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Accueil > Pages personnelles > Stéphane Greff

Stéphane Greff

Ingénieur d’études en techniques d’analyse chimique

Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie Marine et Continentale IMBE UMR CNRS 7263, IRD 237 - Equipe DFME

Campus Saint-Charles - Case 4
3, place Victor Hugo
13331 Marseille cedex 03

Station marine d’Endoume
Rue de la Batterie des Lions
13007 Marseille

Fiche professionnelle


CV

Parcours

depuis juillet 2014 Responsable technique du plateau régional MALLABAR

Janv 2009-à ce jour Ingénieur d’études en techniques d’analyse chimique
Etude et caractérisation du métabolisme spécialisé des organismes terrestres et marins dans le cadre des changements globaux.
Mots-clés : métabolomique, métabolisme spécialisé, GC/MS, UHPLC-HRMS

Sept 2000-Déc 2008 Assistant Ingénieur en techniques d’analyse chimique

Déc 1999-Sept 2000 Technicien conducteur d’appareillages au Laboratoire d’Analyse Environnementale des Procédés et des Systèmes Industriels (LAEPSI) - Institut National des Sciences Appliquées (INSA) de Lyon.

Etude des systèmes pollués en HAPs ou métaux lourds

Formation

2012-2016 Thèse de Doctorat « Sciences de l’Environnement », spécialité Ecologie (ED251), Aix-Marseille Université

2008 Master2 « Chimie Informatique, Spectrométries, Analyse » à l’Université de Provence de Marseille

1995 Maîtrise de chimie à l’Université Louis Pasteur de Strasbourg

1994 Licence de chimie à l’Université Louis Pasteur de Strasbourg, mention AB

1992 DEUG Sciences, Nature et Vie à l’Université Louis Pasteur de Strasbourg

1989 Baccalauréat série D, mention AB


2012-2016

Métabolomique, effets biologiques et caractère invasif de la macroalgue Asparagopsis taxiformis.

Thèse soutenue le 28 novembre 2016 à la Station marine d’Endoume
Manuscrit

Direction :
Thierry Pérez, DR CNRS, Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie marine et continentale. UMR CNRS 7263 / IRD 237, Aix-Marseille Université. Equipe « Diversité et Fonctionnement des Molécules aux Ecosystèmes ».
Olivier P. Thomas, PR-HDR, NUI Galway, University Road, Galway, Irlande

Jury :
Philippe Potin (rapporteur, Univ. Pierre et Marie Curie), Gérald Culioli (rapporteur, Univ. Toulon Var-Sud), Claude Payri (examinatrice, IRD Nouméa), Julijana Ivanisevic (examinatrice, Univ. de Lausanne), Catherine Fernandez (examinatrice, Aix Marseille Univ.), Olivier Thomas (co-directeur, Univ. de Galway), Thierry Pérez (directeur, Aix Marseille Univ.)

PNG - 98.8 ko

Considérées comme des menaces pour les écosystèmes marins tropicaux et subtropicaux, les proliférations de macroalgues sont susceptibles de modifier le fonctionnement et la structure des récifs coralliens. Le genre Asparagopsis (Rhodophyta) est connu pour être largement distribué, introduit et parfois invasif dans certaines régions comme en Méditerranée occidentale. Le manque de connaissances concernant cette algue et ses effets réels sur les récifs nécessitait une étude interdisciplinaire afin de mieux comprendre et, le cas échéant, gérer certains évènements de proliférations. Le programme ERA–NET BIOME « SEAPROLIF » (www.seaprolif.ird) avait pour principaux objectifs d’étudier la distribution et la dynamique d’A. taxiformis en milieux tempérés et tropicaux, et d’évaluer si le caractère invasif d’A. taxiformis pouvait être expliqué par son identité génétique, son phénotype chimique ou la diversité de son microbiome associé.
Des travaux récents ont démontré l’existence de 6 lignées génétiques distinctes pour A. taxiformis. Le premier objectif de cette thèse était de corréler le métabolisme spécialisé et la bioactivité de l’algue à son génotype, et éventuellement à son caractère proliférant. Aucune corrélation génétique/métabolomique n’a été démontrée, ce qui laisse entendre que le métabolisme de cette algue serait principalement influencé par l’environnement et/ou sa flore microbienne associée. En milieu tempéré, A. taxiformis et A. armata présentent des signatures métabolomiques globalement similaires et associées à une bioactivité significativement plus importante qu’en milieu tropical. Cependant, même lorsqu’elle a été introduite, une même lignée génétique et un même phénotype chimique peuvent présenter des caractères proliférants opposés.
Nous avons également étudié l’interaction algue–coraux en s’intéressant particulièrement au rôle du métabolisme spécialisé. En milieu tropical, les extraits de macroalgues testés in situ sur 4 espèces de coraux n’ont provoqué que de faibles blanchissements. En milieu tempéré, aucun effet biologique de l’algue n’a été enregistré sur le corail Astroides calycularis. Par contre des expériences en aquarium ont permis de montrer qu’A. taxiformis pouvait exprimer un métabolisme spécifique avec une bioactivité augmentée après 10 jours de contact avec ce corail.
En conclusion, qu’elle soit indigène ou introduite, A. taxiformis exerce très peu d’effets sur la santé des coraux, et le caractère invasif de cette algue reste une source de débat.


Publications

Soumises

LC/MS approaches applied to Quercus pubescens to assess metabolic variations under recurrent drought and over seasonal cycle, a focus on phenolic metabolism. Soumise à Metabolomics le 07/06/2017. Saunier A., Fernandez C., Greff S., Caroline Lecareux C., Ormeno E.

2017

Biotic interactions in a Mediterranean oak forest : role of allelopathy along phenological development of woody species. European Journal of Forest Research. Accepté pour publication le 07/07/2017. Hashoum H., Santonja M., Gauquelin T., Saatkamp A., Gavinet J., Greff S., Lecareux C., Fernandez C., Bousquet-Mélou A. DOI 10.1007/s10342-017-1066-z

Discrimination of Four Marine Biofilm-Forming Bacteria by LC-MS Metabolomics and Influence of Culture Parameters. Journal of Proteome Research, 2017, 16 (5), 1962–1975. Favre L., Ortalo-Magné A., Greff S., Pérez T., Thomas O., Martin J.-C., Culioli G. DOI : 10.1021/acs.jproteome.6b01027

Chemogeography of the red macroalgae Asparagopsis : metabolomics, bioactivity, and relation to invasiveness. Metabolomics, 2017, 13:33. Greff S., Zubia M., Payri C., Thomas O. P., Pérez T. DOI : 10.1007/s11306-017-1169-z

The interaction between the proliferating macroalga Asparagopsis taxiformis and the coral Astroides calycularis induces changes in microbiome and metabolomic fingerprints. Scientific Reports, 2017, 7, Article number : 42625. Greff S., Aires T., Serrão E. A., Engelen A. H., Thomas O. P., Perez T. DOI:10.1038/srep42625

2014

Mahorones, Highly Brominated Cyclopentenones from the Red Alga Asparagopsis taxiformis. Journal of Natural Products, 2014, 77 (5), 1150–1155 Greff S., Zubia M., Genta-Jouve G., Massi L., Perez T., Thomas O.P. DOI : 10.1021/np401094h

2013

Does Prescribed Burning Affect Leaf Secondary Metabolites in Pine Stands ? Journal of Chemical Ecology, 2013, 39 (3) : 398-412. Lavoir A.V., Ormeño E., Pasqualini V., Ferrat L., Greff S., Lecareux C., Vila B., Mévy J.P. , Fernandez C. DOI : 10.1007/s10886-013-0256-5

2011

Does competition stress decrease allelopathic potential ? Biochemical Systematics and Ecology, 2011, 39 (4-6), 401-407. Rivoal A., Fernandez C., Greff S., Montes N., Vila B. DOI : 10.1016/j.bse.2011.05.017

Compost spreading in Mediterranean shrubland indirectly increases biogenic emissions by promoting growth of VOC-emitting plant parts. Atmospheric Environment, 2011, 45, 3631-3639. Olivier R., Lavoir A.V., Ormeño E., Mouillot F., Greff S., Lecareux C., Staudt M., Fernandez C. DOI : 10.1016/j.atmosenv.2011.03.060

Inter-population variability of terpenoid composition in leaves of Pistacia lentiscus L. from Algeria : A chemoecological approach. Molecules. 2011, 16 (3), 2646-2657.Ait Said S., Fernandez C., Greff S., Torre F., Derridj A., Gauquelin T., Mévy J.P. DOI : 10.3390/molecules16032646

Inter-population variability of leaf morpho-anatomical and terpenoid patterns of Pistacia atlantica Desf. ssp. atlantica growing along an aridity gradient in Algeria.Flora - Morphology, Distribution, Functional Ecology of Plants, 2011, 206 (4), 397-405. Ait Said S., Fernandez C., Greff S., Derridj A., Aired S., Gauquelin T., Mévy J.P. DOI : 10.1016/j.flora.2010.08.002

Direct and indirect impact of sewage sludge compost spreading on Quercus coccifera monoterpene emissions in a Mediterranean shrubland. Environmental Pollution, 2011, 159, 963-969. Olivier R., Staudt M., Lavoir A.V., Ormeño E., Rizvi S.H., Baldy V., Rivoal A., Greff S., Lecareux C., Fernandez C. DOI : 10.1016/j.envpol.2010.12.003

2010

Environmental control of terpene emissions from Cistus monspeliensis L. in natural Mediterranean shrublands. Chemosphere, 2010, 78, 942-949. Rivoal A., Fernandez C., Olivier R., Lecareux C., Greff S., Lavoir A.V., Roche P., Vila B. DOI : 10.1016/j.chemosphere.2009.12.047

2009

Variations in allelochemical composition of leachates of different organs and maturity stages of Pinus halepensis.Journal of Chemical Ecology, 2009, 35, 970-979. Fernandez C., Monnier Y., Ormeño E., Baldy V., Greff S., Pasqualini V., Mévy J.-P., Bousquet-Mélou A. DOI 10.1007/s10886-009-9667-8

2008

On the relative importance of the effects of selection and complementarity as drivers of diversity-productivity relationships in Mediterranean shrublands. Oikois, 2008, 117, 9, 1345-1350. Montes N., Maestre F.T., Ballini, C., Baldy V., Gauquelin T., Planquette M., Greff S., Dupouyet S., Perret J.B. DOI : 10.1111/j.0030-1299.2008.16910.x

2007

Characterization of phenolic compounds in Pinus laricio needles and their responses to prescribed burnings. Molecules, 2007, 12, 1614-1622. Cannac M., Pasqualini V., Greff S., Fernandez C., Ferrat L. DOI:10.3390/12081614

Effect of intraspecific competition and substrate type on terpene emissions from some Mediterranean plant species. Journal of Chemical Ecology, 2007, 33(7), 277-286. Ormeño E., Bousquet-Mélou A., Mevy, J.P., Greff S., Robles C., Bonin G., Fernandez C. DOI 10.1007/s10886-006-9219-4

Monoterpene and sesquiterpene emissions of three Mediterranean species through calcareous and siliceous soils in natural conditions. Atmospheric Environment, 2007, 41(3), 629-639. Ormeño E., Fernandez C., Bousquet-Mélou A., Greff S., Morin E., Robles C., Vila B., Bonin G. DOI : 10.1016/j.atmosenv.2006.08.027

Water deficit stress induces different monoterpene and sesquiterpene emission changes in Mediterranean species. Relationship between terpene emissions and plant water potential. Chemosphere, 2007, 67(2), 276-284. Ormeño E., Mévy J.P, Vila B., Bousquet-Mélou A., Greff S., Bonin, G., Fernandez, C. DOI : 10.1016/j.chemosphere.2006.10.029

2006

Chemical composition of the volatile oil of Laggera aurita Schulz from Burkina Faso. Biochemical Systematics and Ecology, 2006, 34(11), 815-818. Mévy J.P., Bousquet-Mélou A., Greff S., Millogo J., Fernandez C. DOI : 10.1016/j.bse.2006.06.005

Composition of the volatile oil from leaves of Ximenia Americana L. Biochemical Systematics and Ecology, 2006, 34 (7), 549-553. Mévy J.P., Bessière J.M., Greff S., Zombre G., Viano J. DOI : 10.1016/j.bse.2006.01.007

Potential allelopathic effect of Pinus halepensis in the secondary succession : an experimental approach. Chemoecology, 2006, 16(2), 97-105. Fernandez C., Lelong B., Vila B., Mévy J.P., Robles C., Greff S., Dupouyet S., Bousquet-Mélou A. DOI 10.1007/s00049-006-0334-z

2005

Allelopathic potential of Medicago arborea, a Mediterranean invasive shrub. Chemoecology, 2005, 15 (4), 193-198. Bousquet-Mélou A., Louis S., Robles C., Greff S., Dupouyet S., Fernandez C. DOI 10.1007/s00049-005-0311-y

2003

Phenols and flavonoids in Allepo Pine Needles as bioindicators of Air Pollution. Journal of Environmental Quality, 2003, 32, 2265-2271. Robles C., Greff S., Pasqualini V., Garzino S., Bousquet-Mélou A., Fernandez C., Bonin G. DOI:10.2134/jeq2003.2265

Phenolic compounds content in Pinus halepensis Mill. needles : a bioindicator of air pollution. Chemosphere, 2003, 52 (1), 239-248. Pasqualini V., Robles C., Garzino S., Greff S., Bousquet-Melou A., Bonin G. DOI : 10.1016/S0045-6535(03)00268-6


Communications orales

2017

Sponges produce a chemical seascape acting on benthic ecosystem functioning. Pérez T., Santonja M., Greff S., Thomas O. 10th World Sponge Conference, Galway, Ireland, 25 au 30 juin 2017.

2016

Does the metabolome of a drought-resistant species shift under water stress over the seasonal cycle ? Saunier A., Ormeno E., Greff S., Lecareux C., Fernandez C. Sfécologie-2016, International Conference of Ecological Sciences, Marseille, 24 au 27 Octobre 2016.

2015

Ecologie chimique autour de l’algue rouge Asparagopsis taxiformis, une algue supposée invasive… Greff S., Pérez T., Thomas O., et le consortium SEAPROLIF. GDR MediatEC, Banyuls, 27 au 30 octobre 2015.

Sponges smell, this is well known ! Testimony of crustaceans. Pérez T., Le Croller M., Greff S., Thomas O.P. GDR MediaTec, Banyuls, 27 au 30 octobre 2015.

A chemical ecology approach to assess the proliferation of the red alga Asparagopsis taxiformis : Metabolomics, natural toxicity and biological effects. Greff S., Pérez T., Thomas O., and the SEAPROLIF consortium. International Society of Chemical Ecology Conference, Stockholm, Sweden, 29 June to 3 July 2015.

2014

Diversité et fonctionnement des biomes marins littoraux de trois océans sous la pression de proliférations algales. Greff S., Dijoux L., Consortium SEAPROLIF, MediatEC, Paris, 30 octobre 2014.

2013

Morphologie et composition chimique des cires épicuticulaires des feuilles de quatre espèces du genre Pistacia (Anacardiaceae). Belhadj S., Gauquelin T., Greff S., Mévy J.-P. – Biotechnologies et Améliorations des productions végétales et animales : Université Ziane Achour, Djelfa, Algérie, 30-31 octobre 2013.

2012

Allelopathy in Quercus pubescens Oak Forest : impact of chemical leaf compounds of an understory plant species on plant diversity. Fernandez C., Peano S., Santonja M., Dupouyet S., Greff S., Bousquet-Mélou A. - Phytochemical Society of Europe - Congress on Bio-communication, and semiochemicals involving plants (Biocom12). Cadiz, Espagne, 10-12 Septembre 2012.

Composition chimique des cires épicuticulaires des feuilles de deux espèces du genre Pistacia (P. Atlantica et P. lentiscus ; Anacardiaceae) Belhadj S., Gauquelin T., Greff S., Mevy J.P. - International Congress on Aromatic and Medicinal Plants CIPAM2012, Sidi Bel-Abbes, Algérie, 8-10 Mai 2012.

2010

How biotic and abiotic stresses affect growth and secondary metabolism in Mediterranean forest dynamic. A comparative study of a pioneer (Pinus halepensis Mill) and a late successional species (Quercus pubescens Willd). Monnier Y., Vila B., Bousquet-Melou A., Prévosto B., Greff S., Fernandez C. - International Conference on “Mechanisms of Growth, Competition and Stress Defense in Plants” - Munich, Allemagne, 1-3 Mars 2010.

2009

Variabilité saisonnière des émissions de terpènes chez le chêne kermès, sur sol naturel et amendé. Olivier R., Baldy V., Mévy J.P., Greff S., Lecareux C., Fernandez C. - 6ème réunion GDR Ecologie Chimique, Marseille, France, 27-28 octobre 2009.

La strate arborée est-elle affectée par les brûlages dirigés : comparaison du métabolisme secondaire chez deux pins méditerrannéens. Lavoir, A.V., Ormeño E., Greff S., Pasqualini V., Ferrat L., Fernandez C. - 6ème réunion GDR Ecologie Chimique, Marseille, France, 27-28 octobre 2009.

Effets des stress biotiques et abiotiques sur la croissance et le métabolisme secondaire dans la dynamique successionnelle méditerranéenne : étude comparative d’une espèce pionnière (Pinus Halepensis Mill.) et d’une espèce de fin de succession (Quercus pubescens Willd.). Monnier Y., Vila B., Wisniewski N., Bousquet-Mélou A., Prévosto B., Greff S., Fernandez C. – 6ème réunion GDR Ecologie Chimique - Marseille, France, 27-28 octobre 2009.

2007

Conséquences écologiques de la gestion coutumière (« agdal ») des espaces forestiers dans le Haut Atlas marocain : cas de la vallée des Aït Bouguemez. Montès N., Ballini C., Deschamps-Cottin M., Greff S., Bertaudière-Montès V., Hammi, S. - Les agdals de l’Atlas marocain : Savoirs locaux, droits d’accès, gestion de la biodiversité - Marrakech, Maroc, Mai 2007.

2006

Terpenes stored and released from needles of Pinus halepensis. Assesment of environmental flammability risk. Ormeño E., Mévy J.P., Bousquet-Mélou A., Vila B., Greff S., Fernandez C. 1st International Symposium on Environment Identities and Mediterranean Area - Corte-Ajaccio, France, Juillet 2006.

Contribution of some Mediterranean plants to BVOC in the atmosphere of an open and a closed environment. Preliminary study. Ormeño E., Fernandez C., Greff S., Bonin G. XVIth Air Pollution Conference – Londres, Angleterre, Mai 2006.

2004

Phenols and flavonols content in Pinus halepensis needles : a bioindicator of air pollution in Provence. Robles C., Korboulewsky N., Fernandez C., Greff S., Pasqualini V., Bousquet-Mélou A., Garzino S. First European University Chemical and Biological approaches in Environment - Hyères, France, Septembre 2004.

Influence de paramètres écologiques sur les émissions de Composés Organiques Volatils terpéniques par trois végétaux méditerranéens. Morin E., Ormeno E., Robles C., Fernandez C., Bousquet-Mélou A., Greff S., Bonin G. Congrès Environnement et Identité en Méditerranée - Corte, France, Juillet 2004.

Etude des potentialités allelopathiques du pin d’alep (Pinus halepensis) – Conséquences sur la succession secondaire. Lelong B., Fernandez C., Bousquet-Mélou A., Vila B., Robles C., Greff S., Dupouyet S. Congrès Environnement et Identité en Méditerranée – Corte, France, Juillet 2004.


Posters

2017

Metabolomic fingerprinting of 8 mangroves species from North Vietnam. Malachin J.-R., Greff S., Culioli G., Van Tan D., Baldy V., Perez T., Fernandez C., Bousquet-Mélou A. World Congress of Allelopathy, Marseille, 24 au 28 juillet 2017.

2016

Metabolomics and chemical ecology assays to understand biotic interactions in Vietnamese mangrove ecosystem. Bousquet-Mélou A., Van Tan D., Baldy V., de Rodez-Bénavent R., Pouchard N., Saunier A., Pérez T., Proffit M., Greff S., Wortham H., Sy Tuan M., Klein J., Fernandez C. Sfécologie-2016, International Conference of Ecological Sciences, Marseille, 24 au 27 octobre 2016.

Bousquet-Mélou A., Van Tan D., Baldy V., de Rodez-Bénavent R., Pouchard N., Saunier A., Pérez T., Proffit M., Greff S., Wortham H., Sy Tuan M., Klein J., Fernandez C. Journées du GDR MédiaTec, Marseille, 28 au 29 octobre 2016.

2015

A chemical ecology approach to assess the proliferation of the red alga Asparagopsis taxiformis : Metabolomics, natural toxicity and biological effects. Greff S., Pérez T., Thomas O., and the SEAPROLIF consortium. International Society of Chemical Ecology Conference, Stockholm, Sweden, 29 June to 3 July 2015.

Congrès de l’Ecole Doctorale Sciences de l’Environnement (ED251), Cassis, 21 au 22 avril 2015.

2013

SEAPROLIF program : Diversity and functioning of coastal marine biomes under siege : implications of SEAweed PROLIFerations across three oceans. Zubia Mayalen, Cambert Harold, Dijoux Laury, Viard Frederique, Engelen Aschwin, Perez Thierry, Greff Stéphane, Thomas Olivier, Petek Sylvain, Fiat Sylvie, Adjeroud Medhi, Bouchon Claude, Parretti Paola, Monteiro Joao, Santos Ricardo, Quod Jean Pascal & Payri Claude. Eighth WIOMSA Scientific Symposium, Maputo, Mozambique, 28 October to 2 November 2013.

Original highly halogenated derivatives from Asparagopsis taxiformis. Greff S., Zubia M., Perez T. , Thomas O. P. MaNaPro 2013 – XIV International Symposium on Marine Natural Products, La Toja Island, Espagne, 15 – 2 septembre 2013.

2012

Isolation, chemical composition and antifungal activity of essential oils against Rhizopus oligosporus and Penicillium simplicissimum. Filippousi R., Greff S., Laffont–Schwob I., Salducci M.-D., Antoniou P., Roussos S. 5TH Mikrobiokosmos Conference, Agricultural University of Athens, Athènes, Grèce, 13-15 décembre 2012.

2011

Impact of land use change on ecosystem functioning : a case study about Pinus halepensis expansion on leaf litter decomposition process. Baldy V., Chomel M., Bousquet-Mélou A., Monnier Y., Greff S., Pernin C., Fernandez C. 12th European Ecological Federation Congress – Avila, Espagne, 25 – 29 Septembre 2011.

Does prescribed burning affects the secondary metabolism of established stand trees of Mediterranean pines ? Lavoir A.V., Pasqualini V., Ormeno E., Ferrat L., Greff S., Lecareux C., Fernandez C. Medpine, 4th International Conference on Mediterranean Pines – Avignon, France. 4 – 6 juin 2011.

2002

Effets d’un compost de boues urbaines sur un vignoble méditerranéen. Korboulewsky N., Greff S., Dupouyet S., Robles C., Bonin G. Congrès Environnement et Identité en Méditerranée – Corte, France. Juillet 2002.

Autres

Stratégies d’émission de Composés Organiques Volatils (COV) par quatre végétaux méditerranéens, 2004. Ormeño E., Morin E., Fernandez C., Robles C., Greff S., Bousquet-Mélou A., Bonin G.

Phenols and flavonols content in Pinus halepensis needles : a bioindicator of air pollution in Provence. Robles C., Korboulewsky N., Fernandez C., Greff S., Pasqualini V., Bousquet-Mélou A., Garzino S.

Influence de la pollution atmosphérique sur les composés phénoliques du pin d’Alep (Pinus halepensis Mill.) de la région de l’Etang de Berre. Pasqualini V., Robles C., Garzino S., Greff S., Bousquet-Mélou A., Bonin G.


Groupes de recherche - Séminaires - Workshops

2016

Workshop LIA MARRIO, Rio de Janeiro, Brésil, 30 au 4 novembre. Présentation orale : Metabolomic fingerprints to assess macroalgal–coral interactions. Greff S., Thomas O., Pérez T.

Journées d’Ecologie chimiques MediatEC, Marseille, 28 au 29 octobre.

2015

Journées d’Ecologie chimiques MediatEC, Banyuls, 27 au 30 octobre.

2014

Journées d’Ecologie chimiques MediatEC, Paris, 30 octobre. Communication orale : Diversité et le fonctionnement des biomes marins littoraux de trois océans sous la pression de proliférations algales - Greff S., Dijoux L. et le consortium SEAPROLIF

2012

6ème Journées Scientifiques du Réseau Français Métabolomique et Fluxomique, Nantes, 21 au 23 mai.