Biologie moléculaire

Membres / Charte d’utilisation

  • Membres :

Le personnel technique rattaché à ce service commun a pour mission d’organiser les activités techniques, de s’assurer du bon fonctionnement des équipements, d’encadrer techniquement les utilisateurs. Le personnel technique fournit également une aide et une formation technique aux différents projets de recherche.

  • Charte d’utilisation du SCBM :

Le SCBM a établit une charte expliquant le fonctionnement et les procédures à suivre pour tout nouvel utilisateur. Ce service a pour objectif la mise en œuvre de méthodes de biologie moléculaire répondant aux objectifs de recherches.
Le SCBM fournit un environnement et des postes de travail permettant la mise en œuvre des outils moléculaires.

Télécharger la charte de fonctionnement ... (intranet IMBE avec votre loggin)

Programmes et projets

* Les programmes de recherche :

Ces programmes ont utilisé les outils et les équipements du SCBM afin d’étudier la biodiversité sous différents aspects.

ANR :
- CEP Climed (2010-2014)
- Antflocks (2007-2010)
- MedChange (2003-2008)

Réseaux d’Excellence Européens : 
- Marine Genomics Europe : MGE (2003-2008) dont le projet EPIC (Exon Primed Intron Crossing).

- Marine Biology and Ecosystem Functioning : MARBEF (2004-2009) dont le projet GBIRM (marine genetics biodiversity).

Projets :
- AMIDEX-Spongex (« Émergence et Innovation », soutenu par l’AMIDEX (initiative d’excellence de l’Université d’Aix-Marseille)

- DEVOTES (2012-2016)

- EC2CO- Bertox (2010-2011)

ERA-NET
- Seasera projet : CIGESMED (2013-2016)

Séminaires techniques

Liste des Séminaires organisés sur le site Endoume :

  • 15/10/12 : « Identification de communautés bactériennes par une technique de séparation sur gradient de chlorure de césium », Marie Roumagnac
  • 29/10/12 : « Principe et utilisation d’une PCR temps réel », Isabelle Pivotto.
  • 12/11/12 : « Techniques d’hybridation in situ manuelles et automatisées (robot insituProVsi) », Caroline Rocher.
  • 26/11/12 : « Technique d’extraction ARN et construction de librairie pour séquençage illumina », Alexandra Weber.
  • 28/01/13 : « Cultiver l’incultivable », Marie Roumagnac.
  • 11/02/13 : « Technique du clonage », Marjorie Selva.
  • 04/03/13 : « Synthèse de sondes ARN », Quentin Schenkelaars.
  • 25/03/13 : « Coupes semi fines après traitement chimique d’un tissu vivant et analyse biométrique », Laura Fierro.
  • 16/12/13 : « Restriction site Associated DNA sequencing - Principe et applications », Anne Haguenauer.
  • 16/01/14 :« Les techniques de biologie moléculaire utilisées dans l’étude de la fonction d’un gène », Quentin Schenkelaars.
  • 17/11/14 :« L’imagerie cellulaire à l’ère des nouvelles modalités d’imagerie », invité extérieur Cédric Matthews, responsable de la plate-forme d’imagerie nationale CNRS de l’IBDM, est invité à nous présenter leur service.
    Différentes techniques seront abordées : vidéo-microscopie, microscopie confocale, 2 photons, imagerie rapide par Spinning disk, l’imagerie en feuillet de lumière (light sheet microscopy), l’imagerie haute résolution STED et PALM, aussi disponibles sur notre site. Ces deux dernières, sont celles qui ont récompensé Stephan Hell et E . Betzig du prix Nobel de Chimie 2014.
  • 08/12/14 :« Chip-Seq principe et analyse bioinformatique », Anne Haguenauer.
  • 03/04/15 :« Développement de protocoles Biologie Moléculaire et Bio-informatique : approche métabarcoding pour l’étude du régime alimentaire d’un poisson de rivière », Emese Méglecz et Vincent Dubut.

contacts
Caroline Rocher
Emmanuelle Renard
Alex Baumel