Sophie Gachet

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Maître de Conférences

Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie marine et continentale (IMBE)
 UMR CNRS 7263, IRD 237 -
Université Aix-Marseille - Campus Etoile St Jérôme
Av Escadrille Normandie Niémen - case 421 -
13397 Marseille Cedex 20
Tel. +33 4 13 94 49 37
sophie.gachet-at-imbe.fr

Biosketch

Docteur en Écologie, Ingénieur Agronome

Mots-clés : Écologie des communautés végétales, traits fonctionnels de plantes, écologie forestière, bases de données, modélisation, analyses de données, science participative

CV

depuis le 1er septembre 2008 : Maître de Conférences à l’Institut Méditerranéen d’Ecologie et de Biodiversité continentale et marine (Aix-Marseille Université)

2005-2008 : Maître de Conférences au Muséum national d’Histoire naturelle (Paris)

2003-2005 : Stagiaire post-doctorale à la Chaire industrielle en Aménagement Forestier Durable (Canada) (“Diversité de la végétation du sous-bois en plantations de pin gris : effet de l’antécédent cultural et comparaison avec les forêts naturelles”)

1998-2002 : Doctorat en Ecologie à l’Université Paul-Cézanne (“Organisation de la biodiversité forestière : vers une modélisation de la dynamique du sous-bois en fonction des pratiques sylvicoles”)

1995-96 : DESS Informatique Double-Compétence, à l’Université de la Méditerranée

1993-95 : Diplôme d’Agronomie Approfondie, spécialisation en Génie Agronomique, à l’Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Montpellier (titre : Ingénieur Agronome)

Publications

* Revues indexées

1. Carisio, L. and Schurr, L., Masotti V., Porporato, M., Gachet, S., Nève, G., Affre, L., Geslin, B. The interaction of nectar dynamic and insect visitation affects the estimation of nectar resources. (2022) Functional diversity Functional diversity 36(12):3234-3247 (DOI:10.1111/1365-2435.14210) [IF 2021=6.280]

2. Díaz Sandra, Jens Kattge, [...] Sophie Gachet, [...] Mathew Williams, Justin Wright, and Gerhard Zotz. (accepté) The global spectrum of plant form and function: enhanced species-level trait dataset. Scientific Data/Nature

3. Lucie Schurr, Véronique Masotti, Benoît Geslin, Sophie Gachet, Prisca Mahé, Léna Jeannerod, Laurence Affre (2022) To what extent is fennel crop dependent on insect pollination? Agric Eco Env Vol. 338 (DOI: 10.1016/j.agee.2022.108047) [IF = 6,576]

4. Sabatini Francesco Maria; Lenoir, Jonathan; Hattab, Tarek; Arnst, Elise; Chytry, Milan; […] Gachet, Sophie; […] Zobel, Martin; Bruelheide, Helge (2021) sPlotOpen: An environmentally balanced, open-access, global dataset of vegetation plots. Global Ecol. Biogeogr. 30:1740–1764. (DOI.org/10.1111/geb.13346) [IF = 5,958]

5. Schurr, L.; Geslin, B.; Affre, L.; Gachet, S.; Delobeau, M.; Brugger, M.; Bourdon, S.; Masotti, V. (2021) Landscape and local drivers affecting the flower-visitors of fennel (Foeniculum vulgare, Apiaceae) and implications for its yield. Insects, 12(5):407 (DOI:10.3390/insects12050407) [IF 2019=2.327]

6. David R., Mabile L., Bailo D., Gachet S., […] and the Research Data Alliance. (2020) FAIRness literacy: the Achilles’ heel of applying FAIR principles. Data Sci J 19(1) 32:1-11 (DOI: 10.5334/dsj-2020-032) [IF 2018=1.160]

7. Geslin Benoît, Sophie Gachet, Magali Deschamps-Cottin, Floriane Flacher, Benjamin Ignace, Corentin Knoploch, Éric Meineri, Christine Robles, Lise Ropars, Lucie Schurr & Violette Le Féon. (2020) Bee hotels host a high abundance of exotic bees in an urban context. Acta Oecologica, 105, pp.103556 (DOI: 10.1016/j.actao.2020.103556) [IF 2018=1.478]

8. Kattge J., […] Gachet S., […] and the TRY consortium. (2020) TRY plant trait database - enhanced coverage and open access. Global Change Biol. 26:119-188. (DOI: 10.1111/gcb.14904) [IF 2018=8.880]

9. Abadie J., Dupouey JL, Salvaudon A., Gachet S., Videau N., Avon C.,Dumont J., Tatoni T. & Bergès L. (2020) Historical ecology of Mediterranean forests: land use legacies on current understory plants differ with time since abandonment and former agricultural use. Journal of Vegetation Science (DOI: 10.1111/jvs.12860) [IF 2018=2.944]

10. Boutin, N., Batteau, P., Hernandez, S., Gachet, S., Raynal, JC. (2019). Conflits environnementaux, milieux naturels, et décisions publiques. Étude de deux cas industriels. Revue Politiques et management public 36(2):141-167. (DOI : 10.3166/pmp.36. 2019.00011)

11. Borgy Benjamin, Cyrille Violle, Philippe Choler, Pierre Denelle, François Munoz, Jens Kattge, Sandra Lavorel, Jessy Loranger, Bernard Amiaud, Michael Bahn, Peter M. van Bodegom, Henry Brisse, Guilhem Debarros, Sylvain Diquelou, Sophie Gachet, Claudy Jolivet, Servane Lemauviel-Lavenant, Alexis Mikolajczak, Jean Olivier, Jenny Ordoñez, Patrice de Ruffray, Nicolas Viovy, Eric Garnier (2017) Plant community structure and nitrogen inputs modulate the climate signal on leaf trait. Global Ecology and Biogeography, 26(10):1138-1152. (DOI : 10.1111/geb.12623) [IF = 5.667]

12. Metzner K, Gachet S, Rocarpin P, Saatkamp A. (2017) Seed bank, seed size and dispersal in moisture gradients of temporary pools in Southern France. Basic and Applied Ecology, 21:13-22. (DOI : 10.1016/j.baae.2017.06.003) [IF 2018 = 2.474]

13. Borgy, B; Violle, C; Choler, P; Garnier, E; Kattge, J; Loranger, J; Amiaud, B; Cellier, P; Debarros, G; Denelle, P; Diquelou, S; Gachet, S; Jolivet, C; Lavorel, S; Lemauviel-Lavenant, S; Mikolajczak, A; Munoz, F; Olivier, J; Viovy, N. (2017) Sensitivity of community-level trait-environment relationships to data representativeness: a test for functional biogeography. Global Ecology and Biogeography 26(6):729-739. (DOI : 10.1111/geb.12573) [IF = 5,958]

14. Garnier E, Stahl U, Laporte MA, Kattge J, Mougenot I, Kühn I, Laporte B, Amiaud B, Arhestani F, Bönisch G, Bunker D, Cornelissen H, Díaz S, Enquist B, Gachet S, Kleyer M, Lavorel S, Pérez-Harguindeguy N, Maicher L, Naeem S, Poorter H, Schildhauer M, Shipley B, Violle C, Weiher E, Wright IJ, Klotz S. (2016) Towards a thesaurus of plant characteristics: an ecological contribution. J. Ecology 105(2):298-309. (DOI : 10.1111/1365-2745.12698) [IF 2018=5.680]

15. Ngueguim JR, Zapfack L, Onana JM, Noiha NV, Onana D, Betti JL, Gachet S, & Riéra B. (2016) Can the Mangombe forest plantations contribute to restore and conserve biodiversity? Int. J. Biol. Chem. Sci. 10(1): 355-368. (DOI : 10.4314/ijbcs.v10i1.27) [IF = 0.310]

16. Rocarpin P, Gachet S., Metzner K & Saatkamp A. (2016) Moisture and soil parameters drive community assembly in temporary pools. Hydrobiologia, 781(1):55–66. (DOI :10.1007/s10750-015-2604-7) [IF 2018 = 2.325]

17. Violle C, Choler P, Borgy B, Garnier E, Amiaud B, Debarros G, Diquelou S, Gachet S, Jolivet C, Kattge J, Lavorel S, Lemauviel-Lavenant S, Loranger J, Mikolajczak A, Munoz F, Olivier J, Viovy N. (2015) Vegetation Ecology meets Ecosystem Science: French Permanent Grasslands as a functional biogeography case study. Science of the Total Environment, 534:43–51. (DOI : 10.1016/j.scitotenv.2015.03.141) [IF 2018 = 4.610]

18. Brakchi-Ouakour L., Kadik L. & Gachet S. (2015) Typologie fonctionnelle et taxonomique des pinèdes de l’Algérois et de l’Oranais. Rev. Écol. (Terre Vie), 70(3):231-247. (http://hdl.handle.net/2042/56758) [IF 2018= 0.350]

19. Salmon S, Ponge JF, Gachet S, Deharveng L, Lefebvre N, Delabrosse F. (2014) Linking species, traits and habitat features of Collembola at large scale. Soil Biology and Biochemistry, 75:73–85. [IF 2018= 5.290]

20. Chateil C., Goldringer I., Tarallo L., Kerbiriou C., Leviol I., Ponge J-F., Salmon S., Gachet S., Porcher E. (2013) Crop genetic diversity benefits farmland biodiversity in cultivated fields. Agriculture, Ecosystems and Environment, 171:25-32. [IF 2018= 4.099]

* Revues non indexées (mais à comité de lecture)

1. Solère Jérémie, Jean-Yves Meunier, Jean-Pierre Hébrard, Laurent Grima, Lucie Schurr, Jocelyn Claude, Thomas Lebard, Sophie Gachet et Gabriel Nève (2022) Faune entomologique du site de la Feuillanne, Fos-sur-mer (Bouches-du-Rhône). Bulletin de la Société Linnéenne de Provence 73:129-151.

2. Tatoni T, Gachet S, Thiéry A & Viglione J (2015) Vers une approche globale de la structuration écologique des zones humides dans un contexte industriel. Etudes Vauclusiennes 82:7-8.

3. Caron H, Dumas E, Gachet S & Tatoni T (2015) Changements dans les paysages industrialisés de la région PACA : le cas du complexe de Fos-sur-Mer. Etudes Vauclusiennes 82:9-14.

4. Guiller C, Pavon D, Gachet S, Dumas E & Tatoni T (2015) Composition et dynamique végétale d’un site localisé au cœur de la zone industrialo-portuaire de Fos-sur-Mer. Etudes Vauclusiennes 82:47-54.

5. Hecquet C, Raynal JC, Thiéry A & Gachet S (2015) Approche de la microtopographie des mares temporaires méditerranéennes. Etudes Vauclusiennes 82:23-28.

6. Michelot-Antalik A, Gachet S, Legay M & Landmann G. (2014) Vers un outil d’aide à la décision pour l’adaptation des forêts françaises au changement climatique. Innovations Agronomiques, 41 :105-118.

7. Michelot-Antalik A, Gachet S, Legay M & Landmann G. (2014) Vers un outil d’aide à la décision pour l’adaptation des forêts françaises au changement climatique. Forêt-entreprise, 217:30-33.

Enseignement

- Cours, travaux dirigés, travaux pratiques, sorties sur le terrain, en Licence et Master
Disciplines enseignées : dynamique des écosystèmes, initiation aux bases de données, biostatistiques, échantillonnage, génétique des populations, communication scientifique, écologie générale, diversité du monde vivant, diversité des plantes, morpho-anatomie des plantes, approche par traits fonctionnels, interactions biotiques, méthodologie du travail universitaire...

- DESU Biodiversités, Villes et Territoires (CVRH)
https://formations.univ-amu.fr/FHULBI.html
Disciplines enseignées : initiation à l’écologie et à la biodiversité, méthodes d’échantillonnage, vulgarisation, encadrement de mémoires...

- Collaborations avec le rectorat d’Aix-Marseille
 Projet PASS (initiation à la biodiversité en Collège)
 Projet Ascenseur Social (projet du labex A*Midex d’échange entre enseignants du secondaire et de l’université afin d’augmenter les taux de réussite des étudiants)

Encadrement

by GACHET Sophie

--- Coencadrement de thèses ---

 2007-2010 : codirection de la thèse de Carole CHATEIL (MNHN-ENS) avec Emmanuelle Porcher (HDR MNHN) « Organisation de la biodiversité en milieu agricole : réponses structurales et fonctionnelles des communautés végétales et de la faune édaphique aux pratiques agricoles et à la structure du paysage ». Soutenue le 9 décembre 2010.

 2013-2018 : codirection de la thèse de Nathalie BOUTIN (avec S. Hernandez, IMPGT, et P. Batteau, IAE) « Territorial management of biodiversity in a context of growing urbanization and intense interactions man-nature. A multi site analysis. » Financement labex OT-MED. Soutenue le 12 décembre 2018. Nathalie Boutin a reçu le Prix de thèse d’Aix Marseille Université en 2018.

 2018-2022 : codirection de la thèse de Lucie SCHURR (à 25% avec L. Affre, V. Masotti et B. Geslin, IMBE) « Interactions entre insectes floricoles et culture du fenouil aromatique ». Bourse CIFRE Pernod-Ricard. Soutenue le 21 avril 2022.

--- Autres encadrements/coencadrements ---

Stages de M2
 2006 : Anne Trouillon, forêt de Guyane (codir. B. Riéra, MNHN)
 2006 : Mickael Le Coquen, outil de suivi des plantes communes (codir. E. Porcher, MNHN)
 2007 : Carole Chateil, bords de champs (codir. E. Porcher, MNHN)
 2007 : Amandine Sahl, traits de la flore alpine (codir. S. Lavorel, LECA, I. Mougenot, LIRMM) (M2 de Bioinformatique)
 2009 : Jérôme Volant, les Ophrys de Provence (codir. E. Véla, CIRAD-AMAP)
 2012 : Nathalie Boutin, recherche sur les interactions Hommes-Milieux : implication du grand public et des acteurs locaux (direction de son M2 + de sa Validation des Acquis de l’Expérience)
 2012 : Kristin Metzner : mares temporaires méditerranéennes (codir. Arne Saatkamp, IMBE)
 2014 : Pauline Rocarpin : mares temporaires méditerranéennes (codir. A. Saatkamp, IMBE)
 2020 : Sauvane Garitey : médiation scientifique autour du programme Ikea
 2021 : Emily Henry : médiation scientifique autour du Labex DRIIHM
 2022 : Pierre-André Motta : médiation scientifique sur les terrils de l’OHM BMP et esprit critique
 2022 : Pauline Gauffre : médiation versus communication, l’exemple du média Bleu Tomate

Stages de M1
 2007 : Blandine Ghilem, traits de dispersion des diaspores de la flore d’Ile de France
 2007 : Constantin Dancau, forêt de Guyane (codir. B. Riéra, MNHN)
 2008 : Mounir Zeroual, traits fonctionnels de la flore du sous-bois de la forêt de Litimé, Togo
 2009 : Noëlla Lefebvre, traits de vie des collemboles (codir. S. Salmon, MNHN)
 2009 : Céline Ceccarelli & Caroline Matusiak, terrils de Provence
 2010 : Florian Delabrosse, traits de vie des collemboles (codir. S. Salmon, MNHN)
 2010 : Lara Dixon & Marie-Sophie Garcia, végétation des zones humides
 2011 : Hamid Mouloudj & Mohamed Rahmani, croissance des pins sur les terrils (codir. F. Guibal, IMBE)
 2012 : Aurore Clonrozier, traits de vie des collemboles (codir. S. Salmon, MNHN)
 2013 : Pauline Rocarpin, mares temporaires méditerranéennes
 2015 : Delphine Daubercies & Marianne Lott, exploitation forestière et approvisionnement en biomasse de la centrale de Gardanne
 2018 : Coline Rousseau Donadini, protocoles de suivi d’une mare à Valabre (Gardanne)
 2018 : Benjamin Ignace et Corentin Knoploch, suivi de Megachile sculpturalis (codir. Benoit Geslin)
 2019 : Laurent Grima : les coprophages du site La Feuillane (Fos sur Mer) (codir. Gabriel Nève)
 2020 : David Vittorietti : dynamique végétale d’une friche industrielle
 2020 : Thibault Michel : traits de vie des papillons (codir. Gabriel Nève)

Stages de DU / DESU
 Audrey Coquelin (DU) : analyse de données anciennes du Parc National des Ecrins
 Marine Pouget & Fabien Arène (DU) : dynamique de la végétation sur les terrils du bassin minier de Provence
 Thomas Lamailloux, Frédéric Cano, James Gourier et Violaine Namblard (dans le cadre du DESU BVT 2014)
 Sylvie Giret et Véronique Le Bris (dans le cadre du DESU BVT 2015)
 Julien Banus (dans le cadre du DESU BVT 2016)
 Agnès Savignac (dans le cadre du DESU BVT 2017)
 Hugo Maurer (dans le cadre du DESU BVT 2020)

Autres
 codirection de plusieurs stages de BTS, IUT, L3, L3 pro
 tutrice de plusieurs doctorants-moniteurs
 membre de 18 comités de thèse et de 5 jurys de thèse à ce jour

Responsabilités administratives et d’enseignement

--- Responsabilités scientifiques ---

Coordinations et co-coordinations de programmes
 Depuis 2015 : responsable scientifique de l’ODS Provence (déclinaison régionale de l’Observatoire des Saisons national, coord. Isabelle Chuine, CEFE-CNRS, Montpellier)
 2009-2020 : coordinatrice du programme IMBE-IKEA portant sur le suivi écologique de zones humides dans le cadre de la mise en œuvre d’une mesure compensatoire à Fos-sur-Mer

Comités scientifiques
 Depuis 2005 : représentante à l’international du réseau TOPIC (traits fonctionnels des plantes du Canada : http://topic.rncan.gc.ca/)
 Depuis 2008 : membre du Comité Consultatif VegFrance (base de données nationale sur la végétation)
 Depuis 2014 : membre du comité de direction de l’OHM BMP (Observatoire Hommes-Milieux du Bassin Minier de Provence)
 2014-2018 : membre élue collège B au Comité Scientifique de l’INEE, et membre du bureau (secrétaire) de 2015 à 2017
 Depuis 2020 : membre du Comité Scientifique et Technique (CST) de l’Observatoire Des Saisons (coord. Isabelle Chuine, CEFE-CNRS, Montpellier)

--- Responsabilités pédagogiques ---

 Depuis 2012 : Responsable inter-sites de l’UE de Licence 1ère année « Diversité du monde vivant » puis depuis 2018 de l’UE homologue “Monde Vivant” (environ 1000 étudiants)
 Depuis 2015 : dans le cadre de l’ODS Provence, responsable du projet de science participative avec les collèges des BdR (soutien du rectorat, financement CD13)
 Depuis 2015 : membre du projet « Ascenseur Social » pour les SVT (financement A*Midex)
 2016-2019 : membre de l’Equipe Pédagogique de l’UFR Science d’AMU pour la mise en place de la nouvelle maquette de licence et du Portail de L1
 Depuis 2017 : Mise en place et codirection de la Licence Professionnelle ECO-RSE (écologie et responsabilité sociétale des entreprises)
 Depuis 2017 : Mise en place et codirection de l’Année de Mise à Niveau Scientifique (UFR Science, AMU)
 Depuis 2019 : Membre de l’Equipe Formation Licences de l’UFR Science d’AMU

 Présidente de jurys du baccalauréat (2009, 2010, 2012, 2018)

--- Responsabilités administratives ---

 2012-2014 : suppléante au Comité National Universitaire (section 67)
 2014-2019 : création et animation de la sous-commission des sections 67/68 au sein du Comité Enseignement de l’OSU Pythéas
 2013-2019 : membre élue puis réélue du Comité Enseignement de l’OSU Pythéas
 depuis 2014 : membre suppléante élue puis réélue au Conseil Consultatif d’Unité de l’IMBE
 depuis 2019 : membre du comité de sélection des ATER
 depuis 2020 : membre nommée du Comité Enseignement de l’IMBE
 2021 : membre de la commission de sélection de la formation en alternance pour les futurs lauréats du concours de Techniciens Supérieurs du Ministère de la Transition Ecologique
 depuis 2022 : membre nommée de la Commission Enseignement de l’UFR Sciences d’AMU, en tant que représentante de l’OSU Institut Pythéas.
 depuis 2022 : membre du Conseil de Gestion de l’Université du Temps Libre d’AMU