Stéphane Greff

Ingénieur d’études en techniques d’analyse chimique

Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie Marine et Continentale IMBE UMR CNRS 7263, IRD 237
Service Commun d’Ecologie Chimique et Métabolomique (SCECM)

Campus Saint-Charles - Case 4
3, place Victor Hugo
13331 Marseille cedex 03

Station marine d’Endoume
Rue de la Batterie des Lions
13007 Marseille

Parcours

Janv 2009-à ce jour Ingénieur d’études en techniques d’analyse chimique

Etude et caractérisation du métabolisme spécialisé des organismes terrestres et marins dans le cadre des changements globaux.

Mots-clés : métabolomique, métabolisme spécialisé, GC/MS, UHPLC-HRMS

Sept 2000-Déc 2008 Assistant Ingénieur en techniques d’analyse chimique

Déc 1999-Sept 2000 Technicien conducteur d’appareillages au Laboratoire d’Analyse Environnementale des Procédés et des Systèmes Industriels (LAEPSI) - Institut National des Sciences Appliquées (INSA) de Lyon.

Publications

2019

- Allelopathic effects of volatile organic compounds released from Pinus halepensis needles and roots. Santonja M., Bousquet-Mélou A., Greff S., Ormeño E., Fernandez C. Ecology and Evolution, 00:1–13. doi : 10.1002/ece3.5390. HAL

- Phenolics of the understory shrub Cotinus coggygria influence Mediterranean oak forests diversity and dynamics. Gavinet J., Santonja M., Baldy V., Hashoum H., Peano S., Tchong T., Gros R., Greff S., Fernandez C., Bousquet-Mélou A. Forest Ecology and Management, 441(1), 262-270. DOI : 10.1016/j.foreco.2019.03.049. HAL

- Metabolomic variability of four macroalgal species of the genus Lobophora using diverse approaches. Gaubert J., Greff S., Thomas O.P., Payri C. Phytochemistry, 162, 165–172. DOI : 10.1016/j.phytochem.2019.03.002. HAL

2018

- Distance interaction between marine cave-dwelling sponges and crustaceans. Santonja M., Greff S., Le Croller M., Thomas O. P., Pérez T. Marine Biology, 165:121. DOI : 10.1007/s00227-018-3377-0. HAL

2017

- The interaction between the proliferating macroalga Asparagopsis taxiformis and the coral Astroides calycularis induces changes in microbiome and metabolomic fingerprints. Scientific Reports 7, Article number : 42625. Greff S., Aires T., Serrão E. A., Engelen A. H., Thomas O. P., Perez T. DOI : 10.1038/srep42625. HAL

- Chemogeography of the red macroalgae Asparagopsis : metabolomics, bioactivity, and relation to invasiveness. Metabolomics. Greff S., Zubia M., Payri C., Thomas Olivier P., Pérez T. 13:33, https://doi.org/10.1007/s11306-017-1169-z

- Discrimination of Four Marine Biofilm-Forming Bacteria by LC-MS Metabolomics and Influence of Culture Parameters. Journal of Proteome Research, 16 (5), 1962 - 1975. Favre L., Ortalo-Magné A., Greff S., Pérez T., Thomas O., Martin J.-C., Culioli G.

2014

- Mahorones, Highly Brominated Cyclopentenones from the Red Alga Asparagopsis taxiformis. Journal of Natural Products, 2014, 77, 1150-1155. Greff S., Zubia M., Genta-Jouve G., Massi L., Perez T., Thomas O.P.

2013

- Does Prescribed Burning Affect Leaf Secondary Metabolites in Pine Stands ? Journal of Chemical Ecology, 2013, 1-15. Lavoir A.V., Ormeño E., Pasqualini V., Ferrat L., Greff S., Lecareux C., Vila B., Mévy J.P. , Fernandez C.

2011

- Does competition stress decrease allelopathic potential ? Biochemical Systematics and Ecology, 2011, 39 (4-6), 401-407. Rivoal A., Fernandez C., Greff S., Montes N., Vila B.

- Compost spreading in Mediterranean shrubland indirectly increases biogenic emissions by promoting growth of VOC-emitting plant parts. Atmospheric Environment, 2011, 45, 3631-3639. Olivier R., Lavoir A.V., Ormeño E., Mouillot F., Greff S., Lecareux C., Staudt M., Fernandez C.

- Inter-population variability of terpenoid composition in leaves of Pistacia lentiscus L. from Algeria : A chemoecological approach. Molecules. 2011, 16 (3), 2646-2657. Ait Said S., Fernandez C., Greff S., Torre F., Derridj A., Gauquelin T., Mévy J.P.

- Inter-population variability of leaf morpho-anatomical and terpenoid patterns of Pistacia atlantica Desf. ssp. atlantica growing along an aridity gradient in Algeria. Flora - Morphology, Distribution, Functional Ecology of Plants, 2011, 206 (4), 397-405. Ait Said S., Fernandez C., Greff S., Derridj A., Aired S., Gauquelin T., Mévy J.P.

- Direct and indirect impact of sewage sludge compost spreading on Quercus coccifera monoterpene emissions in a Mediterranean shrubland. Environmental Pollution, 2011, 159, 963-969. Olivier R., Staudt M., Lavoir A.V., Ormeño E., Rizvi S.H., Baldy V., Rivoal A., Greff S., Lecareux C., Fernandez C.

2010

- Environmental control of terpene emissions from Cistus monspeliensis L. in natural Mediterranean shrublands. Chemosphere, 2010, 78, 942-949. Rivoal A., Fernandez C., Olivier R., Lecareux C., Greff S., Lavoir A.V., Roche P., Vila B.

2009

- Variations in allelochemical composition of leachates of different organs and maturity stages of Pinus halepensis. Journal of Chemical Ecology, 2009, 35, 970-979. Fernandez C., Monnier Y., Ormeño E., Baldy V., Greff S., Pasqualini V., Mévy J.-P., Bousquet-Mélou A.

2008

- On the relative importance of the effects of selection and complementarity as drivers of diversity-productivity relationships in Mediterranean shrublands. Oikois, 2008, 117, 9, 1345-1350. Montes N., Maestre F.T., Ballini, C., Baldy V., Gauquelin T., Planquette M., Greff S., Dupouyet S., Perret J.B.

2007

- Characterization of phenolic compounds in Pinus laricio needles and their responses to prescribed burnings. Molecules, 2007, 12, 1614-1622. Cannac M., Pasqualini V., Greff S., Fernandez C., Ferrat L.

- Effect of intraspecific competition and substrate type on terpene emissions from some Mediterranean plant species. Journal of Chemical Ecology, 2007, 33(7), 277-286. Ormeño E., Bousquet-Mélou A., Mevy, J.P., Greff S., Robles C., Bonin G., Fernandez C.

- Monoterpene and sesquiterpene emissions of three Mediterranean species through calcareous and siliceous soils in natural conditions. Atmospheric Environment, 2007, 41(3), 629-639. Ormeño E., Fernandez C., Bousquet-Mélou A., Greff S., Morin E., Robles C., Vila B., Bonin G.

- Water deficit stress induces different monoterpene and sesquiterpene emission changes in Mediterranean species. Relationship between terpene emissions and plant water potential. Chemosphere, 2007, 67(2), 276-284. Ormeño E., Mévy J.P, Vila B., Bousquet-Mélou A., Greff S., Bonin, G., Fernandez, C.

2006

- Chemical composition of the volatile oil of Laggera aurita Schulz from Burkina Faso. Biochemical Systematics and Ecology, 2006, 34(11), 815-818. Mévy J.P., Bousquet-Mélou A., Greff S., Millogo J., Fernandez C.

- Composition of the volatile oil from leaves of Ximenia Americana L. Biochemical Systematics and Ecology, 2006, 34 (7), 549-553. Mévy J.P., Bessière J.M., Greff S., Zombre G., Viano J.

- Potential allelopathic effect of Pinus halepensis in the secondary succession : an experimental approach. Chemoecology, 2006, 16(2), 97-105. Fernandez C., Lelong B., Vila B., Mévy J.P., Robles C., Greff S., Dupouyet S., Bousquet-Mélou A.

2005

- Allelopathic potential of Medicago arborea, a Mediterranean invasive shrub. Chemoecology, 2005, 15 (4), 193-198.Bousquet-Mélou A., Louis S., Robles C., Greff S., Dupouyet S., Fernandez C.

2003

- Phenols and flavonoids in Allepo Pine Needles as bioindicators of Air Pollution. Journal of Environmental Quality, 2003, 32, 2265-2271. Robles C., Greff S., Pasqualini V., Garzino S., Bousquet-Mélou A., Fernandez C., Bonin G.

- Phenolic compounds content in Pinus halepensis Mill. needles : a bioindicator of air pollution. Chemosphere, 2003, 52 (1), 239-248. Pasqualini V., Robles C., Garzino S., Greff S., Bousquet-Melou A., Bonin G.

Posters

Congrès internationaux

2019

- Leaf specialized metabolome of Quercus pubescens exposed to amplified drought. Saunier A., Greff S., Ormeño E., Fernandez C. 12eme Colloque du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique - Clermont-Ferrand - 21 et 23 mai 2019.

- Annotation of new classes of lipids in the metabolome of the brown macroalga Taonia atomaria by the molecular network approach. Carriot N., Paix B., Greff S., Briand J.F., Culioli G. 12eme Colloque du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique - Clermont-Ferrand - 21 et 23 mai 2019.

- Exploring metabolic response of Avincennia germinans along a salinity gradient. mahury, Kourou and Sinnamary estuaries, French Guyana. Dhaou D., Fernandez C., Greff S., Duplais C., Gros R., Baldy V., Bousquet-Mélou A. Mangrove, Macrobenthos and Management. 7-11 july 2019. Singapore.

2018

- Identification of anti-aging natural products from southwestern Indian Ocean marine sponges and their microbial symbionts. Said Hassane C. , Fouillaud M., Boyer J.B., Clerc P., De Voogd N. , Garayev E., Greff S., Perez T., Herbette G., Baghdikian B., Ollivier E., Dufossé L., Gauvin-Bialecki A. 18th European Congress on Biotechnology. Genève, Suisse, 1er au 4 Juillet 2018.

- Seasonal co-variation of surface metabolome and epibacterial community of the holobiont Taonia atomaria. Paix B., Othmani A., Carriot N., Debroas D., Greff S., Briand J.-F., Culioli G. 11ème Journées Scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique. Liège, Belgique, 23 au 25 mai 2018

- Essai de déchloration de la CLD par réduction chimique via un couplage Fe(II)/oxydes-Fe(III). Andraud J.P., Criquet S., Oursel B., Greff S., Woignier T., Macarie H. The Sixth International Symposium on Environmental Biotechnology and Engineering, Novembre 2018 - Ciudad Obregón, Mexique.

2017

- Metabolomic fingerprinting of 8 mangroves species from North Vietnam. Malachin J.-R., Greff S., Culioli G., Van Tan D., Baldy V., Perez T., Fernandez C., Bousquet-Mélou A. World Congress of Allelopathy, Marseille, 24 au 28 juillet 2017.

2016

- Metabolomics and chemical ecology assays to understand biotic interactions in Vietnamese mangrove ecosystem. Bousquet-Mélou A., Van Tan D., Baldy V., de Rodez-Bénavent R., Pouchard N., Saunier A., Pérez T., Proffit M., Greff S., Wortham H., Sy Tuan M., Klein J., Fernandez C. Sfécologie-2016, International Conference of Ecological Sciences, Marseille, 24 au 27 octobre 2016.

2015

- A chemical ecology approach to assess the proliferation of the red alga Asparagopsis taxiformis : Metabolomics, natural toxicity and biological effects. Greff S., Pérez T., Thomas O., and the SEAPROLIF consortium. International Society of Chemical Ecology Conference, Stockholm, Sweden, 29 June to 3 July 2015.

2013

- SEAPROLIF program : Diversity and functioning of coastal marine biomes under siege : implications of SEAweed PROLIFerations across three oceans. Zubia Mayalen, Cambert Harold, Dijoux Laury, Viard Frederique, Engelen Aschwin, Perez Thierry, Greff Stéphane, Thomas Olivier, Petek Sylvain, Fiat Sylvie, Adjeroud Medhi, Bouchon Claude, Parretti Paola, Monteiro Joao, Santos Ricardo, Quod Jean Pascal & Payri Claude. Eighth WIOMSA Scientific Symposium, Maputo, Mozambique, 28 October to 2 November 2013.

- Original highly halogenated derivatives from Asparagopsis taxiformis. Greff S., Zubia M., Perez T. , Thomas O. P. MaNaPro 2013 – XIV International Symposium on Marine Natural Products, La Toja Island, Espagne, 15 août – 2 septembre 2013.

2012

- Isolation, chemical composition and antifungal activity of essential oils against Rhizopus oligosporus and Penicillium simplicissimum. Filippousi R., Greff S., Laffont–Schwob I., Salducci M.-D., Antoniou P., Roussos S. 5th Mikrobiokosmos Conference, Agricultural University of Athens, Athènes, Grèce, 13-15 décembre 2012.

2011

- Impact of land use change on ecosystem functioning : a case study about Pinus halepensis expansion on leaf litter decomposition process. Baldy V., Chomel M., Bousquet-Mélou A., Monnier Y., Greff S., Pernin C., Fernandez C. 12th European Ecological Federation Congress – Avila, Espagne, 25 – 29 Septembre 2011.

- Does prescribed burning affects the secondary metabolism of established stand trees of Mediterranean pines ? Lavoir A.V., Pasqualini V., Ormeno E., Ferrat L., Greff S., Lecareux C., Fernandez C. Medpine, 4th International Conference on Mediterranean Pines – Avignon, France. 4 – 6 juin 2011.

Congrès nationaux

[bbleu marine]2019

- Leaf specialized metabolome of Quercus pubescens exposed to amplified drought. Saunier A., Greff S., Ormeño E., Fernandez C. Journées MetaSUD - Toulon - 12 et 13 juin 2019.

- Utilisation de l’approche des réseaux moléculaires pour l’annotation de nouvelles classes de glycérolipides au sein du métabolome de la macroalgue brune Taonia atomaria. Carriot N., Paix B., Greff S., Briand J.F., Culioli G. Journées MetaSUD - Toulon - 12 et 13 juin 2019.

- Couplage des analyses du métabolome et du microbiome pour comprendre les interactions chimiques saisonnières entre l’algue brune Taonia atomaria et ses communautés bactériennes épiphytes. Paix B., Othmani A., Carriot N., Debroas D., Greff S., Briand J.F., Culioli G. Journées MetaSUD - Toulon - 12 et 13 juin 2019.

2016

- Bousquet-Mélou A., Van Tan D., Baldy V., de Rodez-Bénavent R., Pouchard N., Saunier A., Pérez T., Proffit M., Greff S., Wortham H., Sy Tuan M., Klein J., Fernandez C. Journées du GDR MédiaTec, Marseille, 28 au 29 octobre 2016.

2015

- Congrès de l’Ecole Doctorale Sciences de l’Environnement (ED251), Cassis, 21 au 22 avril 2015.

2010

- Étude des relations entre la dynamique successionnelle des mangroves de Guyane et les fonctions microbiennes rhizosphériques. Luglia M., Criquet S., Sarrazin M., Greff S., Lecareux C., Guiral D. Colloque Connaissance et Gestion des Écosystèmes Tropicaux, 1-2 décembre 2010, Montpellier, France.

2002

- Effets d’un compost de boues urbaines sur un vignoble méditerranéen. Korboulewsky N., Greff S., Dupouyet S., Robles C., Bonin G. Congrès Environnement et Identité en Méditerranée – Corte, France. Juillet 2002.

Autres

- Stratégies d’émission de Composés Organiques Volatils (COV) par quatre végétaux méditerranéens, 2004. Ormeño E., Morin E., Fernandez C., Robles C., Greff S., Bousquet-Mélou A., Bonin G.

- Phenols and flavonols content in Pinus halepensis needles : a bioindicator of air pollution in Provence. Robles C., Korboulewsky N., Fernandez C., Greff S., Pasqualini V., Bousquet-Mélou A., Garzino S.

- Influence de la pollution atmosphérique sur les composés phénoliques du pin d’Alep (Pinus halepensis Mill.) de la région de l’Etang de Berre. Pasqualini V., Robles C., Garzino S., Greff S., Bousquet-Mélou A., Bonin G.

Congrès internationaux

2018

- Metabolomic fingerprinting of eight mangroves species from Vietnam. Bousquet-Mélou A., Baldy V., Dao Van T., Greff S., Malachin J.-R., Culioli G., Fernandez C. European Conference of Tropical Ecology - 26 au 29 Mars 2018.

2017

- Sponges produce a chemical seascape acting on benthic ecosystem functioning. Pérez T., Santonja M., Greff S., Thomas O. 10th World Sponge Conference, Galway, Ireland, 25 au 30 juin 2017.

2016

- Metabolomic fingerprints to assess macroalgal–coral interactions. Greff S., Thomas O., Pérez T. Workshop LIA MARRIO, Rio de Janeiro, Brésil, 30 au 4 novembre 2016.

- Does the metabolome of a drought-resistant species shift under water stress over the seasonal cycle ? Saunier A., Ormeno E., Greff S., Lecareux C., Fernandez C. Sfécologie-2016, International Conference of Ecological Sciences, Marseille, 24 au 27 Octobre 2016.

2015

- A chemical ecology approach to assess the proliferation of the red alga Asparagopsis taxiformis : Metabolomics, natural toxicity and biological effects. Greff S., Pérez T., Thomas O., and the SEAPROLIF consortium. International Society of Chemical Ecology Conference, Stockholm, Sweden, 29 June to 3 July 2015.

2013

- Morphologie et composition chimique des cires épicuticulaires des feuilles de quatre espèces du genre Pistacia (Anacardiaceae). Belhadj S., Gauquelin T., Greff S., Mévy J.-P. – Biotechnologies et Améliorations des productions végétales et animales : Université Ziane Achour, Djelfa, Algérie, 30-31 octobre 2013.

2012

- Allelopathy in Quercus pubescens Oak Forest : impact of chemical leaf compounds of an understory plant species on plant diversity. Fernandez C., Peano S., Santonja M., Dupouyet S., Greff S., Bousquet-Mélou A. - Phytochemical Society of Europe - Congress on Bio-communication, and semiochemicals involving plants (Biocom12). Cadiz, Espagne, 10-12 Septembre 2012.

- Composition chimique des cires épicuticulaires des feuilles de deux espèces du genre Pistacia (P. Atlantica et P. lentiscus ; Anacardiaceae) Belhadj S., Gauquelin T., Greff S., Mevy J.P. - International Congress on Aromatic and Medicinal Plants CIPAM2012, Sidi Bel-Abbes, Algérie, 8-10 Mai 2012.

2010

- How biotic and abiotic stresses affect growth and secondary metabolism in Mediterranean forest dynamic. A comparative study of a pioneer (Pinus halepensis Mill) and a late successional species (Quercus pubescens Willd). Monnier Y., Vila B., Bousquet-Melou A., Prévosto B., Greff S., Fernandez C. - International Conference on “Mechanisms of Growth, Competition and Stress Defense in Plants” - Munich, Allemagne, 1-3 Mars 2010.

[bbleu marine]2007

- Conséquences écologiques de la gestion coutumière (« agdal ») des espaces forestiers dans le Haut Atlas marocain : cas de la vallée des Aït Bouguemez. Montès N., Ballini C., Deschamps-Cottin M., Greff S., Bertaudière-Montès V., Hammi, S. - Les agdals de l’Atlas marocain : Savoirs locaux, droits d’accès, gestion de la biodiversité - Marrakech, Maroc, Mai 2007.

[bbleu marine]2006

- Contribution of some Mediterranean plants to BVOC in the atmosphere of an open and a closed environment. Preliminary study. Ormeño E., Fernandez C., Greff S., Bonin G. XVIth Air Pollution Conference – Londres, Angleterre, Mai 2006.

- Terpenes stored and released from needles of Pinus halepensis. Assesment of environmental flammability risk. Ormeño E., Mévy J.P., Bousquet-Mélou A., Vila B., Greff S., Fernandez C. 1st International Symposium on Environment Identities and Mediterranean Area - Corte-Ajaccio, France, Juillet 2006.

2004

- Phenols and flavonols content in Pinus halepensis needles : a bioindicator of air pollution in Provence. Robles C., Korboulewsky N., Fernandez C., Greff S., Pasqualini V., Bousquet-Mélou A., Garzino S. First European University Chemical and Biological approaches in Environment - Hyères, France, Septembre 2004.

Congrès nationaux

2019

- Leaf specialized metabolome of Quercus pubescens exposed to amplified drought. Saunier A., Greff S., Ormeño E., Fernandez C. Journées MetaSUD - 12 et 13 juin 2019.

- Utilisation de l’approche des réseaux moléculaires pour l’annotation du métabolome de la macroalgue brune Taonia atomaria. Carriot N., Paix B., Greff S., Briand J.F., Culioli G. Journées MetaSUD - 12 et 13 juin 2019.

2015

- Sponges smell, this is well known ! Testimony of crustaceans. Pérez T., Le Croller M., Greff S., Thomas O.P. GDR MediaTec, Banyuls, 27 au 30 octobre 2015.

- Ecologie chimique autour de l’algue rouge Asparagopsis taxiformis, une algue supposée invasive… Greff S., Pérez T., Thomas O., et le consortium SEAPROLIF. GDR MediatEC, Banyuls, 27 au 30 octobre 2015.

2014

- Diversité et fonctionnement des biomes marins littoraux de trois océans sous la pression de proliférations algales. Greff S., Dijoux L., Consortium SEAPROLIF, MediatEC, Paris, 30 octobre 2014.

2009

- Variabilité saisonnière des émissions de terpènes chez le chêne kermès, sur sol naturel et amendé. Olivier R., Baldy V., Mévy J.P., Greff S., Lecareux C., Fernandez C. - 6ème réunion GDR Ecologie Chimique, Marseille, 27-28 octobre 2009.

- La strate arborée est-elle affectée par les brûlages dirigés : comparaison du métabolisme secondaire chez deux pins méditerrannéens. Lavoir, A.V., Ormeño E., Greff S., Pasqualini V., Ferrat L., Fernandez C. - 6ème réunion GDR Ecologie Chimique, Marseille, 27-28 octobre 2009.

- Effets des stress biotiques et abiotiques sur la croissance et le métabolisme secondaire dans la dynamique successionnelle méditerranéenne : étude comparative d’une espèce pionnière (Pinus Halepensis Mill.) et d’une espèce de fin de succession (Quercus pubescens Willd.). Monnier Y., Vila B., Wisniewski N., Bousquet-Mélou A., Prévosto B., Greff S., Fernandez C. – 6ème réunion GDR Ecologie Chimique - Marseille, 27-28 octobre 2009.

2004

- Influence de paramètres écologiques sur les émissions de Composés Organiques Volatils terpéniques par trois végétaux méditerranéens. Morin E., Ormeno E., Robles C., Fernandez C., Bousquet-Mélou A., Greff S., Bonin G. Congrès Environnement et Identité en Méditerranée - Corte, Juillet 2004.

- Etude des potentialités allelopathiques du pin d’alep (Pinus halepensis) – Conséquences sur la succession secondaire. Lelong B., Fernandez C., Bousquet-Mélou A., Vila B., Robles C., Greff S., Dupouyet S. Congrès Environnement et Identité en Méditerranée – Corte, Juillet 2004.

Formations dispensées

2019

Metabolomic treatment of GC/MS data with script eRah (30 min) - Journées MétaSUD - Toulon - 12 et 13 juin 2019.

2018

LC-MS and data analyses using MetaboAnalyst (1 h) - Workshop on Good Practices in Metabolomics For Chemical Ecology - Paris - 29 octobre 2018.

Réseaux/Groupes de travail/Séminaires

2019

Journées MétaSUD, Toulon, 12 et 13 juin.
Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique, Clermont-Ferrand, 21 au 23 mai.

2018
Journées d’Ecologie chimiques MediatEC, Rennes, octobre.

2016

Workshop LIA MARRIO, Rio de Janeiro, Brésil, 30 au 4 novembre.
Journées d’Ecologie chimiques MediatEC, Marseille, 28 au 29 octobre.

2015

Journées d’Ecologie chimiques MediatEC, Banyuls, 27 au 30 octobre.

2014

Journées d’Ecologie chimiques MediatEC, Paris, 30 octobre.

2012

6ème Journées Scientifiques du Réseau Français Métabolomique et Fluxomique, Nantes, 21 au 23 mai.

Thèse de Doctorat

Métabolomique, effets biologiques et caractère invasif de la macroalgue Asparagopsis taxiformis.

Thèse soutenue le 28 novembre 2016 à la Station marine d’Endoume

Direction :
Thierry Pérez, DR CNRS, Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie marine et continentale. UMR CNRS 7263 / IRD 237, Aix-Marseille Université. Equipe « Diversité et Fonctionnement des Molécules aux Ecosystèmes ».
Olivier P. Thomas, PR-HDR, NUI Galway, University Road, Galway, Irlande

Jury :
Philippe Potin (rapporteur, Univ. Pierre et Marie Curie), Gérald Culioli (rapporteur, Univ. Toulon Var-Sud), Claude Payri (examinatrice, IRD Nouméa), Julijana Ivanisevic (examinatrice, Univ. de Lausanne), Catherine Fernandez (examinatrice, Aix Marseille Univ.), Olivier Thomas (co-directeur, Univ. de Galway), Thierry Pérez (directeur, Aix Marseille Univ.)

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Considérées comme des menaces pour les écosystèmes marins tropicaux et subtropicaux, les proliférations de macroalgues sont susceptibles de modifier le fonctionnement et la structure des récifs coralliens. Le genre Asparagopsis (Rhodophyta) est connu pour être largement distribué, introduit et parfois invasif dans certaines régions comme en Méditerranée occidentale. Le manque de connaissances concernant cette algue et ses effets réels sur les récifs nécessitait une étude interdisciplinaire afin de mieux comprendre et, le cas échéant, gérer certains évènements de proliférations. Le programme ERA–NET BIOME « SEAPROLIF » (www.seaprolif.ird) avait pour principaux objectifs d’étudier la distribution et la dynamique d’A. taxiformis en milieux tempérés et tropicaux, et d’évaluer si le caractère invasif d’A. taxiformis pouvait être expliqué par son identité génétique, son phénotype chimique ou la diversité de son microbiome associé.
Des travaux récents ont démontré l’existence de 6 lignées génétiques distinctes pour A. taxiformis. Le premier objectif de cette thèse était de corréler le métabolisme spécialisé et la bioactivité de l’algue à son génotype, et éventuellement à son caractère proliférant. Aucune corrélation génétique/métabolomique n’a été démontrée, ce qui laisse entendre que le métabolisme de cette algue serait principalement influencé par l’environnement et/ou sa flore microbienne associée. En milieu tempéré, A. taxiformis et A. armata présentent des signatures métabolomiques globalement similaires et associées à une bioactivité significativement plus importante qu’en milieu tropical. Cependant, même lorsqu’elle a été introduite, une même lignée génétique et un même phénotype chimique peuvent présenter des caractères proliférants opposés.
Nous avons également étudié l’interaction algue–coraux en s’intéressant particulièrement au rôle du métabolisme spécialisé. En milieu tropical, les extraits de macroalgues testés in situ sur 4 espèces de coraux n’ont provoqué que de faibles blanchissements. En milieu tempéré, aucun effet biologique de l’algue n’a été enregistré sur le corail Astroides calycularis. Par contre des expériences en aquarium ont permis de montrer qu’A. taxiformis pouvait exprimer un métabolisme spécifique avec une bioactivité augmentée après 10 jours de contact avec ce corail.
En conclusion, qu’elle soit indigène ou introduite, A. taxiformis exerce très peu d’effets sur la santé des coraux, et le caractère invasif de cette algue reste une source de débat.

Formation initiale

2007 Master2 « Chimie Informatique, Spectrométries, Analyse » à l’Université de Provence de Marseille

1995 Maîtrise de chimie à l’Université Louis Pasteur de Strasbourg

1994 Licence de chimie à l’Université Louis Pasteur de Strasbourg

[bleu marine1992 DEUG Sciences, Nature et Vie à l’Université Louis Pasteur de Strasbourg

1989 Baccalauréat série D, mention AB