Animation scientifique de l’axe 2

La liste de nos animations reflète nos thèmes de recherches. L’ensemble de ces discussions et conférences sont ouvertes.

10 Février 2012 - « Les éponges : une approche combinée phylogénie et génétique du développement comparée » - Carole Borchiellini, Edoume.

9 Mars 2012 - « Génétique du corail rouge : des flux de gènes à l’écologie moléculaire » - Didier Aurelle, St Jérome.

13 Avril 2012 - « Approche génomique de la sélection en environnement spatialement variable et de la spéciation chez les anguilles atlantiques » - Pierre Alexandre Gagnaire, Endoume.

15 Juin 2012 - « Le 454 : taux d’erreur, correction et utilisation en barcoding environnemental » - André Gille, St Charle.

12 octobre 2012 - « L’implication des gènes wnt dans les processus de morphogenèse chez l’éponge Oscarella lobularis » - Quentin Schenkelaars, Endoume.

14 décembre 2012 - « Que fait-on avec des séquences 454 de 154 espèces ? Approche appliquée et fondamentale à la chasse aux microsatellites » - Emese Meglecz, st Charles.

18 Janvier 2013 « Etude du complexe d’espèces d’ophiure Ophioderma longicauda : comparaison entre lignées à larves et lignées incubantes » Station d’Endoume à 14h. Alexandra Weber.

8 Février 2013 « Variation inter spécifique de la température du thorax à l’envol chez les papillons : causes fonctionnelles et contraintes évolutives », Gabriel Neve, st Charles, 14h.

16 Mai 2013 "Exploration de la Biodiversité par NGS, de nouveaux horizons ?" Journée de conférences à st Charles.

27 mai 2013 « Etude des mécanismes de distribution de la diversité des assemblages des communautés à Coralligène en Méditerranée Française. » Florian Holon, Endoume

du 27 au 30 aout 2013 - 35 ème réunion annuelle du Groupe d’Etude de Biologie et Génétique des Populations - « Petit Pois Déridé »

17 février 2014, « Origine et évolution de la diversité des plans d’organisation chez les métazoaires : apports de l’éponge Oscarella et de l’annélide Platynereis ». Eve Gazave, Endoume

19 février 2014, « Approximate Bayesian Computation : principles, applications in ecology, and a demo of the R abc package. » Katalin Csilléry, Endoume

3 juin 2014, « Comment intégrer l’ECOlogie à l’Evo-Devo ? »

  • Benjamin PRUD’HOMME (Institut de Biologie du Développement de Marseille-Luminy, UMR CNRS 6216 ) « Evolution de la pigmentation des ailes chez Drosophila »
  • André GILLES (Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie marine et continentale, CNRS UMR 7263) « Compatibilité génomique entre espèces proches : implication dans la réorganisation du transcriptome chez les hybrides »
  • Mohammed BENDAHMANE (Ecole Normale Supérieure, Laboratoire RDP, CNRS-INRA-Lyon1-ENS) « Contrôle génétique du développement du pétale chez Arabidopsis et Rosa »
  • Mark COCK (Algal Genetics Group, UMR 8227 CNRS-UPMC Integrative Biology of Marine Models, Station Biologique Roscoff) “Regulation des cycles de vie chez les algues brunes et le rôle écologique des variations de ces cycles de vie”
  • Michel VANDENBUSSCHE (Evo-Devo of the flower team-RDP laboratory, UMR5667 INRA-CNRS-ENSL-UCB Lyon I) « Évolution des réseaux de gènes régulateurs floraux »
  • Benoit MENAND (Laboratoire de Génétique et Biophysique des Plantes CEA-CNRS-Université de la Méditerranée) « Evolution de la regulation de la croissance des plantes par la voie de signalization TOR kinase : une perspective Eco-Evo-Devo ”

22 septembre 2014 - « Conservation de la biodiversité et héritages évolutifs »

Journée organisée conjointement par les équipes Macrobio et IDEA de l’IMBE, le M2R SBEM et le Conservatoire botanique national méditerranéen (CBNMED).

  • Thèse de Marine Pouget, IMBE : Comment préserver l’héritage évolutif singulier des végétaux endémiques méditerranéens ?
  • Markus Pfenninger, centre de recherche sur la biodiversité et le climat, Francfort-sur-Maine : Including environmental information in phylogeography : case study in Radix (Gastropoda, Lymnaeidae)
  • Cristina Roquet Ruiz, Laboratoire d’écologie alpine, Grenoble : Phylogénomique : vers une meilleure compréhension de l’évolution des plantes parasites. Perspectives de l’usage des phylogénies en conservation
  • Jérémy Migliore, Laboratoire biologie évolutive et écologie, Bruxelles :Intégrer la dimension évolutive dans la conservation de la biodiversité du Sud des Alpes
  • Gianluigi Bacchetta, Centre de conservation de la biodiversité, Cagliari : La distribution de la flore endémique pour les analyses biogéographiques et la conservation
  • Présentation de la Flore de la France méditerranéenne continentale par le CBNMED et séance de dédicaces par les auteurs

7 novembre 2014 - Rencontre avec la plateforme TGML, Luminy, Marseille.

15 décembre 2014, « Diversité microbienne et fonctionnement des écosystèmes »

These d’Anais Rancon « Diversité et fonctions des microorganismes associés à la litière de garrigue : influence de facteurs biotiques et abiotiques dans un contexte de changement climatique », en salle des thèse à St Jérôme.

  • « Distribution spatiale à grande échelle des communautés microbiennes » Lionel Ranjard UMR Agroécologie & Plateforme GENOSOL INRA de Dijon
  • « Tendances communes dans la microflore de deux plantes alpines pionnières » Roberto A. Geremia Évolution, Modélisation et Analyse de la biOdiversité Laboratoire d’Ecologie Alpine - Grenoble
  • « Approche fonctionnelle des interactions entre qualité des litières et dynamiques du C et N en milieu agricole » Isabelle Bertrand UMR Eco&Sols INRA de Montpellier

16 janvier 2015 journée sur l’évolution moléculaire et la spéciation à l’époque des NGS,

  • Thèse Alexandra Weber « Etude écologique et génétique du complexe d’espèces cryptiques Ophioderma longicauda : comparaison entre lignées incubantes et lignées produisant des larves planctoniques »
  • Pr Harilaos Lessios (Smithsonian institution, Panama - USA) Reproductive molecules of echinoderm gametes : are they involved in speciation ?
  • Nicolas Galtier (Université Montpellier 2) : Génomique des populations comparative chez les animaux.
  • Nicolas Bierne (Université Montpellier 2, station marine de l’environnement littoral de Sète) : « Reconstructing the history of speciation from NGS data and the evolution of introgression rates between two diverging lineages »

3 avril 2015, Conférences de Guillermo Orti (Dept of Biological Sciences, George Washington University) : « Baiting for Phylogenetic Fishing » et de Ivan Paz-Vinas (IMBE, Aix Marseille Université) : “Distribution of genetic diversity in dendritic networks : patterns, processes and implications for biodiversity conservation« , suivi d’un séminaire technique d’Emese Méglecz et deVincent Dubut :  »Développement de protocoles Biologie Moléculaire et Bio-informatique : approche métabarcoding pour l’étude du régime alimentaire d’un poisson de rivière"

8 avril 2015, Abigail Cahill « Understanding how climate change affects species distributions. »

27 novembre 2015, « Biodiversité et écologie à l’ère de la génomique environnementale »

  • Pascal Hingamp, « Les 1000 et une façons d’estimer la biodiversité à partir des données de métagénomique (hors méta-barcodes) »
  • Magali Lescot, « Ressources informatiques et bioinformatiques pour le traitement d’un jeu de données de génomique environnementale (Tara Océans) »
  • Lionel Ranjard, « Distribution spatiale et déterminisme de la diversité microbienne des sols à l’échelle du territoire nationale »