Séries de séminaires
Séminaires de l’atelier thématique "métagénomique et métabarcoding” :
2016 - Génomique environnementale, bioinformatique et écologie
Emese Meglecz & Vincent Dubut(IMBE)
« Etude de régimes alimentaires dans les milieux aquatiques : barcoding alimentaire de l’apron (Zingel asper). »
Laetitia Rouli (Laboratoire IGénétique Médicale et Génomique Fonctionnelle – Marseille)
« Pangénome de pathogènes bactériens et notion d’espèce »
Frédéric Mahé (Laboratoire des Symbioses Tropicales et Méditerranéennes– Montpellier)
« Progrès et limitations des outils bioinformatiques pour le metabarcoding
»
2015 - Biodiversité et écologie à l’ère de la génomique environnementale
Pascal Hingamp(Laboratoire Information Génomique et Structurale – Marseille)
« Les 1000 et une façons d’estimer la biodiversité à partir des données de métagénomique (hors méta-barcodes) »
Magali Lescot (Laboratoire Information Génomique et Structurale – Marseille)
« Ressources informatiques et bioinformatiques pour le traitement d’un jeu de données de génomique environnementale (Tara Océans) »
Lionel Ranjard (AGROECOLOGIE - Dijon)
« Distribution spatiale et déterminisme de la diversité microbienne des sols à l’échelle du territoire nationale »
2014 -
Magali Lescot (Laboratoire Information Génomique et Structurale – Marseille)
« Qu’est ce que la métagénomique et le metabarcoding peuvent nous apprendre sur les écosystèmes marins ? »
Guillaume MINARD (Laboratoire d’Ecologie Microbiene - Lyon)
« Une approche metabarcoding pour la description du microbiote bactérien associé au moustique tigre, Aedes albopictus »
2013 -
Hervé Sanguin (Laboratoire des Symbioses Tropicales et Méditerranéennes - Montpellier)
« Diversité des Champignons Mycorhiziens : Apport des approches Barcoding et des -Nouvelles Technologies de Séquençage »
André Gille (Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie marine et continentale)
« Hybridation Introgressive chez les Cyprinidés : approche éco-génomique »
Frédéric Lehembre (Laboratoire d’Ecologie Microbiene - Lyon)
« Metatranscriptomique et biodiversité fonctionnelle du sol »
