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NOM EQUIPE THEMATIQUES
Bellan Gérard DFMEDescription de la biodiversité marine : taxonomie/phylogénie
  • Inventaires, suivis, Dynamique et évolution des populations
  • Bellan-Santini Denise DFME Description de la biodiversité marine : taxonomie/phylogénie Inventaires, suivis, Dynamique et évolution des populations
    Borchiellini Carole OEB Effet de la pollution sur les organismes et écosystèmes marins
    Chenesseau Sandrine SC Morpho
    Chenuil-Maurel Anne OEB Description de la biodiversité marine : taxonomie/phylogénie ; Inventaires, suivis, Dynamique et évolution des populations ; Effet de la pollution sur les organismes et écosystèmes marins
    Chevaldonne Pierre DFME Description de la biodiversité marine : taxonomie/phylogénie ; Inventaires, suivis, Dynamique et évolution des populations
    David Romain OEB Inventaires, suivis, Dynamique et évolution des populations
    De Jode Aurélien OEB Description de la biodiversité marine : taxonomie/phylogénie ; Inventaires, suivis, Dynamique et évolution des populations
    De Jong-Moreau Laetitia BES 1-Effet de la pollution sur les organismes et écosystèmes marins
    Ereskovsky Alexander DFME Description de la biodiversité marine : taxonomie/phylogénie ; Inventaires, suivis, Dynamique et évolution des populations
    Feral Jean-Pierre OEB Inventaires, suivis, Dynamique et évolution des populations
    Fernandez Catherine DFME
    Gadreaud Justine BES Effet de la pollution sur les organismes et écosystèmes marins
    Issartel Julien BES Effet de la pollution sur les organismes et écosystèmes marins
    Marschal Christian (AI) SC Morpho Inventaires, suivis, Dynamique et évolution des populations
    Mirleau Pascal OEB Description de la biodiversité marine : taxonomie/phylogénie ; Inventaires, suivis, Dynamique et évolution des populations ; Effet de la pollution sur les organismes et écosystèmes marins
    Moreau Xavier BES Effet de la pollution sur les organismes et écosystèmes marins
    Perez Yvan OEB Description de la biodiversité marine : taxonomie/phylogénie ; Inventaires, suivis, Dynamique et évolution des populations ; Effet de la pollution sur les organismes et écosystèmes marins
    Perez Thierry DFME Description de la biodiversité marine : taxonomie/phylogénie ; Inventaires, suivis, Dynamique et évolution des populations
    Renard Emmanuelle OEB Effet de la pollution sur les organismes et écosystèmes marins
    Rocher Caroline OEB/SCBM
    Selva Marjorie OEB/SCBM
    Thiery Alain BES Effet de la pollution sur les organismes et écosystèmes marins
    Thierry de Ville d’Avray Laure OEB
    Vacelet Jean DFME Description de la biodiversité marine : taxonomie/phylogénie
    Vernale Amélie OEB Effet de la pollution sur les organismes et écosystèmes marins

    Thematics

    1- Impacts of pollutions on marine organisms and ecosystems
    Key words : metals, pesticides, nanoparticules, bioaccumulation, lethality, disterbance of cell and developmental mechanisms
    Marine and coastal areas are dynamic ecosystems subjected – seasonally, chronically and/or punctually – to natural and anthropic perturbations. Marine organisms have to cope with many variations of their biotopes such as current modifications, tides, variations in salinity and temperature, food abundance, etc. In addition, since the industrial revolution and the modernization of sea exploitation technics, anthropogenic perturbations are dramatically increasing : global warming, ocean acidification, estuary metallic and organic contaminations, intensive fishing, oil extraction and mining, etc. can exert severe pressures on the marine biota, affecting every biological levels from the individual fitness to population dynamics, community structures and ecosystem maintenance. In order to better understand and anticipate the potential impact of these perturbations and stress, the « Pôle BEM » makes use of its expertise and logistical support (several facilities or “services communs” are available at IMBE : scuba-diving, histology and microscopy, molecular biology, experimentation) to adopt a multi scale approach, including molecular, physiological and behavioral responses of organisms, in situ physicochemical measurements, bioindicator and community monitoring etc.

    2- Description of marine biodiversity : taxonomy/phylogeny
    Mots clés : integrative taxonomy , phylogeny, cryptic species

    We reveal and describe novel marine species using genetic tools and traditional taxonomy. Our genetic data often reveal the presence of several biological species, which are called cryptic species, within a nominal species. Using an approach of integrative taxonomy, these species are studied in their natural environment. Phylogenetic relationships are reconstructed, from the deepest to the shallowest (peri-specific) levels of divergence. We use population genetics (and population genomics) to infer connectivity between marine sites for the species under study and understand how hydrological features (such as currents) and life history traits explain observed connectivity ; we can also infer causal relationships linking life history traits, connectivity levels and evolutionary rates.

    Petit texte + photo

    Liste des Membres concernés :
    Equipe OEB : Carole Borchiellini, Anne Chenuil, Jean-Pierre Féral, Pascal Mirleau, Yvan Perez, Emmanuelle Renard
    Equipe DFME : Denise Bellan, Gérard Bellan, Pierre Chevaldonné, Alexander Ereskovsky, Thierry Pérez, Jean Vacelet

    Programmes passés en en cours avec lien

    3- Inventories, monitoring, Dynamics & evolution of populations
    Keywords : phylogeography, (meta-)barcoding, artificial reefs, global change, environment
    Observing which species are thriving in the marine habitats of our Mediterranean region (but also from tropical to Polar latitudes) has been done since 1882 by researchers of the marine station of Marseille. IMBE experts still observe marine species and habitats on a regular basis, owing to the scientific float and scuba-diving facility (OSU Pytheas Institute). Observations are particularly abundant in rocky bottoms, infralittoral and circalittoral (e.g. emblematic gorgonian animal forests) and marine caves, but also on artificial reefs that were placed in the Bay of Marseille to restore or increase biodiversity, as well as on smaller artificial reefs that are dedicated to monitoring (ARMS : artificial reef monitoring structure, ASU : artificial substrate units, etc.). The population sizes of some species can be monitored more precisely with regular field surveys but also with population genetics tools. The diversity of the species that inhabit the structurally complex and species-rich hard bottoms (like coralligenous habitats) are now also established with the help of semi-automated tools (metabarcoding).

    Cigesmed Project

    4- Développement/Evo-Devo/ Eco-Evo-Devo
    Mots clés : histologie, embryologie, cycle de vie, biologie cellulaire et moléculaire, transcriptomique, génomique, morphogenèse, évolution, environnement

    Notre laboratoire étudie la reproduction et le développement de 3 groupes d’animaux marins souvent mal décrits : Porifères, Chaethognathes et Echinodermes (notamment ophiures). La description d’un cycle de vie (via des suivis in situ) ou la description fine d’un développement embryonnaire, larvaire ou post-larvaire (via l’histologie) font partie intégrante de la descrition d’une espèce. Mais au delà de cette aspect descriptif (équipe DFME), nos modèles présentent des intérêts écologiques et évolutifs particuliers et complémentaires pour répondre à des questionnements s’intégrant dans les domaines de l’Evo-Dévo et l’éco-évo-dévo (équipe OEB).

    Liste des Membres concernés :
    Equipe OEB : Carole Borchiellini, Anne Chenuil, Yvan Perez, Emmanuelle Renard
    Equipe DFME : Alexander Ereskovsky, Jean Vacelet

    Programmes passés ou en cours :

    Spongex
    Stras

    5- Ecologie chimique
    Mots clés : métabolomique, métabolites secondaires, attraction, interactions, symbiotes

    Petit texte + photo

    Liste Membres concernés :
    Equipe DFME : Pierre Chevaldonné, Catherine Fernandez, Stéphane Greff, Thierry Pérez

    Programmes passés ou en cours :

    Modèles/sites d’études

    Biocénoses étudiées

    Coralligène

    Herbiers

    Plancton

    Certains des modèles biologiques étudiés

    Aurelia aurita

    Halisarca dujardinii
    Lycopodina hypogea
    Oscarella lobularis
    Oopsacas minuta

    Myriapora truncata

    Amphipholis squamata
    Echinocardium cordatum
    Ophioderma longicauda

    Lithophyllum stictiforme/cabiochae
    Posidonia oceanica

    Spadella cephaloptera

    Sites d’étude

    Outils/moyens à la mer

    Plongée

    Les observations, inventaires, suivis, échantillonnages nécessaires à nos différentes études en biologie et écologie marine reposent à la fois sur le service plongée, les navires de station et le service d’observation de l’OSU Pythéas et sur des moyens propres à l’IMBE :

    - semi-rigide
    - personnel avec permis bateau
    - 9 IT, chercheurs ou enseignants-chercheurs plongeurs scientifiques :

    Aquariums

    Les échantillons biologiques prélevés peuvent être soient fixés et conditionnés directement sur le navire, ou fixés et conditionnés une fois ramenés en station, ou bien maintenus de quelques heures à plusieurs semaines en aquariums en eau de mer courante. Les expérimentations en conditions contrôlées sont également possibles en circuit fermé d’eau de mer artificiel avec monitoring et systèmes de contrôle de différents paramètres physico-chimiques :