Station Marine d'Endoume

L’IMBE mène à la station marine d’Endoume des recherches multidisciplinaires visant à décrire et comprendre la dynamique et l’évolution de la biodiversité littorale.

Nos équipes de recherche

• L’équipe BEEM (Biologie, Evolution et Ecologie Moléculaires)

BEEM rassemble des expertises en biologie, expérimentation, analyse et modélisation, centrées sur la variabilité de l’information génétique pour étudier la diversité, l’évolution et l’écologie des organismes. Ses modèles d’étude couvrent un large éventail d’organismes, des métazoaires aux viridiplantae et rhodophytes, ainsi que des communautés microbiennes de nombreux phylums, en milieu marin ou émergé. Les thèmes de recherche de BEEM s’appuient sur un socle conceptuel solide en biologie évolutive et sur les méthodes universelles d’étude des génomes, incluant la systématique et l’évolution biologique, la génétique, l’écologie des communautés et la réponse éco-évolutive des organismes aux changements environnementaux.

• L’équipe NEMO (Nature, Ecologie Marine et Océans).

NEMO étudie la biodiversité marine dans toutes ses composantes en promouvant la combinaison d’approches naturalistes, chimiques et expérimentales. NEMO est spécialisé dans l’écologie d’écosystèmes particuliers (grottes sous-marines, coralligène et récifs coralliens, milieux profonds, polaires, et milieux urbanisés tels que ports et marinas). L’équipe étudie également la chimie des substances naturelles, la taxonomie intégrative et la biologie de certains invertébrés marins (éponges, anthozoaires, crustacés, bryozoaires et ascidies notamment).

Nos Services Communs

Les équipes BEEM et NEMO s’appuient sur squatre services communs offrant compétences et ressources techniques :

• Service Biologie Moléculaire et Cellulaire

Le service BMC est un plateau technique de pointe dédié à l’étude des macromolécules du vivant (ADN, ARN et Protéines). Doté de salles dédiées et d’une organisation monodirectionnelle, il garantit des conditions optimales pour les approches sensibles. Il fournit un appui scientifique complet — équipements mutualisés, expertise, formation et conseil — au service de projets de recherche variés, incluant des modèles biologiques conventionnels et non conventionnels, marins ou terrestres. 

• Service Préparation des échantillons pour l’ObservaTion et la production d’images

Le service SPOT est dédié à l’imagerie et aux préparations d’échantillons destinées à l’observation et à l’analyse en microscopie. Il couvre un large champ d’investigation, par la production d’images allant du paysage aux microstructures cellulaires. L’équipe maîtrise l’ensemble des techniques et les adapte selon les besoins spécifiques des projets de recherche de l’IMBE. Ce service dispose d’outils variés de production d’images (drone, binoculaires, microscopes optiques et électroniques) et propose des techniques de préparation d’objets à observer (photogrammétrie, pétrographie, préparation des pollens, histologie, et cytologie). L’objectif est d’apporter un conseil et appui technique aux personnels travaillant sur l’évolution du paysage, les cycles de vie, la taxonomie, la structure morphologique et cellulaire. L’équipe assure également la formation des utilisateurs aux différentes techniques du service. Il dispose de salle de tri, de préparation et d’observation.

• Service Métabolomique et Chimie des Substances Naturelles

Le service MSN s’inscrit dans le champ de l’écologie chimique, une discipline pluridisciplinaire qui étudie les interactions entre les organismes et leur environnement. Ces interactions sont en grande partie médiées par des métabolites spécialisés, essentiels à la communication chimique, à la défense face aux stress environnementaux et, plus largement, au fonctionnement des écosystèmes et à la structuration de la biodiversité.

Dans ce contexte, la métabolomique par spectrométrie de masse constitue un outil central pour explorer les variations qualitatives et quantitatives des métabolites chez des organismes marins et terrestres sessiles. Cette approche permet notamment d’apporter des réponses aux enjeux liés au changement global en caractérisant les réponses métaboliques des organismes à leur environnement. Afin de compléter et de consolider ces analyses, la chimie des substances naturelles intervient en permettant la purification, l’identification et la caractérisation structurale des métabolites d’intérêt. Elle joue ainsi un rôle clé pour confirmer l’identité des composés détectés et en assurer une quantification absolue dans les échantillons.

• Service Expérimentations et Moyens à la Mer

Le service EMM permet la stabulation, l’élevage et l’expérimentation sur les invertébrés marins étudiés à la station. Il dispose de trois salles dédiées : une salle en eau de mer artificielle et deux en eau de mer naturelle courante, avec un parc d’une quarantaine d’aquariums de différents formats. Ces approches ex situ sont complétées par des approches in situ, réalisées par les plongeurs de l’IMBE avec le concours du Service commun de plongée de l’OSU Pytheas. La présence de ce service sur le site d’Endoume garantit un transport rapide et sécurisé des échantillons depuis le prélèvement en mer jusqu’aux aquariums, limitant les perturbations et facilitant l’acclimatation des modèles biologiques.

IMBE TV : une chaîne au service de la diffusion scientifique

La station marine accueille également la chaîne Web IMBE TV, dédiée à la diffusion et à la valorisation des recherches menées à la station marine et au sein de l’IMBE. À travers des contenus originaux (vidéos, reportages, interviews), elle met en lumière les missions de terrain, les projets scientifiques et les dernières avancées de la recherche. Cette initiative contribue à rendre les connaissances scientifiques accessibles à un large public et à renforcer les liens entre science et société. 

Parmi les différentes rubriques proposées, deux formats illustrent particulièrement cette démarche :

• Les Mercredis d’Endoume

Cette série de conférences grand public permet aux chercheurs de présenter leurs travaux dans un format accessible et convivial.

Ces rencontres favorisent les échanges directs avec le public et participent activement à la diffusion de la culture scientifique, notamment autour des enjeux environnementaux et marins.

• Le magazine C publié 

Le magazine C Publié met en avant les publications scientifiques de l’IMBE et de l’Institut Pythéas.

Dans chaque épisode, un auteur présente ses travaux de recherche ainsi que les résultats obtenus. Ce format permet de découvrir régulièrement, en images, une nouvelle communication scientifique, tout en rendant ces contenus plus accessibles à tous.