Alex Baumel

Station Marine d’Endoume
Chemin de la Batterie des Lions
F-13007 Marseille, France

Courriel alex.baumel@imbe.fr

ID HAL : alex-baumel
ResearcherID : T-6400-2017
Twitter : @alexbaumel

Short Outline

Working on ecology, diversity and evolution of plants, I’m interested by wild life and conservation in general. In my other life I’m living with my wife and my son in Marseille, also climbing, hiking and reading a lot.

Cursus
• 2013 : Habilitation à Diriger des Recherches : « Situation des structures de diversité génétique dans l’enquête écologique », Aix-Marseille Université
• 2002 : Maître de conférences de l’Université Paul Cézanne, Aix Marseille III
• 2002 : Attaché temporaire de l’Université Rennes I (ATER)
• 2001 : Thèse de l’Université Rennes I, mention Biologie : « Contexte phylogénétique et conséquences génomiques de l’hybridation et de la polyploïdie : Les enseignements d’une jeune espèce, Spartina anglica C.E. Hubbard (Poacées) ».
• 1998 : DEA Écologie Université Rennes I
• 1997 : Maîtrise Biologie et Ecologie, Université Joseph Fourrier, Grenoble I
• 1993 : Bac D. Lycée Alain Borne, Montélimar.

Researches

Currently my main project is about carob tree (Ceratonia siliqua) phylogeography and ecology (https://dynamic.cirad.fr/), and I’m working on a lot of other case studies : Armeria sp (conservation genetics), Astraglus tragacantha (conservation), Bufonia perennis (phylogeography), Circus pygargus (population biology), Adonis vernalis, ..., and I keep an eye on Arenaria provincialis (phylogeography and evolution).

Despite the appearances my research objective is clear : To improve new knowlegde on life diversity because « we can not protect what we do not know » ...

Some key-words and selected papers,

Phylogeography, Biogeography, Plant systematic, Niche ecology, DNA, Polymorphism, Molecular ecology, Diversity, ...

  • Hardion, L., Dumas, P. J., Abdel-Samad, F., Kharrat, M. B. D., Surina, B., Affre, L., ... & Baumel, A. (2016). Geographical isolation caused the diversification of the Mediterranean thorny cushion-like Astragalus L. sect. Tragacantha DC.(Fabaceae). Molecular Phylogenetics and Evolution 97:187-195
  • Pouget, M., Youssef, S., Dumas, P. J., Baumberger, T., San Roman, A., Torre, F., ... & Baumel, A. (2016). Spatial mismatches between plant biodiversity facets and evolutionary legacy in the vicinity of a major Mediterranean city. Ecological Indicators, 60, 736-745.
  • Pouget, M., Youssef, S., Migliore, J., Juin, M., Médail, F., & Baumel, A. (2013). Phylogeography sheds light on the central–marginal hypothesis in a Mediterranean narrow endemic plant. Annals of botany, 112 : 1409-1420.
  • Migliore, J., Baumel, A., Juin, M., & Médail, F. (2012). From Mediterranean shores to central Saharan mountains : key phylogeographical insights from the genus Myrtus. Journal of Biogeography, 39(5), 942-956.
  • Youssef, S., Baumel, A., Véla, E., Juin, M., Dumas, E., Affre, L., & Tatoni, T. (2011). Factors underlying the narrow distribution of the Mediterranean annual plant Arenaria provincialis (Caryophyllaceae). Folia Geobotanica, 46(4), 327-350.

Responsabilities

Co-leader with Carole of the Team 2 ; the name of the team is « Origin and Evolution of Biodiversity » and is merging researchers from various horizons (animals, plants, bacterias and fungies) in an happy genomic mess.

Student supervisions

  • Cartereau Manuel Master 1 2018 Inférence phylogéographique sur l’isolement et la dynamique d’aire de distribution géographique chez Bufonia perennis Pourr
  • Le Galliot Nicolas Master 2 2018 Un ou plusieurs centres de diversité ? Analyse rétrospective de la diversité génétique du caroubier, Ceratonia siliqua L. (Leguminosae) par test d’hypothèses biogéographiques.
  • Danovaro Cécile Thèse 2017 Modeling the demographic dynamics of a Trans-Saharan migratory bird of prey : the Montagu’s harrier
  • Cartereau Manuel Licence 3 2017 Etude phylogéographique de Bufonia perennis Pourr. (s. str.) (Viridiplantae, Caryophyllaceae) dans le Sud de la France
  • Le Galliot Nicolas Master 1 2017 Modélisation de l’histoire démographique d’Arenaria provincialis : Aspects temporels et populationnels
  • Beaulier Camille Master 1 Sup Biotech 2017 Molecular evaluation of the origins of Adonis vernalis L. (Ranunculaceae) isolates in Provence
  • Viruel Juan Postdoc 2016 Carob tree phylogeography, development of molecular markers
  • Pouget Marine Thèse 2014 Comment préserver l’héritage évolutif singulier des végétaux endémiques méditerranéens ?
  • Batista Manon, Guiller Clémence, Lambert angélique, Pichot du Mezeray Jean Olivier Master 1 2013 Modélisation de la structure de diversité génétique d’Arenaria provincialis (Caryophyllaceae) dans une démarche de conservation
  • Kharrat-Souissi Amina Thèse 2012 Polymorphisme phénotypique, cytogénétique et moléculaire de Cenchrus ciliaris L., (Poaceae) en relation avec l’aridité climatique.
  • Pouget Marine Master 2 2011 Conservation évolutive de la flore des lapiaz de Basse Provence : Apports de la phylogéographie d’Arenaria provincialis (Caryophyllaceae)
  • Migliore Jérémy Thèse 2011 Empreintes des changements environnementaux sur la phylogeographie du genre Myrtus en méditerranée et au Sahara
  • Youssef Sami Thèse 2011 Ecologie d’une espèce endémique méditerranéenne : étude des adaptations et des facteurs déterminant sa persistance et sa distribution
  • Pouget Marine Master 1 2010 Comparaison des traits racinaires et aériens de cinq Sablines (g. Arenaria, Caryophyllacées)
  • Ong’amo George Postdoc 2010 Spatial genetic structures of two herbaceous forest plant species in Champsaur bocage (southern French Alps)
  • Mechouki Zoubida Master 1 2009 Effet du stress hydrique et du substrat de culture sur la survie et la croissance de 5 Sablines (Caryophyllacées, g. Arenaria)
  • Hardion Laurent Master 1 2009 Phylogenetic relationships of Astragalus tragacantha L. (Fabaceae), a rare West Mediterranean species, inferred from nuclear ribosomal DNA Internal transcribed spacers data (nrDNA ITS).
  • Hamouche Yasmina stage de doctorat 2009 Etude de la variabilité morphologique et phylogénétique des scilles automnales de l’Algérie
  • Hardion Laurent Licence 3 2008 Suivi démographique d’Arenaria provincialis, une caryophyllacée endémique de Basse Provence calcaire
  • Gasmi Aïda Master 2 2008 Structures génétiques spatiales comparées de Primula vulgaris et Moehringia trinervia dans un paysage de bocage (Champsaur, Hautes-Alpes) : Simulation et approche empirique
  • Hamouche Yasmina stage de doctorat 2008 Initiation aux méthodes de criblage du polymorphisme génomique par marqueur PCR multilocus, application aux scilles
  • Migliore Jérémy Master 2 2007 Démographie, écologie, diversité et structure génétique de Mercurialis corsica Cosson (Euphorbiaceae), en vue de sa conservation
  • Sami Youssef Master 2 2007 Écologie et viabilité de la population d’Armeria arenaria (Plumbaginaceae) du Cap Lardier (Var), espèce végétale bio-indicatrice de l’état de conservation de la flore littorale des Maures
  • Daniel Sarah, Serrano Magali Licence 3 2006 Dynamique des populations de Gouffeia arenarioïdes (Caryophyllaceae) endémique provençale : Quelles sont les performances de germination des graines ?
  • Sauve Mathieu, Seguin Olivier Licence 3 2006 Impact des Goélands sur les potentialités d’établissement d’Astragalus tragacantha (Fabaceae) sur les îles du Frioul
  • Ménard Léa, Vanderpert Héloïse Licence 3 2005 Écologie et biologie d’une espèce rare et endémique de Provence calcaire : Gouffeia arenarioïdes (Caryophyllaceae)
  • Amm Annabelle, Boissy Marie-Line, Brest Sébastien, Di Liello Marion, Dumas Pierre-Jean Master 1 2005 Démographie de trois espèces végétales protégées de l’archipel du Frioul : Etude des perturbations et élaboration d’un suivi diachronique dans la perspective d’une analyse de viabilité
  • Gonçalves Virginie Master 2 2005 Ecologie et dynamique des populations de Gouffeia arenarioïdes (Caryophyllaceae)
  • Glen Yannick Master 2 2001 Variabilité génétique des populations françaises de Spartina maritima, espèce native en voie de régression