Sophie Gachet

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Maître de Conférences

Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie Marine et Continentale (IMBE)
IMBE UMR CNRS 7263, IRD 237
Université Aix-Marseille - Campus Etoile St Jérôme
Av Escadrille N. Niémen - case 421 -
13397 Marseille cedex 20
Tel. 04.91.28.83.31
sophie.gachet-at-imbe.fr

Biosketch

Docteur en Écologie, Ingénieur Agronome

Mots-clés : Écologie des communautés végétales, traits fonctionnels de plantes, écologie forestière, bases de données, modélisation, analyses de données

CV

depuis le 1er septembre 2008 : Maître de Conférences à l’Institut Méditerranéen d’Ecologie et de Biodiversité continentale et marine (Aix-Marseille Université)

2005-2008 : Maître de Conférences au Muséum national d’Histoire naturelle (Paris)

2003-2005 : Stagiaire post-doctorale à la Chaire industrielle en Aménagement Forestier Durable (Canada) (« Diversité de la végétation du sous-bois en plantations de pin gris : effet de l’antécédent cultural et comparaison avec les forêts naturelles »)

1998-2002 : Doctorat en Ecologie à l’Université Paul-Cézanne (« Organisation de la biodiversité forestière : vers une modélisation de la dynamique du sous-bois en fonction des pratiques sylvicoles »)

1995-96 : DESS Informatique Double-Compétence, à l’Université de la Méditerranée

1993-95 : Diplôme d’Agronomie Approfondie, spécialisation en Génie Agronomique, à l’Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Montpellier (titre : Ingénieur Agronome)

Publications

--- Revues indexées ---

- Borgy Benjamin, Cyrille Violle, Philippe Choler, Pierre Denelle, François Munoz, Jens Kattge, Sandra Lavorel, Jessy Loranger, Bernard Amiaud, Michael Bahn, Peter M. van Bodegom, Henry Brisse, Guilhem Debarros, Sylvain Diquelou, Sophie Gachet, Claudy Jolivet, Servane Lemauviel-Lavenant, Alexis Mikolajczak, Jean Olivier, Jenny Ordoñez, Patrice de Ruffray, Nicolas Viovy, Eric Garnier (2017) Plant community structure and nitrogen inputs modulate the climate signal on leaf trait. Global Ecology and Biogeography, 26(10):1138-1152.

- Metzner K, Gachet S, Rocarpin P, Saatkamp A. (2017) Moisture niche drives risk reduction traits of temporary pool plants. Basic and Applied Ecology, 21:13-22.

- Borgy, B ; Violle, C ; Choler, P ; Garnier, E ; Kattge, J ; Loranger, J ; Amiaud, B ; Cellier, P ; Debarros, G ; Denelle, P ; Diquelou, S ; Gachet, S ; Jolivet, C ; Lavorel, S ; Lemauviel-Lavenant, S ; Mikolajczak, A ; Munoz, F ; Olivier, J ; Viovy, N. (2017) Sensitivity of community-level trait-environment relationships to data representativeness : a test for functional biogeography. Global Ecology and Biogeography 26(6):729-739.

- Garnier E, Stahl U, Laporte MA, Kattge J, Mougenot I, Kühn I, Laporte B, Amiaud B, Arhestani F, Bönisch G, Bunker D, Cornelissen H, Díaz S, Enquist B, Gachet S, Kleyer M, Lavorel S, Pérez-Harguindeguy N, Maicher L, Naeem S, Poorter H, Schildhauer M, Shipley B, Violle C, Weiher E, Wright IJ, Klotz S. (2016) Towards a thesaurus of plant characteristics : an ecological contribution. J. Ecology 105(2):298-309.

- Ngueguim JR, Zapfack L, Onana JM, Noiha NV, Onana D, Betti JL, Gachet S, & Riéra B. (2016) Can the Mangombe forest plantations contribute to restore and conserve biodiversity ? Int. J. Biol. Chem. Sci. 10(1) : 355-368.

- Rocarpin P, Gachet S., Metzner K & Saatkamp A. (2015) Moisture and soil parameters drive community assembly in temporary pools. Hydrobiologia, pp 1-12. doi:10.1007/s10750-015-2604-7

- Violle C, Choler P, Borgy B, Garnier E, Amiaud B, Debarros G, Diquelou S, Gachet S, Jolivet C, Kattge J, Lavorel S, Lemauviel-Lavenant S, Loranger J, Mikolajczak A, Munoz F, Olivier J, Viovy N. (2015) Vegetation Ecology meets Ecosystem Science : French Permanent Grasslands as a functional biogeography case study. Science of the Total Environment, 534:43–51.

- Brakchi-Ouakour L., Kadik L. & Gachet S. (2015) Typologie fonctionnelle et taxonomique des pinèdes de l’Algérois et de l’Oranais. Rev. Écol. (Terre Vie), accepted

- Salmon S, Ponge JF, Gachet S, Deharveng L, Lefebvre N, Delabrosse F. (2014) Linking species, traits and habitat features of Collembola at large scale. Soil Biology and Biochemistry, 75:73–85

- Chateil C., Goldringer I., Tarallo L., Kerbiriou C., Le Viol I., Ponge J-F., Salmon S., Gachet S., Porcher E. (2013) Crop genetic diversity benefits farmland biodiversity in cultivated fields. Agriculture, Ecosystems and Environment, 171:25-32

- Palla F., Gachet S., Picard N. & Riera B. (2013). Defining vegetation groups from life-history traits for the management of a savannah-forest mosaic in the Lopé National Park, Gabon. Journal of Tropical Forest Science, 25:454-466.

- Saatkamp A., Affre L., Baumberger T., Gasmi A., Dumas P.J., Gachet S. & Arène F. (2011). Soil depth detection by seeds and diurnally fluctuating temperatures : different dynamics in 10 annual plants. Plant Soil 349:331–340

- Rebbas K., Véla E., Gharzouli R., Djellouli Y., Alatou D. & Gachet S. (2011). Caractérisation phytosociologique du Parc National de Gouraya (Béjaïa, Algérie). Rev. Écol. (Terre Vie), 66:267-289.

- Pavoine S., Véla E., Gachet S., de Bélair G. & Bonsall M. (2011). Linking patterns in phylogeny, traits, abiotic variables and space : a novel approach to linking environmental filtering and plant community assembly. Journal of Ecology 99 : 165–175

- Lavorel S, Gachet S, Sahl A, Colace MP, Gaucherand S, Burylo M, & Bonet R (2009). A plant functional traits data base for the Alps. In : EM Spehn & C Körner (eds) Data mining for global trends in mountain biodiversity. CRC Press/Taylor and Francis, Boca Raton. p. 107-122

- Gachet S., Sarthou C., Bardat J. & Ponge J.F. (2009). The state of change of Erica scoparia L. heathland through cattle grazing and oak invasion. Rev. Écol. (Terre Vie), vol. 64 : 3-17.

- Pavoine S., Vallet J., Dufour A.B., Gachet S. & Daniel H. (2009). On the challenge of treating various types of variables and its consequence in functional ecology. Oïkos 118:391-402.

- Aubin I., Gachet S., Messier C. & Bouchard A. (2007). How stable are northern hardwood forests to human disturbance ? An evaluation using a plant functional group approach. Ecoscience 14(2) : 259-271.

- Gachet S., Leduc A., Bergeron Y., Nguyen-Xuan T. & Tremblay F. (2007). Understory vegetation of boreal tree plantations : Differences in relation to previous land use and natural forests. Forest Ecology and Management 242:49-57.

- Haeussler S., Macdonald S.E., Gachet S., Bergeron Y. (2007). Understory and epiphytic vegetation as indicators of the ecological integrity of managed forests : a synthesis of the special issue. Forest Ecology and Management 242:1-4.

- Gachet S., Véla E. & Tatoni T. (2005). BASECO : a floristic and ecological database of Mediterranean French flora. Biodiversity and Conservation 14 :1023-1034.

- Gritti E.S., Gachet S., Sykes M. & Guiot J. (2004). An extended probabilistic approach of plant vital attributes : an application to European pollen records at 0 and 6 KA. Global Ecology and Biogeography, 13 : 519-533.

- Roche P., Diaz-Burlinson N., & Gachet S. (2004). Congruency analysis of species ranking based on leaf traits : which traits are the more reliable ? Plant Ecology 174(1) : 37-48.

- Gachet, S., Brewer, S., Cheddadi, R., Davis, B., Gritti, E. & Guiot, J. (2003) A new biogeographical approach to attribute pollen taxa to plant functional types in Europe (18,000 to present). Global Ecology and Biogeography 12(2) : 103-118.

--- Proceedings ---

• Romain David, Jean-Pierre Féral, Anne-Sophie Archambeau, Fanny Arnaud, David Auber, Nicolas Bailly, Loup Bernard, Laure Berti-Equille, Cyrille Blanpain, Vincent Breton, Anne Chenuil-Maurel, Anna Cohen Nabeiro, Alrick Dias, Aurélie Delavaud, Robin Goffaud, Sophie Gachet, Karina Gibert, Manuel Herrera Fernandez, Luc Hogie, Dino Ienco, Romain Julliard, Yvan Le Bras, Julien Lecubin, Yannick Legre, Michelle Leydet, Grégoire Lois, Bénédicte Madon, François Marchal, Victor Mendez Munoz, Jean-Charles Meunier, Jean-Baptiste Mihoub, Isabelle Mougenot, Sophie Pamerlon, Eric Peletier, Geneviève Romier, Dad Roux-Michollet, Alison Specht, Christian Surace, Jean-Claude Raynal, Thierry Tatoni. (2017) IndexMEED cases studies using « Omics » data with graph theory. Proceedings of TDWG (https://doi.org/10.3897/tdwgproceedings.1.20740)

• David R, Féral J-P, Archambeau A-S, Bailly N, Blanpain C, Breton V, De Jode A, Delavaud A, Dias A, Gachet S, Guillemain D, Lecubin J, Romier G, Surace C, Thierry de Ville d’Avray L, Arvanitidis C, Chenuil A, Ҫinar ME, Koutsoubas D, Sartoretto S, Tatoni T (2016) IndexMed projects : new tools using the CIGESMED DataBase on Coralligenous for indexing, visualizing and data mining based on graphs. In : Sauvage S, Sánchez-Pérez J-M., Rizzoli, AE (Eds.), Proceedings of the 8th International Congress on Environmental Modelling and Software, Environmental modelling and software for supporting a sustainable future 3:656-665. July 10-14, Toulouse, FRANCE. ISBN : 978-88-9035-745-9

• David R, Féral J-P, Gachet S, Dias A, Blanpain C, Lecubin J, Diaconu C, Surace C, Gibert K (2015) A first prototype for indexing, visualizing and mining heterogeneous date in Mediterranean ecology within the IndexMed consortium interdisciplinary framework. In : SITIS 2015, 11th International Conference on Signal-Image Technology & Internet-Based Systems (SITIS), 23-27 nov. 2015, Bangkok, Thailand, pp. 232-239, doi : 10.1109/SITIS.2015.119.

--- Revues non indexées à comité de lecture ---

• Michelot-Antalik A, Gachet S, Legay M & Landmann G. Vers un outil d’aide à la décision pour l’adaptation des forêts françaises au changement climatique. Forêt-entreprise, n°217 : 30-33.

• Madon O., Gachet S., Barbero M. (1999). Influence of study scale on the characterisation of plants community organisation in a Mediterranean grassland (Mont Ventoux, France). Ecologia Mediterranea, 25(2) : 205-214

• Tatoni T., Barbero M., Gachet S. (1999). Dynamique des boisements naturels en Provence. Ingénierie-EAT (revue du CEMAGREF), Numéro spécial « Boisements naturels des espaces agricoles en déprise » : 49-57.

--- Ouvrage ---

• Gachet S. & Bergonzini J.C. (2003) Bouquet de Flore : projet de synthèse sur les bases de données floristiques et leurs composantes forestières. GIP-ECOFOR éditions. 128p. (se référer au site suivant : http://www.gip-ecofor.org/ecofor/publi/page.php?id=5669)

Enseignement

- Cours, travaux dirigés, sorties sur le terrain, en Licence et Master
Disciplines : initiation aux bases de données, statistiques, échantillonnage, dynamique de la végétation, génétique des populations, communication scientifique, écologie générale

- DESU Biodiversités, Villes et Territoires (CVRH)
www.lisa.dreal-bn.fr/modules/Formation/cache/fiches/du_biodiversite_villes_territoires.pdf
Initiation à l’écologie et à la biodiversité, échantillonnage, méthodologie, encadrement de mémoires

- Collaborations avec le rectorat d’Aix-Marseille
- Projet PASS (initiation à la biodiversité en Collège)
- Projet Ascenseur Social (projet du labex A*Midex d’échange entre enseignants du secondaire et de l’université afin d’augmenter les taux de réussite des étudiants)

Encadrement

par GACHET Sophie

--- Coencadrement de thèses ---

- 2007-2010 : codirection de la thèse de Carole CHATEIL (MNHN-ENS) avec Emmanuelle Porcher (HDR MNHN) « Organisation de la biodiversité en milieu agricole : réponses structurales et fonctionnelles des communautés végétales et de la faune édaphique aux pratiques agricoles et à la structure du paysage » – soutenue le 9 décembre 2010.

- depuis 2013 : codirection de la thèse de Nathalie BOUTIN (avec S. Hernandez, IMPGT, et P. Batteau, IAE) « Territorial management of biodiversity in a context of growing urbanization and intense interactions man-nature. A multi site analysis. » (Financement labex OT-MED : http://www.otmed.fr/spip.php?article539)

--- Autres encadrements/coencadrements ---

- Stages de M2 Recherche
- Carole Chateil, bords de champs (codir. E. Porcher, MNHN)
- Anne Trouillon, forêt de Guyane (codir. B. Riéra, MNHN)
- Pauline Rocarpin, mares temporaires méditerranéennes (codir. A. Saatkamp, IMBE)

-  Stages de M2 Pro
- Amandine Sahl, traits de la flore alpine (codir. S. Lavorel, LECA, I. Mougenot, LIRMM) (M2 de Bioinformatique)
- Jérôme Volant, Ophrys de Provence (codir. E. Véla, AMAP)
- Nathalie Boutin, recherche sur les interactions Hommes-Milieux : implication du grand public et des acteurs locaux
- Kristin Metzner : mares temporaires méditerranéennes (codir. Arne Saatkamp, IMBE)

- Stages de M1
- Mounir Zeroual, traits fonctionnels de la flore du sous-bois de la forêt de Litimé, Togo
- Blandine Ghilem, traits de dispersion des diaspores de la flore d’Ile de France
- Constantin Dancau, forêt de Guyane (codir. B. Riéra, MNHN)
- Noëlla Lefebvre, Florian Delabrosse, Aurore Clonrozier, traits de vie des collemboles (codir. S. Salmon, MNHN)
- Céline Ceccarelli & Caroline Matusiak, terrils de Provence
- Lara Dixon & Marie-Sophie Garcia, végétation des zones humides
- Hamid Mouloudj & Mohamed Rahmani, croissance des pins sur les terrils (codir. Frédéric Guibal, IMBE)
- Pauline Rocarpin, mares temporaires méditerranéennes

- Stage IUT Avignon
Marjolaine Heyd, terrils de Provence

- Stages de DU / DESU
- Audrey Coquelin : analyse de données anciennes du Parc National des Ecrins
- Marine Pouget & Fabien Arène : dynamique de la végétation sur les terrils du bassin minier de Provence
- Thomas Lamailloux, Frédéric Cano, James Gourier et Violaine Namblard (dans le cadre du DESU BVT 2014)

- codirection de plusieurs stages hors-cursus de L3

- tutrice de plusieurs doctorants-moniteurs

Responsabilités administratives et d’enseignement

--- Responsabilités scientifiques ---

Coordinations et co-coordinations de programmes
- ANR Jeunes Chercheurs “BLUE” (Biodiversity Loss : Understanding changes in Ecosystem composition and functioning : application to bird and plant communities in France) – coord. Emmanuelle Porcher (MNHN) - implication à 40% (2006-2010)
- En 2006 : co-coordination du programme du MNHN portant sur l’étude des landes à Erica scoparia en Brenne (Indre)
- Co-coordinatrice du programme TRAITAUT portant sur les traits et l’autécologie des espèces forestières, financé par le GIP ECOFOR et le RMT AFORCE (2011-2012) : http://traitaut.gip-ecofor.org/
- Coordinatrice du programme IMBE-IKEA portant sur le suivi écologique (2009-2019) de zones humides dans le cadre de la mise en œuvre d’une mesure compensatoire.

Comités scientifiques
- Vice-présidente et membre du comité scientifique du colloque MedBiodiv 2010 « Gestion et conservation de la biodiversité dans le Bassin Méditerranéen » (Tlemcen, Algérie, 11-13 octobre 2010)
- Membre du Comité Consultatif VegFrance (base de données nationale sur la végétation) depuis 2008 : http://vegfrance.univ-rennes1.fr/
- Présidente du comité scientifique du glossaire trilingue de la biodiversité méditerranéenne (français/anglais/arabe) financé par la Banque Mondiale et le Conservatoire du Littoral (2011-2012) : http://ecoonto.cmimarseille.org/index.php/Main_Page/fr
- Membre du comité scientifique du projet collaboratif « Inventaire et modélisation des concepts environnementaux liés à la biodiversité » (financement MEEDDM)
- Représentante à l’international du réseau TOPIC (traits fonctionnels des plantes du Canada : http://topic.rncan.gc.ca/)
- Membre du comité de pilotage du Ca-SIF (catalogue des sources d’information sur la forêt, GIP ECOFOR) depuis 2004 : http://casif.gip-ecofor.org/
- Membre du comité de direction de l’OHM BMP (Observatoire Hommes-Milieux du Bassin Minier de Provence) depuis 2014 : www.ohm-provence.org
- Membre élue du collège B au Comité Scientifique de l’INEE et secrétaire scientifique (membre du bureau)
- Membre du comité d’organisation du colloque SFE Ecologie 2016 à Marseille

Membre de plusieurs comités de thèse depuis 2006
- MNHN (soutenues) : Isabelle Le Viol (diversité des bords d’autoroute), Maelle Rambaud (chenalisation des rivières), Eric Motard (impact de l’Ailante) et Louis de Redon (diversité des bords de routes)
- CEFE / LIRMM, Montpellier (soutenue 2012) : Marie-Angélique Laporte (ontologie des traits fonctionnels de plantes)
- CEMAGREF Grenoble (soutenue 2012) : Walaa Adra (modélisation de la qualité de l’habitat de la gélinotte des bois)
- MNHN (soutenue 2013) : Jules NGUEGUIM (agroforesterie au Cameroun) rapportrice
- IMEP / Université de Lomé, Togo (soutenue 2010) : Denis Soussou (recul forestier au Togo)
- IRSTEA Nogent-sur-Vernisson (en cours) : Lisa LAURENT (interactions écologiques multiples dans la dynamique de l’écosystème forestier)

--- Responsabilités pédagogiques ---

-  Depuis 2010 : enseignant-référent pour environ vingt étudiants chaque année
-  Membre de l’équipe pédagogique de la Licence SNTE
-  Co-responsable de l’UE de Licence 1ère année « Diversité du monde vivant »

--- Responsabilités administratives ---

-  Présidente de plusieurs jurys de baccalauréat (2009, 2010, 2012)
-  depuis 2009 : correspondante Communication de l’IMEP/IMBE auprès du CNRS
-  depuis 2012 : suppléante au Comité National Universitaire (section 67)
-  depuis 2013 : membre élue de la Commission Enseignement de l’OSU Pythéas
-  depuis 2014 : création et animation de la sous-commission enseignement pour les sections CNU 67 et 68 au sein de l’OSU Pythéas