Nathalie Dupuy

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Professeur

Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Écologie Marine et Continentale (IMBE)
UMR IMBE | Aix Marseille Université, CNRS, IRD, Avignon Université

Campus Faculté St Jérôme Av. Escadrille Normandie Niemen F-13397 Marseille cedex 20, France

Coordonnées 04 91 28 85 51
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CV

Déroulement de carrière:
Résumé de carrière

Maître de conférences de 1993 à 2005 à POLYTECH’LILLE
Université des sciences et technologies de Lille
Laboratoire de recherche: LASIR

Maître de conférences de 2005 à 2006 à L’IUT HSE La Ciotat
Université des sciences de Aix-Marseille 2
Laboratoire de recherche: UMR 6171 systèmes chimiques complexes

Professeur depuis 2006 à Université d’ Aix Marseille
2006-2007 Laboratoire de recherche: UMR 6171 systèmes chimiques complexes
2008- 2011 Laboratoire de recherche: UMR 6263 ISM2, Institut des sciences Moleculaires de Marseille, groupe AD²EM
2012- 2016 Laboratoire de recherche: Laboratoire d’Instrumentation et Sciences Analytique EA 4672 Equipe METICA
2016- 2022 Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie marine et continentale UMR 7263

Titres et Diplômes

Licence de chimie Université Paul Sabatier, Toulouse 1988
Maîtrise de Chimie Université Paul Sabatier, Toulouse 1989
DEA Chimie organique et inorganique Université P.Sabatier, Toulouse 1990
Docteur mention Génie Biologique et Médical Université de Lille II 1993
Habilitation à diriger les recherches 1997

Thématiques de recherche

Mon activité est centrée sur les problèmes de traçabilité et de contrôle qualité et sur les problématiques de vieillissements naturels ou simulés.
La traçabilité, processus qui permet de suivre un produit naturel, formulé ou un service depuis sa création jusqu’à sa destruction, est aujourd’hui un enjeu incontournable pour les entreprises. Celles-ci doivent mettre en place des systèmes performants pour identifier les produits défectueux, volontairement ou non. De ce fait, les méthodes analytiques globales comme les méthodes spectroscopiques (proche et moyen infrarouge, fluorescence, Raman) permettent de générer une information rapide sur la qualité des matières premières, le processus de transformation dans la chaîne de production et sur la qualité du produit fini. Le concept de qualité d’un produit inclus généralement le suivi de vieillissement de celui-ci voire son contrôle. En effet la connaissance des processus de vieillissement permet d’optimiser les méthodes de fabrication et de conservation des produits, de comprendre les phénomènes de dégradation et de prévenir la formation de produits de dégradation. Ces problématiques nous ont conduits à développer des méthodologies analytiques originales dans un thème appelé:
Méthodologies avancées pour la spectroscopie et l’analyse chimique. Ce thème rassemble les recherches dans le domaine du traitement des données (chimiométrie), les avancées dans le domaine de la mise au point d’outils simulés de vieillissement (cellules complémentaires liquide-gaz) ainsi que le développement de nouveaux capteurs infrarouge. Ces capteurs ont pour objectif d’être miniaturisés pour des applications in situ ou embarquées (moteurs, chaines de production). Du point de vue du traitement des données ce thème m’a conduit à m’impliquer dans les problématiques multitableaux. En effet pour un même lot d‘échantillons il est facile d’accumuler les données analytiques. Du point de vue du traitement des données, ces données simultanément et non pas technique par technique.

ce thème est un thème transversal puisque les autres thèmes de recherche reposent sur ces avancées méthodologiques.

Le thème vieillissements naturels ou simulés rassemble les projets visant à la compréhension et à la caractérisation des mécanismes de vieillissement des produits naturels (pétrole, huiles végétales) et des produits industriels formulés (polymères multicouches, pesticides ou herbicides). La thèse de F. Gaston, en collaboration avec la société SARTORIUS 2013-2016 a permis de modéliser le vieillissement polymères multicouches soumis à une irradiation gamma. Les résultats obtenus sont extrêmement novateurs car pour la première fois les analyses ont concerné la présence de radicaux (RPE), les matériaux polymériques (IR, Raman), les additifs (GC, HPLC), les tests mécaniques. Les méthodes de résolutions de courbes ont conduit à une meilleure connaissance des procédés de vieillissements afin de mettre en évidence les familles de composés formés ou détruits pendant le processus de vieillissement. Les méthodes multiblock de type ACOMDIM ont permis de montrer l’impact de différents facteurs (doses lots, vieillissement) sur l’évolution des matériaux. Ce thème est actuellement en plein essor puisqu’il a fait l’objet de 8 publications en trois ans et il se poursuit par une thèse financée à nouveau par la société SARTORIUS sur l’impact des rayonnements gamma sur la stabilité des polymères. Sur ce même sujet je suis coordinatrice locale d’un programme européen (Team Cables) horizon H2020 avec le CEA, EDF… Des études ont lieu avec l’IRSN sur l’impact de l’irradiation en présence d’iode sur la stabilité de peintures en utilisant les méthodes multiblock.
Les termes de « métabonomique ou métabolomique » sont aujourd’hui largement utilisés dans le monde scientifique. Ces termes ont été définis précisément par J. Nicholson (1999) puis par O. Fiehn (2001) comme « la mesure quantitative de la réponse multiparamétrique liée au temps d’un système multicellulaire à des stimuli physiopathologiques ou à des modifications génétiques». Cette approche nécessite la mise en place de techniques analytiques telles que l’infrarouge ou la RMN (méthodes d’analyse globales) et des méthodes chromatographiques (méthodes d’analyses séparatives), capables de détecter la variation de la réponse des métabolites présents les échantillons d’origines biologiques. Comme ces données sont complexes, l’utilisation d’analyses statistiques multivariées de type multiblock est indispensable pour l’interprétation de ces données et pour la détermination de marqueurs biologiques potentiels. Au laboratoire l’étude du vieillissement des huiles végétales permet de mettre en évidence que les peroxydes sont les premiers marqueurs à apparaitre alors que les aldéhydes sont des marqueurs d’un vieillissement plus poussé. Les dérivés phénoliques tels que le tyrosol et l’hydroxytyrosol sont des métabolites qui permettent une résistance assez remarquable.
Cette philosophie de travail a été appliquée à la fermentation en milieu solide. Le principe de cette méthode consiste en la croissance de champignons filamenteux pour la production de biomasse ainsi que de métabolites primaires et secondaires sur des matériaux solides préalablement humidifiés. L’eau indispensable à la croissance du microorganisme se trouve absorbée ou complexés à l’intérieur de la matrice solide. Cette matrice, qui sert à la fois de source de nutriments et de support, est envahie par le champignon au cours de sa croissance. La culture en milieu solide a été conçue comme une stimulation de l’habitat naturel de ce groupe de microorganismes, afin de reproduire les conditions de culture les mieux adaptées, et favoriser ainsi le développement de leur activités métabolique. Il s’agit donc d’une croissance en milieu solide et de fait, la FMS est, parmi les différents types de fermentation, la meilleure candidate pour se rapprocher au maximum des conditions naturelles de développement du microorganisme que ce soit concernant la composition du milieu ou le contrôle de paramètres thermodynamiques comme la température ou l’humidité.
Depuis quelques années, suite aux désordres écologiques engendrés par l’utilisation des pesticides (sourtout les problèmes de santé humaines), le marché des biopesticides se développe même s’il ne représente encore que 2 % du marché des produits phytosanitaires. Le contrôle biologique des ravageurs des cultures représente donc une solution alternative pour lutter contre les nuisances. En particulier parmi des champignons filamenteux (Beauveria bassiana, Metarhizium anisopliae, Paecelomyces lilacinus, Trichoderma harzianum) il existe des souches homologuées pour être utilisées en lutte biologique. Des souches de Trichoderma harzianum peuvent produire la 6-pentyl-pyrone (6PP), métabolite secondaire volatile à forte odeur de noix de coco. Ces molécules bioactives, mais également les spores de T.harzianum présentent des potentialités antifongiques intéressantes susceptibles d’être utilisées pour lutter contre des ravageurs des cultures et donc de limiter les apports de pesticides. C’est dans ce contexte que s’est inscrit le projet de thèse de Rayhane Hamrouni qui a consisté à (i) constituer une collection importante de Trichoderma, (ii) sélectionner des souches productrices des 6PP sur des milieux solides sous stress hydrique, (iii) optimiser les conditions des cultures pour la production de grande quantité de métabolites secondaires, (iv) Extraire et caractériser les molécules (v) cribler l’efficacité de ces métabolites contre les champignons phytopathogènes. Les objectifs de ce travail sont multiples et variés : ils vont de l’extraction, purification et caractérisation de ces molécules volatiles (6PP), à la mise au point au laboratoire et au niveau pilote expérimental, des conditions de culture optimales pour la production de spores et de 6PP par les Trichoderma cette partie est actuellement valorisée par 4 publications et se poursuit par un projet intitulé « Nouvelles pratiques pour une agriculture durable: évaluation des effets de biopesticides et biofertilisants pour la viticulture en région SUD PACA ».

Le thème Produits naturels
Les huiles essentielles sont connues pour contenir beaucoup de molécules chirales importantes primordiales pour l’étude du devenir des allergènes. Différentes techniques analytiques telles que la CPG-SM chirale, la CLHP chirale et l’IR-VCD seront mises en œuvre afin d’étudier leurs constituants chiraux. Nous voulons utiliser la chromatographie gazeuse et liquide chirale pour séparer par exemple, les isomères de formule brute C10H16O, comme l’α-thuyone, la β-thuyone, le camphre, la fenchone, le néral, le géranial et la pipéritone, et les énantioméres (+) et (-) du camphre qui sont présents dans certaines huiles essentielles. En chromatographie liquide il existe 1764 phases stationnaires chirales (PSCs) décrites dans la littérature, dont 200 commerciales, d’après la base de données Chirbase. Lors de travaux préliminaires, nous avons criblé plus de 25 PSCs et séparé l’α-thuyone, la β-thuyone et le camphre par chromatographie liquide. Nous avons par exemple obtenu la séparation de ces 3 composés en 6 minutes sur la colonne TCI-chiral CHS. Les chromatogrammes “empreintes chirales” acquis dépendent de la quantité des 3 composés chiraux majoritaires et de leur stéréochimie, puisque les deux énantiomères du camphre peuvent être présents dans les huiles : (+) pour la sauge et (-) pour l’armoise et l’absinthe. Ces méthodes d’investigation des molécules chirales seront complétées par des techniques d’analyses plus classiques (PIR, MIR et Raman). Afin de développer des outils performants, il faut analyser un grand nombre d’échantillons représentatifs de la variabilité de tous les paramètres associés à une HE (procédés de fabrication, stockage, conditionnement, variété, espèce, origine géographique, cueillette, partie de la plante utilisée…). En associant la performance du traitement chimiométrique, la fiabilité, la rapidité des techniques spectroscopiques et le potentiel discriminant de la signature chirale, nous pourrons développer des outils de caractérisation, de contrôle qualité et de traçabilité des HE ce qui a fait l’objet de la thèse de Sofia Lafhal (2015).
La thèse d’A Said (2016) a permis de développer une méthode originale en combinant les spectroscopies IR et VCD avec la LSE (estimation des moindres carrés) sur les spectres IR et VCD des HE brutes d’Artemisia herba alba (AHA), Bubonium graveolens (BG) et Artemisia arborescens (AA) et leurs constituants majoritaires, nous donne accès aux pourcentages relatifs des trois principaux composés chiraux de l’AHA, qui étaient très proches de ceux donnés par la méthode de référence en GC-MS. Ce qui est encore plus intéressant est le fait que cette méthode a pu fournir la forme énantiomérique présente dans l’HE. Ceci peut être lié à la configuration absolue des constituants majeurs chiraux lorsqu’elle est connue. La comparaison entre les spectres IR et VCD analysés et modélisés par notre méthode donne de très bons résultats avec un pourcentage d’erreur très faible qui varie entre 2 et 9 %. Les pourcentages résultant de cette LSE des spectres IR et VCD sont assez similaires, on en déduit que les thujones et le camphre sont présents dans l’HE sous forme d’un seul énantiomère. Réciproquement la comparaison des pourcentages résultant de la LSE des spectres IR et VCD pourrait être utilisée pour détecter une racémisation ou l’origine non naturelle de l’échantillon
Thème environnement
Thème environnement
Le sol constitue un compartiment majeur dans le fonctionnement des écosystèmes, siège du turn-over de la matière organique, processus fonctionnel supportant de nombreux services écosystémiques. Il est notamment susceptible, dans un contexte de changement climatique, de participer aux mécanismes d’atténuation de ces modifications majeures en contribuant au stockage du carbone. Ce potentiel dépend de l’influence de multiples facteurs environnementaux (climat, couvert végétal, substratum géologique, topographie…) et de leurs interactions. Parmi eux, l’usage des terres, passé et présent, ainsi que les pratiques associées (pratiques agricoles, sylvicoles…) jouent un rôle central sur le fonctionnement du sol et les propriétés chimiques et microbiologiques qui en découlent. Mais si l’influence de l’usage des terres (et le changement d’usage) sur la qualité du sol commence à être documentée et spatialisée, peu d’éléments bibliographiques considère l’importance de l’historique des usages sur le fonctionnement actuel du sol. Pour autant, il semble crucial de pouvoir répondre à cette question en reconstruisant la végétation passée- en lien avec l’usage des terres -et son impact sur les structures physico-chimiques du sol puisque celles-ci sont susceptibles de gouverner la productivité et la résilience des écosystèmes face aux nombreux forçages des changements globaux. La matière organique du sol présente une grande variété de molécules, résultantes du type d’occupation des sols, des diversités du couvert végétal et de processus successifs de dégradation et de stabilisation. Il a été montré que la signature chimique de la matière organique peut être caractéristique d’un écosystème, des assemblages forestiers et de leur âge. Elle constitue donc un proxy particulièrement pertinent à cet égard et cette signature chimique autorise une approche intégrant un pas de temps d’une centaine d’années ce qui constitue une échelle temporelle modeste au regard des études paléoenvironnementales intéressant la période de l’Holocène mais tout à fait inédite dans les études pédologiques conventionnelles. Ainsi, l’utilisation de méthodes d’analyses non destructives comme les techniques spectroscopiques (proche et moyen infrarouge, RMN du solide du 13C) permettrait d’appréhender ces signatures et de proposer des modèles prédictifs des usages antérieurs sur la base de la composition chimique de la matière organique des sols. A terme, ce projet permettra donc d’obtenir un outil remarquable, utile dans des champs d’investigation très divers de l’écologie puisqu’il permettra de relier l’histoire du sol avec des proxies ‘actuels’ de biodiversité (comme les diversités du couvert végétal) et de fonctionnement du sol (diversités génétiques et fonctionnelles microbiennes).

Activités d’enseignement

Activité pédagogique

J’enseigne dans un premier lieu la chimie analytique avec des interventions à tous les niveaux. En L2 S3 avec un cours complet de spectroscopie ou nous abordons la rotation, la vibration, la rotation vibration pour les molécules diatomiques. En L2S4 nous abordons les spectres des molécules plus complexes ainsi que les transitions UV, en L3 pro avec un cours d’absorption atomique. En master j’interviens aussi pour un cours d’absorption atomique puis sur un cours de validation de méthodes où je m’intéresse principalement à la métrologie.
Enfin j’enseigne la chimiométrie en M1 environnement et en M2 Chimie
Ensuite je donne plusieurs cours de formulation chimique en L3 cosmétique en L3 Chimie en option puis en M1 en agroalimentaire.
Depuis 2019 je me suis investie dans les projets personnels et professionnels des étudiants pour les L3 en chimie et en génie des procédés. Le but étant d’aider l’étudiant à développer son projet personnel et professionnel post licence.
Les notions d’émulsion et de suspensions sont abordées ainsi que la physico chimie de la formulation (Loi de Juin tension superficielle…) En licence pro cosmétique je supervise la fabrication de rouge à lèvres en TP selon les principes établis en cours de formulation. Plusieurs formules issues d’un plan d’expériences sont réalisées puis les bâtons obtenus sont testés afin d’obtenir une réponse au plan d’expériences. Ce TP est un pont entre deux matières afin de montrer aux étudiants que la science n’est uniquement découpée en modules sans liens les uns avec les autres. Pour les cours en Licence Pro cosmétique et en Master agroalimentaire les étudiants travaillent sur des mini projets et exposent leurs résultats sous forme de présentation orale. Le cours de formulation a été aussi dispensé (2012- 2017) en téléenseignement avec des modules de TD qui illustrent chaque partie.
Enfin depuis 2009 j’enseigne la chimie en DAEU (diplôme d’accès aux études universitaires) cette formation réservée aux adultes en dispensée en formation continue.

Publications

91 results
Article
Blanche Krieguer, Sylvain R A Marque, Samuel Dorey, Fabien Girard, Yelin Ni, Donghui Li, Mark K Murphy, Leonard S Fifield, Nathalie Dupuy
Comparison of effects from gamma, e-beam and X-ray radiation on multilayer polymer films used in biopharmaceutical devices by chemometric treatment of spectroscopic data
Radiation Physics and Chemistry, 2024, 218, ⟨10.1016/j.radphyschem.2024.111607⟩
Article
Blanche Krieguer, Sylvain R A Marque, Samuel Dorey, Nathalie Dupuy, Fabien Girard, Nina Girard‐perier, Florent Kuntz, Nicolas Ludwig
Radical detection and electron‐spin resonance (ESR) monitoring in polymer materials irradiated with gamma and X‐rays: Polyethylene and polypropylene
Journal of Applied Polymer Science, 2024, ⟨10.1002/app.55098⟩
Article
Yelin Ni, Tucker T Bisel, Md Kamrul Hasan, Donghui Li, Witold K Fuchs, Scott K Cooley, Larry Nichols, Matt Pharr, Nathalie Dupuy, Sylvain R A Marque, Mark K Murphy, Suresh D Pillai, Samuel Dorey, Leonard S Fifield
Compatibility of ethylene vinyl acetate (EVA)/ethylene vinyl alcohol (EVOH)/EVA films with gamma, electron-beam, and X-ray irradiation
npj Materials Degradation, 2023, 7, ⟨10.1038/s41529-023-00413-x⟩
Article
Nina Girard-Perier, R A Sylvain, Nathalie Dupuy, Blanche Krieguer, Samuel Dorey
Gamma, E-Beam and X-ray Irradiations on PE/EVOH/PE Multilayer Film: An Industrial Point of View Regarding the Impact on Mechanical Properties
Polymers, 2023, 15, pp.2799. ⟨10.3390/polym15132799⟩
Poster
J.P. Mevy, Bruno Coulomb, Nathalie Dupuy, Isabelle Bombarda, Jean-Claude Raynal
The toxicity of trace metal elements in Downy Oak in Gardanne Mining Basin
The Seventh International Symposium on Environmental Biotechnology and Engineering, May 2023, MARSEILLE, France
Article
Ninon Delcourt, Nathalie Dupuy, Catherine Rébufa, Juliet Abadie, Lisa Foli, Anne‐marie Farnet‐da Silva
Microbial functioning in Mediterranean forest soils: Does land use legacy matter?
Land Degradation and Development, 2023, pp.1-11. ⟨10.1002/ldr.4727⟩
Article
Isaac Yves Lopes de Macêdo, Nathalie Dupuy, Vitor H dos S Brito, Eric de Souza Gil, Giovanna N de M E Silva, Emily K G Moreno, Ivo M Demiate, Marney P Cereda
Modified Cassava Starches’ Identification through Mid-Infrared Spectroscopy and Exploratory Analysis
Analytica, 2023, 4, pp.126 - 140. ⟨10.3390/analytica4020011⟩
Article
Ninon Delcourt, Anne-Marie Farnet-da Silva, C Rebufa, Claude Perissol, Nathalie Dupuy
Does land use legacy matter for current soil functioning? A bibliometric study (2001–2020)
Environmental Reviews -Ottawa- National Research Council, 2023, 31 (1), pp.168-181. ⟨10.1139/er-2021-0128⟩
Book section
Nathalie Dupuy, Ivo Mottin Demiate
Exploring the scientific interest for starch origin in South America from 2000 to 2020: Focus on non-destructive analytical methods
Marney Pascoli Cereda; Olivier François Vilpoux. Starchy Crops Morphology, Extraction, Properties and Applications, Vol 1, Elsevier, pp.289-304, 2023, Underground Starchy Crops of South American Origin: Production, Processing, Utilization and Economic Perspectives, 9780323900584. ⟨10.1016/B978-0-323-90058-4.00016-5⟩
Article
Ninon Delcourt, Anne-Marie Farnet-da Silva, Catherine Rébufa, Lisa Foli, Nathalie Dupuy
Land use legacy footprint in Mediterranean forest soils: An infrared spectroscopy approach
Geoderma, 2023, 430, pp.116299. ⟨10.1016/j.geoderma.2022.116299⟩
Article
Ninon Delcourt, Nathalie Dupuy, Catherine Rébufa, Adriane Aupic-Samain, Lisa Foli, Anne-Marie Farnet-da Silva
Rapid Assessment of Land Use Legacy Effect on Forest Soils: A Case Study on Microarthropods Used as Indicators in Mediterranean Post-Agricultural Forests
Forests, 2023, 14 (11), pp.2223. ⟨10.3390/f14112223⟩
Article
Rayhane Hamrouni, Flor Regus, Magalie Claeys-Bruno, Anne-Marie Farnet da Silva, Thierry Orsière, Isabelle Laffont-Schwob, Jean-Luc Boudenne, Nathalie Dupuy
Plan d'expériences statistiques comme nouvelle approche pour optimiser un substrat de fermentation à l'tat solide pour la production de spores et de composés bioactifs à partir de Trichoderma asperellum
Journal of Fungi, 2023, 9 (11), pp.1123. ⟨10.3390/jof9111123⟩
Article
Fanny Gaston, Nathalie Dupuy, Nina Girard‐perier, Sylvain R A Marque, Samuel Dorey
Comprehensive investigation on physical and chemical properties of γ‐irradiated multilayer PE/EVOH/PE film: A multiscale approach
Applied Research, 2023, 2 (3), pp.e202200065. ⟨10.1002/appl.202200065⟩
Poster
Myriam Moreno, Jean-Marc Limousin, Guillaume Simioni, Julien Ruffault, Elena Ormeño, Jesus Rodriguez-Calcerrada, Jean-Marc Ourcival, Jose Manuel Torres Ruiz, Hervé H. Cochard, Jean-Luc Dupuy, François Pimont, Catherine Fernandez, Jean-Philippe Orts, Améli Tournant, Pierre-Jean Dumas, Sylvain Delzon, Nicolas Martin-StPaul
Multiple hydraulic traits plasticity to drought : influence on whole plant functioning
5th Xylem International Meeting, Sep 2022, Würzburg, Germany
Article
Lea Hippolyte, Sandrine Amat, Nathalie Dupuy, Muriel Ferry
Radio-Oxidation Ageing of XLPE Containing Different Additives and Filler: Principal Component Analyses of Gases Emission and Consumption
Polymers, 2022, 14 (18), pp.3810. ⟨10.3390/polym14183810⟩
Article
Marie Ampères Bedine Boat, Nadira Taïeb, Sofia Agriopoulou, L Miche, Davy Moussango, Modeste Lambert Sameza, Nathalie Dupuy, Sevastianos Roussos, Fabrice Fekam Boyom
Identification of native soil-derived Trichoderma spp. isolates and analysis of their antagonist traits against Lasiodiplodia theobromae causing stem-end rot in papaya
Archives of Phytopathology and Plant Protection, 2022, 55 (15), pp.1766-1794. ⟨10.1080/03235408.2022.2116689⟩
Article
Simone Vincenzo Suraci, Sandrine Amat, Lea Hippolyte, Astrid Maléchaux, Davide Fabiani, Claire Le Gall, Océane Juan, Nathalie Dupuy
Ageing evaluation of cable insulations subjected to radiation ageing: Application of principal component analyses to Fourier Transform Infra‐Red and dielectric spectroscopy
High Voltage, 2022, 7 (4), pp.652-665. ⟨10.1049/hve2.12239⟩
Article
Nina Girard-Perier, Magalie Claeys-Bruno, Sylvain R.A. Marque, Nathalie Dupuy, Fanny Gaston, Samuel Dorey
Monitoring of peroxide in gamma irradiated PE/EVOH/PE multilayer film using methionine probe
Food and Bioproducts Processing, 2022, 132, pp.226 - 232. ⟨10.1016/j.fbp.2022.02.001⟩
Article
Nina Girard-Perier, Sylvain R A Marque, Nathalie Dupuy, Magalie Claeys-Bruno, Fanny Gaston, Samuel Dorey, Leonard S Fifield, Yelin Ni, Donghui Li, Witold K Fuchs, Mark K Murphy, Suresh D Pillai, Matt Pharr, Larry Nichols
Effects of X-Rays, Electron Beam, and Gamma Irradiation on Chemical and Physical Properties of EVA Multilayer Films
Frontiers in Chemistry, 2022, 10, pp.888285. ⟨10.3389/fchem.2022.888285⟩
Article
Nina Girard-Perier, Samuel Dorey, Fanny Gaston, Fabien Girard, Sylvain R.A. Marque, Nathalie Dupuy
One-year ageing FTIR monitoring of PE/EVOH/PE film after gamma or electron beam irradiation
Polymer Degradation and Stability, 2022, 195, pp.109790. ⟨10.1016/j.polymdegradstab.2021.109790⟩
Article
Nathalie Dupuy, R Sylvain, Leonard Marque, Matt Fifield, David Pharr, Suresh Staack, Larry Pillai, Mark Nichols, Samuel Murphy
Supplementing Gamma Sterilization with X-Ray and E-Beam Technologies An International Industry and Academia Collaboration
BioProcess international, 2022, 20, pp.3
Article
Rayhane Hamrouni, Nathalie Dupuy, Alina Karachurina, Gregoria Mitropoulou, Yiannis Kourkoutas, Josiane Molinet, Ynoussa Maiga, Sevastianos Roussos
Biotechnological potential of Zymotis‐2 bioreactor for the cultivation of filamentous fungi
Biotechnology Journal, 2022, 17, pp.2100288. ⟨10.1002/biot.202100288⟩
Article
Flor Regus, Isabelle Laffont-Schwob, Rayhane Hamrouni, Nathalie Dupuy, Anne-Marie Farnet da Silva
Using bibliometrics to analyze the state of art of pesticide use in vineyard agrosystems: a review
Environmental Science and Pollution Research, 2022, ⟨10.1007/s11356-022-23285-1⟩
Article
Nina Girard-Perier, Magalie Claeys-Bruno, Sylvain Marque, Nathalie Dupuy, Fanny Gaston, Samuel Dorey
Effects of X-ray, electron beam and gamma irradiation on PE/EVOH/PE multilayer film properties
Chemical Communications, 2021, 57 (84), pp.11049-11051. ⟨10.1039/d1cc02871e⟩
Article
Catherine Rébufa, N. Dupuy, Isabelle Bombarda
AComDim highlighting of agroclimatic factors influencing the Moringa oleifera Lam. leaf’s composition
Vibrational Spectroscopy, 2021, 116, pp.103297. ⟨10.1016/j.vibspec.2021.103297⟩
Article
Astrid Maléchaux, Juliette Colombani, Sandrine Amat, Sylvain R A Marque, Nathalie Dupuy
Influence of Gamma Irradiation on Electric Cables Models: Study of Additive Effects by Mid-Infrared Spectroscopy
Polymers, 2021, 13 (9), pp.1451. ⟨10.3390/polym13091451⟩
Article
Astrid Maléchaux, Raquel Garcia, Yveline Le Dréau, Arona Pires, Nathalie Dupuy, Maria Joao Cabrita
Chemometric Discrimination of the Varietal Origin of Extra Virgin Olive Oils: Usefulness of 13C Distortionless Enhancement by Polarization Transfer Pulse Sequence and 1H Nuclear Magnetic Resonance Data and Effectiveness of Fusion with Mid-Infrared Spectroscopy Data
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2021, 69 (14), pp.4177-4190. ⟨10.1021/acs.jafc.0c06594⟩
Article
Elodie Mezzatesta, Nathalie Dupuy, Carole Mathe
Evaluation of a characterization method of Egyptian human mummy balms by chemometric treatments of infrared data
Talanta, 2021, 225, pp.121949. ⟨10.1016/j.talanta.2020.121949⟩
Article
Sofia Agriopoulou, Maria Tarapoulouzi, Marie Ampères Bedine Boat, Catherine Rébufa, Nathalie Dupuy, Charis R Theocharis, Theodoros Varzakas, Sevastianos Roussos, Jacques Artaud
Authentication and Chemometric Discrimination of Six Greek PDO Table Olive Varieties through Morphological Characteristics of Their Stones
Foods, 2021, 10 (8), pp.1829. ⟨10.3390/foods10081829⟩
Article
Astrid Maléchaux, Isabelle Giffard, Nathalie Dupuy, Isabelle Bombarda
Rapid disease diagnostic of Nerium oleander L. leaves by visible and near infrared spectroscopies
Ecologia mediterranea, 2021, 47 (1), pp.79-85. ⟨10.3406/ecmed.2021.2121⟩

Communications orales

Communications orales

2018
1. A. Maléchaux, R. Korifi, S. Laroussi, Y. Le Dréau, J. Artaud, N. Dupuy, Varietal origin discrimination of three Tunisian virgin olive oils by multiblock partial least squares- discriminant analysis, CAC 2018, Halifax Canada, 25-29 Juin

2. A. Maléchaux, Y. Le Dréau, M. J. Cabrita, J. Artaud, N. Dupuy, Discrimination variétale des huiles d’olive vierges extra – effet terroir Rencontre de l’association Helio-SPIR (Réseau Scientifique en Spectroscopie Proche InfraRouge) Le 28 Novembre 2018 à Montpellier

3. S. Dorey, N. Dupuy, S. Marque; N. Girard, Dr F. Gaston, I. Pahl, R. Menzel, A.Hauk
pH evolution in solution after contact with multilayer films after different γ-irradiation doses and thus reconciliation of pH and TOC with carboxylic acids detected by ion chromatography, Single-Use Technologies III | 23-26 Septembre 2018 , Snowbird, Utah

4. H. Lakhtar, B. Kharbouch, S. Roussos, S. Amat, N. Dupuy, A. El Mousadik Pilot scale feasibility of vermicomposting process to reduce toxicity of olive by-products using eisenia Andrei earthworms, Olivebioteq 15-19 Octobre 2018 Seville Espagne, Book of Abstracts ref. T11-O3 p.53.

2017
1. S. Dorey, F.Gaston N.Dupuy, S.Marque, Influence of γ-irradiation on biopharmaceutical films, Single-use Technologies II: Bridging Polymer Science to Biotechnology Applications May 7-10, 2017, Tomar, Portugal

2. B. Kharbouch, H. Lakhtar, S. Amat, S. Roussos, C Perissol, S. Criquet, N. Dupuy, A. El Mousadik, Nutrient recovery from olive by-products through vermicomposting with Eisenia Andrei, 15th International Conference on Environmental Science and Technology 31st August - 2nd September 2017, Rhodes, Greece

3. B. Kharbouch, H. Lakhtar, S. Amat, S. Roussos, C Perissol, S. Criquet, N. Dupuy, A. El Mousadik, Effect of thermophilic pre-composting of olive by-products on reproduction and growth of earthworms Eisenia Andrei, 15th International Conference on Environmental Science and Technology 31st August - 2nd September 2017, Rhodes, Greece

4. R. Hamrouni, Q. Carboue, I.Bombarda, J. Molinet , M. Neifar, N. Dupuy , A. Masmoudi , S. Roussos, Production of naphtho-gamma-pyrones by Aspergillus niger in Solid–State Fermentation, 15th International Conference on Environmental Science and Technology 31st August - 2nd September 2017, Rhodes, Greece.

5. A. Maléchaux, Y. Le Dréau, M. J. Cabrita, J. Artaud, N. Dupuy, Discrimination variétale des huiles d’olive vierges extra – effet terroir, Rencontre de l’association Helio-SPIR (Réseau Scientifique en Spectroscopie Proche InfraRouge) Le 28 Novembre 2017 à Montpellier

6. B. Kharbouch, H. Lakhtar, S. Amat, S. Roussos, N. Dupuy, A. El Mousadik, Traitement et valorisation des déchets organiques par compostage et vermicompostage., Sommet Climate Chance 2017, sommet mondiale du climat, 11-13 Septembre 2017, Agadir, Maroc.

7. B. Kharbouch, H. Lakhtar, S. Amat, S. Roussos, N. Dupuy, A. El Mousadik Effect of acclimatization on earthworm’s (Eisenia andrei) potential on olive mille wastewaters detoxification, CFP “Springer Euro-Mediterranean Conference for Environmental Integration” EMCEI-2017, 22-25 Novembre 2017, Sousse, Tunisie.

2016
1. S. Amat, N. Dupuy, Chemometric treatment on γ-irradiated data, Workshop “Cables ageing in nuclear power plants” ÚJV Řež, Czech Republic 24-25 Mai 2016

2. B. Kharbouch, H. Lakhtar, S. Roussos, N. Dupuy, S. Amat, A. El Mousadik, Compostage des sous-produits oléicoles, 4ème édition de l’école recherche: Changement Climatique, Biodiversité & Biotechnologies au Service de la Société, 31 Mai 1-2 Juin 2016, faculté des sciences Agadir, Maroc.

3. B. Kharbouch, N. Dupuy, H. Lakhtar, S. Roussos, S. Amat, A. El Mousadik, Traitement et valorisation des sous-produits oléicoles par lombricompostage, 24-28 Octobre 2016, Sfecologie: International Conference on Ecological Sciences, Marseille, France.

4. B. Kharbouch, H. Lakhtar, S. Roussos, N. Dupuy, S. Amat, A. El Mousadik, Vermicompostage des sous-produits oléicoles , 1ème édition du colloque international : « Environnement 2016: Eco-procédés, Traitement et/ou Valorisation des Déchets et des Effluents pour un Environnement Durable », 17-19 Février 2016 à la Faculté des Sciences d’El Jadida, Université Chouaib Doukkali, Maroc.

Communications par affiche

2016
1. M. E. A. Said, P. Vanloot, I. Bombarda, J. V. Naubron, N. Dupuy, C. Roussel Vibrational circulaire dichrroism (VCD) and least square estimation (LSE) applied to Artemisia Arborescens essential oil.Séminaire International des Biotechnologies appliquées à l’agriculture, la santé et l’environnement. Khenchela, Algerie 17-19 Avril 2016

2. M. E. A. Said, P. Vanloot, I. Bombarda, J. V. Naubron, N. Dupuy, C. Roussel, Essential oil VCD spectra, modelisation using terpenes VCD spectral data base and LSE. CAC Barcelone, 6-11 Juin 2016

3. Y Le Dréau, Y. Yang, J. Costa, J. Paolini, N. Dupuy, Discrimination of Corsican honeys by FTIR spectroscopy and chemometrics, CAC Barcelone, 6-11 Juin 2016.

4. E. Chauvet, N. Dupuy, S. Amat, C. Duffieux, J. Colombani, ACOMDIM study of iodine-paint interactions after gamma irradiation by Raman spectroscopy, CAC Barcelone, 6-11 Juin 2016.

5. M. E. A. Said, P. Vanloot, I. Bombarda, J. V. Naubron, N. Dupuy, C. Roussel Vibrational circulaire dichrroism (VCD) and least square estimation (LSE) applied to Bubonium graveolens essential oil. CAC 2016 Barcelone, 6-11 Juin

6. J. Molinet, M. Claeys-Bruno, N. Dupuy, J. Kister, M. Sergent, Optimization and classification of natural products by chemometric method. Analysis of gas chromatographic data of essential oils of Indonesia Myristica fragans Houtt. Joint Natural Products Conference Copenhagen, 24-27 Juillet 2016

7. C. Rebufa, A.M. Farnet, N. Dupuy, E. Ferré, Infrared Spectroscopy as a useful tool to assess water availability in litters. Sfecologie Marseille 24-28 Octobre 2016.

2017
1. R. Hamrouni, J. Molinet, N. Dupuy, A. Masmoudi, S. Roussos,Trichoderma harzianum spore and 6 pentyl alpha pyrone production in Solid State fermentation and use as biological control agent, 15th International Conference on Environmental Science and Technology 31st August - 2nd September 2017, Rhodes, Greece

2. R. Hamrouni, J. Molinet, M. Claeys-Bruno, N. Dupuy, A. Masmoudi, S. Roussos, Optimization of 6-pentyl-alpha-pyrone, lytic enzymes, and spores production by Trichoderma harzianum in solid state culture, Chimiométrie 2018, 30-31 Janvier 2018 Paris

Responsabilités administratives et d’enseignement

Responsabilités administratives.
2013-2020 Responsable administrative et pédagogique du DAEU (Diplôme d’accès aux études universitaires) sur le site de l’étoile. Effectifs 40-50 stagiaires, 2 options scientifique et littéraire. (Responsabilité du recrutement, du déroulement de l’année, de la tenue des épreuves intermédiaires). Comme cette formation s’adresse à un public très défavorisé et déscolarisé depuis longtemps, j’organise régulièrement des réunions de travail avec les enseignants afin d’optimiser l’apprentissage des savoirs.
Nous privilégions les cours/TD avec beaucoup d’exercices.
2012-2022 Coordonnatrice de l’UE spectroscopie (UE43C) Site de Montperrin (Aix en Provence)
2012-2022 Responsable des UE Chimiometrie (Master SET) et Formulation (Licence pro Cosmétique)

Co-responsable du DESS Formulation (2003-2004) puis du parcours Formulation dans le Master prochimie dirigé par le Pr Galy (2004-2005).

2005-2006 Responsable de la licence Pro, Coordonnateur Santé et Sécurité au travail et évaluation des risques (IUT HSE La Ciotat)

Encadrements et coencadrements de thèses et production scientifique associée:

1. L. Duponchel, soutenue en Octobre 1997 (Thèse Cifre) sous le titre :
« Mise au point d’un analyseur de lait »

N. Dupuy, L. Duponchel, B. Amram, J. P. Huvenne, P. Legrand, Quantitative analysis of latex in coating papers by ATR- FTIR spectroscopy. Journal of Chemometrics 333, 8 (1994) IF= ?
N. Dupuy, L. Duponchel, J. P. Huvenne, P. Legrand, Classification of green coffees by FTIR analysis of dry extract. Applied spectroscopy 49, 5 (1995) IF= ?
N. Dupuy, L. Duponchel, J. P. Huvenne, B. Sombret, P. Legrand, Classification of edible fats and oils by principal component analysis of FT-IR spectra. Food Chemistry 57, 245 ( 1996). IF= ?
N. Dupuy, C. Ruckebusch, L. Duponchel, P. Beurdeley-Saudou, B. Amram, J. P. Huvenne, P. Legrand, Quantitative determination of polymer and mineral content in paper coatings by infrared spectroscopy. Improvement by non linear treatments. Analytical Chimica Acta 335, 79 (1996) IF= ?

2. C. Wojciechowski, (Thèse Cifre) soutenue le 27 Mai 1998 à l’université des Sciences et Technologies de Lille sous le titre : «Méthodes avancées et intelligence artificielle pour l’analyse et la caractérisation de matières premières»
C. Wojciechowski, N. Dupuy, C D Ta, J P Huvenne, P. Legrand, Quantitative analysis of water-solubles vitamins by ATR/FTIR spectroscopy. Food Chemistry 63, 133 (1998), IF=1.917
N. Dupuy, C. Wojciechowski, C. D.Ta, J. P. Huvenne, P. Legrand, Mid-infrared spectroscopy and chemometrics on corn starch classification. J. Mol. Struct. 410, 551 (1997) IF= 0.884
F. Vandeerstraeten, C. Wojciechowski, N. Dupuy et J. P. Huvenne, Reconnaissance de l’origine et des modifications d’amidons par traitement chimiométrique des données spectrales. Analusis Novembre 26, 54 (1998), IF= 0.550
N. Dupuy, C. Wojciechowski, J. P. Huvenne, Quantitative analysis of trans edible fats by Fourier Transform infrared spectroscopy from raw materials to finished products. Science des Aliments, 6, 677 (1999)

3. I M. Demiate, doctorant brésilien, encadrement dans le cadre d’un transfert de connaissance France-Brésil du 1/09/98 au 10/01/99. «Baking property of modified cassava starches studied by infrared spectroscopy and chemometrics»

M. Demiate, N. Dupuy, J. P. Huvenne, M. P. Cereda, G. Wosiacki, Relationship between baking behavior of modified cassava starches and starch chemical structure determined by FTIR spectroscopy. Carbohydrate Polymers, 42, 2, 149 (2000), IF=1.184

4. C. Macron, (Thèse Cifre) soutenue le 28 Mars 2000 à l’université des Sciences et Technologies de Lille sous le titre :
«Suivi en ligne d’une polymérisation radicalaire en émulsion par spectroscopie Raman-TF et chimiométrie»

C. Bauer, B. Amram, M. Agnely, D. Charmot, J. Sawatzki, N. Dupuy, J. P. Huvenne, On-line monitoring of a latex emulsion polymerization by fiber optic FT-Raman spectroscopy : I. Calibration. Applied spectroscopy 54, 4, 528 (2000), IF=1.948

5. N. Vicentini, doctorant brésilien, encadrement dans le cadre d’un transfert de connaissance France-Brésil du 27/02/02 au 28/05/02.
« Etude spectroscopique de polymères d’amidon biodégradables »
N.M. Vicentini, N. Dupuy, M. Leitzelman, M.P. Cereda , P.J.A. Sobral, Prediction of cassava starch edible film properties by chemometric analysis of infrared spectra. Spectroscopic Letters 38, 749-767 (2005). IF= 0.767

6. S. Chavez, (Thèse école des mines d’Albi) soutenue le 30 Avril 2004 à l’université de Perpignan sous le titre :
« Séchage par contact avec agitation de boues résiduaires urbaines: influence de leur origine et des conditions opératoires sur la cinétique de séchage et les caractéristiques des boues sèches et des rejets gazeux »
J. H. Ferrasse, S. Chavez, N. Dupuy, Chemometrics as a tool for the analysis of evolved gas during thermal treatment of sewage sludge using coupled TG-FTIR. Thermochimica Acta , 404, 97-108, (2003). IF= 0.956

7. Oswin Galtier (Thèse MESR) soutenue le 2 décembre 2008
« Application des méthodes spectroscopiques à la détermination de l’origine des olives et des huiles d’olive produites en région PACA. »

O. Galtier, N. Dupuy, Y. Le Dréau, D. Ollivier, C. Pinatel, J. Kister, J. Artaud, Geographic origins and compositions of virgin olive oils determinated by chemometric analysis of NIR spectra. Analytica Chimica Acta, 595, 1-2, 136-144 (2007) IF=3.186
O. Galtier, N. Dupuy, Y. Le Dréau, D. Ollivier, J. Kister, J. Artaud, Lipid compositions and French registered designations of origins of virgin olive oils predicted by chemometric analysis of mid-infrared spectra. Applied spectroscopy 62(5) 583-890, 2008, IF=2.062
O. Galtier, O. Abbas, Y. Le Dréau, C. Rebufa, J. Kister, J. Artaud, N. Dupuy, Comparison of PLS1-DA, PLS2-DA, and SIMCA for classification by origin of crude petroleum oils by MIR and virgin olive oils by NIR for different spectral regions. Vibrational Spectroscopy 55, 2011 132-40, IF=1.650
N. Dupuy, O. Galtier, D. Ollivier, P. Vanloot , J. Artaud, Comparison between NIR, MIR, concatenated NIR and MIR analysis and hierarchical PLS model. Application to virgin olive oil analysis. Analytica Chimica Acta, 666, 2010, 23–31, IF=4.311
O. Galtier Y. Le Dréau, D. Ollivier, C. Pinatel, J. Kister, J. Artaud, N. Dupuy, Chemometric analysis of combined NIR and MIR spectra to the determination of compositions and varietal origins of French olive fruits, Eur. J. Lipid Sci. Technol. 2010, 112, 463–475, IF=1.487

8. Sandrine Tosello (Thèse Cifre) soutenue le 7 juillet 2010
« Développement d’une méthodologie de validation et de comparaison d’analyseurs spectrométriques proche infrarouge »

S. Amat, N. Dupuy, J. Kister, D. N Rutledge, Development of Near Infrared sensors: Detection of influential factors by the AComDim method. Analytica Chimica Acta, 675, 2010 16–23, IF=4.311
S. Amat Tosello, N. Dupuy, J. Kister, Contribution of External Parameter Orthogonalisation For calibration transfer in Short Waves –Near Infrared Spectroscopy Application to gasoline quality. Analytica Chimica Acta ,642, 2009 6-11, IF=3.757

9. Vincent Gaydou (Contrat PSA) soutenue le 10 décembre 2010
“Développement des méthodes multitableaux pour les spectroscopies proche et moyen infrarouge. Application aux carburants et aux huiles essentielles de lavande”

Y. Le Dréau, V. Gaydou, J. Joachim, J. Kister, N. Dupuy. Study of jojoba oil ageing by IRTF. Analytica chimica acta 642, (2009) 163-170 , IF=3.757
N Dupuy, V Gaydou, J Kister, Quantitative Analysis of Lavender (Lavandula angustifolia) Essential Oil Using Multiblock Data from Infrared Spectroscopy. American Journal of Analytical Chemistry 5 (10), 2014, 633

10. F.Aouidi (co-tutelle Tunisie soutenue le 8 Février 2012 “Etude et valorisation des feuilles d’olivier Olea Europaea dans l’industrie Agro-Alimentaire”.
F. Aouidi, N. Dupuy, J. Artaud, S. Roussos, M.Msallem, I. Perraud Gaime, M. Hamdi, Rapid quantitative determination of oleuropein in olive leaves (Olea europaea) using mid-infrared spectroscopy combined with chemometric analyses. Industrial Crops and Products, 37, 2012, 292-297, IF=2.468
F. Aouidi , N. Dupuy, J. Artaud, S. Roussos, M. Msallem,I Perraud-Gaime, M. Hamdi, Discrimination of five Tunisian cultivars by Mid InfraRed spectroscopy combined with chemometric analyses of olive Olea europaea leaves. Food Chemistry 131, 2012, 360–366, IF=3.334

11. A. Traboulsi Soutenue le 12 Janvier 2012 (Thèse CEA)
"Radiolise gamma et lixiviation post irradiation de résine echangeuses d’ions: Etude de l’influence des conditions d’irradiation sur les mécanismes de radiolyse et analyse des composés générés dans les conditions de lixiviation représentatives de sites de stockages.

Traboulsi, N. Dupuy, C. Rebufa, M. Sergent, V. Labed, Investigation of gamma radiation effect on the anion exchange resin Amberlite IRA-400 in hydroxide form by Fourier transformed infrared and 13C nuclear magnetic resonance spectroscopies, Analytica Chimica Acta, 717, 2012, 110-121, IF=4.387
Traboulsi, V. Labed, V. Dauvois, N. Dupuy, C. Rébufa, Gamma radiation effect on gas production in anion exchange resins. Nuclear Instruments and Methods in Physics Research B 312 (2013) 7–14, IF=1.186
C. Rébufa, A. Traboulsi, V. Labed, N. Dupuy, M. Sergent, Experimental design approach for identification of the factors influencing the γ-radiolysis of ion exchange resins. Radiation Physics and Chemistry, 106, 2015, 223–234, IF=1.207

12. R. Korifi Soutenue le 29 Mai 2013 (Thèse CIFRE)
Développement de nouvelles MEthodologies de Traitement des Signaux Analytiques : application aux signaux chromatographiques et spectroscopiques. Analyse des mélanges complexes (METSA).

R. Korifi, Y. Le Dréau, J. Molinet, J. Artaud, N. Dupuy, Composition and authentication of virgin olive oil from French PDO regions by chemometric treatment of Raman spectra. Journal of Raman spectroscopy 42, 2011, 1540–1547, IF=3.087
R. Korifi, Y. Le Dréau, J. F. Antinelli, R. Valls, N. Dupuy, CIEL*a*b* color space predictive models for colorimetry devices – Analysis of perfume quality. Talanta 104, 2013, 58-66, IF=3.511
R. Korifi, Y. Le Dréau, N. Dupuy, Comparative study of alignment method on experimental and simulated chromatographic data, Journal of Separation Science 37, 22, 2014, 3276-91, IF=2.737
R. Korifi, J. Plard, Y. Le Dréau, C. Rébufa, D.N. Rutledge, N. Dupuy, Highlighting metabolic indicators of olive oil during storage by the AComDim method. Food Chemistry, 203, 2016, 104-116, IF=4.529

13. J. Plard Soutenue le 17 Janvier 2014 (Thèse MERS)
Apport de la chimiométrie et des plans d’expériences pour l’évaluation de la qualité de l’huile d’olive au cours de différents processus de vieillissement.

R. Korifi, J. Plard, Y. Le Dréau, C. Rébufa, D.N. Rutledge, N. Dupuy, Highlighting metabolic indicators of olive oil during storage by the AComDim method. Food Chemistry, 203, 2016, 104-116, IF=4.529
J. Plard, Y. Le Dréau, C. Rébufa, N. Dupuy, Comparative Study of the Effects of Thermal and Photochemical Accelerated Oxidations on Quality of “Green Type” and “Black Type” French Olive Oils. American Journal of Analytical Chemistry, 7, 2016, 890-907

14. Z. Braham Soutenue le 13 Mars 2014 (Thèse FUI AirClair)
Caractérisation et vieillissements de produits pétroliers par traitement chimiométrique et développement spectral.

N. Dupuy, Z. Braham, S. Amat, J. Kister, Near-Infrared Spectroscopy Analysis of Heavy Fuel Oils Using a New Diffusing Support. Applied spectroscopy 2015 69 (10) 1137-43, IF=1.798
S. Amat, Z. Braham; Y.Le Dréau,. J. Kister, N. Dupuy, Simulated aging of lubricant oils by chemometric treatment of infrared spectra. Potential antioxidant properties of sulfur structures. Talanta, 107, 2013, 219-224, IF=3.511

15. Lafhal Sofia Soutenue le 8 Décembre 2015 (Thèse: Contrat Doctoral)
Caractérisation, traçabilité et contrôle qualité des huiles essentielles de lavandes et de lavandins ; apports des signatures chromatographiques et spectroscopiques.

S. Lafhal, P. Vanloot, I.Bombarda, J. Kister, N. Dupuy, Chemometric analysis of French lavender and lavandin essential oils by near infrared spectroscopy. Industrial Crops and Products, 80, 2016 156–164, IF=3.181
S. Lafhal, P. Vanloot, I. Bombarda, J. Kister, N. Dupuy, Identification of metabolomic markers of lavender and lavandin essential oils using Mid-infrared (MIR) spectroscopy. Vibrational Spectroscopy, 80, 2016, 79-90, IF=1.740
S. Lafhal, P. Vanloot, I. Bombarda,R. Valls, J. Kister , N. Dupuy, Raman spectroscopy for identification and quantification analysis of essential oil varieties: a multivariate approach applied to lavender and lavandin essential oils
Journal of Raman spectroscopy, 2015 46 (10) 577-585, IF=2.395

16. Mohammed El Amin Said Soutenue le 22 Février 2016 (Thèse Financement Campus France) Contribution des méthodes chiroptiques à l’analyse et à la caractérisation, des huiles essentielles.

M. El-Amin Said, P. Vanloot, I. Bombarda, J.V.Naubron, E. M. Dahmane; A. Aamouche, M. Jean, N. Vanthuyne, N. Dupuy C. Roussel , Analysis of the major chiral compounds of Artemisia herba-alba essential oils using reconstructed Vibrational Circular Dichroism spectra: en route to a chiroptical signature. Analytica Chimica Acta, 903, 2016 121–130, IF=4.950
M. El Amin Said, M. Militello, S. Saia, L. Settanni, A. Aleo, C. Mammina, P. I. Bombarda, C. Roussel, N. Dupuy, Artemisia arborescens essential oil composition, enantiomeric distribution and antimicrobial activity from different wild populations from the Mediterranean Area. Chemistry and Biodiversity, 13, 2016, 1095 – 1102, IF=1.440
M. El-Amin Said, I. Bombarda, J.V. Naubron, P. Vanloot, M. Jean, A. Cheriti, N. Dupuy, C. Roussel. Isolation of the major chiral compounds from Bubonium graveolens essential oil by HPLC and absolute configuration determination by VCD. Chirality 2017 29, 70- 79, IF=1.833

17. F. Gaston Soutenue le 31 Mars 2016 (Thèse Financement Sartorius)
Impact des rayonnements γ sur les films plastiques utilisés pour des applications biopharmaceutiques et biotechnologiques
.

G. Audran, S. Dorey, N. Dupuy, F. Gaston, S. R. A. Marque, Degradation of -irradiated polyethylene-ethylene vinyl alcohol-polyethylene multilayer films: an ESR study. Polymer Degradation and Stability 122, 2015, 169-179. IF=3.120
F. Gaston, N. Dupuy, S. R.A. Marque, M. Barbaroux, S. Dorey, One year monitoring by FTIR of -irradiated multilayer film PE/EVOH/PE. Radiation Physics and Chemistry, 125,2016 ,115-121, IF=1.315
F. Gaston, N. Dupuy, S. R.A. Marque, M. Barbaroux, S. Dorey, FTIR study of ageing of γ-irradiated biopharmaceutical EVA based film. Polymer Degradation and Stability, 129, 2016, 19-25, IF=3.386
F. Gaston, N. Dupuy, S. R.A. Marque, M. Barbaroux, S. Dorey, Impact of γ-irradiation, ageing and their interactions on multilayer films followed by AComDim. Analytica Chimica Acta, 981, 2017, 11-23, IF=5.123
S. Dorey F. Gaston, S. R.A. Marque, B. Bortolotti, N. Dupuy, XPS analysis of PE and EVA samples irradiated at different γ-doses. Applied Surface Science 427 (2018) 966–972 doi.org/10.1016/j.apsusc.2017.09.00, IF=4.439
F.Gaston, N. Dupuy, S. R.A. Marque, D.Gigmes, S. Dorey, Monitoring of the discoloration on γ-irradiated PE and EVA films to evaluate antioxidant stability. Journal of Applied Polymer Science 135, (2018), DOI:10.1002/app.46114, IF=2.588
S. Dorey, F. Gaston, N. Dupuy, M. Barbaroux, S. RA Marque, Reconciliation of pH, conductivity, total organic carbon with carboxylic acids detected by ion chromatography in solution after contact with multilayer films after γ-irradiation. European Journal of Pharmaceutical Sciences 117, (2018), 216-226, IF=3.466
F. Gaston, N. Dupuy, S. R.A. Marque, S. Dorey, Evaluation of multilayer film stability by Raman spectroscopy after gamma-irradiation sterilization process. Vibrational Spectroscopy 96 (2018) 52–59, IF=1.363

18. B. Karbouch Soutenue le 17 Avril 2018 (Cotutelle Maroc Financement TOUBKAL) Etude comparative de valorisation des déchets oléicoles par compostage et vermicompostage

Effect of Acclimatization on Earthworm’s (Eisenia Andrei) Potential on Olive Mill Wastewaters Detoxification. B. Kharbouch, H. Lakhtar, S. Amat, S. Roussos, N. Dupuy, A. E. Mousadik. (2018) In: Kallel A., Ksibi M., Ben Dhia H., Khélifi N. (eds) Recent Advances in Environmental Science from the Euro-Mediterranean and Surrounding Regions. EMCEI 2017. Advances in Science, Technology & Innovation (IEREK Interdisciplinary Series for Sustainable Development). Springer, Cham.

19. R. Hamrouni Soutenue le 23 Juillet 2019 (Cotutelle Tunisie) Physiologie de croissance et métabolisme des Trichoderma harzianum cultivés en milieux solides sous stress hydrique : Production et caractérisation des métabolites

R. Hamrouni, J. Molinet, L. Miché, Q. Carboué, N. Dupuy, A. Masmoudi, S. Roussos, Production of coconut aroma in solid-state cultivation: Screening and identification of Trichoderma strains for 6-pentyl-alpha-pyrone and conidia production. Journal of chemistry (2019) IF=1.726
R. Rayhane, J. Molinet, G. Mitropoulou, Y. Kourkoutas, N. Dupuy, A. Masmoudi , S. Roussos, From flasks to single used bioreactor: Scale-up of solid state fermentation process for metabolites and conidia production by Trichoderma asperellum. J. Environ. Manage., 252 (2019) 109496 IF= 4.865
R. Hamrouni, J. Molinet , N. Dupuy, N.Taieb, Q. Carboue, A. Masmoudi, S. Roussos, The effect of aeration for 6-pentyl-alpha-pyrone, conidia and lytic enzymes production by Trichoderma asperellum strains grown in solid-state fermentation, Waste and biomass valorization ( 2020) IF=2.358
R. Hamrouni, M. Claeys-Bruno, J. Molinet, A. Masmoudi, S. Roussos, N. Dupuy, Challenges of Enzymes, Conidia and 6-Pentyl-alpha-pyrone Production from Solid-State-Fermentation of Agroindustrial Wastes Using Experimental Design and T. asperellum Strains ( 2020) IF=2.358

20. A Malechaux Soutenue le 10 Janvier 2020 (ARIMnet MedOOmics) Mise en évidence des marqueurs chimiques de traçabilité et d’authenticité des huiles d’olive par des analyses multi-éléments et des outils chimiométriques

Authentication and Detection of Adulteration of Olive Oil. Chap : Application of Vibrational Spectroscopy Techniques for the Authentication and Detection of Adulteration of Olive Oil
A. Malechaud, J. Artaud, N. Dupuy, Nova science Publisher 2018
A. Malechaux, Y. Le Dreau, P.Vanloot, J. Artaud, N. Dupuy Discrimination of extra virgin olive oils from five French cultivars: En route to a control chart approach, Food Control (2019) 106, UNSP 106691 IF=4.248
A.Malechaux, Sonda Laroussi-Mezghani, Y. Le Dreau, J. Artaud, N. Dupuy, Multiblock chemometrics for the discrimination of three extra virgin olive oil varieties, Food Chemistry, (2020) ) IF=5.399

21. N. Girard Soutenance le 2 Juin 2021 (Thèse Financement Sartorius) Impact des rayonnements ionisants sur les films plastiques utilisés pour des applications biopharmaceutiques et biotechnologiques
Prix de thèse AMU 2022

• F. Gaston, N. Dupuy, S. R. A. Marque, S. . S. Dorey, F. Gaston, N. Girard-Perier, N. Dupuy, S. Marque, L. Delaunay, Generation of O2-permeation barrier during the gamma-irradiation of polyethylene / ethylene-vinyl alcohol / polyethylene multilayer film"nd. Eng. Chem. Res. (2019) 58, 31, 14115-14123 IF=3.573
• N. Girard, S. Dorey, S.R. Marque, N. Dupuy, Mapping the scientific research on the gamma irradiated polymers degradation (1975-2018), Radiat. Phys. Chem., 168 (2020) 108577 IF=2.858
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22. N. Delcourt Soutenue le 30/02/2022 Mars 2022 (Contrat Doctoral) Modélisation des signatures chimiques des sols en fonction de l’historique de leurs usages : la mémoire du sol au service de l’écologie actuelle.

• N. Delcourt, C. Rébufa, N. Dupuy, N. Boukhdoud, C. Brunel, J. Abadie, I. Giffard, AM Farnet-Da Silva,Infrared spectroscopy predicts land use under contrasting climate conditions: a case study on Mediterranean soils from olive-orchards and forests. Science of the Total Environment 686, (2019), 179-190 IF=4.610

• Liste des thèses en cours

B. Krieguer Soutenance prévue février 2025 (Thèse Financement Sartorius) Impact des rayonnements ionisants et électroniquessur les films plastiques utilisés pour des applications biopharmaceutiques et biotechnologiques