{"id":12788,"date":"2026-09-17T15:23:16","date_gmt":"2026-09-17T13:23:16","guid":{"rendered":"https:\/\/www.imbe.fr\/?p=12788"},"modified":"2026-09-17T15:24:07","modified_gmt":"2026-09-17T13:24:07","slug":"mieux-suivre-la-biodiversite-marine-grace-a-ladn-environnemental","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.imbe.fr\/fr\/mieux-suivre-la-biodiversite-marine-grace-a-ladn-environnemental\/","title":{"rendered":"Mieux suivre la biodiversit\u00e9 marine gr\u00e2ce \u00e0 l\u2019ADN environnemental"},"content":{"rendered":"\t\t
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Un papier cosign\u00e9 par des auteurs de l\u2019IMBE, du MIO et de l\u2019OSU Pyth\u00e9as vient de para\u00eetre dans <\/strong>Molecular Ecology Resources<\/strong><\/em>, dans le prolongement du projet Seamobb<\/a>.<\/strong> Cette \u00e9tude est le fruit d\u2019une belle collaboration, qui a r\u00e9uni des comp\u00e9tences allant de la plong\u00e9e et de l\u2019\u00e9chantillonnage \u00e0 la g\u00e9n\u00e9tique et \u00e0 la bioinformatique<\/strong>, en passant par la taxonomie marine et l\u2019\u00e9cologie des communaut\u00e9s<\/strong>.<\/p>

Dans cette \u00e9tude, Anne Chenuil<\/a> et ses collaborateurs s\u2019int\u00e9ressent \u00e0 l\u2019utilisation de l\u2019ADN environnemental pour am\u00e9liorer le suivi de la biodiversit\u00e9 marine. Ils combinent une analyse par m\u00e9tabarcoding de l\u2019ADN<\/strong> avec des observations photographiques<\/strong> r\u00e9alis\u00e9es sur des structures artificielles de suivi des r\u00e9cifs, les ARMS<\/strong> (Autonomous Reef Monitoring Structures).<\/p>

L\u2019\u00e9tude porte sur 10 sites du nord-ouest de la M\u00e9diterran\u00e9e<\/strong>. Les chercheurs ont d\u2019abord optimis\u00e9 les protocoles exp\u00e9rimentaux, notamment l\u2019extraction de l\u2019ADN et le choix de la polym\u00e9rase, puis utilis\u00e9 une m\u00e9thode d\u2019analyse bioinformatique permettant de limiter les faux positifs et d\u2019assurer la tra\u00e7abilit\u00e9 des r\u00e9sultats.<\/p>

Une attention particuli\u00e8re a \u00e9t\u00e9 port\u00e9e \u00e0 la structure m\u00eame des ARMS. Plut\u00f4t que de regrouper les organismes pr\u00e9sents sur l\u2019ensemble des faces, les chercheurs ont analys\u00e9 s\u00e9par\u00e9ment les diff\u00e9rentes faces des structures, afin de mieux prendre en compte les microhabitats<\/strong> qu\u2019elles offrent.<\/p>

Le m\u00e9tabarcoding a ainsi d\u00e9tect\u00e9 une richesse sp\u00e9cifique environ 15 fois sup\u00e9rieure<\/strong> \u00e0 celle r\u00e9v\u00e9l\u00e9e par les observations photographiques \u00e0 l\u2019\u00e9chelle des sites. Les deux m\u00e9thodes apportent toutefois des informations compl\u00e9mentaires : l\u2019ADN permet de d\u00e9tecter une diversit\u00e9 taxonomique plus fine, tandis que la photographie renseigne notamment sur les grands groupes d\u2019organismes et leur couverture de surface.<\/p>

Les r\u00e9sultats montrent surtout que conserver la structure spatiale des ARMS est essentiel<\/strong> pour exploiter pleinement le potentiel du m\u00e9tabarcoding. Les auteurs proposent ainsi de regrouper les 17 faces de chaque structure en cinq cat\u00e9gories structurales<\/strong>, une approche plus op\u00e9rationnelle pour d\u00e9velopper un suivi reproductible et \u00e0 grande \u00e9chelle de la biodiversit\u00e9 marine.<\/p>

\u00c0 lire dans Molecular Ecology Resources<\/em> :<\/strong> Separating Faces in ARMS Metabarcoding Improves Marine Biodiversity Monitoring: A Comparison Across Protocols, Experimental Designs and Photographic Surveys<\/em><\/a><\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t

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