872

TESTIATI E., PARINET J., MASSIANI C., LAFFONT-SCHWOB I., RABIER J., PFEIFER H.-R., LENOBLE V., MASOTTI V., PRUDENT P. (2013) Trace metal and metalloid contamination levels in soils and in two native plant species of a former industrial site : Evaluation of the phytostabilization potential. Journal of Hazardous Materials, 248-249, 131-141.
doi:10.1016/j.jhazmat.2012.12.039

WOIGNIER T., FERNANDES P., SOLER A., CLOSTRE F., CARLES C., RANGON L., LESUEUR JANNOYER M. (2013) Soil microstructure and organic matter : Keys for chlordecone sequestration. Journal of Hazardous Materials, 262, 357-364.
DOI : 10.1016/j.jhazmat.2013.08.070

WOIGNIER T., DUFFOURS L., COLOMBEL P., DURIN C. (2013) Aerogels Materials as Space Debris Collectors. Advances in Materials Science and Engineering, Volume 2013. Article ID 48415.
DOI : 10.1155/2013/484153
http://dx.doi.org/10.1155/2013/484153

2012

AOUIDI F., DUPUY N., ARTAUD J., ROUSSOS S., MSALLEM M., PERRAUD-GAIME I., HAMDI M. (2012) Rapid quantitative determination of oleuropein in olive leaves (Olea europea) using mid-infrared spectroscopy combined with chemometric analyses. Industrial Crops and Products, 37(1), 292-297.
doi:10.1016/j.indcrop.2011.12.024
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010055356

AOUIDI F., DUPUY N., ARTAUD J., ROUSSOS S., MSALLEM M., PERRAUD-GAIME I., HAMDI M. (2012) Discrimination of five tunisian cultivars by mid infrared spectroscopy combined with chemometric analyses of five Olea europea leaves. Food Chemistry, 131(1), 360-366.
doi:10.1016/j.foodchem.2011.08.041
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010054262

DOLFING J., NOVAK I., ARCHELAS A., MACARIE H. (2012) Gibbs free energy of formation of chlordecone and potential degradation products : implications for remediation strategies and environmental fate. Environmental Science & Technology, 46(15), 8131-8139.
doi:10.1021/es301165p
http://www.documentation.ird.fr/hor/PAR00009222

JUDZENTIENE A., BUDIENE J., GIRCYTE R., MASOTTI V., LAFFONT-SCHWOB I. (2012) Toxic Activity and Chemical Composition of Lithuanian wormwood (Artemisia absinthium L.) essential oils. Records of Natural Products, 6(2), 180-183.

MASOTTI V., DE JONG L., MOREAU X., RABIER J., LAFFONT-SCHWOB I., THIERY A. (2012) Larvicidal activity of extracts from Artemisia species against Culex pipiens L. mosquito : Comparing endemic versus ubiquist species for effectiveness. Comptes Rendus Biologies, 335(1), 19-25.
DOI : 10.1016/j.crvi.2011.10.003

ROOPESH K., ABHILASH J., HARIDAS M., SABU A., PERRAUD-GAIME I., ROUSSOS S., AUGUR C. (2012) Dioxygenase from Aspergillus fumigatus MC8 : molecular modeling and in silico studies on enzyme-substrate interactions. Molecular Simulation, 38(2), 144-151.
DOI : 10.1080/08927022.2011.608672

WOIGNIER T., CLOSTRE F., MACARIE H., LESUEUR JANNOYER M. (2012) Chlordecone retention in the fractal structure of volcanic clay. Journal of Hazardous Materials, 241/242, 224-230.
doi:10.1016/j.jhazmat.2012.09.034
http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010058848

WOIGNIER T., FERNANDES P., JANNOYER-LESUEUR M., SOLER A. (2012) Sequestration of chlordecone in the porous structure of an andosol and effects of added organic matter : an alternative to decontamination. European Journal of Soil Science, 63 (5 SI), 717-723.
DOI : 10.1111/j.1365-2389.2012.01471.x

Doctorants

Doctorat en cours

1ere année 2eme année 3eme année
PETIT Marie-Eléonore (2015) Évaluation et optimisation d’Eco-filtres pour la protection des milieux aquatiques méditerranéen impactés par des rejets anthropiques Inscription : Université d’Aix-Marseille. Direction : I. Laffont-Schwob (50%) V. Masotti (50%). Financement CIFRE (N° 2014/208) (ANRT/bureau d’études ECO-MED) CARBOUE Quentin (2014) Mise au point d’un bioreacteur de fermentation en milieu solide fonctionnant pour la production de metabolites secondaires fongiques. Inscription : Université d’Aix-Marseille. Direction : S. Roussos ; coencadrants I. Bombarda ; M. Maresca et I. Perraud-Gaime
Financement : CIFRE (ANRT/société Vinovalie)
ELLILI Ahlem (2011) soutenance prévue en 2016 Etude des effets conjugués de la salinité et des éléments traces métalliques et métalloïdes sur plusieurs espèces de genre Atriplex. Inscription : AMU
Direction : J. Rabier - IMBE ; Pr Lachaal-Tunisie
JIMENEZ SANTIAGO Luis Fernando (2015) Estudio de las interacciones entre bacterias lacticas y hongos micotoxigenicos para la inhibicion de la produccion de Ochratoxina A en el café. Inscription : These en Biotechnologie, Universidad Autonoma Metropolitana Iztapalapa, Mexico DF. Direction : Rodriguez-Serrano G. (UAM-I), Roman Guerrero A. (UAM-I), Perraud -Gaime I. (IRD-IMBE) (20%). Financement : Bourse CONACYT Mexique, projet ANR ANGELICA DESBIOLLES Fanny (2014) Etude de la dégradation de micropolluants organiques émergents par des processus biologiques innovants : élucidation de la réactivité et du devenir dans l’environnement et évolution de la toxicité suite au traitement et au rejet dans le milieu. Direction :P. Wong-Wah-Chung (50%), L. Malleret (30%), I. Laffont-Schwob (20%). Financement : Région Provence Alpes Côtes d’Azur et Société Seakalia HECKENROTH Alma (2012- soutenance prévue en juin 2016) Evaluation des méthodes de phytoremédiation adaptées à la restauration d’une friche industrielle incluse dans une zone protégée : cas de l’usine de l’Escalette au sein du Parc National des Calanques. Inscription : AMU. Direction : I. Laffont-Schwob (50%) ; J. Rabier (50%). Financement : contrat CIFRE (N° 2012/0175) avec la Société ORTEC GENERALE DE DEPOLLUTION (OGD)
FERNANDEZ SOTO Rosalia Ruth (2015) Estudio de la biodiversidad de bacterias acido lácticas antagonistas de hongos productores de ocratoxina A durante el proceso post cosecha del café. These en Biotechnologie, Universidad Autonoma Metropolitana Iztapalapa, Mexico DF. Comite tutorial : Rodriguez-Serrano G. (UAM-I), Fernandez-Perrino F. (UAM-I), Perraud -Gaime I. (IRD-IMBE) (20%). Financement : Bourse CONACYT Mexique, projet ANR ANGELICA LOPEZ-RAMIREZ Nohemi (2014) Obtention d’un extrait enzymatique en bioreacteur à partir de jacinthe d’eau. Inscription : These en Biotechnologie, Universidad Autonoma Metropolitana Iztapalapa, Mexico DF.
Direction : Favela-Torres E. (UAM-I) (60%), Volke-Sepulveda Tania (UAM-I) (20%), Perraud -Gaime I. (IRD-IMBE) (20 %). Financement : Bourse CONACYT Mexique, projet LIRMEX
BELTRAN DELGADO Yaixa (2015) Evaluation de l’activité préventive d’extrait de Pleurotus sp. Inscription : Université de Oriente, Santiago de Cuba, Cuba. Direction : Morris Quevedo H.J., Moukha S.M., Perraud-Gaime I. (10 %) Financement : Ministere Education Cubain, Projet JEAI-BHS AIT HAMZA Mohamed (2013-2016) Communautés de nématodes phytoparasites en pépinières oléicoles au Maroc : caractérisation éco-systémique et gestion microbiologique. Inscription : cotutelle Université IbnouZohr ; Faculté de sciences d’Agadir Maroc et Sup Agro de Montpellier. Direction : T. Mateille (IRD) et A. El Mousadik. Coencadrants : S. Roussos et H.Lakhtar

Doctorat soutenus

CUAPIO-ANGEL Rafael (Mars 2016) Production de conidies de champignons entomopathogenes sur riz et jacinthe d’eau comme facteur de texture. Thèse en Biotechnologie, Universidad Autonoma Metropolitana Iztapalapa, Mexico DF. Comite tutorial : Loera-Corral O. (UAM-I), Favela-Torres E. (UAM-I), Perraud -Gaime I. (IRD-IMBE) Financement Bourse Conacyt, projet LIRIASA DE LA CRUZ QUIROZ Reynaldo (2012-2015) Détermination des enzymes et des métabolites secondaires produits pendant la phase de sporulation de Trichoderma sp. cultivé en FMS. Inscription : Université de Coahuila, Faculté des sciences de Saltillo, Mexique. Direction : C. Aguilar 60% ; S. Roussos (40%). Financement : Bourse Conacyt Mexique. Actuellement Responsable de Production à Greencorp Biorganiks, Saltillo, Mexique
BOUKHRIS Asma (2015) Réponse écophysiologique de la végétation naturelle vis-à-vis de la pollution atmosphérique fluorée, dans la région de la Skhira. Thèse en cotutelle AMU / Université de Sfax, Tunisie. Co-Direction Pr. M. Chaieb, T. Tatoni, I. Laffont-Schwob NEHMTOW Julie (2015) Évaluation des potentialités de traitement par phytoépuration du lisier de porc en région PACA : paramètres chimiques, microbiologiques et macrophytiques. Co-Direction : I. Laffont-Schwob (50%) J. Rabier (50%). contrat CIFRE (N° 2011/1241) avec la Société RECYCL’EAU (A. Alary) TRANIER Marie Stéphane (2015) Production de Biopesticides pour lutter contre les nématodes à galles des cultures intensives sous abris de tomate au Maroc. Cotutelle AMU / Université de Coahuila (Mexique) Direction : S.Roussos (50%) / C. Aguilar (50%) Coencadrants : I.Perraud-Gaime ; Financement Société Idyl/IRD
BELKACEM HANFI Nesrine (2014) Distribution des moisissures post récolte et action antifongique des bactéries lactiques isolées du blé dur en Tunisie. Doctorat en Microbiologie. Co-Tutelle AMU / Université de Tunis-El Manar Direction Boudabous A., Roussos S. (IRD-IMBE) GUITTONNY-PHILIPPE Anna (2014) Phytoépuration de mélanges de polluants organiques et métalliques pour la préservation des zones-humides méditerranéennes – approche exploratoire vers la mise au point d’outils d’ingénierie écologique. – Université d’Aix-Marseille. Direction : I. Laffont-Schwob (50%) V. Masotti (50%). Financement CIFRE (ANRT/bureau d’études ECO-MED), ATER (AMU) puis actuellement CDI pôle risques
GOMES DE GADOY Mateus (2013) Valoração e biodestoxificação das tortas de mamona (Ricinus communis) e pinhão-manso (Jatropha curcas) por fermentaçãoem estado sólido. Doctorat en Biochimie. Université Fédérale de Rio de Janeiro (Brésil) Comité de Direction Guimares Freire D.M. (UFRJ), Roussos S. (IRD-IMBE) Financement CNPQ Bresil. Actuellement Professeur à l’Institut de Microbiologie Paulo de Goes de l’UFRJ (Université Fédérale de Rio de Janeiro) Brésil TORRES MANCERA Maria Teresa (2013) Obtencion de acidoclorogenico de la pulpa de café a partir de extractos enzimaticos producidos por fermentacion en medio solido. Doctorat en Biotechnologie. Universidad Autonoma Metropolitana (UAM-I) Mexique Comité de Direction Saucedo Castaneda G. (UAM-I), Ramirez-Coronel A. (UAM-I), Favela-Torres E. (UAM-I), Perraud-Gaime I. (IRD-IMBE), Roussos S. (IRD-IMBE). Financement Conacyt Mexique. Actuellement ProfesseurTitulaire A au Tecnologico de Estudios Superiores de Coacalco (Mexique)
AOUIDI Fathia (2012) Etude et valorisation des feuilles d’olivier Olea Europaea dans l’industrie agro-Alimentaire. Thèse de Doctorat en Génie Biologique. Institut National des Sciences Appliquées et de Technologie, Université de Carthage. Direction M. Hamdi (INSAT-Tunis), Roussos S (IMBE). Actuellement Enseignant Chercheur à l’Institut Supérieur de Biotechnologie de Beja (Tunisie)

Stagiaires

Master en cours

GRANGE Florence. Inscription AMU ; MASTER II INGEBIO. Encadrement Perraud Gaime I. (Stage à la UAM-Iztapalapa au Mexique). Financement : IMBE ; Projet LIRMEX KYPRIOTIS Theo. Inscription AMU ; MASTER II INGEBIO. Encadrement : Roussos S., Carboue Q. Financement : Projet Vinovalie MELINE Camille Inscription AMU ; MASTER II INGEBIO. Encadrement : Roussos S. Financement : projet Vinovalie
BATISTA CORBAL Pedro . Etude de l’activité antimicrobienne et antioxidante de fractions bioactives de Pleurotus sp. Inscription : Maestria en Biotechnologia (edición8), CEBI, Facultad de Ciencias Naturales, Universidad de Oriente, Santiago de Cuba, Cuba
Comité tutorial : Dr. Morris Quevedo H.J., MSc. Beltrán Y., Dr. Perraud-Gaime I.
LOPEZ GODINEZ Dargis Production de Pleurotus en conditions rurales.
Inscription : Maestria en Biotechnologia (edición8), CEBI, Facultad de Ciencias Naturales, Universidad de Oriente, Santiago de Cuba, Cuba. Comité tutorial : Dr. Bermúdez Savón R.C. Dr. García Oduardo N., Perraud-Gaime I.
CHAVEZ TOLEDRANO Madellin.
Etude des enzymes laccase lors de l’étape de colonisation de substrat cellulosique par la souche CEBI 3021. Inscription : Maestria en Biotechnologia (edición8), CEBI, Facultad de Ciencias Naturales, Universidad de Oriente, Santiago de Cuba, Cuba. Comité tutorial : Bermudez Savon R.C., Garcia Oduardo N., Perraud Gaime I.
TELLEZ SUAREZ Iluvis. Etude des enzymes laccase lors de l’étape de colonisation de substrat cellulosique par la souche CEBI 3027. Inscription : Maestria en Biotechnologia (edición8), CEBI, Facultad de Ciencias Naturales, Universidad de Oriente, Santiago de Cuba, Cuba. Comité tutorial : Bermudez Savon R.C., Garcia Oduardo N., Perraud Gaime I.

Master soutenus

AGUILERA RODRIGUEZ Isabel Arelis (2015)
Biodegradación de residuales lignocelulósicos por Pleurotus spp. , Master en Biotecnología, Mención Biotecnología Ambiental, Centro de Estudios de Biotecnología Industrial,Facultad de Ciencias Naturales, Universidad de Oriente, Santiago de Cuba. Cuba. Tuteurs : Dra. Bermúdez Savón R.C., Dra. Garcia Oduardo N., Dra. Perraud Gaime I.
GUIGNARD Nicolas, LADENT Emilie, LE GUEN Lucie, MARIANI Vincent (2015) Alternanthera philoxeroides et Eicchornia crassipes, deux especes aquatiques potentiellement invasives en région PACA ; Etat des lieux des populations et modélisation de leur niche bioclimatique potentielle actuelle et future.
Master I Sciences de l’Environnement Terrestre, Spécialité Sciences de la Biodiversité et Ecologie, FST St Jérôme, Aix-Marseille Université. Référent EBB Perraud-Gaime I.
PDF
HAMROUNI Rayhane (2015) Culture de Aspergillus niger sur des milieux solides pour la production de métabolites secondaires. Master de Recherche en Sciences et Technologies, : Biologie moléculaire et santé ; Université de Manouba- Tunisie
DELEMONTEY Numa (2015) Production des spores et de la Naphtho-gama-pyrone par Aspergillus niger cultivé en FMS : Analyses en HPLC ; Master Pro IngeBio AMU BEN MENADI Yassine (2015) Mise au point des prototypes FMS-unique 3D,5D, 8D. Master Ingénieur en Génie Biotechnologique de l’Ecole Polytechnique de Souss (Tunisie) FLUTET Nicolas (2014) Mise en fonctionnalité d’un ECO-FILTRE pilote pour le traitement des eaux industrielles :Suivi multi-paramétrique- Master Biologie et Valorisation des plantes (Strasbourg) – Direction I. Laffont-Schwob (50%)/V. Masotti (50%) Service civique environnement
NACHI Insaf (2013) Conservation des déchets agro-alimentaires par ensilage. Mémoire Projet Ingénieur en industrie Alimentaires., Université de carthage, Tunisie, 82 pp. Encadrant I. Perraud gaime AMIC Aurélie (2013) Etude de la biodégradation de la chlordécone, insecticide organochloré, en conditions méthanogéniques au moyen d’un réacteur de laboratoire : optimisation de la composition du milieu de culture et mise au points des méthodes d’analyse permettant de suivre la dégradation. Master SET 2, Spécialité Sciences de la biodiversité et écologie, parcours professionnel « valorisation de la Biodiversité et des Bio-ressources », Aix-Marseille Université. Encadrant : Macarie H. et Labrousse Y. AMIC A., DALMASSO C. (2013) Unite de valorisation complète de déchets oléicoles par lombricompostage : production de produits à haute valeur ajoutée : lombricompost, savon, collagène et lombrics. Atelier tutoré de simulation de projets professionnels, Master II Sciences de l’Environnement Terrestre, Spécialité VaBB, FST St Jérôme, Aix-Marseille Universite. Référent EBB Perraud Gaime I.
FEUARDANT Pierre (2013) Suivi d’un méthaniseur de laboratoire alimenté avec de la chlordécone”, 1re année de l’Ecole Nationale Supérieure des Ingénieurs en Arts Chimiques et Technologiques (ENSIACET) de Toulouse. Encadrant : Macarie H.

Accueil stagiaires

2014
ARISTEO Cynthia Mexicaine (30 janvier 2014 au 10 avril 2014) Stage de master mexique : Valorisation des feuilles de Nopal par FMS Encadrant ROUSSOS Sevastianos Financement Conacyt Mexique IBARRA DIAZ Nayeli Mexicaine
(30 janvier 2014 au 10 avril 2014) Stage de master mexique : production d’enzyme en FMS sous stress hydrique Encadrant ROUSSOS Sevastianos Financement Conacyt Mexique
MAHJOUB Meriem Tunisienne Encadrant ROUSSOS Sevastianos
Financement
2013
AIT HAMZA Mohamed Marocain (2 mois et demi Octobre-décembre 2013) Doctorant en co-tutelle de thèse Université d’Agadir / Sup Agro de Montpellier Financement Projet Volubilis AZIM Khalid Marocain 1 mois novembre 2013 Doctorant these IAV Rabat Maroc Financement Projet PRAD BELKACEM Nesrine Tunisienne 1 mois 22 avril au 22 mai 2013 Doctorante en co-tutelle de these AMU / Université de Tunis Financement IMBE
BEN AKACHA Najla Tunisienne 15 jours décembre 2013 Analyse échantillon
Financement gouvernement Tunisien
BEN M’HENNI Yosra Tunisienne
2 mois 15 mai 15 juillet 2013 Master II Financement Gouvernement Tunisien
HAMIM Ahlam Marocaine 3 mois octobre décembre 2013 Doctorant en co-tutelle de these Université de Tanger / Université de Montpellier II Financement Projet PRAD
INSAF Nachi Tunisienne 3 mois Février-Mai 2013 Stage Ingénieur Ecole Tunisienne
Encadrant PERRAUD GAIME Isabelle et FRAGOSO Sébastien Financement Gouvernement Tunisien et projet Noshan
MEDOUNI Lamia Algérienne 2 mois avril mai 2013 Doctorante 2 ème année Université de Beija, Algérie Encadrant : ROUSSOS Sévastianos Financement gouvernement algérien

Accueil chercheurs et invités

2014

BELKACEM Nesrine
Conférencier invité Journee OSU PYTHEAS

GARCIA ODUARDO Nora, Pr Université de Oriente Cuba
(15 jours juillet 2014)
Projet JEAI CARISETA
Financement FSP Cuba

RODRIGUEZ PEREZ Suyen
(15 jours juillet 2014)
Projet JEAI CARISETA
Financement FSP Cuba

2013

BEN AKACHA Najla Tunisienne
(15 jours decembre 2013)
Analyse échantillon
Financement gouvernement Tunisien

BOUBAKER Hassan Marocain
7 jours novembre 2013
Activités projet Volubilis
Financement Projet Volubilis

BOUHARROUD Rachid Marocain
7 jours novembre 2013
Activités projet PRAD
Financement Projet PRAD

CHAIEB Mohamed, Pr. Université de Sfax, Tunisie. Séjours d’une semaine du 10 au 15 juin 2013 et d’une semaine en septembre 2013 dans le cadre du Partenariat Hubert Curien UTIQUE -CMCU pour l’encadrement en co-tutelle de la thèse d’Asma Boukhris.

LAKHTAR Hicham Marocain
7 jours novembre 2013
Montage projet
Correspondant : ROUSSOS Sévastianos
Financement Projet Volubilis

OUATTARA Amadou Burkinabe
(15 jours novembre 2013)
Financement MAE

PFEIFER Hans-Rudolf, Pr. Géochimiste, Université de Lausanne, Suisse.
11-12 avril 2013
Intervention pour le colloque de restitution de l’ANR Marséco
Correspondant : LAFFONT SCHWOB Isabelle

RODRIGUEZ JASSO Rosa Mexicaine
1 mois novembre 2013
Post Doc
Financement Conacyt Mexique

SEMMAR Nabil Tunisien
15 jours juin 2013
Conférencier invité Journées des Doctorants de l’IMBE
Financement IMBE


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