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SUMMARY:Marie Zakardjian "Interactions plantes-pollinisateurs dans un contexte de changements globaux"
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Marie Zakardjian nous propose une conférence intitulée “Interactions plantes-pollinisateurs dans un contexte de changements globaux“ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct. \nRésumé de la conférence : Les interactions-plantes-pollinisateurs sont essentielles au fonctionnement des écosystèmes et aux services écosystémiques associés. Or\, les populations et espèces d’insectes\, notamment les pollinisateurs\, sont en déclin à l’échelle globale. Cette conférence présentera les résultats d’études visant à évaluer la réponse et la vulnérabilité des systèmes plantes-pollinisateurs aux changements globaux
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LOCATION:Station Marine d’Endoume\, Rue de la Batterie des Lions Salle de conférence Batiment IV\, Marseille\, 13007\, France
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SUMMARY:Peut-on mieux protéger le vivant en lui donnant des droits ?
DESCRIPTION:Le 20 mai 2026 au Pharo à Marseille\, dans le cadre de la Chaire UNESCO « Éducation à la transition environnementale en Méditerranée »\, Victor David\, chargé de recherche IRD à l’IMBE\, présentera ses travaux sur la reconnaissance juridique du vivant. \nSes recherches portent sur une idée forte : reconnaître certaines espèces et écosystèmes comme entités juridiques afin de mieux les protéger. Il reviendra notamment sur ses travaux en Nouvelle-Calédonie et sur son engagement pour la reconnaissance de la mer Méditerranée comme sujet de droit. \nUne intervention qui invite à repenser notre rapport au vivant et ouvre de nouvelles perspectives pour sa protection. \n👉 Découvrez le programme et inscrivez-vous gratuitement !
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/peut-on-mieux-proteger-le-vivant-en-lui-donnant-des-droits/
LOCATION:Palais du Pharo\, 58 boulevard Charles Livon\, Marseille\, 13007\, France
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SUMMARY:Colloque SOS insectes : Conservation et réintroduction. Quels défis et comment y faire face ?
DESCRIPTION:Les insectes sont présents dans la plupart des écosystèmes terrestres et aquatiques. Ils représentent les animaux avec la plus grande diversité\, abondance et biomasse. 73% des espèces animales décrites sont des insectes. Ils assurent des fonctions et services écosystémiques diversifiés et cruciaux. \nCependant\, nombre d’espèces sont fortement menacés d’extinction\, avec seulement 0\,12% protégés à l’échelle de l’Union Européenne. Les changements environnementaux opérés par les activités humaines perturbent l’équilibre des services écosystémiques\, entraînant davantage d’impacts négatifs sur la santé\, l’agriculture et l’alimentation\, et renforçant une perception globalement défavorable des insectes. \nPourtant\,des initiatives locales de conservation sont mises en œuvre depuis plusieurs décennies pour inverser cette tendance. Si les réintroductions (ou actions similaires) ont été longtemps des opérations orientées principalement vers les mammifères et les oiseaux\, elles pourraient accompagner d’avantage les actions de conservation des habitats dans le cas des insectes. \nÀ partir de la stratégie de conservation du Criquet de Crau (Prionotropis rhodanica)\, une espèce endémique\, et du projet LIFE SOS Criquet de Crau arrivé à son terme après 10 ans d’actions\, le colloque SOS insectes\, a pour objectif de : \n\nPartager les connaissances acquises\nIdentifier les lacunes dans la conservation des insectes\nExplorer toutes les étapes d’une réintroduction réussie\, incluant l’analyse des menaces\, les suivis scientifiques et la gestion de l’espèce ainsi que son habitat\n\nLaurent Tatin\, co-organisateur du colloque et chercheur associé dans l’équipe EECAR-IMBE\, nous invite à découvrir les enjeux et solutions pour la conservation des espèces menacées et de leurs habitats. \nContact : thierry.dutoit@imbe.fr
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/colloque-sos-insectes-conservation-et-reintroduction-quels-defis-et-comment-y-faire-face/
LOCATION:Maison de la vie associative\, 3 Bd des Lices\, Arles\, 13200
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SUMMARY:François Marchal "Le genre Homo n'est plus ce qu'il était"
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, François Marchal nous propose une conférence intitulée “Le genre Homo n’est plus ce qu’il était“ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct. \nRésumé de la conférence : Le genre Homo est celui dont nous\, Homo sapiens\, faisons partie\, et est à ce titre un sujet d’étude de longue date en paléoanthropologie. Pourtant\, les chercheurs de cette discipline ne savent plus comment le définir. Pourquoi et comment en sommes-nous arrivés là\, c’est ce que cette conférence tentera d’expliquer.
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LOCATION:Station Marine d’Endoume\, Rue de la Batterie des Lions Salle de conférence Batiment IV\, Marseille\, 13007\, France
CATEGORIES:Les Mercredis d'Endoume
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SUMMARY:Thèse de Arnaud Lec'hvien "Sols\, plantes\, pollinisateurs et fonctions écologiques associées dans les centrales photovoltaïques du sud de la France : Vers des recommandations pour la conservation de cette biodiversité"
DESCRIPTION:Monsieur Arnaud Lec’hvien\, doctorant à l’IMBE (équipes Ecologie fonctionnelle : des systèmes socioécologiques aux molécules\, et Ecologie\, Ecotoxicologie & Chimie appliquées à l’Agroécologie et à la Restauration)\, et au CEFE (Montpellier) soutiendra publiquement ses travaux de thèse le mercredi 29 avril 2026\, à 14h dans l’amphithéatre MASSINI à la faculté de Saint-Charles. \nDevant le jury composé de : \n\nIsabelle DAJOZ\, Professeure\, Université Paris cité\, Rapportrice\nEstelle FOREY\, Professeure\, Université de Rouen normandie\,  Rapportrice\nCatherine PICON-COCHARD\, Directrice de recherche\, INRAE\, Examinatrice\nJérémy FROIDEVAUX\,  Maître de conférences\, Université de Franche-Comté\, Examinateur\nRaphaël GROS\,  Professeur\, Aix Marseille Université\, Directeur de thèse\nBertrand SCHATZ\,  Directeur de recherche\, CEFE \, Co-directeur de thèse\nArmin BISCHOFF\,   Professeur\, Avignon Université\, Co-encadrant de thèse\n\n  \nRésumé des travaux : \nLes prairies et les pelouses assurent de multiples fonctions écologiques qui soutiennent des services écosystémiques indispensables à l’homme. Les interactions biotiques complexes entre les organismes du sol et la végétation\, entre ces organismes du sol ainsi qu’entre les plantes et les pollinisateurs contribuent à ces fonctions et à la résilience de ces écosystèmes lorsqu’ils sont dégradés. Ces milieux figurent parmi les plus menacés de la planète en raison l’intensification des usages agricoles\, du changement climatique et de l’artificialisation des sols. Les centrales photovoltaïques (CPV) au sol\, bien qu’indispensables à la transition énergétique\, exercent une forte pression sur les prairies du fait de leur emprise spatiale\, des travaux de construction et de la présence des panneaux solaires qui modifient les conditions microclimatiques. Elles peuvent donc représenter une menace supplémentaire ou\, selon le contexte d’implantation\, leurs caractéristiques techniques\, et les pratiques de gestion notamment de l’enherbement\, une potentielle opportunité pour la conservation d’une certaine biodiversité. Les objectifs de cette thèse sont d’évaluer les incidences positives\, neutres ou négatives des CPV terrestres sur les interactions sol-plantes-pollinisateurs des milieux prairiaux et certaines fonctions écologiques et de tester les effets des différentes pratiques de gestion de la végétation et de développer des méthodes de restauration écologique adaptées à ce contexte industriel où le stress généré par les panneaux sont persistants. Pour atteindre ces objectifs\, plus de trente centrales réparties dans 2 régions françaises aux conditions écologiques\, pédologiques et climatiques contrastées ont été étudiées. Cette sélection de CPV a permis de déployer 3 plans d’expériences complémentaires pour étudier 1) la modulation des impacts des centrales et des panneaux solaires par les variations climatiques inter- et intra-régionales\, 2) les effets combinés des panneaux solaires et de la gestion de la végétation et 3) l’efficacité de plusieurs techniques de restauration écologiques et sa modulation par les panneaux solaires. Les conditions pédologiques et climatiques régionales modulent les effets des panneaux solaires\, tandis que le pâturage diminue la fonction de pollinisation par rapport à la fauche. Les panneaux solaires modifient l’influence des variations bioclimatiques infrarégionales sur la biodiversité. Ils limitent aussi l’efficacité de restauration écologique\, mais certaines techniques de restauration\, comme les semis diversifiés et l’ajout de galets\, ont montré des résultats prometteurs pour augmenter la richesse végétale et restaurer partiellement les fonctions écologiques. Ce travail offre aux développeurs et gestionnaires des arguments scientifiquement éprouvés pour une meilleure prise en compte des enjeux de conservation de la biodiversité. \n  \n  \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-arnaud-lechvien-sols-plantes-pollinisateurs-et-fonctions-ecologiques-associees-dans-les-centrales-photovoltaiques-du-sud-de-la-france-vers-des-recommandations-pour-la-conservation-de/
LOCATION:Campus Saint-Charles\, Amphithéatre MASSIANI\, 3 place Victor Hugo\, Marseille\, 13003
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SUMMARY:Cycle de conférences Midisciences - Emma Leone : "Une contamination ancrée dans le temps\, 78 ans de pollution après le brulage de munition dans un espace naturel protégé"
DESCRIPTION:Dans le cadre du cycle de conférences Midisciences\, Emma Léone\, doctorante en 2ᵉ année dans l’équipe EECAR-IMBE\, présentera ses recherches sur les sols de la plaine de la Crau (Sud-PACA) contaminés par les métaux issus du brûlage de munitions de la Seconde Guerre mondiale. \n75 ans après\, ces sols restent partiellement dépourvus de vie\, et les polluants modifient les propriétés et impactent la biodiversité. Brachypodium retusum montre un potentiel de stabilisation des métaux\, ouvrant la voie à des stratégies de phytoremédiation et guidant les actions de renaturation et gestion de la pollution. \nContact : thierry.dutoit@imbe.fr
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/cycle-de-conferences-midisciences-emma-leone-une-contamination-ancree-dans-le-temps-78-ans-de-pollution-apres-le-brulage-de-munition-dans-un-espace-naturel-protege/
LOCATION:Avignon Université\, Campus Jean-Henri Fabre\, Bâtiment A\, Amphi Agrosciences\, 301 Rue Baruch de Spinoza\, Avignon\, 84140\, France
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SUMMARY:Mireille Harmelin-Vivien "Les Amours des poissons : Némo n’est pas une histoire pour les enfants… !"
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Mireille Harmelin-Vivien nous propose une conférence intitulée “Les Amours des poissons : Némo n’est pas une histoire pour les enfants… !“ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct. \nRésumé de la conférence : Côté Amours\, les poissons ont tout essayé…ou presque ! Changements de sexe\, reproduction en couple ou en groupe\, parents attentifs ou indignes\, pères porteurs et autres solutions\, ont été développés pour assurer la survie des espèces. Mais les activités humaines peuvent modifier la donne et mettre en danger la pérennité de certaines populations.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/mireille-harmelin-vivien-les-amours-des-poissons-nemo-nest-pas-une-histoire-pour-les-enfants/
LOCATION:Station Marine d’Endoume\, Rue de la Batterie des Lions Salle de conférence Batiment IV\, Marseille\, 13007\, France
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SUMMARY:Atelier thématique Montagnes
DESCRIPTION:Les 18 et 19 mars 2026\, l’IMBE\, en partenariat avec ITEM et ARKAIA\, organise deux journées d’étude consacrées aux territoires de montagne face aux changements globaux. \nOrganisé en collaboration avec ORCHAMP (observatoire national de la biodiversité de montagne) et Sentinelles des Alpes\, cet événement place l’interdisciplinarité au cœur de la réflexion\, croisant l’écologie\, l’hydrobiologie\, les sciences du sol et l’archéologie. \nCes journées visent également à mutualiser nos connaissances et à faire émerger des synergies concrètes entre partenaires académiques (IMBE\, LECA\, CARRTEL\, MMSH) et acteurs de terrain (CBNA\, CBNmed\, Parc National des Ecrins). \n📍 L’atelier thématique se tiendra à la Faculté de Saint-Jérôme (Marseille) en présentiel\, et pourra également être suivi en visioconférence. \nDécouvrez d’ores et déjà le programme ! \n 
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LOCATION:Amphitéatre INSPE\, Campus Saint-Jérôme\, 52 Av. Escadrille Normandie Niemen\, Marseille\, 13013
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SUMMARY:Gérer la biodiversité fonctionnelle dans les paysages agricoles – 11ᵉ rencontre LMFB à Avignon
DESCRIPTION:Les rencontres du groupe de travail « Landscape Management for Functional Biodiversity » (LMFB) de l’International Organisation for Biological and Integrated Control (IOBC/WPRS) se tiendront à Avignon\, dans le sud de la France. \nCo-organisé par Armin Bischoff et Olivier Blight (équipe EECAR-IMBE-Avignon Université) en partenariat avec l’INRAE\, ces rencontres biennales\, rassemblant une centaine de participants européens majoritairement non francophones\, sont un rendez-vous incontournable pour les chercheurs travaillant sur la gestion de la biodiversité fonctionnelle dans les paysages agricoles. \nL’objectif est de partager les dernières avancées en matière de protection des cultures contre les ravageurs\, pathogènes et adventices\, en s’appuyant sur la biodiversité fonctionnelle\, ainsi que d’échanger sur les méthodes de suivi et de préservation de la biodiversité dans les agroécosystèmes. \nLe programme mettra l’accent sur la régulation des ravageurs\, l’amélioration de la pollinisation et la diversification des habitats et des ressources végétales favorables à la biodiversité fonctionnelle\, quelle que soit l’échelle spatiale ou le type de système de culture. Ces rencontres permettront également d’établir de nouvelles collaborations et de mieux comprendre la diversité des systèmes agricoles dans la zone paléarctique ouest. \nPour tous les détails pratiques\, ainsi que les dates limites pour la soumission des résumés et des articles complets\, rendez-vous sur le site de l’événement.
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LOCATION:Avignon Université\, Campus Hannah Arendl\, Amphi 2E01\, 74 Rue Louis Pasteur\, 84029
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SUMMARY:Brigitte Talon "De l'horizon au paysage : ce que les charbons des sols révèlent des forêts passées"
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Brigitte Talon\, nous propose une conférence intitulée “De l’horizon au paysage : ce que les charbons des sols révèlent des forêts passées“ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct. \nRésumé de la conférence : Comprendre les héritages des activités humaines passées aide à raconter l’histoire des forêts et des paysages\, façonnés par le temps et les usages. De la Provence aux Alpes du Sud\, nous avons croisé archives historiques\, vestiges archéologiques et charbons de bois\, témoins des feux passés\, pour mieux saisir comment les paysages d’aujourd’hui se sont construits au fil du temps.
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SUMMARY:Conférence de la Société Linnéenne de Provence
DESCRIPTION:  \nLa Société Linnéenne de Provence a le plaisir de vous inviter à une conférence ouverte à toutes et à tous\, qui se tiendra le mercredi 11 février au Palais Longchamp\, avec une participation possible en distanciel. \nCette conférence sera présentée par Alex Baumel\, enseignant-chercheur à Aix-Marseille Université (IMBE)\, et portera sur le thème : \n« Illustrer la biodiversité en évolution : le polymorphisme floral des germandrées dans le Parc national des Calanques »
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LOCATION:Museum d’Histoire Naturelle – Palai Longchamp\, Boulevard Philippon\, Marseille\, 13004
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SUMMARY:Christian Garing "Pythéas\, l’extraordinaire astronome de Massalia"
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Christian Garing\, agrégé et docteur en physique\, nous propose une conférence intitulée “ Pythéas\, l’extraordinaire astronome de Massalia“ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct. \nRésumé de la conférence : Pythéas\, dans la seconde moitié du IVe avant notre ère\, a été le premier\, avec pour seul outil un gnomon\, à mesurer la latitude de Marseille\, et surtout à avoir trouvé l’inclinaison de l’axe terrestre sur l’écliptique. Comment a-t-il fait ? Le but de son voyage était de prouver la rotondité de la Terre ; il raconte que dans ces contrées nordiques\, le Soleil ne se couche pas au solstice d’été et que la mer commence à geler…
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/christian-garing-pytheas-lextraordinaire-astronome-de-massalia/
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SUMMARY:Journées de REVER14 - Réseau d'Echanges et de Valorisation en Ecologie de la Restauration
DESCRIPTION:Les quatorzièmes journées de REVER – Réseau d’Echanges et de Valorisation en Ecologie de la Restauration\, REVER ET PLANIFIER\, seront organisées par l’Institut Méditerranéen de Biodiversité et Ecologie (IMBE) les 13 et 14 janvier 2026 à Avignon Université (Campus Hanna Arendt\, au centre ville).\nLe site internet est à présent ouvert pour recueillir vos propositions de communication et vos inscriptions. Toutes les informations y sont :\nhttps://rever14.sciencesconf.org \n  \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/rever14/
LOCATION:Avignon Université\, Campus Hanna Arendt (centre ville)\, 74 rue Louis Pasteur\, Avignon\, 84000\, France
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SUMMARY:Remise des Prix de l’Académie des Sciences\, Lettres et Arts de Marseille à jean Vacelet
DESCRIPTION:L’Académie des Sciences\, Lettres et Arts de Marseille\, institution fondée au XVIIᵉ siècle et dédiée à la promotion de la connaissance\, de la culture et de la recherche dans notre région\, organise sa traditionnelle cérémonie annuelle de remise des Prix. \nChaque année\, l’Académie distingue des auteurs\, historiens\, artistes\, scientifiques\, associations engagées\, ainsi que de jeunes élèves méritants. Cette édition met une nouvelle fois à l’honneur des personnalités et des initiatives qui contribuent au rayonnement de Marseille. Parmi les distinctions majeures remises cette année\, le Prix du Duc de Villars sera attribué à Jean Vacelet\, Directeur de recherche CNRS émérite à la Station marine d’Endoume (IMBE – Équipe NEMO)\, pour l’excellence de ses travaux consacrés aux éponges marines et à la biodiversité méditerranéenne.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/remise-des-prix-de-lacademie-des-sciences-lettres-et-arts-de-marseille-a-jean-vacelet/
LOCATION:Salon Eugénie – Palais du Pharo\, 58 boulevard Charles Livon\, Marseille\, 13007
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SUMMARY:Thèse de  LEGROS Thibaud "La litière des forêts méditerranéennes comme source d'émission de Composés Organiques Volatils Biogéniques (COVB) dans un climat plus aride : quelles conséquences atmosphériques à l'échelle régionale ?"
DESCRIPTION:Monsieur LEGROS Thibaud\, doctorant à l’IMBE\, équipe Ecologie fonctionnelle : des systèmes socioécologiques aux molécules\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le mercredi 17 décembre 2025\, à 14h dans L’Amphithéâtre PONTE\, Campus Saint Jérôme. \nDevant le jury composé de : \n\nDr Alexandre ARMENGAUD\, Membre invité\, AtmoSud\nDr Karine SARTELET\, rapporteuse\, CEREA\, Ecole nationale des ponts et chaussées\nDr Joan LLUSIÀ\, rapporteur\, CREAF\, Espagne\nDr Raluca CIURARU\, examinatrice\, Université Paris-Saclay\, INRAE\nPr Philippe Cuny\, Président du jury\, AMU-MIO\nPr Catherine Fernandez\, co-directrice de thèse\, IMBE\nDr Elena Ormeno-Fuentes\, directrice de thèse\, IMBE\n\n  \nRésumé des travaux : \nLes émissions de Composés Organiques Volatils Biogéniques (COVB) de la canopée sont caractérisées depuis les années ’80 et leur contribution à la formation d’O3 a été quantifiée de l’échelle régionale (région Sud-PACA) à l’échelle globale. Cela contraste avec les émissions de COVB des sols et de leur litière qui restent rarement caractérisées y compris dans la région méditerranéenne alors qu’elle est fortement concernée par la pollution à l’O3 et qu’elle représente un point chaud du changement climatique ce qui pourrait impacter rapidement les flux de COVB. Pour combler ce manque de connaissances\, ce travail de thèse présente un double volet. D’une part\, le volet expérimental a pour but de caractériser les flux de COVB des sols recouverts de litière dans deux formations forestières typiques de la région méditerranéenne : la forêt décidue de Quercus pubescens au sein de la plateforme expérimentale in natura de l’O3HP – où les COVB ont été mesurés en temps réel par PTR-ToF-MS – et la forêt mixte de Pinus halepensis et Quercus ilex au sein du site in natura de Fontblanche où les COVB ont été étudiés via des analyses off-line par GC-MS. Ces flux ont été mesurés à la fin du printemps ou en été respectivement en conditions de stress hydrique naturel (SN) et de stress hydrique amplifié sur le long-terme (SA)\, via des dispositifs de restriction des précipitations mis en place depuis 10 ou 9 ans respectivement. D’autre part\, le volet de modélisation a permis d’évaluer la contribution actuelle des sols (recouverts de litière) des forêts (feuillus et de conifères) de la région Sud-PACA à l’aide de l’algorithme de Tingey. Ces émissions ont ensuite été comparées à la fois avec les émissions de COVB dans un scénario futur plus sec et avec les COVB émis par la canopée modélisée via MEGAN. Enfin\, la formation d’O3 a été estimée via le modèle CHIMERE. Le volet expérimental illustre que le sol (couvert de litière) de la forêt mixte se caractérise par un facteur d’émission (émissions à 30°C) de COVB important (184 µgC.m-2.h-1 en moyenne) formé par des monoterpènes et des sesquiterpènes compte tenu principalement de la participation de P. halepensis à ces émissions. La forêt décidue se caractérise en revanche par un facteur d’émission plus faible (22 µgC.m-2.h-1 en moyenne) de composés hautement volatils (acétone et acétaldéhyde). Dans les deux cas\, le flux total des COVB des sols diminue très fortement en conditions de SA (84% à Fontblanche et 43% à l’O3HP). En termes de modélisation\, les flux de COVB des sols forestiers représentent\, à l’échelle de la région Sud-PACA et pendant l’été 2022\, 26 tC.jour-1 sous SN et 7 tC.jour-1 sous SA\, ce qui induit une augmentation de 4% et 2% (respectivement) de la concentration en O3 à l’échelle de la région. \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-legros-thibaud-la-litiere-des-forets-mediterraneennes-comme-source-demission-de-composes-organiques-volatils-biogeniques-covb-dans-un-climat-plus-aride-quelles-consequences-atmospher/
LOCATION:Amphithéatre PONTE – Campus Saint Jérôme\, 52 Av. Escadrille Normandie Niemen\, Marseille\, 13013
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SUMMARY:Thèse de BREAUD Célia "Nouvelle stratégie dans la recherche d’agents antituberculeux naturels issus de la flore de Guyane française"
DESCRIPTION:Madame BREAUD Célia\, doctorant à l’IMBE\, équipe Ecologie fonctionnelle : des systèmes socioécologiques aux molécules\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le lundi 15 décembre 2025\, à 14h dans la salle des thèses de la faculté de Pharmacie. \nDevant le jury composé de : \n\nSophie TOMASI\,  Rapporteuse et Présidente du Jury\, Professeure des Universités\, Université de Rennes\nMehdi BENIDDIR\, Rapporteur\, Professeur des Universités\, Université Paris-Saclay\nGaëtan HERBETTE\, Examinateur\, Ingénieur de recherche\, Université Paris-Saclay\nStéphane CANAAN\,  Examinateur\, Directeur de recherche\, Université d’Aix-Marseille\nSok-Siya BUN-LLOPET\, Directrice de thèse\, Professeure des universités – Praticienne hospitalière\, Université d’Aix-Marseille\nElnur GARAYEV\, Co-directeur de thèse\, Maître de conférences\, Université d’Aix-Marseille\n\n  \nRésumé des travaux : \nLa tuberculose demeure un enjeu de santé publique majeur\, renforcé par l’émergence de souches résistantes. Dans ce contexte\, cette thèse explore la flore de Guyane française comme source de métabolites à potentiel antituberculeux\, en combinant criblage biologique\, métabolomique par LC-MS/MS et analyse par réseaux moléculaires\, avec intégration des données d’activité. \nUn premier volet a porté sur sept espèces sélectionnées sur la base de critères ethnopharmacologiques et phytochimiques. Les extraits et fractions ont été testés contre Mycobacterium tuberculosis H37Ra\, puis profilés par LC-HRMS/MS. Les réseaux moléculaires ont permis de relier familles chimiques et niveaux d’activité\, de prioriser des candidats et de dérépliquer rapidement des composés connus\, tout en révélant des composés antituberculeux dans plusieurs extraits actifs. \nLe second volet s’est focalisé sur deux espèces du genre Aspidosperma (Apocynaceae)\, riches en alcaloïdes indoliques monoterpéniques. Le fractionnement bioguidé\, couplé aux réseaux moléculaires\, a mis en évidence un noyau de composés corrélés à l’inhibition de M. tuberculosis. Les résultats soutiennent l’intérêt de ce réservoir chimique\, tout en soulignant la nécessité d’isolements ciblés et de validations structurales par RMN pour attribuer finement l’activité. \nLe troisième volet a abordé Lantana trifolia (Verbenaceae). Les fractions de polarité intermédiaire se sont révélées les plus actives\, et l’analyse métabolomique a indiqué la contribution possible d’un petit groupe de métabolites abondants avec l’activité. L’annotation globale a par ailleurs confirmé un profil riche en flavonoïdes\, acides phénols et phénylpropanoïdes glycosylés\, suggérant un effet cumulatif ou synergique concordant avec la distribution de l’activité observée. \nSur le plan méthodologique\, la thèse montre l’intérêt d’un pipeline reproductible alliant LC-MS/MS haute résolution\, déréplication automatisée et réseaux moléculaires bioactifs pour rationaliser la priorisation des fractions et orienter l’isolement. Sur le plan scientifique\, elle documente la chimiodiversité d’espèces amazoniennes encore peu étudiées\, établit des liens clairs entre familles chimiques et réponse antimycobactérienne\, et met en lumière des ensembles moléculaires prioritaires. \nEnsemble\, ces travaux démontrent l’apport des approches métabolomiques intégrées pour valoriser des bioressources tropicales dans la lutte contre Mycobacteium tuberculosis. Ils fournissent un corpus analytique et biologique\, directement mobilisable pour des actions d’isolement ciblé\, d’évaluation pharmacologique et de valorisation locale des ressources\, en cohérence avec une démarche éthique et partenariale de bioprospection en Guyane française. \n  \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-breaud-celia-nouvelle-strategie-dans-la-recherche-dagents-antituberculeux-naturels-issus-de-la-flore-de-guyane-francaise/
LOCATION:Salle des thèses\, faculté de Pharmacie\, La timone\, 27 Bd Jean Moulin\, Marseille\, 13385
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SUMMARY:Thèse de  Sarah Kubien "L'évitement en droit de l'environnement : une entrée par l'évaluation environnementale"
DESCRIPTION:Madame Sarah Kubien\, doctorante à l’IMBE\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le lundi 15 décembre 2025\, à 15h en salle des thèses\, Avignon Université. \nPour suivre la soutenance en distanciel\, c’est ici ! \nDevant le jury composé de : \n\nMme Isabelle DOUSSAN\, Directrice de recherche INRAE\, Co-directrice de thèse\nThierry DUTOIT\, Directeur de recherche CNRS\, Co-directeur de thèse\nMme Marthe LUCAS\, Maîtresse de conférences Avignon Université\, ADR Co-encadrante de thèse\nPhilippe BILLET Professeur des universités\, Université Jean-Moulin Lyon 3\, Rapporteur\nCharles-Hubert BORN\, Professeur\, Université catholique de Louvain\, Rapporteur\nBernard DROBENKO\, Professeur émérite\, Université Littoral Côte d’Opale Examinateur\nMme Isabelle MICHALLET\, Professeure des universités\, Université de Rennes Examinatrice\n\n  \nRésumé des travaux : \nL’étude d’impact est un outil de prévention des impacts à l’environnement adopté en droit interne en 1976. Novatrice à l’époque\, l’étude d’impact\, devenue plus récemment l’évaluation environnementale\, prévoit la réalisation d’un rapport scientifique\, la consultation du public\, des collectivités territoriales et de différents organismes concernés par la procédure avant autorisation d’un projet ou approbation d’un plan. Parmi les rubriques de l’étude d’impact\, la séquence “Eviter-réduire-compenser” (ERC) met en place une hiérarchie entre les différentes phases : le maître d’ouvrage ou décideur public doit faire en sorte d’éviter en priorité les impacts causés à l’environnement\, puis de réduire ceux n’ayant pas été évités et enfin de compenser les impacts résiduels. À l’époque et jusqu’il y a une quinzaine d’année\, la séquence dite ERC n’avait pas été réellement appropriée par les acteurs ni donné lieu à des mesures de prévention et de réparation des dommages environnementaux résiduels. Ce n’est qu’avec la montée en puissance des réflexions autour des mesures compensatoires\, que le cadre juridique de la séquence est revu et renforcé en 2010\, puis en 2016 par la loi sur la reconquête de la biodiversité\, la nature et les paysages. \nReste qu’aujourd’hui\, en comparaison avec la compensation écologique\, l’évitement fait l’objet d’un très faible nombre d’études. Pourtant\, en pratique\, les acteurs de terrain comme les chercheurs alertent sur un déficit d’application de l’évitement. En examinant cette phase\, il apparaît que les causes de ce déficit sont multiples. A priori simple\, la thématique de l’évitement s’avère en effet ardue à traiter au regard des confusions qu’elle engendre avec d’autres rubriques de l’étude d’impact et au-delà en raison de sa dimension plurielle. Celle-ci s’exprime ainsi par les différentes formes d’évitement utilisées\, par le large champ d’application de l’évaluation environnementale\, ou encore par la diversité des impacts environnementaux censés être appréhendés. Il est\, de plus\, marqué par l’implication des choix politiques\, très présents à ce niveau. La thèse met ainsi en lumière une typologie de l’évitement. En sus des différents vecteurs de mise en œuvre de l’évitement\, y compris l’articulation entre les évaluations des plans et celles des projets\, la thèse souhaite une mise en cohérence du droit autour de cet outil\, afin d’en rationaliser la pratique et augmenter l’effectivité. Cette mise à jour est primordiale car l’évitement est aujourd’hui remis sur le devant de la scène. En adoptant des objectifs ambitieux de limitation des impacts à l’environnement\, tels que ceux de “zéro artificialisation nette”\, de “zéro émission nette” de gaz à effet de serre\, ou encore d’absence de perte nette de biodiversité\, les politiques publiques s’inscrivent dans la droite ligne des évaluations environnementales et de l’évitement. L’urgence écologique aujourd’hui indéniable impose en effet de nouvelles réflexions sur la consommation sobre des ressources naturelles et l’inscription des activités humaines dans les limites planétaires. \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-sarah-kubien-levitement-en-droit-de-lenvironnement-une-entree-par-levaluation-environnementale/
LOCATION:Salle des Thèses – Avignon Université\, Campus Hannah Arendt\, 74 Rue Louis Pasteur\, Avignon\, 84029
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SUMMARY:Thèse de ACHARD-BACCATI Clémentine "Valorisation ethnopharmacologique de cinq espèces végétales Provençales du Parc Naturel Régional du Luberon"
DESCRIPTION:Madame ACHARD-BACCATI Clémentine\, doctorante à l’IMBE\, équipe Ecologie fonctionnelle : des systèmes socioécologiques aux molécules\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le vendredi 12 décembre 2025\, à 9h dans la salle des thèses\, Faculté de pharmacie\, La Timone. \nDevant le jury composé de : \n\nAnne Gauvin-Bialecki\, Rapporteure\, Professeure des Universités\, Université de La Réunion\nFrançois Chassagne\, Rapporteur\, Chargé de Recherches\, IRD Nouméa\nDominique Laurain-Mattar\, Présidente du jury\, Professeure des Universités\, Université de Lorraine\nGérald Culioli\, Examinateur\, Professeur des Universités\, Avignon Université\nBéatrice BAGHDIKIAN\, Directrice de thèse\, Maître de Conférences HDR\, Aix-Marseille Université\nElnur GARAYEV\, Co-directeur de thèse\, Maître de Conférences\, Aix-Marseille Université\nSylvie MOREL\, Membre invitée\, Maître de Conférences\, Université de Montpellier\n\n  \nRésumé des travaux : \nCette thèse propose une démarche ethnopharmacologique pour la valorisation de plantes médicinales Provençales issues du Parc Naturel Régional du Luberon. Cette approche s’appuie sur les inventaires ethnobotaniques de Pierre Lieutaghi et Magali Amir afin de sélectionner cinq espèces de plantes médicinales utilisées en médecine traditionnelle Provençale pour des usages cutanés : Helichrysum stoechas\, Pilosella officinarum\, Plantago sempervirens\, Rubus ulmifolius et Satureja montana. \nLes drogues végétales de chaque espèce sélectionnée ont été extraites aux ultrasons avec un mélange hydro-éthanolique\, les extraits résultant ont été fractionnés par extraction liquide/liquide. \nLes extraits et fractions ont fait l’objet d’un criblage biologique pour évaluer des activités en lien avec les usages traditionnels : anti-oxydante (DPPH/ABTS en microplaque et couplage en ligne UHPLC-DAD-DPPH/ABTS-MS/MS)\, anti-inflammatoire (inhibition du NO)\, anti-microbienne (diamètres d’inhibition et CMI sur souches du microbiote cutané) et cicatrisante (scratch-test sur kératinocytes). \nEn parallèle\, la composition chimique a été étudiée par des analyses UHPLC-HRMS/MS et GC-MS. La déréplication et l’emploi des réseaux moléculaires ont permis de décrire la diversité chimique des extraits et fractions\, et de mettre en évidence des familles chimiques contribuant aux activités biologiques évaluées. \nLe couplage On-Line UHPLC-DAD-DPPH/ABTS-MS/MS a permis de déterminer avec précision les composés responsables de l’activité anti-oxydante. Compte tenu d’un fort potentiel anti-oxydant et d’une abondance naturelle favorable\, l’espèce Rubus ulmifolius a été retenue pour une valorisation industrielle. La sanguiine-H6\, identifiée comme principal contributeur à l’activité anti-oxydante de R. ulmifolius\, a été isolée par HPLC préparative et sa structure a été confirmée par RMN. Le développement d’une méthode de dosage spécifique en HPLC-UV et la mise en œuvre d’un plan d’expériences ont permis d’optimiser les conditions d’extraction pour majorer la concentration en sanguiine-H6 dans des extraits hydro-glycérinés. \nDans l’ensemble\, les résultats expérimentaux soutiennent les savoirs ethnopharmacologiques locaux relatifs aux usages cutanés\, avec des profils anti-oxydants\, anti-inflammatoires et anti-microbiens des espèces étudiées. \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-achard-baccati-clementine-valorisation-ethnopharmacologique-de-cinq-especes-vegetales-provencales-du-parc-naturel-regional-du-luberon/
LOCATION:Salle des hèses – Faculté de Pharmacie\, Campus Timone. 27 boulevard Jean Moulin\, Marseille CEDEX 05\, 13385
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SUMMARY:Thèse de  Mas-Normand Lindsay "Nouveaux développements analytiques pour la métabolomique et l’annotation d’extraits de plantes tinctoriales : Applications dans un contexte de patrimoine culturel"
DESCRIPTION:Madame Mas-Normand Lindsay\, doctorante à l’IMBE\, équipe Ecologie\, Ecotoxicologie & Chimie appliquées à l’Agroécologie et à la Restauration\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le mercredi 10 décembre 2025\, à 9h30 dans L’Amphithéâtre Agrosciences\, Avignon. Pour suivre la soutenance en distanciel. \nDevant le jury composé de : \n\nMme Émilie Destandau\, Professeure\, Université d’Orléans\, Rapporteure\nMme Audrey Le Gouellec\, Maître de Conférences\, HDR\, Université Grenoble Alpes\, Rapporteure\nJoël Boustié\, Professeur\, Université de Rennes 1\, Examinateur\nThibaut Devièse\, Maître de Conférences\, HDR\, Aix Marseille Université\, Examinateur\nGérald Culioli\, Professeur\, Avignon Université\, Directeur de thèse\nOlivier Dangles\, Professeur émérite\, Avignon Université\, Co-directeur de thèse\nMme Carole Mathe de Souza\, Maître de Conférences\, HDR\, Avignon Université\, Co-directrice de thèse\n\n\nRésumé des travaux : \nLes colorants naturels ont été employés par l’Homme afin de teindre des tissus et divers objets du quotidien jusqu’à la fin du XIXème siècle. Aujourd’hui\, historiens\, conservateurs de musées et scientifiques tentent de décrypter les secrets d’objets patrimoniaux\, afin de mieux comprendre leur histoire et de mieux les préserver. Grâce aux données recueillies\, il est parfois possible de remonter aux techniques et matériaux employés lors de leur teinture\, ou aux échanges de matières premières et de savoir-faire. Afin d’obtenir de telles informations\, un large panel de techniques analytiques peuvent être mises en œuvre. Néanmoins\, il est souvent ardu de remonter à l’origine botanique exacte des colorants naturels identifiés dans un objet\, notamment dans le cas de la couleur jaune. En effet\, cette couleur peut être obtenue à partir d’une grande variété de plantes tinctoriales et de nombreux composés sont communément retrouvés chez plusieurs d’entre elles. \nAfin de proposer une méthode permettant d’identifier avec précision l’origine botanique des colorants ayant servi à teindre des objets patrimoniaux\, mais aussi de mieux caractériser l’impact des conditions de teinture et de dégradation sur leurs compositions en molécules colorantes\, une approche métabolomique non ciblée est proposée dans le cadre de ces travaux de thèse. La métabolomique a déjà fait ses preuves dans le cadre d’études sur les stress environnementaux\, la découverte de biomarqueurs ou la recherche de molécules bioactives\, mais son utilisation reste encore anecdotique en chimie du patrimoine. \nLe premier objectif de cette thèse a consisté à développer une approche métabolomique non ciblée\, utilisant la LC-HRMS/MS et des outils d’annotation tels que les réseaux moléculaires\, afin de déterminer des marqueurs chimiques spécifiques propres à une sélection de plantes tinctoriales jaunes. Le second objectif a visé à étudier la stabilité et la dégradation de molécules colorantes\, en fonction des conditions de teinture\, de conservation de l’objet et des méthodes d’extraction employées. Enfin\, le troisième objectif a eu pour but d’appliquer la méthode développée à des objets anciens et de voir s’il était possible de retrouver certains des marqueurs chimiques décrits au niveau des deux premiers objectifs. \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-mas-normand-lindsay-nouveaux-developpements-analytiques-pour-la-metabolomique-et-lannotation-dextraits-de-plantes-tinctoriales-applications-dans-un-contexte-de-patrimoi/
LOCATION:Avignon Université\, Campus Jean-Henri Fabre\, Bâtiment A\, Amphi Agrosciences\, 301 Rue Baruch de Spinoza\, Avignon\, 84140\, France
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SUMMARY:Thèse de Salomé Coquin "Métabolites spécialisés volatils et non volatils des Magnoliophytes marines : caractérisation et saisonnalité en mer Méditerranée"
DESCRIPTION:Madame Salomé Coquin\, doctorante à l’IMBE\, équipe Ecologie fonctionnelle : des systèmes socioécologiques aux molécules\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le mercredi 10 décembre 2025\, à 9h dans l’amphithéâtre INSPE\, Campus Saint-Jérôme. Pour suivre la soutenance en distanciel.  \nDevant le jury composé de : \n\nDr Anne-violette Lavoir\, Rapporteure\, Université Côte d’Azur\nDr Philippe Potin\, Rapporteur\, Station Biologique de Roscoff\, Université de Brest\nDr Jean-Baptiste Raina\, Examinateur\, Université de technologie de Sydney\, Australie\nPr Patricia Bonin\, Examinatrice\, Aix-Marseille Université\nPr Catherine Fernandez\, Directrice de thèse\, Aix-Marseille Université\nDr Elena Ormeno-Fuentes\, Co-directrice de thèse\, CNRS\n\n  \nRésumé des travaux : \nLes métabolites spécialisés des espèces végétales\, volatils ou non volatils\, sont des molécules clés du fonctionnement des écosystèmes jouant un rôle majeur dans la défense contre les stress biotiques (herbivorie\, compétition) et abiotiques (sécheresse\, température)\, et dans la médiation chimique intra- et interspécifique. Leur étude éclaire ainsi les mécanismes de résistance et de résilience des plantes face aux changements environnementaux. \nBien que cruciaux\, ces composés restent peu connus dans les milieux marins\, notamment chez les Magnoliophytes marines\, essentielles à la qualité des eaux\, à la stabilité des côtes et à la séquestration du carbone bleu. Or\, ces services sont menacés car les herbiers marins sont en déclin dû aux changements globaux. Une compréhension approfondie de leurs métabolites spécialisés pourrait améliorer la compréhension des dynamiques de ces écosystèmes dans un contexte de changements globaux. \nLes travaux de thèses présentés s’inscrivent dans ce cadre en visant à 1) caractériser les métabolites spécialisés volatils ou Composés Organiques Volatils Biogéniques (COVB)\, 2) caractériser les métabolites spécialisés non-volatils\, 3) déterminer l’impact de la saisonnalité sur les COVB et 4) déterminer l’impact de la saisonnalité sur les métabolites non volatils pour quatre espèces majeures de Magnoliophytes méditerranéennes : Posidonia oceanica\, Cymodocea nodosa\, Zostera noltei et Zostera marina. Les COVB ont été prélevés par fibres SPME et analysés en GC-MS\, et les métabolites non volatils ont été extraits par solvant et détectés par UHPLC-qToF-MS sur des échantillonnages ponctuels et saisonniers. \nLes volatilomes (i.e.\, ensemble des composés volatils produits par un individu) et les métabolomes (i.e.\, ensemble des composés non-volatils produits par un individu) des différentes espèces d’herbiers marins présentent une forte diversité chimique. Plusieurs familles de composés identifiés sont bien connues en milieu terrestre comme l’acide chicorique\, l’acide rosmarinique\, le benzaldéhyde ou α-ionone. Cependant\, ces travaux ont également mis en évidence la présence de composés caractéristiques du milieu marin comme les composés halogénés (1-chlorodecane) et les composés soufrés (sulfure de diméthyl – DMS). Certains composés se sont révélés être des biomarqueurs spécifiques\, permettant de discriminer chimiquement les espèces entre elles\, avec des biomarqueurs volatils tels que le citral\, l’humulène ou l’alloaromadendrène ainsi que des composés non-volatils comme la rutine ou le sulfate de kaempferol. Les résultats obtenus confirment la phylogénie des espèces étudiées avec des volatilomes et des métabolomes plus ou moins proches en fonction des séparations phylogéniques\, prouvant l’intérêt de la chimiotaxonomie comme un outil complémentaire pour la distinction des espèces. De plus\, la saisonnalité influence significativement la production de composés spécialisés. L’été\, se distingue particulièrement par un nombre important de composés spécifiques comme le3-hexen-1-ol\, le menthol\, zonarene\, l’acide succinique et l’acide férulique. Ces résultats suggèrent que les métabolites spécialisés des plantes marines pourraient jouer des rôles de composés de défense\, grâce à leurs propriétés antioxydantes déjà mises en évidence en milieu terrestre. Au-delà de la variabilité saisonnière\, cette étude a également permis de mettre en évidence une variabilité spatiale importante pouvant révéler une acclimatation métabolique spécifique à des conditions environnementales suggérant des chémotypes chez C. nodosa. Ces premiers résultats offrent une base pour de futures recherches mécanistiques\, en particulier sur le rôle fonctionnel de ces composés dans l’écologie chimique des herbiers marins. \n 
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SUMMARY:Thèse de Marc-Antoine RACICOT : « Vers un droit plus effectif pour la conservation des milieux humides et hydriques au Canada : d’une séquence Éviter-Réduire-Compenser à une séquence de conservation »
DESCRIPTION:Monsieur Marc-Antoine RACICOT\, doctorant au laboratoire JPEG\, co-encadré par Marthe Lucas (IMBE\, équipe EECAR) en co-tutelle avec l’Université Laval (Canada) soutiendra publiquement ses travaux de thèse le vendredi 28 novembre 2025 à 15h en distanciel. \nDevant le jury composé de : \n\nPRISO-ESSAWE Samuel Jacques (Professeur des universités\, Avignon Université)\, CoDirecteur\n Mme HALLEY Paule (Professeure des universités\, Université de Laval)\, CoDirectrice\n Mme LUCAS Marthe (Maîtresse de conférences\, Avignon Université)\, Coencadrante\n Mme LANGLAIS Alexandra (Chargée de recherche CNRS\, Université de Rennes)\, Rapporteure\n M. TREMBLAY Hugo (Professeur des universités\, Université de Montréal)\, Rapporteur\n Mme DOUSSAN Isabelle (Directrice de recherche\, INRAE)\, Examinatrice\n M. PELLERIN Antoine (Professeur des universités\, Université de Laval) Examinateur\n\nRésumé des travaux : \nLa séquence d’atténuation « Éviter-Réduire-Compenser » (ERC) a été introduite dans de nombreux pays afin de contribuer à la conservation des milieux humides\, tels que les étangs\, les tourbières\, les marais et les marécages. Son utilisation dans les procédures d’autorisation environnementale délivrée par les ministères de l’Environnement est promue pour contribuer à atteindre l’objectif d’aucune perte nette de superficies\, de fonctions écologiques et/ou de biodiversité de ces milieux. Toutefois\, ces dispositifs se révèlent généralement insuffisants pour atteindre un tel objectif\, en raison d’un manque d’effectivité observé à chacune des trois étapes constitutives de cette séquence. \nPour remédier à cette situation\, de plus en plus de chercheurs s’entendent pour renforcer la séquence en élargissant son champ d’application\, notamment à la planification territoriale\, à l’aménagement du territoire\, ainsi qu’à d’autres types de milieux comme les habitats fauniques\, les boisés\, les bassins versants\, les friches agricoles ou industrielles\, les coulées\, les chemins forestiers\, les lisières\, etc. Du point de vue légistique\, un cadre élargi pour la séquence ERC suppose de répondre à plusieurs conditions d’effectivité\, dont la qualité\, la pertinence\, la cohérence\, la stratégie\, l’efficacité ou la réflexivité. Cette thèse propose ainsi d’évaluer ces critères à travers une analyse approfondie du droit canadien\, en examinant les régimes juridiques qui mobilisent déjà la séquence ERC ou qui offrent un potentiel pour son renforcement. Elle porte notamment sur les domaines du droit de l’environnement\, de l’aménagement du territoire\, de la gestion des ressources naturelles\, de l’agriculture et des forêts. Ce regard d’ensemble démontre que le droit fonctionne comme un système interconnecté\, dont les effets dépendent des structures\, des interactions et des finalités qu’il organise. En ce sens\, seule une approche systémique fondée sur la durabilité forte permettrait de rendre l’objectif d’aucune perte nette effectif et cohérent\, notamment en matière de milieux humides et hydriques.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-marc-antoine-racicot-vers-un-droit-plus-effectif-pour-la-conservation-des-milieux-humides-et-hydriques-au-canada-dune-sequence-eviter-reduire-compenser-a-une-sequence-de-c/
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SUMMARY:Thèse de Maximillien FIL "Design et optimisation de nouvelles drogues naturelles pour lutter contre la tuberculose"
DESCRIPTION:Monsieur Maximillien FIL \, doctorant à l’IMBE\, équipe Ecologie fonctionnelle : des systèmes socioécologiques aux molécules\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le jeudi 27 novembre 2025\, à 14h dans la salle des thèses  de la faculté de Pharmacie. \nDevant le jury composé de : \n\nProfesseur Nicolas WILLAND\,  Rapporteur\, Université de Lille\nProfesseur Rino RAGNO\, Rapporteur\, Sapienza Université de Rome\nDocteur Jessica HERNANDEZ\, Examinatrice\, Aixial\nProfesseure Laurence FERAY\, Présidente du jury\, Aix-Marseille Université\nDocteure Sandrine ALIBERT\, Directrice de thèse\, Aix-Marseille Université\nProfesseur Gérard BOYER\, Co-encadrant\, Aix-Marseille Université\nDocteur Paul BREMOND\, Membre Invité\, Aix-Marseille Université\nProfesseure Christine CONTINO-PEPIN\,  Membre Invitée\, Université d’Avignon\n\n  \nRésumé des travaux : \nDepuis l’antiquité\, la tuberculose est l’une des principales causes de mortalité ayant touché l’humanité. Si depuis la deuxième moitié du XXe siècle\, celle-ci est de mieux en mieux prise en charge\, elle demeure encore aujourd’hui la première cause de décès liés aux maladies infectieuses dans le monde. De plus\, l’émergence de résistances du pathogène Mycobacterium tuberculosis\, notamment à la rifampicine et à l’isoniazide – deux des quatre molécules de la quadrithérapie utilisée en première intention – rend indispensable le développement de nouvelles thérapeutiques. \nParmi les premiers freins au développement de nouvelles thérapeutiques antituberculeuses\, se trouve la membrane mycobactérienne\, membrane vitale particulièrement complexe et lipophile représentant un réel obstacle vis-à-vis des antibiotiques. Celle-ci est entre autres caractérisée par la présence d’acides mycoliques ainsi que d’arabinogalactane. Déstabiliser cette membrane est aujourd’hui une méthode de choix dans le développement de nouveaux composés à visée antituberculeuse. \nAfin de participer à la lutte contre la maladie\, cette étude propose le développement de modèles 3D-QSAR (Analyse quantitative 3D des relations structure-activités) basés des modèles pharmacophoriques 3D ainsi que des modèles de machine learning\, et tout particulièrement de Random Forest (RF) pour la découverte de composés capable de cibler l’Enoyl-[acyl-carrier-protein] réductase (InhA) et la Décaprenylphosphoryl-beta-D-ribose oxydase (DprE1)\, deux enzymes impliquées respectivement dans la biosynthèse des acides mycoliques et de la mycomembrane de Mycobacterium tuberculosis. Quarante-trois modèles pharmacophoriques 3D ont été réalisés et cinq d’entre eux ont été retenus pour le développement de modèles de RF. 10 modèles de RF qualitatifs ont ensuite été réalisés avec des F1 scores allant de 0\,88 à 0\,97 et des justesses entre 0\,96 et 0\,99. \nL’analyse de ces modèles souligne l’importance de descripteurs comme le Shape Index\, la masse molaire ou la globularité pour identifier de nouveaux inhibiteurs d’InhA. De la même manière\, si la prise en compte du Shape Index ou de la masse molaire restent clés pour l’inhibition de DprE1\, d’autres paramètres comme le volume et la surface de Van der Waals ou le LogP doivent être pris en compte pour inhiber correctement cette cible. \nCes modèles ont ensuite été utilisés pour le criblage in silico de près de 30 000 composés majoritairement d’origine naturelle. Lors des premiers criblages in vitro sur les 16 premiers composés sélectionnés et testés sur Mtb H37Ra\, 7 ont démontré une CMI50 soit un taux de sélection de hit de 47 %. \nParmi les composés potentiellement actifs\, 7 composés étaient prédits actifs par l’entièreté des modèles des deux cibles InhA et DprE1. Parmi ses composés\, se trouvait une quinazolin-4-one substituée en position 3\, 6 et 7. Une approche dite « multitarget » pouvant être une solution clé dans la prévention de l’émergence de résistances\, il a été choisi de synthétiser une série de 17 quinazolin-4-ones substituées en position 3 par une chaîne peptidique dont les tests microbiologiques sur Mtb H37Ra sont en cours. \nEn définitive\, ces travaux montrent le potentiel des modèles de 3D-QSAR et particulièrement de machine learning dans la lutte contre la tuberculose et dans les process de Drug Discovery. Ils mettent également en lumière le potentiel antituberculeux des quinazolin-4-ones substituées en position 3 par une chaîne peptidique. \n  \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-maximillien-fil-design-et-optimisation-de-nouvelles-drogues-naturelles-pour-lutter-contre-la-tuberculose/
LOCATION:Salle des hèses – Faculté de Pharmacie\, Campus Timone. 27 boulevard Jean Moulin\, Marseille CEDEX 05\, 13385
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SUMMARY:Thèse de Léa Saby "Évaluer des Solutions Fondées sur la Nature pour restaurer des pelouses méditerranéennes : Impacts des héritages écologiques sur les communautés et espèces dominantes"
DESCRIPTION:Madame Léa Saby \, doctorante à l’IMBE\, équipe Ecologie\, Ecotoxicologie & Chimie appliquées à l’Agroécologie et à la Restauration\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le jeudi 27 novembre 2025\, à 14h dans l’ Amphithéâtre de l’IUT d’Avignon. Pour suivre la soutenance en distanciel. \nDevant le jury composé de : \n\nEstelle Langlois\, Professeure\, ECODIV\, Université de Rouen\, rapporteure\nGregory Mahy\, Professeur\, Gembloux Agro-bio Tech\, Université de Liège\, Belgique\, rapporteur\nAdeline Bulot\, Maîtresse de Conférences\, BAGAP\, Institut Agro Rennes-Angers\, examinatrice\nRenaud Jaunatre\, Chargé de Recherches Inrae\, LESSEM\, Grenoble\, examinateur\nThierry Dutoit\, Directeur de Recherches Cnrs\, IMBE\, directeur de thèse\nChristel Vidaller\, Maîtresse de Conférences\, IMBE\, Université d’Avignon\, co-encadrante de thèse\nPierre Bourget\, Directeur de la Société des Carrières de La Ménudelle\, Fos-sur-Mer\, invité\n\n  \nRésumé des travaux : \nLes pelouses méditerranéennes de la plaine de Crau constituent des écosystèmes semi-naturels uniques\, reconnus pour leur grande richesse floristique et faunistique ainsi que pour leur valeur patrimoniale élevée. Cependant\, ceux-ci sont aujourd’hui menacés en raison de l’intensification agricole et du développement industriel. Restaurer leur diversité et leurs fonctions écologiques représente alors un défi majeur\, d’autant plus que ces écosystèmes sont fortement contraints par les héritages écologiques liés aux usages passés des sols. Cette thèse s’inscrit dans le cadre de la recherche de Solutions Fondées sur la Nature (NbS) pour restaurer ces pelouses\, en évaluant différentes méthodes allant de la réhabilitation de l’habitat à la biodiversité via des approches en écologie des communautés et dynamique des populations. \nDans un premier temps (chapitre 1)\, nous avons évalué les effets à moyen-terme (vingt années après leur mise en oeuvre)\, d’une restauration fondée sur la réhabilitation du micro-habitat (remise en place du recouvrement en galets) et la réintroduction de l’espèce dominante Brachypodium retusum. Si les galets ont favorisé la création de micro-habitats propices et soutenu certaines communautés d’invertébrés\, les effets de l’introduction du brachypode se sont révélés contrastés : augmentation de la biomasse et stabilisation du couvert herbacé\, mais réduction de la richesse végétale et du fourrage disponible. Ces résultats montrent donc que la réintroduction d’une espèce dominante seule ne suffit pas à restaurer la complexité et la diversité des communautés caractéristiques à moyen terme. \nLes chapitres 2 et 3 se sont focalisés sur des méthodes de restauration par apport d’un pool d’espèces comparant un mélange commercial de semences\, le transfert de foin et une méthode innovante utilisant les dépotoirs de fourmis. Le suivi à court terme (6 mois) a montré que les semis commerciaux échouaient en conditions réelles\, dominés par quelques espèces peu adaptées et parfois avec des espèces indésirables par rapport aux objectifs de restauration. En revanche\, le transfert de foin et les dépotoirs de fourmis ont permis l’installation d’une végétation plus riche et plus proche de la référence. Le suivi prolongé (3 ans) a confirmé l’efficacité du foin\, qui favorise la convergence floristique vers les communautés de référence\, tandis que les dépotoirs se sont révélés complémentaires en enrichissant les communautés en espèces spécialisées des croûtes biologiques\, un faciès typique des pelouses sub-steppiques de Crau. \nEnfin\, le chapitre 4 a abordé la restauration ciblée d’espèces dominantes (Brachypodium retusum et Thymus vulgaris) absentes malgré les semis\, en testant différentes modalités de réintroduction. Les résultats ont montré que les semis restaient peu efficaces\, tandis que la transplantation de jeunes plants augmentait significativement les taux de survie et d’installation. Les performances dépendaient néanmoins de l’origine du matériel (locale vs micro-locale) et du type de sol\, les sols issus d’anciens vergers apparaissant particulièrement défavorables. \nDans l’ensemble\, cette thèse souligne l’importance des héritages écologiques dans les trajectoires de restauration. Les sols agricoles fortement enrichis en nutriments apparaissent les plus difficiles à restaurer\, alors que les sols issus de steppe\, même remaniés et stockés pendant plusieurs années\, conservent des propriétés plus favorables. Elle met aussi en avant la pertinence des approches combinées : transfert de foin pour installer rapidement une matrice\, dépotoirs de fourmis pour enrichir en espèces spécialisées\, et introduction ciblée des espèces dominantes par transplants. \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-lea-saby-evaluer-des-solutions-fondees-sur-la-nature-pour-restaurer-des-pelouses-mediterraneennes-impacts-des-heritages-ecologiques-sur-les-communautes-et-especes-dominantes/
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SUMMARY:Baptiste Suchéras-Marx "Mais à quoi ça sert de faire des fouilles paléontologiques ? "
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Baptiste Suchéras-Marx\,enseignant-chercheur à Aix Marseille Université\, nous propose une conférence intitulée “ Mais à quoi ça sert de faire des fouilles paléontologiques ? “ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct. \nRésumé de la conférence : \nLa paléontologie\, discipline consacrée à l’étude des fossiles\, s’est fait connaître grâce à la découverte d’organismes extraordinaires ayant peuplé la Terre au fil des temps géologiques. Pourtant\, la récolte de fossiles lors des fouilles paléontologiques ne présente pas qu’un intérêt scientifique. Dans cette conférence\, notre intervenant vous proposera une réflexion sur l’utilité de ces fouilles dans leur ensemble — du point de vue d’un ancien fouilleur. Il ne s’agira donc pas d’une présentation de résultats de recherche\, mais d’une discussion sur la place et le rôle de la pratique paléontologique dans la société.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/baptiste-sucheras-marx-mais-a-quoi-ca-sert-de-faire-des-fouilles-paleontologiques/
LOCATION:Station Marine d’Endoume\, Rue de la Batterie des Lions Salle de conférence Batiment IV\, Marseille\, 13007\, France
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SUMMARY:HDR d'Irene TEIXIDOR TONEU  "Ethnobiologie et science de la durabilité : contributions réciproques entre société et nature comme leviers de changements transformateurs"
DESCRIPTION:Madame TEIXIDOR TONEU Irene\, équipe Écologie fonctionnelle : des systèmes socio-écologiques aux molécules\, soutiendra son Habilitation à Diriger les Recherches\, le mardi 25 novembre 2025 dans l’Amphithéatre Charve sur le Campus de St Charles à partir de 14h. \nDevant le jury composé de : \n\nEdmond Dounias\, DR IRD – Rapporteur – Centre d’Écologie Fonctionnelle et Évolutive\nAdeline Barnaud\, DR IRD –  Rapportrice – Diversité\, Adaptation\, Développement des Plantes\nMarie Jacqué\, MC AMU – Rapportrice – Laboratoire Population Environnement Développement\nEmma Rochelle-Newall\, DR IRD – Institut d’Écologie et des sciences de l’environnement\nWadi Badri\, PR U Hassan II – Département de Biologie de la Faculté des Sciences Ben M’sik\nMatthieu Salpeteur\, CR IRD – Patrimoines locaux\, Environnement et Globalisation\nAnne Bousquet-Mélou\, PR AMU – Tutrice universitaire – Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Écologie marine et continentale\n\nRésumé des travaux: \nRépondre de façon pertinente à la crise environnementale et sociale actuelle nécessite des recherches innovantes transcendant les frontières disciplinaires\, géographiques et épistémologiques. La science de la durabilité apparaît comme un nouveau domaine de recherche académique pour répondre aux défis socio-écologiques croissants\, de l’échelle locale à l’échelle mondiale. Les systèmes de savoirs autochtones et locaux\, objets d’étude de prédilection du champ de recherche interdisciplinaire qu’est l’ethnoécologie\, sont aujourd’hui considérés essentiels pour formuler et implémenter des changements transformateurs vers des sociétés durables. Cependant\, les peuples autochtones et les communautés locales continuent d’être marginalisés dans les sphères académique et politique. Cet HDR examine les caractéristiques des systèmes de savoirs autochtones et locaux qui les rendent exemplaires en matière d’atténuation de la dégradation environnementale et d’adaptation aux changements globaux. Une analyse de la diversité de ces systèmes à diverses échelles sociales\, temporelles et spatiales permet d’en appréhender les dynamiques et l’évolution à court et à long terme. Cette compréhension soutient une mobilisation réussie de ces savoirs pour des projets de développement durable. S’appuyant sur le cadre conceptuel des contributions réciproques entre l’homme et la nature et sur des données empiriques\, des boucles de rétroaction positives pour le bien-être humain et écosystémique sont identifiées à travers quelques études de cas. De l’Europe à l’Afrique du Nord et à l’Amérique latine\, ces exemples illustrent des processus conduisant aux pratiques de soins et leurs impacts écologiques. Cet HDR identifie donc aussi les défis théoriques et méthodologiques ainsi que les opportunités de co-construction de recherches transdisciplinaires avec les détenteurs des savoirs autochtones et locaux et propose des nouvelles approches pour articuler l’ethnobiologie et les sciences de la durabilité par la recherche et l’enseignement.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/hdr-direne-teixidor-toneu-ethnobiologie-et-science-de-la-durabilite-contributions-reciproques-entre-societe-et-nature-comme-leviers-de-changements-transformateurs/
LOCATION:Amphithéatre Charve\, Campus St Charles\, 3 place Victor Hugo\, Marseille Cedex 3\, 13001\, France
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SUMMARY:Soutenance HDR de Arne Saatkamp "Plant communities in temporally variable environments and seed functional ecology"
DESCRIPTION:Monsieur Arne Saatkamp\, équipe POpulations\, Paysages\, Communautés & cOnservation\, soutiendra son Habilitation à Diriger les Recherches\, le mercredi 19 novembre 2025 à partir de 14h dans la salle 7 sur le Campus de St Jérôme. \nDevant le jury composé de : \n\nElena Kazakou\, professeure à l’Institut Agro Montpellier\, CEFE UMR5127\, rapportrice\nFabien Atnhelme\, Directeur de Recherche à l’IRD\, rapporteur\nFrançois Munoz\, Professeur à l’ Université Lyon 1\, rapporteur\nAlex Baumel\, enseignant-chercheur à Aix-Marseille Université\, examinateur\nEvelyne Franquet\, professeure à Aix-Marseille Université\, présidente du jury\n\n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/soutenance-hdr-de-arne-saatkamp-plant-communities-in-temporally-variable-environments-and-seed-functional-ecology/
LOCATION:Salle 7\, Campus Saint-Jérôme\, 52 avenue Escadrille Normandie Niemen\, Marseille
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SUMMARY:École internationale de terrain sur les espèces exotiques portuaires – Tunisie\, 15-21 novembre 2025
DESCRIPTION:L’école internationale de terrain sur les espèces exotiques portuaires se tiendra du 15 au 21 novembre 2025 en Tunisie\, conjointement organisée par le programme Amidex Interdisciplinarité POMMAR (coordination : C. Lejeusne) et l’Institut National Agronomique de Tunisie (INAT). \nCet événement rassemble des experts de divers groupes taxonomiques qui donneront des conférences et animeront des activités pratiques en laboratoire. L’objectif est de former les participants à l’identification des espèces les plus courantes du biofouling (salissures biologiques) dans les marinas\, avec un accent particulier sur les espèces non indigènes (exotiques). \nCette école offre une occasion unique d’acquérir des compétences pratiques et d’échanger avec des spécialistes internationaux sur la gestion et la surveillance des espèces exotiques marines.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/ecole-internationale-de-terrain-sur-les-especes-exotiques-portuaires-tunisie-15-21-novembre-2025/
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SUMMARY:Webinaire de la Société Botanique de France : Le Genévrier thurifère\, héros des Atlas marocains et bien au-delà...
DESCRIPTION:Pour le Webinaire de Novembre\, la SBF accueille Thierry Gauquelin\, professeur émérite à Aix-Marseille Université\, qui présentera le fascinant Genévrier thurifère. \nRejoignez nous en direct dès 12h30 sur ce lien.Et si vous ne pouvez pas être présent\, pas de souci : le webinaire sera enregistré et disponible quelques semaines plus tard sur la chaîne YouTube de la SBF\, dans la playlist “Webinaires”. \nRÉSUMÉ : \nLe Genévrier thurifère (Juniperus thurifera L.)\, dont un vieux représentant âgé de 500 ans est le héros du roman « De mémoire d’arbre » est l’espèce emblématique des Atlas marocains. Il symbolise la difficile réalité de ces forêts de haute montagne soumises à un climat extrême… et à la dent du bétail et la hache du berger. \nC’est aussi un bel exemple d’espèce partagée. \nPartagée d’abord entre le Sud et le Nord de la Méditerranée\, avec certes des exigences de gestion et de préservation différentes\, mais toujours en intégrant les contraintes anthropiques et climatiques qu’elle subit dans toute son aire de répartition. \nPartagée ensuite entre tous ses utilisateurs\, gestionnaires et protecteurs\, animés par une même fascination pour cet arbre original fortement implanté dans les cultures locales. \nPartagée enfin entre tous les scientifiques qui y voient un modèle pour analyser et comprendre comment une espèce donnée peut se différencier\, s’étendre\, fonctionner et résister dans des environnements fortement contraints et changeants.
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SUMMARY:Loïc Damelet "La photographie en archéologie"
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Loïc Damelet\, photographe spécialisé en archéologie (Centre Camille Jullian – CNRS-UMR 7299)\, nous propose une conférence intitulée “ La photographie en archéologie“ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct. \nRésumé de la conférence : \nDe sites archéologiques aux salles des musées\, le travail du photographe en archéologie s’inscrit dans une diversité d’actions souvent méconnue. À la fois témoin\, technicien et passeur d’histoire\, il intervient à chaque étape de la recherche : documentation minutieuse des fouilles\, réalisation de clichés destinés aux catalogues scientifiques\, valorisation des objets pour les expositions\, et aujourd’hui modélisation 3D permettant de restituer sites et artefacts en volume.\nEntre rigueur scientifique et sens artistique\, son regard accompagne l’archéologie dans son évolution\, transformant l’image en véritable outil de compréhension\, de conservation et de partage du patrimoine.
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SUMMARY:Mauvais souvenirs militaires dans les espaces naturels. Comment dépolluer et renaturer ?
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Thierry Dutoit\, Ecologue\, Directeur de recherches CNRS à l’IMBE et Emma Leone\, doctorante en écologie à l’IMBE\, nous proposent une conférence intitulée “ Mauvais souvenirs militaires dans les espaces naturels. Comment dépolluer et renaturer ? “ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct. \nRésumé de la conférence : \nLa contamination des écosystèmes par des substances persistantes issus des munitions militaires est un phénomène très préoccupant notamment suite à l’extension des zones de conflits à travers le monde mais aussi\, dans les zones d’anciens conflits ou possédant des sites d’entraînement militaire\, de fabrication ou de destruction des munitions. C’est notamment le cas de la plaine de Crau dans les Bouches-du-Rhône\, un espace naturel remarquable aujourd’hui protégé mais qui présente de nombreux impacts d’activités militaires depuis la fin du 19e siècle. Des solutions fondées sur la nature pourraient-elles alors aider à dépolluer et renaturer cet écosystème tout en limitant les impacts sur sa flore et sa faune exceptionnelles ?
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/mauvais-souvenirs-militaires-dans-les-espaces-naturels-comment-depolluer-et-renaturer/
LOCATION:Station Marine d’Endoume\, Rue de la Batterie des Lions Salle de conférence Batiment IV\, Marseille\, 13007\, France
CATEGORIES:Les Mercredis d'Endoume
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