Je suis Chimiste analytique, et je m’intéresse à l’étude de la diversité chimique marine et terrestre par des approches de métabolomique par Spectrométrie de masse Haute Résolution. Mes activités de recherche se focalisent sur l’identification des métabolites spécialisés, leur production et leur libération dans l’environnement pour mieux comprendre leur rôle dans le fonctionnement des écosystèmes, notamment dans le cadre des changements globaux.

depuis janvier 2018 Co-responsable technique du Service Commun d’Ecologie Chimique et Métabolomique (SCECM) incluant le plateau technique MALLABAR

depuis juillet 2014 Responsable technique du plateau régional MALLABAR

Janv 2009-à ce jour Ingénieur d’études en techniques d’analyse chimique

Etude et caractérisation du métabolisme spécialisé des organismes terrestres et marins dans le cadre des changements globaux.

Mots-clés : métabolomique, métabolisme spécialisé, GC/MS, UHPLC-HRMS

Sept 2000-Déc 2008 Assistant Ingénieur en techniques d’analyse chimique

Déc 1999-Sept 2000 Technicien conducteur d’appareillages au Laboratoire d’Analyse Environnementale des Procédés et des Systèmes Industriels (LAEPSI) - Institut National des Sciences Appliquées (INSA) de Lyon.

2019

– Production métabolique d’une algue rouge, une « arme » pour la prolifération ? S. Greff et T. Pérez - notice 69 dans « 101 Secrets de l’ADN » - CNRS Editions, coordonné par Denis Faure, Dominique Joly et Sylvie Salamitou.
ISBN : 978-2-271-12323-7

2024

– Genome sequencing of Porostereum spadiceum to study the degradation of levofloxacin. Ben Ayed A, Akrout I, Staita K, Albert Q, Greff S, Simmler C, Ahrendt S, LaButti K, Lipzen A, He G, Savage E, Armengaud J, Kielbasa M, Navarro D, Drula E, Turbé-Doan A, Bertrand E, Lomascolo A, Chaduli D, Faulds C, Chamkha M, Maalej A, Barry K, Grigoriev IV, Martin F, Zouari-Mechichi H, Sciara G, Mechichi T, Record E. Ecotoxicol Environ Saf, 2024, 270:115808
DOI HAL

2023

– LC-MS Based Phytochemical Profiling towards the Identification of Antioxidant Markers in Some Endemic Aloe Species from Mascarene Islands. Breaud C, Lallemand L, Mares G, Mabrouki F, Bertolotti M, Simmler C, Greff S, Mauduit M, Herbette G, Garayev E, Lavergne C, Cesari M, Bun-Llopet SS, Baghdikian B, Garayev E. Antioxidants, 2023, 12(1):50
DOI HAL

– Mangrove’s species are weak isoprenoid emitters. Saunier A, Wortham H, Ormeño E, Proffit M, Lecareux C, Greff S, Van Tan D, Sy Tuan M, Duc Hoan H, Bui Nguyen The K ; Dhaou D, Baldy V, Bousquet-Mélou A, Fernandez C 2023 Estuar Coast Shelf Sci 283:108256
DOI HAL

– In Situ Capture and Real-Time Enrichment of Marine Chemical Diversity. Mauduit M, Derrien M, Grenier M, Greff S, Molinari S, Chevaldonne P, Simmler C, Perez T. ACS Central Science, 9(11):2084-2095
DOI HAL

– Cytotoxic Metabolites from Calophyllum tacamahaca Willd. : Isolation and Detection through Feature-Based Molecular Networking. Gerometta E, Herbette G, Garayev E, Marvilliers A, Naubron JV, Di Giorgio C, Campos PE, Clerc P, Ledoux A, Frederich M, Baghdikian B, Grondin I, Gauvin-Bialecki A 2023 Metabolites 13(5):582 (Greff remerciements)
DOI HAL

– Identification of Antioxidant Metabolites from Five Plants (Calophyllum inophyllum, Gardenia taitensis, Curcuma longa, Cordia subcordata, Ficus prolixa) of the Polynesian Pharmacopoeia and Cosmetopoeia for Skin Care. Chambon M, Ho R, Baghdikian B, Herbette G, Bun-Llopet SS, Garayev E, Raharivelomanana P 2023 Antioxidants 12(10):1870 (Greff remerciements)
DOI HAL

2022

– Feature-Based Molecular Networks Identification of Bioactive Metabolites from plants of the Polynesian Cosmetopoeia targeting the Hair Cycle. Hughes K, Ho R, Greff S, Herbette G, Filaire E, Ranouille E, Berthon JY, Raharivelomanana P. Molecules, 2022, 27(1), 105
DOI HAL

– New Metabolites from the Marine Sponge Scopalina hapalia Collected in Mayotte Lagoon. Said Hassane C, Herbette G, Garayev E, Mabrouki F, Clerc P, de Voogd NJ, Greff S, Trougakos IP, Ouazzani J, Fouillaud M, Dufossé L, Baghdikian B, Ollivier E, Gauvin-Bialecki A. Marine drugs, 2022, 20:186
DOI HAL

– Amplified drought and seasonal cycle modulate Quercus pubescens leaf metabolome. Saunier A*, Greff S*, Blande J, Lecareux C, Baldy V, Fernandez C, Ormeno E. Metabolites, 2022, 12(4):307 (* co-first-authors)
DOI HAL

– Pollution gradient leads to local adaptation and small-scale spatial variability of communities and functions in an urban marine environment. Gauff RPM, Davoult D, Greff S, Bohner O, Coudret J, Jacquet S, Loisel S, Rondeau S, Sevin L, Wafo E, Lejeusne C. Science of The Total Environment, 2022, 838(1):155911
DOI HAL

– Impact of in Situ Simulated Climate Change on Communities and Non-Indigenous Species : Two Climates, Two Responses. Gauff RPM, Lejeusne C, Greff S, Loisel S, Bohner O, Davoult D. J Chem Ecol , 2022, 48:761-771
DOI HAL

– Biotransformation of the fluoroquinolone, Levofloxacin, by the white-rot fungus Coriolopsis gallica. Ben Ayed A, Akrout I, Albert Q, Greff S, Simmler S, Armengaud J, Kielbasa M, Turbé-Doan A, Chaduli D, Navarro D, Bertrand E, Faulds CB, Chamkha M, Maalej A, Zouari-Mechichi H, Sciara G, Mechichi T, Record E. Journal of Fungi, 2022, 9(9):965
DOI HAL

– Use of the allelopathic potential of mangroves in the Red River estuary (Vietnam) for the control of the rice weed Echinochloa crus-galli. Dhaou D, Baldy V, Van DT, Malachin JR, Pouchard N, Roux A, Dupouyet S, Greff S, Culioli G, Michel T, Fernandez C, Bousquet-Mélou A. Plants, 2022, 11(19):2464
DOI HAL

– Diving into the molecular diversity of Aplysina cavernicola’s exo-metabolites : contribution of bromo-spiroisoxazoline alkaloids. Mauduit M, Greff S, Herbette G, Naubron JV, Chentouf S, Huy Ngo T, Nam, JW, Molinari S, Mabrouki F, Garayev E, Baghdikian B, Pérez T, Simmler C. ACS Omega, 2022, 7(47):43068-43083
DOI HAL

– Impact of phosphate concentration on the metabolome of biofilms of the marine bacterium Pseudoalteromonas lipolytica. Carriot N, Barry‑Martinet R, Briand JF, Ortalo‑Magné A, Culioli G. Metabolomics, 2022, 18:18 (Greff remerciements)
DOI HAL

– Hydra bioassay for the evaluation of chlordecone toxicity at environmental concentrations, alone or in complex mixtures with dechlorinated byproducts : experimental observations and modeling by experimental design. Moreau X, Claeys-Bruno M, Andraud JP, Macarie H, Martínez DE, Robin M, Sergent M, De Jong L. Environ Sci Pollut Res, 2022 (Greff remerciements)
DOI HAL

– Amplified Drought Alters Leaf Litter Metabolome, Slows Down Litter Decomposition, and Modifies Home Field (Dis)Advantage in Three Mediterranean Forests. Quer E, Pereira S, Michel T, Santonja M, Gauquelin T, Simioni G, Ourcival JM, Joffre R, Limousin JM, Aupic-Samain A, Lecareux C, Dupouyet S, Orts JP, Bousquet-Mélou A, Gros R, Sagova-Mareckova M, Kopecky J, Fernandez C, Baldy V. Plants , 2022, 11(19):2582 (acquisition profils métaboliques)
DOI HAL

2021

– Integration of LC/MS-based molecular networking and classical phytochemical approach allows in-depth annotation of the metabolome of non-model organisms - The case study of the brown seaweed Taonia atomaria. Carriot N, Paix B, Greff S, Viguier B, Briand JF, Culioli G. Talanta, 2021, 225, 121925
DOI HAL

– In Vitro Hair Dermal Papilla Cells Induction by Fagraea berteroana, a Tree of the Marquesan Cosmetopoeia (French Polynesia). Hughes K, Ho R, Chazaud C, Hermitte S, Greff S, Butaud JF, Filaire E, Ranouille E, Berthon JY, Raharivelomanana P. Cosmetics , 2021, 8(1), 13
DOI HAL

– Disrupting quorum sensing alters social interactions in Chromobacterium violaceum. Mion S, Carriot N, Lopez J, Plener L, Ortalo-Magné A, Chabrière E, Culioli G, Daudé D. NPJ Biofilms Microbiome,2021, 7(1):40 (Remerciements Greff)
DOI HAL

– French Mediterranean and Atlantic populations of the brown algal genus Taonia (Dictyotales) display differences in phylogeny, surface metabolomes and epibacterial communities. Paix B, Vieira C, Potin P, Leblanc C, De Clerck O, Briand JF, Culioli G. Algal Research, 2021, 59:102452 (remerciements Greff)
DOI HAL

– Synergistic effects of temperature and light affect the relationship between Taonia atomaria and its epibacterial community : a controlled conditions study. Paix B, Potin P, Schires G, Le Poupon C, Misson B, Leblanc C, Culioli G, Briand JF. Environmental Microbiology, 2021, 23(11):6777-6797 (remerciements Greff).
DOI HAL

– Integration of spatio-temporal variations of surface metabolomes and epibacterial communities highlights the importance of copper stress as a major factor shaping host-microbiota interactions within a Mediterranean seaweed holobiont. Paix B, Layglon N, Le Poupon C, D’Onofrio S, Misson B, Garnier C, Culioli G, Briand JF. Microbiome, 2021, 9:201 (remerciements Greff)
DOI HAL

– Fernandez M, Malagoli P, Gallet C, Fernandez C, Vernay A, Ameglio T, Balandier P 2021 Investigating the role of root exudates in the interaction between oak seedlings and purple moor grass in temperate forest. Forest Ecology and Management 9491:119175 (remerciements Greff, Mallabar)
DOI HAL

2020

– Impact of ocean acidification on the metabolome of the brown macroalgae Lobophora rosacea from New Caledonia. Gaubert J, Rodolfo-Metalpa R, Greff S, Thomas O, Payri C. Algal Research, 2020, 46, 101783
DOI HAL

– Soil scarification favors natural regeneration of Pinus pinea in Lebanon forests : evidences from field and laboratory experiments. Nakhoul J, Fernandez C, Bousquet-Mélou A, Santonja M, Greff S, Dupouyet S, Nemer N, Kattar S, Abboud J, Prevosto B. Forest Ecology and Management, 2020, 49, 117840
DOI HAL

– A multi-omics analysis suggests links between the differentiated surface metabolome and epiphytic microbiota along the thallus of a Mediterranean seaweed holobiont. Paix B, Carriot N, Barry-Martinet R, Greff S, Misson B, Briand JF, Culioli G. Frontiers in Microbiology, 2020, 11, 494
DOI HAL

– Litter leachates have stronger impact than leaf litter on Folsomia candida fitness. Chomel M, Baldy V, Guittonny M, Greff S, DesRochers A. Soil Biology and Biochemistry, 2020, 147, 107850
DOI HAL

– Hair Growth Activity of Three Plants of the Polynesian Cosmetopoeia and Their Regulatory Effect on Dermal Papilla Cells. Hughes K, Ho R, Greff S, Filaire E, Ranouille E, Chazaud C, Herbette G, Butaud JF, Berthon JY, Raharivelomanana P. Molecules, 2020, 25 (19), 4360
DOI HAL

-Exploring the Role of Macroalgal Surface Metabolites on the Settlement of the Benthic Dinoflagellate Ostreopsis cf. ovata. Ternon E, Paix B, Thomas OP, Briand JF, Culioli G. Front. Mar. Sci., 2020, 7:683. (remerciements)
DOI HAL

2019

– Allelopathic effects of volatile organic compounds released from Pinus halepensis needles and roots. Santonja M, Bousquet-Mélou A, Greff S, Ormeño E, Fernandez C. Ecology and Evolution, 2019, 9, 8201-8213
DOI HAL

– Phenolics of the understory shrub Cotinus coggygria influence Mediterranean oak forests diversity and dynamics. Gavinet J, Santonja M, Baldy V, Hashoum H, Peano S, Tchong T, Gros R, Greff S, Fernandez C, Bousquet-Mélou A. Forest Ecology and Management, 2019, 441(1), 262-270
DOI HAL

– Metabolomic variability of four macroalgal species of the genus Lobophora using diverse approaches. Gaubert J, Greff S, Thomas OP, Payri C. Phytochemistry, 2019, 162, 165-172
DOI HAL

– Metabolomic and proteomic changes induced by growth inhibitory concentrations of copper in the biofilm-forming marine bacterium Pseudoalteromonas lipolytica. Favre L, Ortalo-Magné A, Kerloch L, Pichereaux C, Misson B, Briand JF, Garnier C, Culioli G. Metallomics, 2019, 11(11):1887-1899 (remerciements Greff)
DOI HAL

2018

– Distance interaction between marine cave-dwelling sponges and crustaceans. Santonja M., Greff S, Le Croller M, Thomas OP, Pérez T. Marine Biology, 2018, 165, 121
DOI HAL

– Seasonal variations of Quercus pubescens isoprene emissions from an in natura forest under drought stress and sensitivity to future climate change in the Mediterranean area. Genard-Zielinski AC, Boissard C, Ormeno E, Lathiere J, Reiter I, Wortham H, Orts JP, Temime-Roussel B, Guenet B, Bartsch S, Gauquelin T, Fernandez C Biogeosciences, 2018, 15(15):4711-4730 (Remerciements Greff)
DOI HAL

– Metabolome variability for two Mediterranean sponge species of the genus Haliclona : specificity, time, and space. Reverter M, Tribalat MA, Pérez T, Thomas O Metabolomics, 2018, 14(9):114 (remerciements Greff)
DOI HAL

– Resistance of native oak to recurrent drought conditions simulating predicted climatic changes in the Mediterranean region. Saunier A, Ormeño E, Havaux M, Wortham H, Ksas B, Temime-Roussel B, Blande J, Lecareux C, Mevy JP, Bousquet-Mélou A, Gauquelin T, Fernandez C. Plant Cell & Environment, 2018, 41(10):2299-2312 (Remerciements Greff)
DOI HAL

2017

– The interaction between the proliferating macroalga Asparagopsis taxiformis and the coral Astroides calycularis induces changes in microbiome and metabolomic fingerprints. Greff S, Aires T, Serrão EA, Engelen AH, Thomas OP, Perez T. Scientific Reports, 2017, 7, 42625
DOI HAL

– Chemogeography of the red macroalgae Asparagopsis : metabolomics, bioactivity, and relation to invasiveness. Greff S, Zubia M, Payri C, Thomas OP, Pérez T. Metabolomics, 2017, 13, 33
DOI HAL

– Discrimination of Four Marine Biofilm-Forming Bacteria by LC-MS Metabolomics and Influence of Culture Parameters. Favre L, Ortalo-Magné A, Greff S, Pérez T, Thomas O, Martin JC., Culioli G. Journal of Proteome Research, 2017, 16 (5), 1962-1975
DOI HAL

2014

– Mahorones, Highly Brominated Cyclopentenones from the Red Alga Asparagopsis taxiformis. Greff S, Zubia M, Genta-Jouve G, Massi L, Perez T, Thomas OP. Journal of Natural Products, 2014, 77, 1150-1155
DOI HAL

2013

– Does Prescribed Burning Affect Leaf Secondary Metabolites in Pine Stands ? Lavoir AV, Ormeño E, Pasqualini V, Ferrat L, Greff S, Lecareux C, Vila B, Mévy JP, Fernandez C. Journal of Chemical Ecology, 2013, 1-15
DOI HAL

2011

– Does competition stress decrease allelopathic potential ? Rivoal A, Fernandez C, Greff S, Montes N, Vila B. Biochemical Systematics and Ecology, 2011, 39 (4-6), 401-407
DOI HAL

– Compost spreading in Mediterranean shrubland indirectly increases biogenic emissions by promoting growth of VOC-emitting plant parts. Olivier R, Lavoir AV, Ormeño E, Mouillot F, Greff S, Lecareux C, Staudt M, Fernandez C. Atmospheric Environment, 2011, 45, 3631-3639
DOI HAL

– Inter-population variability of terpenoid composition in leaves of Pistacia lentiscus L. from Algeria : A chemoecological approach. Ait Said S, Fernandez C, Greff S, Torre F, Derridj A, Gauquelin T, Mévy JP. Molecules, 2011, 16 (3), 2646-2657
DOI HAL

– Inter-population variability of leaf morpho-anatomical and terpenoid patterns of Pistacia atlantica Desf. ssp. atlantica growing along an aridity gradient in Algeria. Ait Said S, Fernandez C, Greff S, Derridj A, Aired S, Gauquelin T, Mévy JP. Flora - Morphology, Distribution, Functional Ecology of Plants, 2011, 206 (4), 397-405
DOI HAL

– Direct and indirect impact of sewage sludge compost spreading on Quercus coccifera monoterpene emissions in a Mediterranean shrubland. Olivier R, Staudt M, Lavoir AV, Ormeño E, Rizvi SH, Baldy V, Rivoal A, Greff S, Lecareux C, Fernandez C. Environmental Pollution, 2011, 159, 963-969
DOI HAL

2010

– Environmental control of terpene emissions from Cistus monspeliensis L. in natural Mediterranean shrublands. Rivoal A, Fernandez C, Olivier R, Lecareux C, Greff S, Lavoir AV, Roche P, Vila B. Chemosphere, 2010, 78, 942-949
DOI HAL

2009

– Variations in allelochemical composition of leachates of different organs and maturity stages of Pinus halepensis. Fernandez C, Monnier Y, Ormeño E, Baldy V, Greff S, Pasqualini V, Mévy JP, Bousquet-Mélou A. Journal of Chemical Ecology, 2009, 35, 970-979
DOI HAL

2008

– On the relative importance of the effects of selection and complementarity as drivers of diversity-productivity relationships in Mediterranean shrublands. Montes N, Maestre FT, Ballini C, Baldy V, Gauquelin T, Planquette M, Greff S, Dupouyet S, Perret JB. Oikois, 2008, 117, 9, 1345-1350
DOI HAL

2007

– Characterization of phenolic compounds in Pinus laricio needles and their responses to prescribed burnings. Cannac M, Pasqualini V, Greff S, Fernandez C, Ferrat L. Molecules, 2007, 12, 1614-1622
DOI HAL

– Effect of intraspecific competition and substrate type on terpene emissions from some Mediterranean plant species. Ormeño E, Bousquet-Mélou A, Mevy JP., Greff S, Robles C, Bonin G, Fernandez C. Journal of Chemical Ecology, 2007, 33 (7), 277-286
DOI HAL

– Monoterpene and sesquiterpene emissions of three Mediterranean species through calcareous and siliceous soils in natural conditions. Ormeño E, Fernandez C, Bousquet-Mélou A, Greff S, Morin E, Robles C, Vila B, Bonin G. Atmospheric Environment, 2007, 41 (3), 629-639
DOI HAL

– Water deficit stress induces different monoterpene and sesquiterpene emission changes in Mediterranean species. Relationship between terpene emissions and plant water potential. Ormeño E, Mévy JP, Vila B, Bousquet-Mélou A, Greff S, Bonin G, Fernandez C. Chemosphere, 2007, 67 (2), 276-284
DOI HAL

2006

– Chemical composition of the volatile oil of Laggera aurita Schulz from Burkina Faso. Mévy JP, Bousquet-Mélou A, Greff S, Millogo J, Fernandez C. Biochemical Systematics and Ecology, 2006, 34 (11), 815-818
DOI HAL

– Composition of the volatile oil from leaves of Ximenia Americana L. Mévy JP, Bessière JM, Greff S, Zombre G, Viano J. Biochemical Systematics and Ecology, 2006, 34 (7), 549-553
DOI HAL

– Potential allelopathic effect of Pinus halepensis in the secondary succession : an experimental approach. Fernandez C, Lelong B, Vila B, Mévy JP, Robles C, Greff S, Dupouyet S, Bousquet-Mélou A. Chemoecology, 2006, 16 (2), 97-105
DOI HAL

2005

– Allelopathic potential of Medicago arborea, a Mediterranean invasive shrub. Bousquet-Mélou A, Louis S, Robles C, Greff S, Dupouyet S, Fernandez C. Chemoecology, 2005, 15 (4), 193-198
DOI HAL

2003

– Phenols and flavonoids in Allepo Pine Needles as bioindicators of Air Pollution. Robles C, Greff S, Pasqualini V, Garzino S, Bousquet-Mélou A, Fernandez C, Bonin G. Journal of Environmental Quality, 2003, 32, 2265-2271
DOI HAL

– Phenolic compounds content in Pinus halepensis Mill. needles : a bioindicator of air pollution. Pasqualini V, Robles C, Garzino S, Greff S, Bousquet-Melou A, Bonin G. Chemosphere, 2003, 52 (1), 239-248
DOI HAL

Congrès internationaux

2022

– Exploring the diversity of brominated alkaloids naturally released by the sponge Aplysina cavernicola. Mauduit M, Greff S, Pérez T, Simmler C 2022 11th World Sponge Conference, Leiden, The Netherlands, 10 to 14 October 2022
HAL

– Approche métabolomique combinant l’analyse LC-MS/MS et les réseaux moléculaires pour suivre les constituants bioactifs des amandes de Calophyllum inophyllum (tamanu) pendant le processus de séchage. Stierlin E, Ho R, Greff S, Herbette G, Raharivelomanana P 2022 Colloque Cosmétopée 2022 : « Arbres et autres plantes de la Cosmétopée : perspectives d’innovation et de valorisation des filières en Outre-mer », Cayenne, Guyane Française, 28 au 30 mars 2022 (flash Poster)

2021

– Metabolomic approach using LC-MS/MS analysis and molecular networking to follow up bioactive constituents of Callophyllum inophyllum nuts during drying process. Stierlin E, Ho R, Greff S, Herbette G, Raharivelomanana P. Vanguards of Natural Product Research 2021. 23rd July 2021 (distanciel)

– Approche métabolomique combinant l’analyse LC-MS/MS et les réseaux moléculaires pour suivre les constituants bioactifs des amandes de Calophyllum inophyllum (tamanu) pendant le processus de séchage. Stierlin E, Ho R, Greff S, Herbette G, Raharivelomanana P 2021 AFERP – Association Francophone pour l’Enseignement et la Recherche en Pharmacognosie, 15 et 16 juillet 2021, distanciel, flash poster

– Exploring the diversity of brominated alkaloids naturally released by the sponge Aplysina cavernicola. Mauduit M, Greff S, Pérez T, Simmler C. XII European Conference on Natural Products, Galway, Ireland. 30th Aug - 1st Sept 2021 (distanciel)
HAL

2020

– Molecular networks as a metabolomic tool to link traditional uses to biological activities and potential valuation of Polynesian plants. Hughes K, Ho R, Butaud JF, Greff S, Herbette G, Ranouille E., Filaire E, Berthon JY, Raharivelomanana P. European RFMF Metabomeeting, Toulouse, France, 22 au 24 janvier 2020.

2019

– Leaf specialized metabolome of Quercus pubescens exposed to amplified drought. Saunier A, Greff S, Ormeño E, Fernandez C. 12eme Colloque du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique, Clermont-Ferrand, France, 21 au 23 mai 2019.

– Annotation of new classes of lipids in the metabolome of the brown macroalga Taonia atomaria by the molecular network approach. Carriot N, Paix B, Greff S, Briand JF, Culioli G. 12eme Colloque du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique, Clermont-Ferrand, France, 21 au 23 mai 2019.

– Exploring metabolic response of Avicennia germinans along a salinity gradient. mahury, Kourou and Sinnamary estuaries, French Guyana. Dhaou D, Fernandez C, Greff S, Duplais C, Gros R, Baldy V, Bousquet-Mélou A. Mangrove, Macrobenthos and Management, Singapour, 7 au 11 juillet 2019.

– Vegetation dynamics and factors affecting natural regeneration of stone pine in Lebanon. Nakhoul J, Santonja M, Fernandez C, Greff S, Bousquet-Mélou A, Nemer N, Kattar S, Abboud J, Prévosto B. Labex Labex OT-MED Final Conference - what kind of environmental transition for the mediterranean region ? Marseille, France, 14 au 16 octobre 2019.

2018

– Identification of anti-aging natural products from southwestern Indian Ocean marine sponges and their microbial symbionts. Said Hassane C, Fouillaud M, Boyer JB, Clerc P, De Voogd N, Garayev E, Greff S, Perez T, Herbette G, Baghdikian B, Ollivier E, Dufossé L, Gauvin-Bialecki A. 18th European Congress on Biotechnology, Genève, Suisse, 1er au 4 Juillet 2018.

– Seasonal co-variation of surface metabolome and epibacterial community of the holobiont Taonia atomaria. Paix B, Othmani A, Carriot N, Debroas D, Greff S, Briand JF, Culioli G. 11ème Journées Scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique, Liège, Belgique, 23 au 25 mai 2018.

– Essai de déchloration de la CLD par réduction chimique via un couplage Fe(II)/oxydes-Fe(III). Andraud JP, Criquet S, Oursel B, Greff S, Woignier T, Macarie H. The 6th International Symposium on Environmental Biotechnology and Engineering, Ciudad Obregón, Mexique, Novembre 2018.

2017

– Metabolomic fingerprinting of 8 mangroves species from North Vietnam. Malachin JR, Greff S, Culioli G, Van Tan D, Baldy V, Pérez T, Fernandez C, Bousquet-Mélou A. World Congress of Allelopathy, Marseille, France, 24 au 28 juillet 2017.

– Integrative investigation of an unprecedented epizootic event affecting endemic sponges of Lake Baikal. Ereskovsky A, Voorhoeve A, Greff S, Chernogor LI, Chenesseau S, Khanaev I, Belikov S, Thomas OP, Pérez T. 10th World Sponge Conference, Galway, Irlande, 25 au 30 juin 2017.

2016

– Metabolomics and chemical ecology assays to understand biotic interactions in Vietnamese mangrove ecosystem. Bousquet-Mélou A, Van Tan D, Baldy V, de Rodez-Bénavent R, Pouchard N, Saunier A, Pérez T, Proffit M, Greff S, Wortham H, Sy Tuan M, Klein J, Fernandez C. Sfécologie-2016, International Conference of Ecological Sciences, Marseille, France, 24 au 27 octobre 2016.

2015

– A chemical ecology approach to assess the proliferation of the red alga Asparagopsis taxiformis : Metabolomics, natural toxicity and biological effects. Greff S, Pérez T, Thomas O, and the SEAPROLIF consortium. International Society of Chemical Ecology Conference, Stockholm, Sweden, 29 Juin au 3 Juillet 2015.

2013

– SEAPROLIF program : Diversity and functioning of coastal marine biomes under siege : implications of SEAweed PROLIFerations across three oceans. Zubia M, Cambert H, Dijoux L, Viard F, Engelen A, Perez T, Greff S, Thomas O, Petek S, Fiat S, Adjeroud M, Bouchon C, Parretti P, Monteiro J, Santos R, Quod JP, Payri C. 8th WIOMSA Scientific Symposium, Maputo, Mozambique, 28 octobre au 2 novembre 2013.

– Original highly halogenated derivatives from Asparagopsis taxiformis. Greff S, Zubia M, Perez T, Thomas OP. MaNaPro 2013, XIV International Symposium on Marine Natural Products, La Toja Island, Espagne, 15 août au 2 septembre 2013.

2012

– Isolation, chemical composition and antifungal activity of essential oils against Rhizopus oligosporus and Penicillium simplicissimum. Filippousi R, Greff S, Laffont–Schwob I, Salducci MD, Antoniou P, Roussos S. 5th Mikrobiokosmos Conference, Agricultural University of Athens, Athènes, Grèce, 13 au 15 décembre 2012.

2011

– Impact of land use change on ecosystem functioning : a case study about Pinus halepensis expansion on leaf litter decomposition process. Baldy V, Chomel M, Bousquet-Mélou A, Monnier Y, Greff S, Pernin C, Fernandez C. 12th European Ecological Federation Congress, Avila, Espagne, 25 au 29 Septembre 2011.

– Does prescribed burning affects the secondary metabolism of established stand trees of Mediterranean pines ? Lavoir AV, Pasqualini V, Ormeno E, Ferrat L, Greff S Lecareux C, Fernandez C. Medpine, 4th International Conference on Mediterranean Pines, Avignon, France, 4 au 6 juin 2011.

Congrès nationaux

2023

– Centrifugal Partition Chromatography, a sustainable tool for the purification and enrichment of cosmetic ingredients : the case of the photoprotective mycosporin-like amino acids. Michel T, Rieusset L, Simmler C, Greff S, Boulho R, Hardouin K, Bourgougnon N, Audo G, Bedoux G 2023 Cosm’ing 2023, 5 au 7 juillet 2023, Saint-Malo, France.

2022

– Approche métabolomique combinant LC-MS/MS et les réseaux moléculaires pour suivre les constituants bioactifs des amandes de Calophyllum inophyllum (tamanu) pendant le processus de séchage. Stierlin E, Ho R, Greff S, Herbette G, Raharivelomanana P 2022 Arbres et autres plantes de la Cosmétopée : Perspectives d’innovation et de valorisation des filières en Outre-Mer, Cayenne, Guyane, 28 au 30 mars 2022 (Prix de l’Innovation)
HAL

– Identification par les réseaux moléculaires de métabolites bioactifs de trois plantes de la cosmétopée polynésienne intervenant dans le cycle du cheveu via leur prolifération des cellules de la papille dermique 2022 Hughes K, Ho R, Greff S, Herbette G, Filaire E, Ranouille E, Berthon JY, Raharivelomanana P. Arbres et autres plantes de la Cosmétopée : Perspectives d’innovation et de valorisation des filières en Outre-Mer, Cayenne, Guyane, 28 au 30 mars 2022

– Diving into the chemistry of sponge exo-metabolomes : contribution of brominated specialized metabolites. Mauduit M, Greff S, Pérez T, Simmler C 2022 Ecole Thématique Metabiodivex, Aussois, France, 16 juin au 1er juillet 2022
HAL

– Un bioessai avec l’hydre d’eau douce pour évaluer la toxicité de la chlordécone aux concentrations environnementales, seule ou en mélange complexe avec des sous-produits déchlorés : observations et modélisation par plan d’expériences. Moreau X, Macarie H, Claeys-Bruno M, Andraud JP, Martínez DE, Greff S, Vanloot P, Robin M, Sergent M, de Jong L 2022 Rencontres Chlordecone 2022, Guadeloupe, Martinique, 12 au 16 décembre 2022

2019

– Leaf specialized metabolome of Quercus pubescens exposed to amplified drought. Saunier A, Greff S, Ormeño E, Fernandez C. Journées MetaSUD, Toulon, France, 12 et 13 juin 2019.

– Utilisation de l’approche des réseaux moléculaires pour l’annotation de nouvelles classes de glycérolipides au sein du métabolome de la macroalgue brune Taonia atomaria. Carriot N, Paix B, Greff S, Briand JF, Culioli G. Journées MetaSUD, Toulon, France, 12 et 13 juin 2019.

– Couplage des analyses du métabolome et du microbiome pour comprendre les interactions chimiques saisonnières entre l’algue brune Taonia atomaria et ses communautés bactériennes épiphytes. Paix B, Othmani A, Carriot N, Debroas D, Greff S, Briand JF, Culioli G. Journées MetaSUD, Toulon, France, 12 et 13 juin 2019.

– Study of root grafting in balsam fir Abies balsamea (L.). Quer E, DesRochers A, Greff S, Dupouyet S, Duval P, Lecareux C, Baldy V. Journée du GDR MediaTEC, Lille, France, 28 au 29 Octobre 2019.

2016

– Bousquet-Mélou A, Van Tan D, Baldy V, de Rodez-Bénavent R, Pouchard N, Saunier A, Pérez T, Proffit M, Greff S, Wortham H, Sy Tuan M, Klein J, Fernandez C. Journées du GDR MédiaTec, Marseille, France, 28 au 29 octobre 2016.

2015

– Congrès de l’Ecole Doctorale Sciences de l’Environnement (ED251), Cassis, France, 21 au 22 avril 2015.

2010

– Étude des relations entre la dynamique successionnelle des mangroves de Guyane et les fonctions microbiennes rhizosphériques. Luglia M, Criquet S, Sarrazin M, Greff S, Lecareux C, Guiral D. Colloque Connaissance et Gestion des Écosystèmes Tropicaux, Montpellier, France, 1er au 2 décembre 2010.

2002

– Effets d’un compost de boues urbaines sur un vignoble méditerranéen. Korboulewsky N, Greff S, Dupouyet S, Robles C, Bonin G. Congrès Environnement et Identité en Méditerranée, Corte, France, juillet 2002.

Autres

– Stratégies d’émission de Composés Organiques Volatils (COV) par quatre végétaux méditerranéens, 2004. Ormeño E, Morin E, Fernandez C, Robles C, Greff S, Bousquet-Mélou A, Bonin G.

– Phenols and flavonols content in Pinus halepensis needles : a bioindicator of air pollution in Provence. Robles C, Korboulewsky N, Fernandez C, Greff S, Pasqualini V, Bousquet-Mélou A, Garzino S.

– Influence de la pollution atmosphérique sur les composés phénoliques du pin d’Alep (Pinus halepensis Mill.) de la région de l’Etang de Berre. Pasqualini V, Robles C, Garzino S, Greff S, Bousquet-Mélou A, Bonin G.

2023

– Ultimos resultados obtenidos en la caracterizacion fisico-quimica y microbiologica de los Microorganismos de Montaña (LiFoFer). Christen P, Marois J, Ben Ammar I, Abecassis V, Lerch T, Criquet S, Nafil S, Greff S, Davidson S, Dries A, Martinez M, Cagnacci L, Miché L. International Scientific Workshop on Biochar in Sustainable Agriculture. Indio Hatuey Experimental Station, Univ. Matanzas, Cuba, 14-16 March 2023

– Le Parfum des Eponges de Méditerranée : Capture, Composition et Trésor Caché ? Simmler C, Mauduit M, Greff S, Pérez T. 15ème Congrès Francophone sur les Sciences Séparatives et les couplages de l’AFSEP (SEP2023), Paris, France, 28 au 30 mars 2023

– Tracing sponge specialized exometabolites in seawater sheds new light on their chemical diversity. Mauduit M, Grenier M, Derrien M, Greff S, Chevaldonné P, Pérez T, Simmler C. 6ème Symposium International de l’AFERP, Orsay, France, 17 au 19 juillet 2023

– Accessing the hidden treasure of brominated exometabolites released by two mediterranean sponges. Mauduit M, Greff S, Chevaldonné P, Pérez T, Simmler C. 31st International Symposium on the Chemistry of Natural Products & 11th International Congress on Biodiversity, Naples, Italie, 15 au 19 octobre 2023

2022

– Metabolomics analysis of a medicinal Polynesian plant during drying process : Calophyllum inophyllum nuts (tamanu). Stierlin É, Ho R, Greff S, Herbette G, Raharivelomanana P. 5th Global Webinar on Traditional and Integrative Medicine, Global Scientific Guild, 18-20 March 2022

2021

– Diversity and functioning of harbor communities - Studying small-scale spatial variability on different levels of biological organisation. Gauff R, Davoult D, Greff S, Bohner O, Coudret J, Loisel S, Wafo E, Lejeusne C. ECSA 58 - EMECS 13 Estuaries and coastal seas in the Anthropocene - Structure, functions, services and management. Hull, UK, 6 au 9 septembre 2021

– Metabolomic approach using LC-MS/MS analysis and molecular networking to follow up bioactive constituents of Calophyllum inophyllum nuts (tamanu) during drying process. Stierlin É, Ho R, Greff S, Herbette G, Raharivelomanana P. 4th European Conference on Natural Products, Francfort, Allemagne, 6-8 September 2021

2018

– Metabolomic fingerprinting of eight mangroves species from Vietnam. Bousquet-Mélou A, Baldy V, Dao Van T, Greff S, Malachin JR, Culioli G, Fernandez C. European Conference of Tropical Ecology - Paris - 26 au 29 Mars 2018.

2017

– Sponges produce a chemical seascape acting on benthic ecosystem functioning. Pérez T, Santonja M, Greff S, Thomas O. 10th World Sponge Conference - Galway, Irlande - 25 au 30 juin 2017.

2016

– Metabolomic fingerprints to assess macroalgal–coral interactions. Greff S, Thomas O, Pérez T. Workshop LIA MARRIO - Rio de Janeiro, Brésil - 30 au 4 novembre 2016.

– Does the metabolome of a drought-resistant species shift under water stress over the seasonal cycle ? Saunier A, Ormeno E, Greff S, Lecareux C, Fernandez C. Sfécologie-2016, International Conference of Ecological Sciences - Marseille - 24 au 27 Octobre 2016.

2015

– A chemical ecology approach to assess the proliferation of the red alga Asparagopsis taxiformis : Metabolomics, natural toxicity and biological effects. Greff S, Pérez T, Thomas O, and the SEAPROLIF consortium. International Society of Chemical Ecology Conference - Stockholm, Suède - 29 Juin au 3 Juillet 2015.

2013

– Morphologie et composition chimique des cires épicuticulaires des feuilles de quatre espèces du genre Pistacia (Anacardiaceae). Belhadj S, Gauquelin T, Greff S, Mévy JP. Biotechnologies et Améliorations des productions végétales et animales : Université Ziane Achour, Djelfa, Algérie, 30-31 octobre 2013.

2012

– Allelopathy in Quercus pubescens Oak Forest : impact of chemical leaf compounds of an understory plant species on plant diversity. Fernandez C, Peano S, Santonja M, Dupouyet S, Greff S, Bousquet-Mélou A. Phytochemical Society of Europe - Congress on Bio-communication, and semiochemicals involving plants (Biocom12) - Cadiz, Espagne - 10 au 12 Septembre 2012.

– Composition chimique des cires épicuticulaires des feuilles de deux espèces du genre Pistacia (P. Atlantica et P. lentiscus ; Anacardiaceae). Belhadj S, Gauquelin T, Greff S, Mevy JP. International Congress on Aromatic and Medicinal Plants CIPAM2012 - Sidi Bel-Abbes, Algérie - 8 au 10 Mai 2012.

2010

– How biotic and abiotic stresses affect growth and secondary metabolism in Mediterranean forest dynamic. A comparative study of a pioneer (Pinus halepensis Mill) and a late successional species (Quercus pubescens Willd). Monnier Y, Vila B, Bousquet-Melou A, Prévosto B, Greff S, Fernandez C. International Conference on “Mechanisms of Growth, Competition and Stress Defense in Plants” - Munich, Allemagne - 1er au 3 Mars 2010.

2007

– Conséquences écologiques de la gestion coutumière (« agdal ») des espaces forestiers dans le Haut Atlas marocain : cas de la vallée des Aït Bouguemez. Montès N, Ballini C, Deschamps-Cottin M, Greff S, Bertaudière-Montès V, Hammi S. Les agdals de l’Atlas marocain : Savoirs locaux, droits d’accès, gestion de la biodiversité - Marrakech, Maroc - Mai 2007.

2006

– Contribution of some Mediterranean plants to BVOC in the atmosphere of an open and a closed environment. Preliminary study. Ormeño E, Fernandez C, Greff S, Bonin G. XVIth Air Pollution Conference - Londres, Angleterre - Mai 2006.

– Terpenes stored and released from needles of Pinus halepensis. Assesment of environmental flammability risk. Ormeño E, Mévy JP, Bousquet-Mélou A, Vila B, Greff S, Fernandez C. 1st International Symposium on Environment Identities and Mediterranean Area - Corte-Ajaccio, France - Juillet 2006.

2004

– Phenols and flavonols content in Pinus halepensis needles : a bioindicator of air pollution in Provence. Robles C, Korboulewsky N, Fernandez C, Greff S, Pasqualini V, Bousquet-Mélou A, Garzino S. First European University Chemical and Biological approaches in Environment - Hyères, France - Septembre 2004.

2023

– Principaux Résultats de l’étude de la LiFoFer (2019-2023). Christen P, Miché L, Davidson S, Cagnacci L, Lerch T, Farnet AM, Rebufa C, Combet Blanc Y, Criquet S, Greff S, Martinez M, Foli L, Chemin C. Les journées nationales de la Litière forestière fermentée « Lifofer », La Roche-sur-Grane, France, 13 et 14 novembre 2023

2021

– Suivi d’un andain-pilote de compostage de sargasses polluées par la chlordécone. Devault DA, Massat F, Greff S, Dolique F, Macarie H. GFP2021 : Congrès du Groupe Français de recherches sur les Pesticides, 27 mai 2021 (distanciel)

– Accéder à la diversité des molécules naturellement libérées par les éponges : Exo-métabolites, Attrapez-les (tous) ! Mauduit M, Greff S, Pérez T, Simmler C. 7èmes Journées Scientifiques du GDR MediatEC, Toulouse, 27 au 29 octobre 2021

2020

– Diversité et fonctionnement des ports de plaisance - une variabilité multi-échelle, de la communauté au métabolome. Gauff R, Greff S, Davoult D, Lejeusne C. 1ères Journées Scientifiques numériques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique, Perpignan, France, 25 au 26 juin 2020 (distanciel)

– Getting used to the heat - Does climate change favor introduced speciesonly in already warmer climates ? Gauff R, Lejeusne C, Bohner O, Greff S, Loisel S, Davoult D. Webinar of RFMF (Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique) - RFMF junior, octobre 2020 (distanciel)

2019

– Study of root grafting in balsam fir Abies balsamea (L.). Quer E, DesRochers A, Greff S, Dupouyet S, Duval P, Lecareux C, Baldy V. ED 251, Marseille - Mars 2019.

– Leaf specialized metabolome of Quercus pubescens exposed to amplified drought. Saunier A, Greff S, Ormeño E, Fernandez C. Journées MetaSUD, Toulon - 12 et 13 juin 2019.

– Utilisation de l’approche des réseaux moléculaires pour l’annotation du métabolome de la macroalgue brune Taonia atomaria. Carriot N, Paix B, Greff S, Briand JF, Culioli G. Journées MetaSUD, Toulon - 12 et 13 juin 2019.

– Climate change alters leaf litter chemistry, slowdowns litter decomposition and modifies “Home field advantage” in three Mediterranean forests. Pereira S, Quer E, Santonja M, Gauquelin T, Simioni G, Ourcival JM, Joffre R, Limousin JM, Aupic-Samain A, Greff S, Lecareux C, Dupouyet S, Orts JP, Reiter I, Bousquet-Mélou A, Gros R, Sagova-Mareckova M, Fernandez C, Baldy V. Final Conference OTMED - what kind of environmental transition for the mediterranean region ? Marseille - 14 to 16 October 2019.

2018

– Study of root grafting in balsam fir Abies balsamea (L.). Quer E, DesRochers A, Greff S, Dupouyet S, Duval P, Lecareux C, Baldy V. Journée du GDR MediaTEC, Rennes, Novembre 2018.

2015

– Sponges smell, this is well known ! Testimony of crustaceans. Pérez T, Le Croller M, Greff S, Thomas OP. GDR MediaTec, Banyuls, 27 au 30 octobre 2015.

– Ecologie chimique autour de l’algue rouge Asparagopsis taxiformis, une algue supposée invasive… Greff S, Pérez T, Thomas O, et le consortium SEAPROLIF. GDR MediatEC, Banyuls, 27 au 30 octobre 2015.

2014

– Diversité et fonctionnement des biomes marins littoraux de trois océans sous la pression de proliférations algales. Greff S, Dijoux L, Consortium SEAPROLIF, MediatEC, Paris, 30 octobre 2014.

2009

– Variabilité saisonnière des émissions de terpènes chez le chêne kermès, sur sol naturel et amendé. Olivier R, Baldy V, Mévy JP, Greff S, Lecareux C, Fernandez C. 6ème réunion GDR Ecologie Chimique, Marseille, 27-28 octobre 2009.

– La strate arborée est-elle affectée par les brûlages dirigés : comparaison du métabolisme secondaire chez deux pins méditerrannéens. Lavoir AV, Ormeño E, Greff S, Pasqualini V, Ferrat L, Fernandez C. 6ème réunion GDR Ecologie Chimique, Marseille, 27-28 octobre 2009.

– Effets des stress biotiques et abiotiques sur la croissance et le métabolisme secondaire dans la dynamique successionnelle méditerranéenne : étude comparative d’une espèce pionnière (Pinus Halepensis Mill.) et d’une espèce de fin de succession (Quercus pubescens Willd.). Monnier Y, Vila B, Wisniewski N, Bousquet-Mélou A, Prévosto B, Greff S, Fernandez C. 6ème réunion GDR Ecologie Chimique - Marseille, 27-28 octobre 2009.

2004

– Influence de paramètres écologiques sur les émissions de Composés Organiques Volatils terpéniques par trois végétaux méditerranéens. Morin E, Ormeno E, Robles C, Fernandez C, Bousquet-Mélou A, Greff S, Bonin G. Congrès Environnement et Identité en Méditerranée - Corte, Juillet 2004.

– Etude des potentialités allelopathiques du pin d’alep (Pinus halepensis) – Conséquences sur la succession secondaire. Lelong B, Fernandez C, Bousquet-Mélou A, Vila B, Robles C, Greff S, Dupouyet S. Congrès Environnement et Identité en Méditerranée – Corte, Juillet 2004.

2023

– Metabolite extraction and analysis in chemical ecology. Plan Structurant de Formation IRD CHEMMANGO. Hanoi, Vietnam, 4 to 16th january 2023.

– Metabolite extraction and analysis in chemical ecology. Plan Structurant de Formation IRD CHEMMANGO. Ho Chi Minh, Vietnam, 4 to 12th november 2023. (1h30 course + 2 practicals of 3 h, GC-MS and LC-MS analysis).

2019

– Metabolomics approaches in chemical ecology : use of high resolution mass spectrometry - Mobilité Internationale de Crédit (MIC AMU) - Universidade Federal do Rio de Janeiro - 27 octobre au 11 novembre 2019.

– Metabolomic treatment of GC/MS data with script eRah (30 min) - Journées MétaSUD - Toulon - 12 et 13 juin 2019.

2018

– LC-MS and data analyses using MetaboAnalyst (1 h) - Workshop on Good Practices in Metabolomics For Chemical Ecology - Paris - 29 octobre 2018.

2023

Hien KHONG THU
Role of plant-plant interaction in mangrove ecosystem succession of the Red River Delta : Untargeted metabolomic approach for the study of mangrove potential allelochemicals
University of Science and technology of Hanoi, Vietnam
Encadrement : Dounia DHAOU, Stéphane GREFF, Anne BOUSQUET-MELOU

Huyen BUI
The metabolomic diversity of marine magnoliophyta from Vietnam to the
Mediterranean Sea
University of Science and technology of Hanoi, Vietnam
Encadrement : Salomé COQUIN, Stéphane GREFF, Catherine FERNANDEZ

2020

Morgane MAUDUIT
Optimizing Aplysina cavernicola exo-metabolome capture by solid phase adsorption.
Final project of engineering school - Ecole Supérieure de Chimie Organique et Minérale (ESCOM) de Compiègne
Encadrement : Charlotte SIMMLER, Thierry PEREZ, Stéphane GREFF

2019

Damien DEVILLY
Développement méthodologique pour l’étude de l’exométabolome des organismes et des paysages chimiques marins.
Master 2 Sciences de la mer, Parcours Interactions biotiques et Perturbations Anthropiques en environnement marin - UFR Sciences et Techniques, Université de Toulon
Encadrement : Thierry PEREZ, Mathieu SANTONJA, Stéphane GREFF

Métabolomique, effets biologiques et caractère invasif de la macroalgue Asparagopsis taxiformis

Thèse soutenue le 28 novembre 2016 à la Station marine d’Endoume

Direction :
Thierry Pérez, DR CNRS, Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie marine et continentale. UMR CNRS 7263 / IRD 237, Aix-Marseille Université. Equipe « Diversité et Fonctionnement des Molécules aux Ecosystèmes ».
Olivier P. Thomas, PR-HDR, NUI Galway, University Road, Galway, Irlande

Jury :
Philippe Potin (rapporteur, Univ. Pierre et Marie Curie), Gérald Culioli (rapporteur, Univ. Toulon Var-Sud), Claude Payri (examinatrice, IRD Nouméa), Julijana Ivanisevic (examinatrice, Univ. de Lausanne), Catherine Fernandez (examinatrice, Aix Marseille Univ.), Olivier Thomas (co-directeur, Univ. de Galway), Thierry Pérez (directeur, Aix Marseille Univ.)

Considérées comme des menaces pour les écosystèmes marins tropicaux et subtropicaux, les proliférations de macroalgues sont susceptibles de modifier le fonctionnement et la structure des récifs coralliens. Le genre Asparagopsis (Rhodophyta) est connu pour être largement distribué, introduit et parfois invasif dans certaines régions comme en Méditerranée occidentale. Le manque de connaissances concernant cette algue et ses effets réels sur les récifs nécessitait une étude interdisciplinaire afin de mieux comprendre et, le cas échéant, gérer certains évènements de proliférations. Le programme ERA–NET BIOME « SEAPROLIF » (www.seaprolif.ird) avait pour principaux objectifs d’étudier la distribution et la dynamique d’A. taxiformis en milieux tempérés et tropicaux, et d’évaluer si le caractère invasif d’A. taxiformis pouvait être expliqué par son identité génétique, son phénotype chimique ou la diversité de son microbiome associé.
Des travaux récents ont démontré l’existence de 6 lignées génétiques distinctes pour A. taxiformis. Le premier objectif de cette thèse était de corréler le métabolisme spécialisé et la bioactivité de l’algue à son génotype, et éventuellement à son caractère proliférant. Aucune corrélation génétique/métabolomique n’a été démontrée, ce qui laisse entendre que le métabolisme de cette algue serait principalement influencé par l’environnement et/ou sa flore microbienne associée. En milieu tempéré, A. taxiformis et A. armata présentent des signatures métabolomiques globalement similaires et associées à une bioactivité significativement plus importante qu’en milieu tropical. Cependant, même lorsqu’elle a été introduite, une même lignée génétique et un même phénotype chimique peuvent présenter des caractères proliférants opposés.
Nous avons également étudié l’interaction algue–coraux en s’intéressant particulièrement au rôle du métabolisme spécialisé. En milieu tropical, les extraits de macroalgues testés in situ sur 4 espèces de coraux n’ont provoqué que de faibles blanchissements. En milieu tempéré, aucun effet biologique de l’algue n’a été enregistré sur le corail Astroides calycularis. Par contre des expériences en aquarium ont permis de montrer qu’A. taxiformis pouvait exprimer un métabolisme spécifique avec une bioactivité augmentée après 10 jours de contact avec ce corail.
En conclusion, qu’elle soit indigène ou introduite, A. taxiformis exerce très peu d’effets sur la santé des coraux, et le caractère invasif de cette algue reste une source de débat.

2007 Master2 « Chimie Informatique, Spectrométries, Analyse » à l’Université de Provence de Marseille

1995 Maîtrise de chimie à l’Université Louis Pasteur de Strasbourg

1994 Licence de chimie à l’Université Louis Pasteur de Strasbourg

1992 DEUG Sciences, Nature et Vie à l’Université Louis Pasteur de Strasbourg

1989 Baccalauréat série D, mention AB

2019

Journées MétaSUD, Toulon, 12 et 13 juin.
Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique, Clermont-Ferrand, 21 au 23 mai.

2018

Journées d’Ecologie chimiques MediatEC, Rennes, octobre.

2016

Workshop LIA MARRIO, Rio de Janeiro, Brésil, 30 au 4 novembre.
Journées d’Ecologie chimiques MediatEC, Marseille, 28 au 29 octobre.

2015

Journées d’Ecologie chimiques MediatEC, Banyuls, 27 au 30 octobre.

2014

Journées d’Ecologie chimiques MediatEC, Paris, 30 octobre.

2012

6ème Journées Scientifiques du Réseau Français Métabolomique et Fluxomique, Nantes, 21 au 23 mai.