Thémes de recherche

actuels
- Evaluation de la diversité microbienne associées aux litières de feuille, au coralligène et au sédiments marins par séquençage haut débit (metabarcoding)
- Comprendre la rhizosphère de l’Astragale de Marseille (Astragalus tragacantha) dans une perspective de renforcement des populations du Parc National des Calanques
- Diversité microbienne associée aux litières de feuilles et relations avec le fonctionnement des écoystèmes forestier et de garrigues sous contraintes hydrique (site expérimentaux O3HP et CLIMED)

passés
- Communautés microbiennes associées aux oiseaux sauvages (plumage, cloaque) : rôle sur le comportement (e.g. reproduction, nichée, entretien sanitaire …).
- Ecologie et épidémiologie moléculaire : détection de bactéries pathogènes et de parasites sanguin, recherche de gènes de résistance aux antibiotiques.
- Mécanismes de transferts génétiques chez les bactéries du sol et évaluation des risques liés à la culture des plantes transgéniques.
- Caractérisation génétique et biochimique de sulfatases bactériennes : importance dans le cycle du soufre du sol et sur la croissance des plantes
- Métabolismes bactériens du fer (synthèse de sidérophores) et de l’azote (dénitrification) : rôle dans la colonisation de la rhizosphère.
- Oxydo-réductrion biologique du manganèse dans les sédiments aquifères et pollution des eaux courantes.