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SUMMARY:Marie-Noelle ROSSO : Les champignons de nos forêts comme sources d'inspiration pour les technologies - En présentiel à la Station Marine d'Endoume ou en distanciel
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Marie-Noelle ROSSO\, directrice de recherche à l’INRAE\, directrice de l’Unité Biodiversité et Biotechnologie Fongiques (Aix-Marseille Université – INRAE)\, nous propose une conférence intitulée “Les champignons de nos forêts comme sources d’inspiration pour les technologies” en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou sur en direct.\n \nRésumé de la conférence  \nNés dans les océans il y a peut-être 2\,4 milliards d’années\, les champignons ont accompagné les premières plantes dans leur colonisation de l’environnement terrestre. Aujourd’hui\, les champignons de nos forêts peuvent être parasites\, partenaires symbiotiques ou recycleurs. Les recycleurs possèdent l’extraordinaire capacité de dégrader des composants très récalcitrants\, tels que le bois\, pour en extraire les sucres dont ils se nourrissent. Les recherches actuelles tentent de s’inspirer des champignons pour produire des molécules à base de carbone renouvelable\, en alternative au carbone fossile\, sans impact sur les usages du sol à vocation de productions alimentaires ni la préservation des espaces naturels
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SUMMARY:Thèse de Hugo Fontes "Quelle utilisation du concept d’écosystème de référence pour évaluer le succès de création de mares temporaires en Camargue ?"
DESCRIPTION:Monsieur Hugo Fontes\,  doctorant à l’UMR IMBE\, équipe EECAR\, IUT d’Avignon et à la Tour du Valat\, Institut de recherche pour la conservation des zones humides méditerranéennes\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le lundi 24 février 2025\, à 14h à la Tour du Valat\, Le Sambuc\, Arles – Pour assister à la soutenance en distanciel (code secret de réunion 049097)\n \n  \nDevant le jury composé de : \n\nLaila Rhazi\, Professeure\, Université Hassan II Mohammedia\, Casablanca\, Maroc\, rapporteure\nAna Rodrigues\, Directrice de recherches CNRS\, UMR CEFE\, Montpellier\, rapporteure\nRenaud Jaunatre\, Chargé de recherches INRAE\, UMR LESSEM\, Grenoble\, examinateur\nElise Buisson\, Maîtresse de conférences HDR\, Avignon Université\, UMR IMBE\, examinatrice\nThierry Dutoit\, Directeur de recherches CNRS\, UMR IMBE\, Avignon\, co-directeur\nFrançois Mesléard\, Professeur\, Avignon Université\, UMR IMBE et Tour du Valat\, co-directeur\nPatrick Grillas\, Directeur de recherches\, Tour du Valat\, co-encadrant\n\nRésumé des travaux : \nFace à la dégradation des espaces naturels et la perte de biodiversité\, la restauration écologique est considérée comme un des outils majeurs de la conservation biologique. Cette discipline récente\, fait encore l’objet de controverses en particulier concernant le concept d’« écosystème de référence » considérée comme trop fixiste. Il est cependant aujourd’hui communément admis que la définition d’un écosystème de référence consiste non pas à figer une représentation d’un écosystème « idéal » passé\, mais à explorer ses variations tant historiques qu’actuelles. Malgré ces avancées conceptuelles\, des lacunes méthodologiques sont encore à combler afin de mieux prendre en compte la variabilité des écosystèmes de référence dans l’évaluation du succès d’opérations de restauration écologiques. Pour répondre à ce besoin\, nous avons choisi comme cas d’étude les mares temporaires méditerranéennes de Camargue\, un écosystème dont les conditions environnementales et les communautés végétales sont particulièrement variables\, notamment en raison de l’intermittence des phases aquatiques et sèches. Malgré leurs enjeux de conservation\, les mares temporaires méditerranéennes ont connu et connaissent encore de forts impacts anthropiques. En réponse\, des opérations de restauration et de création ont été réalisées et nécessitent maintenant d’être évaluées. Dans un premier temps\, nous avons développé un indicateur\, le «Distance to References Communities Index» (DRCI) qui permet de comparer un site ou une communauté en cours de restauration avec un panel de sites ou de communautés de référence. Cette méthode considère que chaque situation de référence est un objectif potentiel\, contrairement aux méthodes couramment utilisées qui considèrent une situation moyenne de référence comme objectif optimal. Le DRCI est un indicateur intégratif qui\, focalisé sur les communautés\, utilise un indice de distance ou de similarité. Il est particulièrement adapté aux systèmes écologiques variables comme les mares temporaires. Nous avons ensuite exploré la diversité spatio-temporelle des mares de Camargue\, au travers de toutes les données floristiques anciennes disponibles et des relevés réalisés dans le cadre de cette thèse dans 27 mares de références en avril\, mai\, juin et août 2019 et 2020. Les relevés ont permis de retrouver l’essentiel des espèces connues depuis les années 50\, avec des proportions comparables. Les mares contemporaines peuvent donc être considérées comme des écosystèmes de référence pertinents\, comparables aux mares temporaires inventoriées dans la seconde moitié du 20ème siècle. Néanmoins\, certains changements mineurs dans la végétation des mares peuvent être interprétés comme des dégradations\, avec notamment l’apparition d’espèces exotiques envahissantes et des phénomènes de salinisation peut être liés aux changements climatiques. Enfin\, nous avons comparé la végétation de 25 mares créées aux 19ème\, 20ème et 21ème siècle (inventoriées en avril\, mai\, juin et juillet 2020) avec celle des 27 mares de références. Les communautés végétales (composition et abondance des espèces) des mares créées au 21ème siècle sont bien distinctes des communautés de références\, contrairement aux communautés des mares créées antérieurement. Les communautés en conditions inondées sont plus proches des communautés de références que les communautés de la phase sèche. En particulier\, les\nespèces émergentes protégées et menacées sont généralement absentes des mares créées\, contrairement aux macrophytes submergés. L’intérêt de la création de mares temporaires méditerranéennes est donc important pour les communautés aquatiques\, mais reste limité pour certaines communautés terrestres et amphibies. Le choix du modèle de référence et des variables mesurées peuvent fortement influencer les résultats et les conclusions de l’évaluation. La définition d’un modèle de référence revient à définir les objectifs de projets de restauration et rend donc plus ou moins flexible leur évaluation. \n 
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SUMMARY:Jean Yves Meunier :  Les punaises des lits : Résurgence d’une nuisance millénaire - En présentiel à la Station Marine d'Endoume ou en distanciel
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Jean Yves Meunier\, entomologiste – Écologue IRD à l’IMBE nous propose une conférence intitulée “Les punaises des lits : Résurgence d’une nuisance millénaire” en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou sur en direct.\n \nRésumé de la conférence  \nLes punaises des lits ont fait un retour remarqué depuis quelques temps dans nos sociétés occidentales bien que ces insectes soient connus des hommes de très longue date pour les désagréments importants qu’ils causent. Bien qu’elles ne transmettent pas directement de maladies\, elles sont la cause de nuisances et il est très difficile de s’en débarrasser une fois que le logis est infecté. Un portrait de cette espèce nommée Cimex lectularius sera brossé avec des aspects historiques\, physiologiques\, écologiques ainsi que des méthodes pratiques pour permettre l’élimination de ces insectes en cas de contamination.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/jean-yves-meunier-les-punaises-des-lits-resurgence-dune-nuisance-millenaire-en-presentiel-a-la-station-marine-dendoume-ou-en-distanciel-copy/
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SUMMARY:Thèse de Krieguer Blanche  "Impact des rayonnements ionisants sur les matériaux polymères utilisés pour des applications biopharmaceutiques et biotechnologiques "
DESCRIPTION:Madame Krieguer Blanche \, doctorante à l’UMR IMBE\, équipe Chimiométrie\, Plans d’expériences et Systèmes experts\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le vendredi 7 mars 2025\, à 9h dans la salle des thèses sur le campus de St Jérôme \n  \nDevant le jury composé de : \n\nChristine BRESSY\, Rapporteuse PR\, Université de Toulon\nEmmanuel RICHAUD\, Rapporteur PR\, Arts et Métiers Paris Tech\nSophie ROUIF\, Examinatrice Expert R&D\, Ionisos Group\nBelkacem OTAZAGHINE\, Examinateur MCF\, Ecole des mines d’Alès\nGrégoire DANGER\, Président du jury PR\, Aix-Marseille Université\nSamuel DOREY\, Membre invité\, Principal Scientist\, Sartorius Stedim FMT S.A.S.\n\nRésumé des travaux : \nLes systèmes en plastique à usage unique sont conçus pour les industries biopharmaceutiques afin de stocker\, transporter ou mélanger des solutions biopharmaceutiques. Ces systèmes\, fabriqués à partir de polymères\, sont actuellement stérilisés par rayonnement gamma. Le contexte sanitaire actuel entraîne une croissance de la production de produits destinés à l’industrie pharmaceutique. Des préoccupations émergent quant à la capacité de stérilisation par rayonnement gamma dans les années à venir. L’irradiation par faisceau d’électrons et par rayonnement X sont comparées pour être utilisées en tant que méthodes alternatives à la stérilisation gamma. \nL’objectif de cette thèse est d’examiner l’impact potentiel des irradiations par rayons gamma\, rayons X et faisceau d’électrons sur deux types de films (PE/EVOH/PE et EVA/EVOH/EVA) ainsi que sur des matériaux formulés à partir de polypropylène\, de polyéthylène et de polyamide. \nLes échantillons irradiés ont été analysés à l’aide d’une approche multi-échelle : au niveau moléculaire\, macro-moléculaire et au niveau du matériau. Les résultats montrent que\, quel que soit le polymère\, les trois technologies d’irradiation produisent des effets équivalents : les mêmes types de radicaux sont générés\, il n’y a pas de modification de la structure et de la composition des polymères observés dans les conditions d’analyse. Les variations observées entre les différentes classes de polymères sont principalement dues à la composition des matériaux. \n  \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-krieguer-blanche-impact-des-rayonnements-ionisants-sur-les-materiaux-polymeres-utilises-pour-des-applications-biopharmaceutiques-et-biotechnologiques/
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SUMMARY:Thèse de Karolina Argote "Microarthropod Responses to Habitat Fragmentation: Laboratory Experiments in Artificial Landscapes"
DESCRIPTION:Madame Karolina Argote\, doctorante à l’UMR IMBE\, équipe Populations\, Paysages\, Communautés & conservation\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le mardi 18 mars 2025\, à 14h  dans l’Amphi Marion\, Bâtiment 5\,  Campus St Charles. \n  \nDevant le jury composé de : \n\nMarc CADOTTE\, Rapporteur\, Professeur des universités\, University of Toronto\nPatrick LAVELLE\, Rapporteur\, Professeur émérite\, Université Paris Sorbonne\nStéphanie MANEL\, Examinatrice\, Directrice de recherche HDR\, CEFE Montpellier\nThomas TULLY\, Examinateur\, Maître de conférences\, Sorbonne Université\nVirginie BALDY\, Présidente du jury Professeure des universités\, Aix-Marseille Université\, IMBE\nCécile ALBERT\, Directrice de thèse\, Directrice de recherche HDR\, CNRS\nMathieu SANTONJA\, Co-directeur de thèse\, Maître de conférences\, Aix-Marseille Université\, IMBE\nBenoît GESLIN\, Co-directeur de thèse\, Maître de conférences HDR\, Université de Rennes\, ECOBIO\n\nRésumé des travaux : \nCette thèse de doctorat étudie comment la fragmentation de l’habitat influence la persistance des populations d’un collembole\, Folsomia candida\, à travers une approche expérimentale utilisant des mini-paysages artificiels suivis en laboratoire. \nDans un premier temps\, nous analysons comment la qualité des ressources et la distance entre tâches d’habitat influencent le comportement de recherche de nourriture et la démographie de F. candida\, posant les bases de la compréhension des dynamiques de population à l’échelle du paysage. Ensuite\, nous examinons comment différentes configurations d’habitat et qualités de la matrice affectent la survie et les déplacements des collemboles. Les résultats montrent que la quantité d’habitat accessible\, comprenant la distance entre les habitats et la résistance de la matrice\, est un bon prédicteur de la taille de la population et du risque d’extinction. La survie lors des mouvements à travers la matrice s’est révélée être un mécanisme clé\, influençant les taux de colonisation et la stabilité démographique tout en limitant l’accès aux patches distants. \nNous évaluons ensuite l’efficacité des éléments de connectivité\, tels que les corridors et les pas-japonais (« stepping stones »)\, pour promouvoir la dispersion et la persistance des populations dans des matrices à forte rugosité. Nous avons constaté que les matrices hostiles amplifiaient les risques liés à la dispersion\, créant un compromis entre colonisation et taille de population. Même si la connectivité a globalement facilité la colonisation et augmenté la reproduction dans les nouveaux patches\, son efficacité dépendait de la distance entre patches. En particulier\, l’augmentation de la dispersion a aussi entrainé une mortalité plus élevée\, conduisant à des populations globalement plus petites dans les paysages connectés que dans les paysages non connectés. \nDans l’ensemble\, ma thèse met en évidence la nécessité d’intégrer explicitement la résistance de la matrice paysagère dans les stratégies de conservation et les effets des éléments paysagers sur les dynamiques des populations. En quantifiant expérimentalement les effets combinés de la résistance de la matrice et de la configuration de l’habitat\, ce travail insiste sur l’importance d’intégrer ces facteurs dans les modèles de connectivité et la planification de la conservation\, offrant des solutions pratiques pour gérer et aménager les paysages fragmentés et restaurer les connectivités écologiques. \nMots clés : configuration de l’habitat\, résistance de la matrice\, accessibilité de l’habitat\, Folsomia candida\, fragmentation\, connectivité. \n 
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SUMMARY:Clémentine Mutillod : "De la France à la Mongolie\, retour du cheval de Przewalski et ses effets sur la steppe"
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Clémentine Mutillod\, Attachée Temporaire d’Enseignement et de Recherche Avignon Université à l’IMBE nous propose une conférence intitulée “De la France à la Mongolie\, retour du cheval de Przewalski et ses effets sur la steppe“ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct.\n \nRésumé de la conférence : \nDes chevaux de Przewalski – considérés comme les derniers chevaux sauvages au monde – ont été réintroduits en 2004 et 2005 au sein d’une réserve close de 14 000ha dans leur aire originelle\, les steppes d’Asie centrale. A la suite d’un premier suivi de la flore à l’intérieur et à l’extérieur de cette réserve en 2010\, une deuxième campagne de terrain a pu être réalisée en 2023 grâce à Avignon Université\, la Société Française d’Écologie et d’Évolution\, l’association Khomyn Talyn Takhi et l’Association Takh. Retour sur les deux mois passés dans la steppe\, entre relevés scientifiques\, découvertes naturalistes et culturelles.
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SUMMARY:CONFÉRENCE "Midisciences" - ROMANE BLAYA : Les fourmis : d’un maillon essentiel des écosystèmes aux invasions biologiques
DESCRIPTION:Romane Blaya (UMR IMBE\, équipe EECAR) docteure en écologie étudie les communautés de fourmis\, leurs rôles et leurs impacts dans les écosystèmes du bassin méditerranéen.\nLes fourmis jouent un rôle important dans le fonctionnement des écosystèmes. Elles pourraient être utiles pour mieux comprendre et suivre les modifications qu’ils subissent. Toutefois\, face à l’augmentation des introductions d’espèces de fourmis exotiques en Europe\, il est important de comprendre les raisons de leur succès\, identifier leurs principales routes d’introduction et améliorer les outils législatifs pour éviter ou réduire leurs impacts. \n[Midisciences 2025] Découvrez la programmation complète – sur www Avignon Université
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/conference-midisciences-de-romane-blaya-les-fourmis-dun-maillon-essentiel-des-ecosystemes-aux-invasions-biologiques/
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SUMMARY:Thèse d'Emile Melloul "Effets de l’irrigation sur la biodiversité dans les écosystèmes viticoles méditerranéens"
DESCRIPTION:Monsieur Emile Melloul\, doctorant à l’UMR IMBE\, équipe Ecologie\, Ecotoxicologie & Chimie appliquées à l’Agroécologie et à la Restauration\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le lundi 7 avril 2025\, à 13h30 Amphithéatre IUT Avignon. \nDevant le jury composé de : \nM. Mickaël Hedde\, Directeur de recherche\, INRAE\, Eco&Sols\, Montpellier\, Rapporteur \nM. Sébastien Barot\, Directeur de Recherche\, IRD\, IEES Paris\, Rapporteur \nMme Appoline Auclerc\, Maître de conférences\, Université de Lorraine\, ENSAIA\, Vandœuvre-lès-Nancy\, Examinatrice \nMme Estelle Forey\, Professeure\, Université de Rouen Normandie\, ECODIV\, Mont Saint-Aignan\, Examinatrice \nM. Armin Bischoff\, Professeur\, Avignon Université\, IMBE\, Avignon\, Directeur de thèse \nM. Olivier Blight\, Maître de Conférences\, Avignon Université\, IMBE\, Avignon\, Co-directeur de thèse \nM. Raphaël Gros\, Professeur\, Aix-Marseille Université\, IMBE\, Marseille\, Co-directeur de thèse \nRésumé des travaux : \nL’irrigation est une pratique courante en agriculture\, permettant notamment d’améliorer les rendements agricoles. C’est également l’une des principales réponses des agriculteurs aux changements climatiques\, qui devraient entraîner une modification des régimes de précipitations et une augmentation des températures. Ces changements seront particulièrement prononcés dans la région méditerranéenne\, où des températures plus élevées\, ainsi que des sécheresses plus fréquentes et plus intenses\, sont attendues. \nDans les vignobles\, l’irrigation est en plein essor. Elle est utilisée pour stabiliser la production et réguler le taux de sucre dans le vin. Son utilisation se fait principalement par goutte-à-goutte durant les périodes de sécheresse\, afin de simuler les effets des orages d’été. Bien que bénéfique pour la production dans un contexte de stress hydrique\, l’augmentation de l’humidité pourrait affecter la biodiversité de l’agroécosystème en modifiant sa composition\, sa structure et ses réseaux d’interactions. Cela pourrait affecter des fonctions écologiques clés\, et se répercuter sur les cultures. Il est donc primordial de mieux comprendre les effets et processus liés à l’irrigation\, qui devient de plus en plus fréquente et intense. \nC’est dans ce contexte que s’inscrivent mes travaux de thèse\, qui visent à mieux comprendre les effets de l’irrigation sur la biodiversité dans les agroécosystèmes viticoles méditerranéens. Cette réflexion a conduit à trois grandes questions de recherche : (1) Quels effets l’irrigation a-t-elle sur la végétation et les arthropodes épigés dans les inter-rangs de vigne ? (2) Quels effets l’irrigation a-t-elle sur la végétation et les organismes du sol à court et moyen terme sous le rang de vigne ? (3) Comment les effets de l’irrigation évoluent-ils à court terme pendant la période estivale ? \nDans le premier axe (1)\, nous avons montré une réduction du recouvrement floral dans les vignobles irrigués\, sans toutefois observer de différence en termes de richesse spécifique. L’abondance de plusieurs arthropodes bénéfiques a été directement affectée par l’irrigation. Ces effets directs étaient amplifiés par l’impact négatif de l’irrigation sur le recouvrement floral. Les taux de prédation étaient également plus faibles dans les vignobles irrigués\, mais seulement pendant la journée. Dans le second axe (2)\, aucun effet clair de l’irrigation n’a été observé sur la végétation sous le rang de vigne. En revanche\, une augmentation de la faune du sol a été notée pendant la période estivale\, au moment de l’irrigation\, avec une hausse des populations d’acariens prédateurs et une modification de la structure des communautés d’acariens et de collemboles. L’irrigation semble atténuer les effets de la sécheresse\, qui affectent négativement les collemboles et acariens. Les collemboles\, plus sensibles à la sécheresse\, étaient absents des relevés effectués en août. Dans le troisième axe (3)\, l’apport d’eau dans les vignes pendant la période de sécheresse a montré un effet de “priming” sur les bactéries\, sans toutefois modifier la composition de la communauté microbienne. De plus\, nous avons observé une augmentation des abondances de collemboles et d’acariens\, ainsi qu’une hausse de l’activité biologique du sol. Les organismes plus résistants à la sécheresse n’ont pas été affectés par l’irrigation. Les effets de l’irrigation ont disparu après seulement quelques jours. Toutefois\, à long terme\, un appauvrissement potentiel en matière organique du sol\, dû à des pics d’activité lors des cycles de réhumidification\, pourrait s’observer. \nL’ensemble de ces résultats souligne l’importance d’étudier les effets de l’irrigation et leur temporalité\, dans un contexte où son utilisation tend à devenir la norme. Cette thèse ouvre de nouvelles perspectives sur les effets potentiels de l’irrigation\, notamment au niveau des traits fonctionnels des organismes et de la composition spécifique des communautés. \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-demile-melloul-effets-de-lirrigation-sur-la-biodiversite-dans-les-ecosystemes-viticoles-mediterraneens/
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SUMMARY:Edouard Bard "La dernière déglaciation et ses implications pour l’étude de la Grotte Cosquer et des anneaux de coralligène du Cap Corse"
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Edouard Bard\, Professeur au Collège de France\, membre de l’Académie des sciences\, chercheur au CEREGE\, nous propose une conférence intitulée “La dernière déglaciation et ses implications pour l’étude de la Grotte Cosquer et des anneaux de coralligène du Cap Corse“ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct.\n \nRésumé de la conférence : \nLa dernière transition entre une période glaciaire et une période interglaciaire s’est déroulée de 21.000 à 8000 ans avant le présent. Cette phase climatique tourmentée est caractérisée par des variations rapides et de grande ampleur des températures et des niveaux marins. Ces bouleversements paléoclimatiques à l’échelle mondiale ont eu des répercussions majeures sur les environnements et les écosystèmes de sites emblématiques de Méditerranée comme ceux des Calanques de Marseille autour de la Grotte Cosquer ou des anneaux de coralligène au large du Cap Corse (expédition Gombessa-6 conduite par Laurent Ballesta). Cette présentation sera illustrée avec les résultats nombreux et variés obtenus au CEREGE d’Aix-en-Provence.
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SUMMARY:Une école d’été pour reconnaître la Méditerranée comme sujet de droit
DESCRIPTION:Face à la dégradation alarmante de la biodiversité marine\, une école d’été inédite se tiendra au premier semestre 2025\, avant la conférence UNOC3 à Nice. Portée par le projet interdisciplinaire MerMéd\, cette initiative vise à sensibiliser étudiants et professionnels à la reconnaissance de la Méditerranée comme une entité naturelle sujet de droit. Malgré de nombreux textes juridiques existants\, la mer reste insuffisamment protégée\, fragmentée par des lois nationales incohérentes. L’objectif : construire un consensus méditerranéen et promouvoir une approche unifiée\, écologique et juridique. Des enseignants\, chercheurs\, praticiens et artistes animeront les sessions\, mêlant droit et création. L’école accueillera principalement des étudiants de Master d’AMU et de Toulon\, mais aussi du Maghreb. Une démarche innovante pour un changement de regard essentiel. \nPour plus d’informations : sarah.thomas@univ-amu.fr; victor.david@ird.fr
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/une-ecole-dete-pour-reconnaitre-la-mediterranee-comme-sujet-de-droit/
LOCATION:Aix Marseille Université\, 63 La Canebière\, Marseille\, 13001
CATEGORIES:Ecole d'été
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SUMMARY:Conférence de Victor David : Et si la Méditerranée avait des droits ?
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Victor David\, chercheur IRD à l’IMBE\, nous propose une conférence intitulée “Et si la Méditerranée avait des droits ?“ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct. \nRésumé de la conférence : \nMerMéd est un Voluntary Commitment (engagement volontaire) pris par l’IRD en juin 2022 auprès de la Conférence des Nations-Unies sur les Océans (UNOC) consistant à réaliser une étude de faisabilité de la reconnaissance de la mer Méditerranée comme entité naturelle juridique (ENJ). À la veille de la 3ème Conférence des NU sur les Océans en juin 2025 à Nice\, cette conférence reviendra sur les travaux de recherche et réflexions menés pour explorer\, à partir du constat de l’ineffectivité en bonne partie des règles juridiques existantes et en s’appuyant sur le concept de droits de la Nature\, la piste d’une Méditerranée ENJ dotée de droits propres et avec une gouvernance unifiée respectueuse de son unité et des solidarités écologiques qu’elle abrite.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/et-si-la-mediterranee-avait-des-droits/
LOCATION:Station Marine d’Endoume\, Rue de la Batterie des Lions Salle de conférence Batiment IV\, Marseille\, 13007\, France
CATEGORIES:Les Mercredis d'Endoume
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SUMMARY:Plongez dans le projet ATLASea : interviews en direct du 19 au 26 juin
DESCRIPTION:Du 16 au 26 juin\, la Station Marine d’Endoume accueille les équipes du projet ATLASea\, un ambitieux programme européen dédié à percer les secrets de la biodiversité marine. \nL’objectif ? Séquencer le génome de 4 500 espèces marines\, en métropole et dans les territoires ultramarins\, pour mieux comprendre\, protéger et étudier le vivant sous toutes ses formes. \nVivez cette aventure de l’intérieur grâce à trois interviews en direct sur IMBETV\, où vous pourrez poser toutes vos questions aux chercheuses et chercheurs : \n\nJeudi 19 juin à partir de 18h30\nLundi 23 juin à partir de 18h30\nJeudi 26 juin à partir de 18h30\n\nSuivez les échanges en direct sur notre chaîne. \nNe manquez pas cette occasion unique de plonger au cœur de la recherche marine et d’échanger avec les experts !
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/plongez-dans-le-projet-atlasea-interviews-en-direct-du-19-au-26-juin/
LOCATION:Station Marine d’Endoume\, Rue de la Batterie des Lions Salle de conférence Batiment IV\, Marseille\, 13007\, France
CATEGORIES:Événement
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SUMMARY:Thèse de Sabrina Cesarin de Oliveira “Ecosystem services provided by arthropods in forest fragments adjacent to cultivated areas”
DESCRIPTION:  \nMadame Sabrina Cesarin de Oliveira \, doctorante à l’IMBE\, équipe Ecologie\, Ecotoxicologie & Chimie appliquées à l’Agroécologie et à la Restauration\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le jeudi 4 septembre 2025\, à 13h à l’Université Estadual Paulista (Brésil). Pour suivre la soutenance en distanciel. \nDevant le jury composé de : \nMme Alessandra Marieli Vacari\, Professeure\, University of Franca\, Franca – SP\, Rapporteure \nPedro Henrique Brum Togni\, Professeur\, University of Brasilia\, Brasília – DF\, Rapporteur \nPierre Franck\, Chargé de recherche\, INRAE\, Plantes et Systèmes de culture Horticoles\, Avignon\, Examinateur \nArmin Bischoff\, Professeur à l’UMR IMBE\, Avignon – Directeur de thèse \nM. Odair Aparecido Fernandes\, Professeur à l’UNESP\, Brésil – Directeur de thèse \n  \nRésumé des travaux : \nLes fragments de forêt intégrés dans les paysages agricoles jouent un rôle fondamental dans le maintien de la biodiversité des insectes et dans la fourniture de services écosystémiques associés. Cette thèse vise à analyser de quelle manière les caractéristiques de la végétation et la composition du paysage influencent les communautés d’insectes et leurs rôles fonctionnels\, dans des contextes agricoles tropicaux et tempérés\, en portant une attention particulière à la régulation des ravageurs\, à la pollinisation et à la stabilité des interactions écologiques. Les travaux ont été menés dans deux régions contrastées: des parcelles de canne à sucre adjacents à des fragments de forêt atlantique au sud-est du Brésil\, et des vignobles situés dans le sud-est de la France. En intégrant des études dans des contextes environnementaux et agricoles différents\, cette thèse apporte une compréhension approfondie sur la contribution des habitats semi-naturels à la conservation de la biodiversité et au fonctionnement des agroécosystèmes. La première partie s’intéresse à la relation entre la diversité des arbres rencontrés dans des fragments de forêt et la diversité ainsi que l’abondance des groupes fonctionnels des insectes au sein des forêts mais aussi dans des parcelles agricoles adjacentes. Les données\, récoltées pendant deux ans\, montrent que la richesse spécifique d’arbres est positivement corrélée à la diversité d’insectes et à une fréquence accrue de groupes fonctionnels clés tels que les prédateurs et les phytophages. Des corrélations positives entre la diversité des insectes dans les forêts et dans les parcelles agricoles suggèrent un spillover à partir des forêts\, mettant en évidence le rôle des fragments de forêt comme sources de biodiversité et fournisseurs potentiels de services écosystémiques. La deuxième partie porte sur l’ordre des Hyménoptères\, un groupe présentant une diversité taxonomique et fonctionnelle remarquable\, incluant des parasitoïdes\, des prédateurs et des pollinisateurs. L’analyse de la variation saisonnière de leur abondance et de la composition des communautés révèle des dynamiques temporelles différenciées selon les habitats. Les fragments de forêt montrent des communautés plus stables au fil du temps\, tandis que les parcelles de canne à sucre présentent des fluctuations plus marquées\, probablement liées aux pratiques agricoles et aux variations microclimatiques plus importantes. Les réponses des groupes fonctionnels varient selon les saisons et les habitats\, soulignant le rôle des fragments forestiers en tant que refuges atténuant l’instabilité écologique dans les paysages cultivés. Dans la troisième partie\, l’analyse est élargie à une région méditerranéenne\, à travers l’étude des communautés d’insectes et des taux de prédation dans les vignobles et les boisements adjacents. L’influence de différentes caractéristiques de la végétation\, telles que la recouvrement en fleurs\, le recouvrement  herbacé et la richesse spécifique végétale\, est évaluée. Les résultats montrent que les ressources florales et la diversité végétale sont des facteurs clés qui conduisent l’abondance des insectes auxiliaires\, notamment en bordure de vigne\, où l’effet de spillover depuis le milieu forestier est le plus marqué. La mise en place  de proies sentinelles révèle des taux de prédation plus élevés dans les forêts\, avec des effets positifs s’étendant vers les parcelles viticoles\, suggérant une contribution des habitats semi-naturels à la lutte biologique. Dans l’ensemble\, cette thèse met en évidence l’importance de la qualité de la végétation et de la configuration spatiale du paysage dans la structuration des communautés d’insectes et la fourniture de services écosystémiques. Les fragments de forêt renforcent la biodiversité et favorisent les interactions écologiques au-delà de leurs limites\, bien que ces effets restent spatialement limités et modulés par la structure des habitats et les pratiques culturales. En intégrant des approches fonctionnelles et comparatives entre régions\, ce travail souligne la nécessité des stratégies de conservation et de restauration visant à préserver la qualité des habitats et la connectivité fonctionnelle dans les paysages agricoles. Les résultats obtenus fournissent des pistes concrètes pour la conception de systèmes agricoles durables conciliant production et conservation de la biodiversité \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-sabrina-cesarin-de-oliveira-ecosystem-services-provided-by-arthropods-in-forest-fragments-adjacent-to-cultivated-areas/
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SUMMARY:Mauvais souvenirs militaires dans les espaces naturels. Comment dépolluer et renaturer ?
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Thierry Dutoit\, Ecologue\, Directeur de recherches CNRS à l’IMBE et Emma Leone\, doctorante en écologie à l’IMBE\, nous proposent une conférence intitulée “ Mauvais souvenirs militaires dans les espaces naturels. Comment dépolluer et renaturer ? “ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct. \nRésumé de la conférence : \nLa contamination des écosystèmes par des substances persistantes issus des munitions militaires est un phénomène très préoccupant notamment suite à l’extension des zones de conflits à travers le monde mais aussi\, dans les zones d’anciens conflits ou possédant des sites d’entraînement militaire\, de fabrication ou de destruction des munitions. C’est notamment le cas de la plaine de Crau dans les Bouches-du-Rhône\, un espace naturel remarquable aujourd’hui protégé mais qui présente de nombreux impacts d’activités militaires depuis la fin du 19e siècle. Des solutions fondées sur la nature pourraient-elles alors aider à dépolluer et renaturer cet écosystème tout en limitant les impacts sur sa flore et sa faune exceptionnelles ?
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/mauvais-souvenirs-militaires-dans-les-espaces-naturels-comment-depolluer-et-renaturer/
LOCATION:Station Marine d’Endoume\, Rue de la Batterie des Lions Salle de conférence Batiment IV\, Marseille\, 13007\, France
CATEGORIES:Les Mercredis d'Endoume
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SUMMARY:Loïc Damelet "La photographie en archéologie"
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Loïc Damelet\, photographe spécialisé en archéologie (Centre Camille Jullian – CNRS-UMR 7299)\, nous propose une conférence intitulée “ La photographie en archéologie“ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct. \nRésumé de la conférence : \nDe sites archéologiques aux salles des musées\, le travail du photographe en archéologie s’inscrit dans une diversité d’actions souvent méconnue. À la fois témoin\, technicien et passeur d’histoire\, il intervient à chaque étape de la recherche : documentation minutieuse des fouilles\, réalisation de clichés destinés aux catalogues scientifiques\, valorisation des objets pour les expositions\, et aujourd’hui modélisation 3D permettant de restituer sites et artefacts en volume.\nEntre rigueur scientifique et sens artistique\, son regard accompagne l’archéologie dans son évolution\, transformant l’image en véritable outil de compréhension\, de conservation et de partage du patrimoine.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/la-photographie-en-archeologie/
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SUMMARY:Webinaire de la Société Botanique de France : Le Genévrier thurifère\, héros des Atlas marocains et bien au-delà...
DESCRIPTION:Pour le Webinaire de Novembre\, la SBF accueille Thierry Gauquelin\, professeur émérite à Aix-Marseille Université\, qui présentera le fascinant Genévrier thurifère. \nRejoignez nous en direct dès 12h30 sur ce lien.Et si vous ne pouvez pas être présent\, pas de souci : le webinaire sera enregistré et disponible quelques semaines plus tard sur la chaîne YouTube de la SBF\, dans la playlist “Webinaires”. \nRÉSUMÉ : \nLe Genévrier thurifère (Juniperus thurifera L.)\, dont un vieux représentant âgé de 500 ans est le héros du roman « De mémoire d’arbre » est l’espèce emblématique des Atlas marocains. Il symbolise la difficile réalité de ces forêts de haute montagne soumises à un climat extrême… et à la dent du bétail et la hache du berger. \nC’est aussi un bel exemple d’espèce partagée. \nPartagée d’abord entre le Sud et le Nord de la Méditerranée\, avec certes des exigences de gestion et de préservation différentes\, mais toujours en intégrant les contraintes anthropiques et climatiques qu’elle subit dans toute son aire de répartition. \nPartagée ensuite entre tous ses utilisateurs\, gestionnaires et protecteurs\, animés par une même fascination pour cet arbre original fortement implanté dans les cultures locales. \nPartagée enfin entre tous les scientifiques qui y voient un modèle pour analyser et comprendre comment une espèce donnée peut se différencier\, s’étendre\, fonctionner et résister dans des environnements fortement contraints et changeants.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/webinaire-de-la-societe-botanique-de-france-le-genevrier-thurifere-heros-des-atlas-marocains-et-bien-au-dela/
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SUMMARY:École internationale de terrain sur les espèces exotiques portuaires – Tunisie\, 15-21 novembre 2025
DESCRIPTION:L’école internationale de terrain sur les espèces exotiques portuaires se tiendra du 15 au 21 novembre 2025 en Tunisie\, conjointement organisée par le programme Amidex Interdisciplinarité POMMAR (coordination : C. Lejeusne) et l’Institut National Agronomique de Tunisie (INAT). \nCet événement rassemble des experts de divers groupes taxonomiques qui donneront des conférences et animeront des activités pratiques en laboratoire. L’objectif est de former les participants à l’identification des espèces les plus courantes du biofouling (salissures biologiques) dans les marinas\, avec un accent particulier sur les espèces non indigènes (exotiques). \nCette école offre une occasion unique d’acquérir des compétences pratiques et d’échanger avec des spécialistes internationaux sur la gestion et la surveillance des espèces exotiques marines.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/ecole-internationale-de-terrain-sur-les-especes-exotiques-portuaires-tunisie-15-21-novembre-2025/
LOCATION:Tunisie
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SUMMARY:Soutenance HDR de Arne Saatkamp "Plant communities in temporally variable environments and seed functional ecology"
DESCRIPTION:Monsieur Arne Saatkamp\, équipe POpulations\, Paysages\, Communautés & cOnservation\, soutiendra son Habilitation à Diriger les Recherches\, le mercredi 19 novembre 2025 à partir de 14h dans la salle 7 sur le Campus de St Jérôme. \nDevant le jury composé de : \n\nElena Kazakou\, professeure à l’Institut Agro Montpellier\, CEFE UMR5127\, rapportrice\nFabien Atnhelme\, Directeur de Recherche à l’IRD\, rapporteur\nFrançois Munoz\, Professeur à l’ Université Lyon 1\, rapporteur\nAlex Baumel\, enseignant-chercheur à Aix-Marseille Université\, examinateur\nEvelyne Franquet\, professeure à Aix-Marseille Université\, présidente du jury\n\n 
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LOCATION:Salle 7\, Campus Saint-Jérôme\, 52 avenue Escadrille Normandie Niemen\, Marseille
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SUMMARY:HDR d'Irene TEIXIDOR TONEU  "Ethnobiologie et science de la durabilité : contributions réciproques entre société et nature comme leviers de changements transformateurs"
DESCRIPTION:Madame TEIXIDOR TONEU Irene\, équipe Écologie fonctionnelle : des systèmes socio-écologiques aux molécules\, soutiendra son Habilitation à Diriger les Recherches\, le mardi 25 novembre 2025 dans l’Amphithéatre Charve sur le Campus de St Charles à partir de 14h. \nDevant le jury composé de : \n\nEdmond Dounias\, DR IRD – Rapporteur – Centre d’Écologie Fonctionnelle et Évolutive\nAdeline Barnaud\, DR IRD –  Rapportrice – Diversité\, Adaptation\, Développement des Plantes\nMarie Jacqué\, MC AMU – Rapportrice – Laboratoire Population Environnement Développement\nEmma Rochelle-Newall\, DR IRD – Institut d’Écologie et des sciences de l’environnement\nWadi Badri\, PR U Hassan II – Département de Biologie de la Faculté des Sciences Ben M’sik\nMatthieu Salpeteur\, CR IRD – Patrimoines locaux\, Environnement et Globalisation\nAnne Bousquet-Mélou\, PR AMU – Tutrice universitaire – Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Écologie marine et continentale\n\nRésumé des travaux: \nRépondre de façon pertinente à la crise environnementale et sociale actuelle nécessite des recherches innovantes transcendant les frontières disciplinaires\, géographiques et épistémologiques. La science de la durabilité apparaît comme un nouveau domaine de recherche académique pour répondre aux défis socio-écologiques croissants\, de l’échelle locale à l’échelle mondiale. Les systèmes de savoirs autochtones et locaux\, objets d’étude de prédilection du champ de recherche interdisciplinaire qu’est l’ethnoécologie\, sont aujourd’hui considérés essentiels pour formuler et implémenter des changements transformateurs vers des sociétés durables. Cependant\, les peuples autochtones et les communautés locales continuent d’être marginalisés dans les sphères académique et politique. Cet HDR examine les caractéristiques des systèmes de savoirs autochtones et locaux qui les rendent exemplaires en matière d’atténuation de la dégradation environnementale et d’adaptation aux changements globaux. Une analyse de la diversité de ces systèmes à diverses échelles sociales\, temporelles et spatiales permet d’en appréhender les dynamiques et l’évolution à court et à long terme. Cette compréhension soutient une mobilisation réussie de ces savoirs pour des projets de développement durable. S’appuyant sur le cadre conceptuel des contributions réciproques entre l’homme et la nature et sur des données empiriques\, des boucles de rétroaction positives pour le bien-être humain et écosystémique sont identifiées à travers quelques études de cas. De l’Europe à l’Afrique du Nord et à l’Amérique latine\, ces exemples illustrent des processus conduisant aux pratiques de soins et leurs impacts écologiques. Cet HDR identifie donc aussi les défis théoriques et méthodologiques ainsi que les opportunités de co-construction de recherches transdisciplinaires avec les détenteurs des savoirs autochtones et locaux et propose des nouvelles approches pour articuler l’ethnobiologie et les sciences de la durabilité par la recherche et l’enseignement.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/hdr-direne-teixidor-toneu-ethnobiologie-et-science-de-la-durabilite-contributions-reciproques-entre-societe-et-nature-comme-leviers-de-changements-transformateurs/
LOCATION:Amphithéatre Charve\, Campus St Charles\, 3 place Victor Hugo\, Marseille Cedex 3\, 13001\, France
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SUMMARY:Baptiste Suchéras-Marx "Mais à quoi ça sert de faire des fouilles paléontologiques ? "
DESCRIPTION:Dans le cadre des conférences grand public des Mercredis d’Endoume\, Baptiste Suchéras-Marx\,enseignant-chercheur à Aix Marseille Université\, nous propose une conférence intitulée “ Mais à quoi ça sert de faire des fouilles paléontologiques ? “ en présentiel à la Station Marine d’Endoume ou en direct. \nRésumé de la conférence : \nLa paléontologie\, discipline consacrée à l’étude des fossiles\, s’est fait connaître grâce à la découverte d’organismes extraordinaires ayant peuplé la Terre au fil des temps géologiques. Pourtant\, la récolte de fossiles lors des fouilles paléontologiques ne présente pas qu’un intérêt scientifique. Dans cette conférence\, notre intervenant vous proposera une réflexion sur l’utilité de ces fouilles dans leur ensemble — du point de vue d’un ancien fouilleur. Il ne s’agira donc pas d’une présentation de résultats de recherche\, mais d’une discussion sur la place et le rôle de la pratique paléontologique dans la société.
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SUMMARY:Thèse de Léa Saby "Évaluer des Solutions Fondées sur la Nature pour restaurer des pelouses méditerranéennes : Impacts des héritages écologiques sur les communautés et espèces dominantes"
DESCRIPTION:Madame Léa Saby \, doctorante à l’IMBE\, équipe Ecologie\, Ecotoxicologie & Chimie appliquées à l’Agroécologie et à la Restauration\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le jeudi 27 novembre 2025\, à 14h dans l’ Amphithéâtre de l’IUT d’Avignon. Pour suivre la soutenance en distanciel. \nDevant le jury composé de : \n\nEstelle Langlois\, Professeure\, ECODIV\, Université de Rouen\, rapporteure\nGregory Mahy\, Professeur\, Gembloux Agro-bio Tech\, Université de Liège\, Belgique\, rapporteur\nAdeline Bulot\, Maîtresse de Conférences\, BAGAP\, Institut Agro Rennes-Angers\, examinatrice\nRenaud Jaunatre\, Chargé de Recherches Inrae\, LESSEM\, Grenoble\, examinateur\nThierry Dutoit\, Directeur de Recherches Cnrs\, IMBE\, directeur de thèse\nChristel Vidaller\, Maîtresse de Conférences\, IMBE\, Université d’Avignon\, co-encadrante de thèse\nPierre Bourget\, Directeur de la Société des Carrières de La Ménudelle\, Fos-sur-Mer\, invité\n\n  \nRésumé des travaux : \nLes pelouses méditerranéennes de la plaine de Crau constituent des écosystèmes semi-naturels uniques\, reconnus pour leur grande richesse floristique et faunistique ainsi que pour leur valeur patrimoniale élevée. Cependant\, ceux-ci sont aujourd’hui menacés en raison de l’intensification agricole et du développement industriel. Restaurer leur diversité et leurs fonctions écologiques représente alors un défi majeur\, d’autant plus que ces écosystèmes sont fortement contraints par les héritages écologiques liés aux usages passés des sols. Cette thèse s’inscrit dans le cadre de la recherche de Solutions Fondées sur la Nature (NbS) pour restaurer ces pelouses\, en évaluant différentes méthodes allant de la réhabilitation de l’habitat à la biodiversité via des approches en écologie des communautés et dynamique des populations. \nDans un premier temps (chapitre 1)\, nous avons évalué les effets à moyen-terme (vingt années après leur mise en oeuvre)\, d’une restauration fondée sur la réhabilitation du micro-habitat (remise en place du recouvrement en galets) et la réintroduction de l’espèce dominante Brachypodium retusum. Si les galets ont favorisé la création de micro-habitats propices et soutenu certaines communautés d’invertébrés\, les effets de l’introduction du brachypode se sont révélés contrastés : augmentation de la biomasse et stabilisation du couvert herbacé\, mais réduction de la richesse végétale et du fourrage disponible. Ces résultats montrent donc que la réintroduction d’une espèce dominante seule ne suffit pas à restaurer la complexité et la diversité des communautés caractéristiques à moyen terme. \nLes chapitres 2 et 3 se sont focalisés sur des méthodes de restauration par apport d’un pool d’espèces comparant un mélange commercial de semences\, le transfert de foin et une méthode innovante utilisant les dépotoirs de fourmis. Le suivi à court terme (6 mois) a montré que les semis commerciaux échouaient en conditions réelles\, dominés par quelques espèces peu adaptées et parfois avec des espèces indésirables par rapport aux objectifs de restauration. En revanche\, le transfert de foin et les dépotoirs de fourmis ont permis l’installation d’une végétation plus riche et plus proche de la référence. Le suivi prolongé (3 ans) a confirmé l’efficacité du foin\, qui favorise la convergence floristique vers les communautés de référence\, tandis que les dépotoirs se sont révélés complémentaires en enrichissant les communautés en espèces spécialisées des croûtes biologiques\, un faciès typique des pelouses sub-steppiques de Crau. \nEnfin\, le chapitre 4 a abordé la restauration ciblée d’espèces dominantes (Brachypodium retusum et Thymus vulgaris) absentes malgré les semis\, en testant différentes modalités de réintroduction. Les résultats ont montré que les semis restaient peu efficaces\, tandis que la transplantation de jeunes plants augmentait significativement les taux de survie et d’installation. Les performances dépendaient néanmoins de l’origine du matériel (locale vs micro-locale) et du type de sol\, les sols issus d’anciens vergers apparaissant particulièrement défavorables. \nDans l’ensemble\, cette thèse souligne l’importance des héritages écologiques dans les trajectoires de restauration. Les sols agricoles fortement enrichis en nutriments apparaissent les plus difficiles à restaurer\, alors que les sols issus de steppe\, même remaniés et stockés pendant plusieurs années\, conservent des propriétés plus favorables. Elle met aussi en avant la pertinence des approches combinées : transfert de foin pour installer rapidement une matrice\, dépotoirs de fourmis pour enrichir en espèces spécialisées\, et introduction ciblée des espèces dominantes par transplants. \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-lea-saby-evaluer-des-solutions-fondees-sur-la-nature-pour-restaurer-des-pelouses-mediterraneennes-impacts-des-heritages-ecologiques-sur-les-communautes-et-especes-dominantes/
LOCATION:Amphithéâtre de l’IUT d’Avignon. Site Agroparc\, 337 chemin des Ménajariés\, Avignon\, Avignon CEDEX 09\, 84911
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SUMMARY:Thèse de Maximillien FIL "Design et optimisation de nouvelles drogues naturelles pour lutter contre la tuberculose"
DESCRIPTION:Monsieur Maximillien FIL \, doctorant à l’IMBE\, équipe Ecologie fonctionnelle : des systèmes socioécologiques aux molécules\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le jeudi 27 novembre 2025\, à 14h dans la salle des thèses  de la faculté de Pharmacie. \nDevant le jury composé de : \n\nProfesseur Nicolas WILLAND\,  Rapporteur\, Université de Lille\nProfesseur Rino RAGNO\, Rapporteur\, Sapienza Université de Rome\nDocteur Jessica HERNANDEZ\, Examinatrice\, Aixial\nProfesseure Laurence FERAY\, Présidente du jury\, Aix-Marseille Université\nDocteure Sandrine ALIBERT\, Directrice de thèse\, Aix-Marseille Université\nProfesseur Gérard BOYER\, Co-encadrant\, Aix-Marseille Université\nDocteur Paul BREMOND\, Membre Invité\, Aix-Marseille Université\nProfesseure Christine CONTINO-PEPIN\,  Membre Invitée\, Université d’Avignon\n\n  \nRésumé des travaux : \nDepuis l’antiquité\, la tuberculose est l’une des principales causes de mortalité ayant touché l’humanité. Si depuis la deuxième moitié du XXe siècle\, celle-ci est de mieux en mieux prise en charge\, elle demeure encore aujourd’hui la première cause de décès liés aux maladies infectieuses dans le monde. De plus\, l’émergence de résistances du pathogène Mycobacterium tuberculosis\, notamment à la rifampicine et à l’isoniazide – deux des quatre molécules de la quadrithérapie utilisée en première intention – rend indispensable le développement de nouvelles thérapeutiques. \nParmi les premiers freins au développement de nouvelles thérapeutiques antituberculeuses\, se trouve la membrane mycobactérienne\, membrane vitale particulièrement complexe et lipophile représentant un réel obstacle vis-à-vis des antibiotiques. Celle-ci est entre autres caractérisée par la présence d’acides mycoliques ainsi que d’arabinogalactane. Déstabiliser cette membrane est aujourd’hui une méthode de choix dans le développement de nouveaux composés à visée antituberculeuse. \nAfin de participer à la lutte contre la maladie\, cette étude propose le développement de modèles 3D-QSAR (Analyse quantitative 3D des relations structure-activités) basés des modèles pharmacophoriques 3D ainsi que des modèles de machine learning\, et tout particulièrement de Random Forest (RF) pour la découverte de composés capable de cibler l’Enoyl-[acyl-carrier-protein] réductase (InhA) et la Décaprenylphosphoryl-beta-D-ribose oxydase (DprE1)\, deux enzymes impliquées respectivement dans la biosynthèse des acides mycoliques et de la mycomembrane de Mycobacterium tuberculosis. Quarante-trois modèles pharmacophoriques 3D ont été réalisés et cinq d’entre eux ont été retenus pour le développement de modèles de RF. 10 modèles de RF qualitatifs ont ensuite été réalisés avec des F1 scores allant de 0\,88 à 0\,97 et des justesses entre 0\,96 et 0\,99. \nL’analyse de ces modèles souligne l’importance de descripteurs comme le Shape Index\, la masse molaire ou la globularité pour identifier de nouveaux inhibiteurs d’InhA. De la même manière\, si la prise en compte du Shape Index ou de la masse molaire restent clés pour l’inhibition de DprE1\, d’autres paramètres comme le volume et la surface de Van der Waals ou le LogP doivent être pris en compte pour inhiber correctement cette cible. \nCes modèles ont ensuite été utilisés pour le criblage in silico de près de 30 000 composés majoritairement d’origine naturelle. Lors des premiers criblages in vitro sur les 16 premiers composés sélectionnés et testés sur Mtb H37Ra\, 7 ont démontré une CMI50 soit un taux de sélection de hit de 47 %. \nParmi les composés potentiellement actifs\, 7 composés étaient prédits actifs par l’entièreté des modèles des deux cibles InhA et DprE1. Parmi ses composés\, se trouvait une quinazolin-4-one substituée en position 3\, 6 et 7. Une approche dite « multitarget » pouvant être une solution clé dans la prévention de l’émergence de résistances\, il a été choisi de synthétiser une série de 17 quinazolin-4-ones substituées en position 3 par une chaîne peptidique dont les tests microbiologiques sur Mtb H37Ra sont en cours. \nEn définitive\, ces travaux montrent le potentiel des modèles de 3D-QSAR et particulièrement de machine learning dans la lutte contre la tuberculose et dans les process de Drug Discovery. Ils mettent également en lumière le potentiel antituberculeux des quinazolin-4-ones substituées en position 3 par une chaîne peptidique. \n  \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-maximillien-fil-design-et-optimisation-de-nouvelles-drogues-naturelles-pour-lutter-contre-la-tuberculose/
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SUMMARY:Thèse de Marc-Antoine RACICOT : « Vers un droit plus effectif pour la conservation des milieux humides et hydriques au Canada : d’une séquence Éviter-Réduire-Compenser à une séquence de conservation »
DESCRIPTION:Monsieur Marc-Antoine RACICOT\, doctorant au laboratoire JPEG\, co-encadré par Marthe Lucas (IMBE\, équipe EECAR) en co-tutelle avec l’Université Laval (Canada) soutiendra publiquement ses travaux de thèse le vendredi 28 novembre 2025 à 15h en distanciel. \nDevant le jury composé de : \n\nPRISO-ESSAWE Samuel Jacques (Professeur des universités\, Avignon Université)\, CoDirecteur\n Mme HALLEY Paule (Professeure des universités\, Université de Laval)\, CoDirectrice\n Mme LUCAS Marthe (Maîtresse de conférences\, Avignon Université)\, Coencadrante\n Mme LANGLAIS Alexandra (Chargée de recherche CNRS\, Université de Rennes)\, Rapporteure\n M. TREMBLAY Hugo (Professeur des universités\, Université de Montréal)\, Rapporteur\n Mme DOUSSAN Isabelle (Directrice de recherche\, INRAE)\, Examinatrice\n M. PELLERIN Antoine (Professeur des universités\, Université de Laval) Examinateur\n\nRésumé des travaux : \nLa séquence d’atténuation « Éviter-Réduire-Compenser » (ERC) a été introduite dans de nombreux pays afin de contribuer à la conservation des milieux humides\, tels que les étangs\, les tourbières\, les marais et les marécages. Son utilisation dans les procédures d’autorisation environnementale délivrée par les ministères de l’Environnement est promue pour contribuer à atteindre l’objectif d’aucune perte nette de superficies\, de fonctions écologiques et/ou de biodiversité de ces milieux. Toutefois\, ces dispositifs se révèlent généralement insuffisants pour atteindre un tel objectif\, en raison d’un manque d’effectivité observé à chacune des trois étapes constitutives de cette séquence. \nPour remédier à cette situation\, de plus en plus de chercheurs s’entendent pour renforcer la séquence en élargissant son champ d’application\, notamment à la planification territoriale\, à l’aménagement du territoire\, ainsi qu’à d’autres types de milieux comme les habitats fauniques\, les boisés\, les bassins versants\, les friches agricoles ou industrielles\, les coulées\, les chemins forestiers\, les lisières\, etc. Du point de vue légistique\, un cadre élargi pour la séquence ERC suppose de répondre à plusieurs conditions d’effectivité\, dont la qualité\, la pertinence\, la cohérence\, la stratégie\, l’efficacité ou la réflexivité. Cette thèse propose ainsi d’évaluer ces critères à travers une analyse approfondie du droit canadien\, en examinant les régimes juridiques qui mobilisent déjà la séquence ERC ou qui offrent un potentiel pour son renforcement. Elle porte notamment sur les domaines du droit de l’environnement\, de l’aménagement du territoire\, de la gestion des ressources naturelles\, de l’agriculture et des forêts. Ce regard d’ensemble démontre que le droit fonctionne comme un système interconnecté\, dont les effets dépendent des structures\, des interactions et des finalités qu’il organise. En ce sens\, seule une approche systémique fondée sur la durabilité forte permettrait de rendre l’objectif d’aucune perte nette effectif et cohérent\, notamment en matière de milieux humides et hydriques.
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-marc-antoine-racicot-vers-un-droit-plus-effectif-pour-la-conservation-des-milieux-humides-et-hydriques-au-canada-dune-sequence-eviter-reduire-compenser-a-une-sequence-de-c/
LOCATION:https://ulaval.zoom.us/j/67179583559?pwd=Dfa7YoKnQ3K9kmermPYEY6hdvelmvF.1\, ID de réunion : 671 7958 3559 Code secret : 194610
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SUMMARY:Thèse de Salomé Coquin "Métabolites spécialisés volatils et non volatils des Magnoliophytes marines : caractérisation et saisonnalité en mer Méditerranée"
DESCRIPTION:Madame Salomé Coquin\, doctorante à l’IMBE\, équipe Ecologie fonctionnelle : des systèmes socioécologiques aux molécules\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le mercredi 10 décembre 2025\, à 9h dans l’amphithéâtre INSPE\, Campus Saint-Jérôme. Pour suivre la soutenance en distanciel.  \nDevant le jury composé de : \n\nDr Anne-violette Lavoir\, Rapporteure\, Université Côte d’Azur\nDr Philippe Potin\, Rapporteur\, Station Biologique de Roscoff\, Université de Brest\nDr Jean-Baptiste Raina\, Examinateur\, Université de technologie de Sydney\, Australie\nPr Patricia Bonin\, Examinatrice\, Aix-Marseille Université\nPr Catherine Fernandez\, Directrice de thèse\, Aix-Marseille Université\nDr Elena Ormeno-Fuentes\, Co-directrice de thèse\, CNRS\n\n  \nRésumé des travaux : \nLes métabolites spécialisés des espèces végétales\, volatils ou non volatils\, sont des molécules clés du fonctionnement des écosystèmes jouant un rôle majeur dans la défense contre les stress biotiques (herbivorie\, compétition) et abiotiques (sécheresse\, température)\, et dans la médiation chimique intra- et interspécifique. Leur étude éclaire ainsi les mécanismes de résistance et de résilience des plantes face aux changements environnementaux. \nBien que cruciaux\, ces composés restent peu connus dans les milieux marins\, notamment chez les Magnoliophytes marines\, essentielles à la qualité des eaux\, à la stabilité des côtes et à la séquestration du carbone bleu. Or\, ces services sont menacés car les herbiers marins sont en déclin dû aux changements globaux. Une compréhension approfondie de leurs métabolites spécialisés pourrait améliorer la compréhension des dynamiques de ces écosystèmes dans un contexte de changements globaux. \nLes travaux de thèses présentés s’inscrivent dans ce cadre en visant à 1) caractériser les métabolites spécialisés volatils ou Composés Organiques Volatils Biogéniques (COVB)\, 2) caractériser les métabolites spécialisés non-volatils\, 3) déterminer l’impact de la saisonnalité sur les COVB et 4) déterminer l’impact de la saisonnalité sur les métabolites non volatils pour quatre espèces majeures de Magnoliophytes méditerranéennes : Posidonia oceanica\, Cymodocea nodosa\, Zostera noltei et Zostera marina. Les COVB ont été prélevés par fibres SPME et analysés en GC-MS\, et les métabolites non volatils ont été extraits par solvant et détectés par UHPLC-qToF-MS sur des échantillonnages ponctuels et saisonniers. \nLes volatilomes (i.e.\, ensemble des composés volatils produits par un individu) et les métabolomes (i.e.\, ensemble des composés non-volatils produits par un individu) des différentes espèces d’herbiers marins présentent une forte diversité chimique. Plusieurs familles de composés identifiés sont bien connues en milieu terrestre comme l’acide chicorique\, l’acide rosmarinique\, le benzaldéhyde ou α-ionone. Cependant\, ces travaux ont également mis en évidence la présence de composés caractéristiques du milieu marin comme les composés halogénés (1-chlorodecane) et les composés soufrés (sulfure de diméthyl – DMS). Certains composés se sont révélés être des biomarqueurs spécifiques\, permettant de discriminer chimiquement les espèces entre elles\, avec des biomarqueurs volatils tels que le citral\, l’humulène ou l’alloaromadendrène ainsi que des composés non-volatils comme la rutine ou le sulfate de kaempferol. Les résultats obtenus confirment la phylogénie des espèces étudiées avec des volatilomes et des métabolomes plus ou moins proches en fonction des séparations phylogéniques\, prouvant l’intérêt de la chimiotaxonomie comme un outil complémentaire pour la distinction des espèces. De plus\, la saisonnalité influence significativement la production de composés spécialisés. L’été\, se distingue particulièrement par un nombre important de composés spécifiques comme le3-hexen-1-ol\, le menthol\, zonarene\, l’acide succinique et l’acide férulique. Ces résultats suggèrent que les métabolites spécialisés des plantes marines pourraient jouer des rôles de composés de défense\, grâce à leurs propriétés antioxydantes déjà mises en évidence en milieu terrestre. Au-delà de la variabilité saisonnière\, cette étude a également permis de mettre en évidence une variabilité spatiale importante pouvant révéler une acclimatation métabolique spécifique à des conditions environnementales suggérant des chémotypes chez C. nodosa. Ces premiers résultats offrent une base pour de futures recherches mécanistiques\, en particulier sur le rôle fonctionnel de ces composés dans l’écologie chimique des herbiers marins. \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-salome-coquin-metabolites-specialises-volatils-et-non-volatils-des-magnoliophytes-marines-caracterisation-et-saisonnalite-en-mer-mediterranee/
LOCATION:Amphitéatre INSPE\, Campus Saint-Jérôme\, 52 Av. Escadrille Normandie Niemen\, Marseille\, 13013
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SUMMARY:Thèse de  Mas-Normand Lindsay "Nouveaux développements analytiques pour la métabolomique et l’annotation d’extraits de plantes tinctoriales : Applications dans un contexte de patrimoine culturel"
DESCRIPTION:Madame Mas-Normand Lindsay\, doctorante à l’IMBE\, équipe Ecologie\, Ecotoxicologie & Chimie appliquées à l’Agroécologie et à la Restauration\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le mercredi 10 décembre 2025\, à 9h30 dans L’Amphithéâtre Agrosciences\, Avignon. Pour suivre la soutenance en distanciel. \nDevant le jury composé de : \n\nMme Émilie Destandau\, Professeure\, Université d’Orléans\, Rapporteure\nMme Audrey Le Gouellec\, Maître de Conférences\, HDR\, Université Grenoble Alpes\, Rapporteure\nJoël Boustié\, Professeur\, Université de Rennes 1\, Examinateur\nThibaut Devièse\, Maître de Conférences\, HDR\, Aix Marseille Université\, Examinateur\nGérald Culioli\, Professeur\, Avignon Université\, Directeur de thèse\nOlivier Dangles\, Professeur émérite\, Avignon Université\, Co-directeur de thèse\nMme Carole Mathe de Souza\, Maître de Conférences\, HDR\, Avignon Université\, Co-directrice de thèse\n\n\nRésumé des travaux : \nLes colorants naturels ont été employés par l’Homme afin de teindre des tissus et divers objets du quotidien jusqu’à la fin du XIXème siècle. Aujourd’hui\, historiens\, conservateurs de musées et scientifiques tentent de décrypter les secrets d’objets patrimoniaux\, afin de mieux comprendre leur histoire et de mieux les préserver. Grâce aux données recueillies\, il est parfois possible de remonter aux techniques et matériaux employés lors de leur teinture\, ou aux échanges de matières premières et de savoir-faire. Afin d’obtenir de telles informations\, un large panel de techniques analytiques peuvent être mises en œuvre. Néanmoins\, il est souvent ardu de remonter à l’origine botanique exacte des colorants naturels identifiés dans un objet\, notamment dans le cas de la couleur jaune. En effet\, cette couleur peut être obtenue à partir d’une grande variété de plantes tinctoriales et de nombreux composés sont communément retrouvés chez plusieurs d’entre elles. \nAfin de proposer une méthode permettant d’identifier avec précision l’origine botanique des colorants ayant servi à teindre des objets patrimoniaux\, mais aussi de mieux caractériser l’impact des conditions de teinture et de dégradation sur leurs compositions en molécules colorantes\, une approche métabolomique non ciblée est proposée dans le cadre de ces travaux de thèse. La métabolomique a déjà fait ses preuves dans le cadre d’études sur les stress environnementaux\, la découverte de biomarqueurs ou la recherche de molécules bioactives\, mais son utilisation reste encore anecdotique en chimie du patrimoine. \nLe premier objectif de cette thèse a consisté à développer une approche métabolomique non ciblée\, utilisant la LC-HRMS/MS et des outils d’annotation tels que les réseaux moléculaires\, afin de déterminer des marqueurs chimiques spécifiques propres à une sélection de plantes tinctoriales jaunes. Le second objectif a visé à étudier la stabilité et la dégradation de molécules colorantes\, en fonction des conditions de teinture\, de conservation de l’objet et des méthodes d’extraction employées. Enfin\, le troisième objectif a eu pour but d’appliquer la méthode développée à des objets anciens et de voir s’il était possible de retrouver certains des marqueurs chimiques décrits au niveau des deux premiers objectifs. \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-mas-normand-lindsay-nouveaux-developpements-analytiques-pour-la-metabolomique-et-lannotation-dextraits-de-plantes-tinctoriales-applications-dans-un-contexte-de-patrimoi/
LOCATION:Avignon Université\, Campus Jean-Henri Fabre\, Bâtiment A\, Amphi Agrosciences\, 301 Rue Baruch de Spinoza\, Avignon\, 84140\, France
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SUMMARY:Thèse de ACHARD-BACCATI Clémentine "Valorisation ethnopharmacologique de cinq espèces végétales Provençales du Parc Naturel Régional du Luberon"
DESCRIPTION:Madame ACHARD-BACCATI Clémentine\, doctorante à l’IMBE\, équipe Ecologie fonctionnelle : des systèmes socioécologiques aux molécules\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le vendredi 12 décembre 2025\, à 9h dans la salle des thèses\, Faculté de pharmacie\, La Timone. \nDevant le jury composé de : \n\nAnne Gauvin-Bialecki\, Rapporteure\, Professeure des Universités\, Université de La Réunion\nFrançois Chassagne\, Rapporteur\, Chargé de Recherches\, IRD Nouméa\nDominique Laurain-Mattar\, Présidente du jury\, Professeure des Universités\, Université de Lorraine\nGérald Culioli\, Examinateur\, Professeur des Universités\, Avignon Université\nBéatrice BAGHDIKIAN\, Directrice de thèse\, Maître de Conférences HDR\, Aix-Marseille Université\nElnur GARAYEV\, Co-directeur de thèse\, Maître de Conférences\, Aix-Marseille Université\nSylvie MOREL\, Membre invitée\, Maître de Conférences\, Université de Montpellier\n\n  \nRésumé des travaux : \nCette thèse propose une démarche ethnopharmacologique pour la valorisation de plantes médicinales Provençales issues du Parc Naturel Régional du Luberon. Cette approche s’appuie sur les inventaires ethnobotaniques de Pierre Lieutaghi et Magali Amir afin de sélectionner cinq espèces de plantes médicinales utilisées en médecine traditionnelle Provençale pour des usages cutanés : Helichrysum stoechas\, Pilosella officinarum\, Plantago sempervirens\, Rubus ulmifolius et Satureja montana. \nLes drogues végétales de chaque espèce sélectionnée ont été extraites aux ultrasons avec un mélange hydro-éthanolique\, les extraits résultant ont été fractionnés par extraction liquide/liquide. \nLes extraits et fractions ont fait l’objet d’un criblage biologique pour évaluer des activités en lien avec les usages traditionnels : anti-oxydante (DPPH/ABTS en microplaque et couplage en ligne UHPLC-DAD-DPPH/ABTS-MS/MS)\, anti-inflammatoire (inhibition du NO)\, anti-microbienne (diamètres d’inhibition et CMI sur souches du microbiote cutané) et cicatrisante (scratch-test sur kératinocytes). \nEn parallèle\, la composition chimique a été étudiée par des analyses UHPLC-HRMS/MS et GC-MS. La déréplication et l’emploi des réseaux moléculaires ont permis de décrire la diversité chimique des extraits et fractions\, et de mettre en évidence des familles chimiques contribuant aux activités biologiques évaluées. \nLe couplage On-Line UHPLC-DAD-DPPH/ABTS-MS/MS a permis de déterminer avec précision les composés responsables de l’activité anti-oxydante. Compte tenu d’un fort potentiel anti-oxydant et d’une abondance naturelle favorable\, l’espèce Rubus ulmifolius a été retenue pour une valorisation industrielle. La sanguiine-H6\, identifiée comme principal contributeur à l’activité anti-oxydante de R. ulmifolius\, a été isolée par HPLC préparative et sa structure a été confirmée par RMN. Le développement d’une méthode de dosage spécifique en HPLC-UV et la mise en œuvre d’un plan d’expériences ont permis d’optimiser les conditions d’extraction pour majorer la concentration en sanguiine-H6 dans des extraits hydro-glycérinés. \nDans l’ensemble\, les résultats expérimentaux soutiennent les savoirs ethnopharmacologiques locaux relatifs aux usages cutanés\, avec des profils anti-oxydants\, anti-inflammatoires et anti-microbiens des espèces étudiées. \n 
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SUMMARY:Thèse de  Sarah Kubien "L'évitement en droit de l'environnement : une entrée par l'évaluation environnementale"
DESCRIPTION:Madame Sarah Kubien\, doctorante à l’IMBE\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le lundi 15 décembre 2025\, à 15h en salle des thèses\, Avignon Université. \nPour suivre la soutenance en distanciel\, c’est ici ! \nDevant le jury composé de : \n\nMme Isabelle DOUSSAN\, Directrice de recherche INRAE\, Co-directrice de thèse\nThierry DUTOIT\, Directeur de recherche CNRS\, Co-directeur de thèse\nMme Marthe LUCAS\, Maîtresse de conférences Avignon Université\, ADR Co-encadrante de thèse\nPhilippe BILLET Professeur des universités\, Université Jean-Moulin Lyon 3\, Rapporteur\nCharles-Hubert BORN\, Professeur\, Université catholique de Louvain\, Rapporteur\nBernard DROBENKO\, Professeur émérite\, Université Littoral Côte d’Opale Examinateur\nMme Isabelle MICHALLET\, Professeure des universités\, Université de Rennes Examinatrice\n\n  \nRésumé des travaux : \nL’étude d’impact est un outil de prévention des impacts à l’environnement adopté en droit interne en 1976. Novatrice à l’époque\, l’étude d’impact\, devenue plus récemment l’évaluation environnementale\, prévoit la réalisation d’un rapport scientifique\, la consultation du public\, des collectivités territoriales et de différents organismes concernés par la procédure avant autorisation d’un projet ou approbation d’un plan. Parmi les rubriques de l’étude d’impact\, la séquence “Eviter-réduire-compenser” (ERC) met en place une hiérarchie entre les différentes phases : le maître d’ouvrage ou décideur public doit faire en sorte d’éviter en priorité les impacts causés à l’environnement\, puis de réduire ceux n’ayant pas été évités et enfin de compenser les impacts résiduels. À l’époque et jusqu’il y a une quinzaine d’année\, la séquence dite ERC n’avait pas été réellement appropriée par les acteurs ni donné lieu à des mesures de prévention et de réparation des dommages environnementaux résiduels. Ce n’est qu’avec la montée en puissance des réflexions autour des mesures compensatoires\, que le cadre juridique de la séquence est revu et renforcé en 2010\, puis en 2016 par la loi sur la reconquête de la biodiversité\, la nature et les paysages. \nReste qu’aujourd’hui\, en comparaison avec la compensation écologique\, l’évitement fait l’objet d’un très faible nombre d’études. Pourtant\, en pratique\, les acteurs de terrain comme les chercheurs alertent sur un déficit d’application de l’évitement. En examinant cette phase\, il apparaît que les causes de ce déficit sont multiples. A priori simple\, la thématique de l’évitement s’avère en effet ardue à traiter au regard des confusions qu’elle engendre avec d’autres rubriques de l’étude d’impact et au-delà en raison de sa dimension plurielle. Celle-ci s’exprime ainsi par les différentes formes d’évitement utilisées\, par le large champ d’application de l’évaluation environnementale\, ou encore par la diversité des impacts environnementaux censés être appréhendés. Il est\, de plus\, marqué par l’implication des choix politiques\, très présents à ce niveau. La thèse met ainsi en lumière une typologie de l’évitement. En sus des différents vecteurs de mise en œuvre de l’évitement\, y compris l’articulation entre les évaluations des plans et celles des projets\, la thèse souhaite une mise en cohérence du droit autour de cet outil\, afin d’en rationaliser la pratique et augmenter l’effectivité. Cette mise à jour est primordiale car l’évitement est aujourd’hui remis sur le devant de la scène. En adoptant des objectifs ambitieux de limitation des impacts à l’environnement\, tels que ceux de “zéro artificialisation nette”\, de “zéro émission nette” de gaz à effet de serre\, ou encore d’absence de perte nette de biodiversité\, les politiques publiques s’inscrivent dans la droite ligne des évaluations environnementales et de l’évitement. L’urgence écologique aujourd’hui indéniable impose en effet de nouvelles réflexions sur la consommation sobre des ressources naturelles et l’inscription des activités humaines dans les limites planétaires. \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-sarah-kubien-levitement-en-droit-de-lenvironnement-une-entree-par-levaluation-environnementale/
LOCATION:Salle des Thèses – Avignon Université\, Campus Hannah Arendt\, 74 Rue Louis Pasteur\, Avignon\, 84029
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SUMMARY:Thèse de BREAUD Célia "Nouvelle stratégie dans la recherche d’agents antituberculeux naturels issus de la flore de Guyane française"
DESCRIPTION:Madame BREAUD Célia\, doctorant à l’IMBE\, équipe Ecologie fonctionnelle : des systèmes socioécologiques aux molécules\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le lundi 15 décembre 2025\, à 14h dans la salle des thèses de la faculté de Pharmacie. \nDevant le jury composé de : \n\nSophie TOMASI\,  Rapporteuse et Présidente du Jury\, Professeure des Universités\, Université de Rennes\nMehdi BENIDDIR\, Rapporteur\, Professeur des Universités\, Université Paris-Saclay\nGaëtan HERBETTE\, Examinateur\, Ingénieur de recherche\, Université Paris-Saclay\nStéphane CANAAN\,  Examinateur\, Directeur de recherche\, Université d’Aix-Marseille\nSok-Siya BUN-LLOPET\, Directrice de thèse\, Professeure des universités – Praticienne hospitalière\, Université d’Aix-Marseille\nElnur GARAYEV\, Co-directeur de thèse\, Maître de conférences\, Université d’Aix-Marseille\n\n  \nRésumé des travaux : \nLa tuberculose demeure un enjeu de santé publique majeur\, renforcé par l’émergence de souches résistantes. Dans ce contexte\, cette thèse explore la flore de Guyane française comme source de métabolites à potentiel antituberculeux\, en combinant criblage biologique\, métabolomique par LC-MS/MS et analyse par réseaux moléculaires\, avec intégration des données d’activité. \nUn premier volet a porté sur sept espèces sélectionnées sur la base de critères ethnopharmacologiques et phytochimiques. Les extraits et fractions ont été testés contre Mycobacterium tuberculosis H37Ra\, puis profilés par LC-HRMS/MS. Les réseaux moléculaires ont permis de relier familles chimiques et niveaux d’activité\, de prioriser des candidats et de dérépliquer rapidement des composés connus\, tout en révélant des composés antituberculeux dans plusieurs extraits actifs. \nLe second volet s’est focalisé sur deux espèces du genre Aspidosperma (Apocynaceae)\, riches en alcaloïdes indoliques monoterpéniques. Le fractionnement bioguidé\, couplé aux réseaux moléculaires\, a mis en évidence un noyau de composés corrélés à l’inhibition de M. tuberculosis. Les résultats soutiennent l’intérêt de ce réservoir chimique\, tout en soulignant la nécessité d’isolements ciblés et de validations structurales par RMN pour attribuer finement l’activité. \nLe troisième volet a abordé Lantana trifolia (Verbenaceae). Les fractions de polarité intermédiaire se sont révélées les plus actives\, et l’analyse métabolomique a indiqué la contribution possible d’un petit groupe de métabolites abondants avec l’activité. L’annotation globale a par ailleurs confirmé un profil riche en flavonoïdes\, acides phénols et phénylpropanoïdes glycosylés\, suggérant un effet cumulatif ou synergique concordant avec la distribution de l’activité observée. \nSur le plan méthodologique\, la thèse montre l’intérêt d’un pipeline reproductible alliant LC-MS/MS haute résolution\, déréplication automatisée et réseaux moléculaires bioactifs pour rationaliser la priorisation des fractions et orienter l’isolement. Sur le plan scientifique\, elle documente la chimiodiversité d’espèces amazoniennes encore peu étudiées\, établit des liens clairs entre familles chimiques et réponse antimycobactérienne\, et met en lumière des ensembles moléculaires prioritaires. \nEnsemble\, ces travaux démontrent l’apport des approches métabolomiques intégrées pour valoriser des bioressources tropicales dans la lutte contre Mycobacteium tuberculosis. Ils fournissent un corpus analytique et biologique\, directement mobilisable pour des actions d’isolement ciblé\, d’évaluation pharmacologique et de valorisation locale des ressources\, en cohérence avec une démarche éthique et partenariale de bioprospection en Guyane française. \n  \n 
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SUMMARY:Thèse de  LEGROS Thibaud "La litière des forêts méditerranéennes comme source d'émission de Composés Organiques Volatils Biogéniques (COVB) dans un climat plus aride : quelles conséquences atmosphériques à l'échelle régionale ?"
DESCRIPTION:Monsieur LEGROS Thibaud\, doctorant à l’IMBE\, équipe Ecologie fonctionnelle : des systèmes socioécologiques aux molécules\, soutiendra publiquement ses travaux de thèse le mercredi 17 décembre 2025\, à 14h dans L’Amphithéâtre PONTE\, Campus Saint Jérôme. \nDevant le jury composé de : \n\nDr Alexandre ARMENGAUD\, Membre invité\, AtmoSud\nDr Karine SARTELET\, rapporteuse\, CEREA\, Ecole nationale des ponts et chaussées\nDr Joan LLUSIÀ\, rapporteur\, CREAF\, Espagne\nDr Raluca CIURARU\, examinatrice\, Université Paris-Saclay\, INRAE\nPr Philippe Cuny\, Président du jury\, AMU-MIO\nPr Catherine Fernandez\, co-directrice de thèse\, IMBE\nDr Elena Ormeno-Fuentes\, directrice de thèse\, IMBE\n\n  \nRésumé des travaux : \nLes émissions de Composés Organiques Volatils Biogéniques (COVB) de la canopée sont caractérisées depuis les années ’80 et leur contribution à la formation d’O3 a été quantifiée de l’échelle régionale (région Sud-PACA) à l’échelle globale. Cela contraste avec les émissions de COVB des sols et de leur litière qui restent rarement caractérisées y compris dans la région méditerranéenne alors qu’elle est fortement concernée par la pollution à l’O3 et qu’elle représente un point chaud du changement climatique ce qui pourrait impacter rapidement les flux de COVB. Pour combler ce manque de connaissances\, ce travail de thèse présente un double volet. D’une part\, le volet expérimental a pour but de caractériser les flux de COVB des sols recouverts de litière dans deux formations forestières typiques de la région méditerranéenne : la forêt décidue de Quercus pubescens au sein de la plateforme expérimentale in natura de l’O3HP – où les COVB ont été mesurés en temps réel par PTR-ToF-MS – et la forêt mixte de Pinus halepensis et Quercus ilex au sein du site in natura de Fontblanche où les COVB ont été étudiés via des analyses off-line par GC-MS. Ces flux ont été mesurés à la fin du printemps ou en été respectivement en conditions de stress hydrique naturel (SN) et de stress hydrique amplifié sur le long-terme (SA)\, via des dispositifs de restriction des précipitations mis en place depuis 10 ou 9 ans respectivement. D’autre part\, le volet de modélisation a permis d’évaluer la contribution actuelle des sols (recouverts de litière) des forêts (feuillus et de conifères) de la région Sud-PACA à l’aide de l’algorithme de Tingey. Ces émissions ont ensuite été comparées à la fois avec les émissions de COVB dans un scénario futur plus sec et avec les COVB émis par la canopée modélisée via MEGAN. Enfin\, la formation d’O3 a été estimée via le modèle CHIMERE. Le volet expérimental illustre que le sol (couvert de litière) de la forêt mixte se caractérise par un facteur d’émission (émissions à 30°C) de COVB important (184 µgC.m-2.h-1 en moyenne) formé par des monoterpènes et des sesquiterpènes compte tenu principalement de la participation de P. halepensis à ces émissions. La forêt décidue se caractérise en revanche par un facteur d’émission plus faible (22 µgC.m-2.h-1 en moyenne) de composés hautement volatils (acétone et acétaldéhyde). Dans les deux cas\, le flux total des COVB des sols diminue très fortement en conditions de SA (84% à Fontblanche et 43% à l’O3HP). En termes de modélisation\, les flux de COVB des sols forestiers représentent\, à l’échelle de la région Sud-PACA et pendant l’été 2022\, 26 tC.jour-1 sous SN et 7 tC.jour-1 sous SA\, ce qui induit une augmentation de 4% et 2% (respectivement) de la concentration en O3 à l’échelle de la région. \n 
URL:https://www.imbe.fr/en/evenement/these-de-legros-thibaud-la-litiere-des-forets-mediterraneennes-comme-source-demission-de-composes-organiques-volatils-biogeniques-covb-dans-un-climat-plus-aride-quelles-consequences-atmospher/
LOCATION:Amphithéatre PONTE – Campus Saint Jérôme\, 52 Av. Escadrille Normandie Niemen\, Marseille\, 13013
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SUMMARY:Remise des Prix de l’Académie des Sciences\, Lettres et Arts de Marseille à jean Vacelet
DESCRIPTION:L’Académie des Sciences\, Lettres et Arts de Marseille\, institution fondée au XVIIᵉ siècle et dédiée à la promotion de la connaissance\, de la culture et de la recherche dans notre région\, organise sa traditionnelle cérémonie annuelle de remise des Prix. \nChaque année\, l’Académie distingue des auteurs\, historiens\, artistes\, scientifiques\, associations engagées\, ainsi que de jeunes élèves méritants. Cette édition met une nouvelle fois à l’honneur des personnalités et des initiatives qui contribuent au rayonnement de Marseille. Parmi les distinctions majeures remises cette année\, le Prix du Duc de Villars sera attribué à Jean Vacelet\, Directeur de recherche CNRS émérite à la Station marine d’Endoume (IMBE – Équipe NEMO)\, pour l’excellence de ses travaux consacrés aux éponges marines et à la biodiversité méditerranéenne.
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LOCATION:Salon Eugénie – Palais du Pharo\, 58 boulevard Charles Livon\, Marseille\, 13007
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