Sophie Gachet

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Maître de Conférences

Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie Marine et Continentale (IMBE)
IMBE UMR CNRS 7263, IRD 237
Université Aix-Marseille - Campus Etoile St Jérôme
Av Escadrille N. Niémen - case 421 -
13397 Marseille cedex 20
Tel. 04.91.28.83.31
sophie.gachet-at-imbe.fr

Biosketch

Docteur en Écologie, Ingénieur Agronome

Mots-clés : Écologie des communautés végétales, traits fonctionnels de plantes, écologie forestière, bases de données, modélisation, analyses de données, science participative

CV

depuis le 1er septembre 2008 : Maître de Conférences à l’Institut Méditerranéen d’Ecologie et de Biodiversité continentale et marine (Aix-Marseille Université)

2005-2008 : Maître de Conférences au Muséum national d’Histoire naturelle (Paris)

2003-2005 : Stagiaire post-doctorale à la Chaire industrielle en Aménagement Forestier Durable (Canada) (« Diversité de la végétation du sous-bois en plantations de pin gris : effet de l’antécédent cultural et comparaison avec les forêts naturelles »)

1998-2002 : Doctorat en Ecologie à l’Université Paul-Cézanne (« Organisation de la biodiversité forestière : vers une modélisation de la dynamique du sous-bois en fonction des pratiques sylvicoles »)

1995-96 : DESS Informatique Double-Compétence, à l’Université de la Méditerranée

1993-95 : Diplôme d’Agronomie Approfondie, spécialisation en Génie Agronomique, à l’Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Montpellier (titre : Ingénieur Agronome)

Publications

1. Lucie Schurr, Véronique Masotti, Benoît Geslin, Sophie Gachet, Prisca Mahé, Léna Jeannerod, Laurence Affre (soumis) Is fennel crop dependent on insect pollination ?

2. Sabatini Francesco Maria ; Lenoir, Jonathan ; Hattab, Tarek ; Arnst, Elise ; Chytry, Milan ; […] Gachet, Sophie ; […] Zobel, Martin ; Bruelheide, Helge (2021) sPlotOpen : An environmentally balanced, open-access, global dataset of vegetation plots. Global Ecol. Biogeogr. 2021 ;30:1740–1764. (DOI.org/10.1111/geb.13346) [IF = 5,958]

3. Schurr, L. ; Geslin, B. ; Affre, L. ; Gachet, S. ; Delobeau, M. ; Brugger, M. ; Bourdon, S. ; Masotti, V. (2021) Landscape and local drivers affecting the flower-visitors of fennel (Foeniculum vulgare, Apiaceae) and implications for its yield. Insects, 12(5):407 (DOI:10.3390/insects12050407) [IF 2019=2.327]

4. David R., Mabile L., Bailo D., Gachet S., […] and the Research Data Alliance.(2020) FAIRness literacy : the Achilles’ heel of applying FAIR principles. Data Sci J 19(1) 32:1-11 (DOI : 10.5334/dsj-2020-032) [IF 2018=1.160]

5. Geslin Benoît, Sophie Gachet, Magali Deschamps-Cottin, Floriane Flacher, Benjamin Ignace, Corentin Knoploch, Éric Meineri, Christine Robles, Lise Ropars, Lucie Schurr & Violette Le Féon. (2020) Bee hotels host a high abundance of exotic bees in an urban context. Acta Oecologica, 105, pp.103556 (DOI : 10.1016/j.actao.2020.103556) [IF 2018=1.478]

6. Kattge J., […] Gachet S., […] and the TRY consortium. (2020) TRY plant trait database - enhanced coverage and open access. Global Change Biol. 26:119-188. (DOI : 10.1111/gcb.14904) [IF 2018=8.880] Commentary : Fraser, LH. TRY—A plant trait database of databases. Global Change Biol. 2020 26:189-190. (DOI : 10.1111/gcb.14869)

7. Abadie J., Dupouey JL, Salvaudon A., Gachet S., Videau N., Avon C.,Dumont J., Tatoni T. & Bergès L. (2020) Historical ecology of Mediterranean forests : land use legacies on current understory plants differ with time since abandonment and former agricultural use. Journal of Vegetation Science (DOI : 10.1111/jvs.12860) [IF 2018=2.944]

8. Boutin, N., Batteau, P., Hernandez, S., Gachet, S., Raynal, JC. (2019). Conflits environnementaux, milieux naturels, et décisions publiques. Étude de deux cas industriels. Revue Politiques et management public 36(2):141-167. (DOI : 10.3166/pmp.36. 2019.00011)

9. Borgy Benjamin, Cyrille Violle, Philippe Choler, Pierre Denelle, François Munoz, Jens Kattge, Sandra Lavorel, Jessy Loranger, Bernard Amiaud, Michael Bahn, Peter M. van Bodegom, Henry Brisse, Guilhem Debarros, Sylvain Diquelou, Sophie Gachet, Claudy Jolivet, Servane Lemauviel-Lavenant, Alexis Mikolajczak, Jean Olivier, Jenny Ordoñez, Patrice de Ruffray, Nicolas Viovy, Eric Garnier (2017) Plant community structure and nitrogen inputs modulate the climate signal on leaf trait. Global Ecology and Biogeography, 26(10):1138-1152. (DOI : 10.1111/geb.12623) [IF = 5.667]

10. Metzner K, Gachet S, Rocarpin P, Saatkamp A. (2017) Seed bank, seed size and dispersal in moisture gradients of temporary pools in Southern France. Basic and Applied Ecology, 21:13-22. (DOI : 10.1016/j.baae.2017.06.003) [IF 2018 = 2.474]

11. Borgy, B ; Violle, C ; Choler, P ; Garnier, E ; Kattge, J ; Loranger, J ; Amiaud, B ; Cellier, P ; Debarros, G ; Denelle, P ; Diquelou, S ; Gachet, S ; Jolivet, C ; Lavorel, S ; Lemauviel-Lavenant, S ; Mikolajczak, A ; Munoz, F ; Olivier, J ; Viovy, N. (2017) Sensitivity of community-level trait-environment relationships to data representativeness : a test for functional biogeography. Global Ecology and Biogeography 26(6):729-739. (DOI : 10.1111/geb.12573) [IF = 5,958]

12. Garnier E, Stahl U, Laporte MA, Kattge J, Mougenot I, Kühn I, Laporte B, Amiaud B, Arhestani F, Bönisch G, Bunker D, Cornelissen H, Díaz S, Enquist B, Gachet S, Kleyer M, Lavorel S, Pérez-Harguindeguy N, Maicher L, Naeem S, Poorter H, Schildhauer M, Shipley B, Violle C, Weiher E, Wright IJ, Klotz S. (2016) Towards a thesaurus of plant characteristics : an ecological contribution. J. Ecology 105(2):298-309. (DOI : 10.1111/1365-2745.12698) [IF 2018=5.680]

13. Ngueguim JR, Zapfack L, Onana JM, Noiha NV, Onana D, Betti JL, Gachet S, & Riéra B. (2016) Can the Mangombe forest plantations contribute to restore and conserve biodiversity ? Int. J. Biol. Chem. Sci. 10(1) : 355-368. (DOI : 10.4314/ijbcs.v10i1.27) [IF = 0.310]

14. Rocarpin P, Gachet S., Metzner K & Saatkamp A. (2016) Moisture and soil parameters drive community assembly in temporary pools. Hydrobiologia, 781(1):55–66. (DOI :10.1007/s10750-015-2604-7) [IF 2018 = 2.325]

15. Violle C, Choler P, Borgy B, Garnier E, Amiaud B, Debarros G, Diquelou S, Gachet S, Jolivet C, Kattge J, Lavorel S, Lemauviel-Lavenant S, Loranger J, Mikolajczak A, Munoz F, Olivier J, Viovy N. (2015) Vegetation Ecology meets Ecosystem Science : French Permanent Grasslands as a functional biogeography case study. Science of the Total Environment, 534:43–51. (DOI : 10.1016/j.scitotenv.2015.03.141) [IF 2018 = 4.610]

16. Brakchi-Ouakour L., Kadik L. & Gachet S. (2015) Typologie fonctionnelle et taxonomique des pinèdes de l’Algérois et de l’Oranais. Rev. Écol. (Terre Vie), 70(3):231-247. (http://hdl.handle.net/2042/56758) [IF 2018= 0.350]

17. Salmon S, Ponge JF, Gachet S, Deharveng L, Lefebvre N, Delabrosse F. (2014) Linking species, traits and habitat features of Collembola at large scale. Soil Biology and Biochemistry, 75:73–85. [IF 2018= 5.290]

18. Chateil C., Goldringer I., Tarallo L., Kerbiriou C., Leviol I., Ponge J-F., Salmon S., Gachet S., Porcher E. (2013) Crop genetic diversity benefits farmland biodiversity in cultivated fields. Agriculture, Ecosystems and Environment, 171:25-32. [IF 2018= 4.099]

19. Palla F., Gachet S., Picard N. & Riéra B. (2013). Defining vegetation groups from life-history traits for the management of a savannah-forest mosaic in the Lopé National Park, Gabon. Journal of Tropical Forest Science, 25:454-466.

20. Saatkamp A., Affre L., Baumberger T., Gasmi A., Dumas P.J., Gachet S. & Arène F. (2011). Soil depth detection by seeds and diurnally fluctuating temperatures : different dynamics in 10 annual plants. Plant Soil 349:331–340. [IF 2018= 2.969]

21. Rebbas K., Véla E., Gharzouli R., Djellouli Y., Alatou D. & Gachet S. (2011). Caractérisation phytosociologique du Parc National de Gouraya (Béjaïa, Algérie). Rev. Écol. (Terre Vie), 66:267-289. [IF 2018= 0.350]

22. Pavoine S., Véla E., Gachet S., de Bélair G. & Bonsall M. (2011). Linking patterns in phylogeny, traits, abiotic variables and space : a novel approach to linking environmental filtering and plant community assembly. Journal of Ecology 99 : 165–175 [IF 2018= 5.172]

23. Gachet S., Sarthou C., Bardat J. & Ponge J.F. (2009). The state of change of Erica scoparia L. heathland through cattle grazing and oak invasion. Rev. Écol. (Terre Vie), vol. 64 : 3-17. [IF 2018= 0.350]

24. Pavoine S., Vallet J., Dufour A.B., Gachet S. & Daniel H. (2009). On the challenge of treating various types of variables and its consequence in functional ecology. Oïkos 118:391-402. [IF 2018= 3.710]

25. Aubin I., Gachet S., Messier C. & Bouchard A. (2007). How stable are northern hardwood forests to human disturbance ? An evaluation using a plant functional group approach. Ecoscience 14(2) : 259-271. [IF 2018= 0.696]

26. Gachet S., Leduc A., Bergeron Y., Nguyen-Xuan T. & Tremblay F. (2007). Understory vegetation of boreal tree plantations : Differences in relation to previous land use and natural forests. Forest Ecology and Management 242:49-57. [IF 2018= 3.126]

27. Haeussler S., Macdonald S.E., Gachet S., Bergeron Y. (2007). Understory and epiphytic vegetation as indicators of the ecological integrity of managed forests : a synthesis of the special issue. Forest Ecology and Management 242:1-4. [IF 2018= 3.126]

28. Gachet S., Véla E. & Tatoni T. (2005). BASECO : a floristic and ecological database of Mediterranean French flora. Biodiversity and Conservation 14:1023-1034. [IF 2018= 3.142]

29. Gritti E.S., Gachet S., Sykes M. & Guiot J. (2004). An extended probabilistic approach of plant vital attributes : an application to European pollen records at 0 and 6 KA. Global Ecology and Biogeography, 13 : 519-533. [IF 2018= 5.273]

30. Roche P., Diaz-Burlinson N., & Gachet S. (2004). Congruency analysis of species ranking based on leaf traits : which traits are the more reliable ? Plant Ecology 174(1) : 37-48. [IF 2018= 1.829]

31. Gachet, S., Brewer, S., Cheddadi, R., Davis, B., Gritti, E. & Guiot, J. (2003) A new biogeographical approach to attribute pollen taxa to plant functional types in Europe (18,000 to present). Global Ecology and Biogeography 12(2) : 103-118. [IF 2018= 5.273]

Ouvrages et chapitres d’ouvrages

1. Nicault A. et al. (2021) Le Parc naturel régional du Verdon face aux défis du changement climatique, Les cahiers du GREC-SUD, édités par l’Association pour l’innovation et la recherche au service du climat (AIR Climat), 91 pages. ISBN : 978-2-491380-02-1 (participation au chapitre 5.3 portant sur les sciences participatives)

2. Lavorel S, Gachet S, Sahl A, Colace MP, Gaucherand S, Burylo M, & Bonet R (2010). A plant functional traits data base for the Alps. In : EM Spehn & C Körner (eds) Data mining for global trends in mountain biodiversity. CRC Press/Taylor and Francis, Boca Raton. p. 107-122

3. Gachet S. & Bergonzini J.C. (2003) Bouquet de Flore : synthèse sur les bases de données floristiques et leurs composantes forestières. GIP-ECOFOR éditions. 128p. (se référer au site suivant : http://www.gip-ecofor.org/ecofor/publi/page.php?id=5669)

Enseignement

- Cours, travaux dirigés, travaux pratiques, sorties sur le terrain, en Licence et Master
Disciplines enseignées : dynamique des écosystèmes, initiation aux bases de données, biostatistiques, échantillonnage, génétique des populations, communication scientifique, écologie générale, diversité du monde vivant, diversité des plantes, morpho-anatomie des plantes, approche par traits fonctionnels, interactions biotiques, méthodologie du travail universitaire...

- DESU Biodiversités, Villes et Territoires (CVRH)
https://formations.univ-amu.fr/FHULBI.html
Disciplines enseignées : initiation à l’écologie et à la biodiversité, méthodes d’échantillonnage, vulgarisation, encadrement de mémoires...

- Collaborations avec le rectorat d’Aix-Marseille
- Projet PASS (initiation à la biodiversité en Collège)
- Projet Ascenseur Social (projet du labex A*Midex d’échange entre enseignants du secondaire et de l’université afin d’augmenter les taux de réussite des étudiants)

Encadrement

par GACHET Sophie

--- Coencadrement de thèses ---

- 2007-2010 : codirection de la thèse de Carole CHATEIL (MNHN-ENS) avec Emmanuelle Porcher (HDR MNHN) « Organisation de la biodiversité en milieu agricole : réponses structurales et fonctionnelles des communautés végétales et de la faune édaphique aux pratiques agricoles et à la structure du paysage » – soutenue le 9 décembre 2010.

- depuis 2013 : codirection de la thèse de Nathalie BOUTIN (avec S. Hernandez, IMPGT, et P. Batteau, IAE) « Territorial management of biodiversity in a context of growing urbanization and intense interactions man-nature. A multi site analysis. » (Financement labex OT-MED : http://www.otmed.fr/spip.php?article539)

--- Autres encadrements/coencadrements ---

- Stages de M2 Recherche
- Carole Chateil, bords de champs (codir. E. Porcher, MNHN)
- Anne Trouillon, forêt de Guyane (codir. B. Riéra, MNHN)
- Pauline Rocarpin, mares temporaires méditerranéennes (codir. A. Saatkamp, IMBE)

-  Stages de M2 Pro
- Amandine Sahl, traits de la flore alpine (codir. S. Lavorel, LECA, I. Mougenot, LIRMM) (M2 de Bioinformatique)
- Jérôme Volant, Ophrys de Provence (codir. E. Véla, AMAP)
- Nathalie Boutin, recherche sur les interactions Hommes-Milieux : implication du grand public et des acteurs locaux
- Kristin Metzner : mares temporaires méditerranéennes (codir. Arne Saatkamp, IMBE)

- Stages de M1
- Mounir Zeroual, traits fonctionnels de la flore du sous-bois de la forêt de Litimé, Togo
- Blandine Ghilem, traits de dispersion des diaspores de la flore d’Ile de France
- Constantin Dancau, forêt de Guyane (codir. B. Riéra, MNHN)
- Noëlla Lefebvre, Florian Delabrosse, Aurore Clonrozier, traits de vie des collemboles (codir. S. Salmon, MNHN)
- Céline Ceccarelli & Caroline Matusiak, terrils de Provence
- Lara Dixon & Marie-Sophie Garcia, végétation des zones humides
- Hamid Mouloudj & Mohamed Rahmani, croissance des pins sur les terrils (codir. Frédéric Guibal, IMBE)
- Pauline Rocarpin, mares temporaires méditerranéennes

- Stage IUT Avignon
Marjolaine Heyd, terrils de Provence

- Stages de DU / DESU
- Audrey Coquelin : analyse de données anciennes du Parc National des Ecrins
- Marine Pouget & Fabien Arène : dynamique de la végétation sur les terrils du bassin minier de Provence
- Thomas Lamailloux, Frédéric Cano, James Gourier et Violaine Namblard (dans le cadre du DESU BVT 2014)

- codirection de plusieurs stages hors-cursus de L3

- tutrice de plusieurs doctorants-moniteurs

Responsabilités administratives et d’enseignement

--- Responsabilités scientifiques ---

Coordinations et co-coordinations de programmes
- ANR Jeunes Chercheurs “BLUE” (Biodiversity Loss : Understanding changes in Ecosystem composition and functioning : application to bird and plant communities in France) – coord. Emmanuelle Porcher (MNHN) - implication à 40% (2006-2010)
- En 2006 : co-coordination du programme du MNHN portant sur l’étude des landes à Erica scoparia en Brenne (Indre)
- Co-coordinatrice du programme TRAITAUT portant sur les traits et l’autécologie des espèces forestières, financé par le GIP ECOFOR et le RMT AFORCE (2011-2012) : http://traitaut.gip-ecofor.org/
- Coordinatrice du programme IMBE-IKEA portant sur le suivi écologique (2009-2019) de zones humides dans le cadre de la mise en œuvre d’une mesure compensatoire.

Comités scientifiques
- Vice-présidente et membre du comité scientifique du colloque MedBiodiv 2010 « Gestion et conservation de la biodiversité dans le Bassin Méditerranéen » (Tlemcen, Algérie, 11-13 octobre 2010)
- Membre du Comité Consultatif VegFrance (base de données nationale sur la végétation) depuis 2008 : http://vegfrance.univ-rennes1.fr/
- Présidente du comité scientifique du glossaire trilingue de la biodiversité méditerranéenne (français/anglais/arabe) financé par la Banque Mondiale et le Conservatoire du Littoral (2011-2012) : http://ecoonto.cmimarseille.org/index.php/Main_Page/fr
- Membre du comité scientifique du projet collaboratif « Inventaire et modélisation des concepts environnementaux liés à la biodiversité » (financement MEEDDM)
- Représentante à l’international du réseau TOPIC (traits fonctionnels des plantes du Canada : http://topic.rncan.gc.ca/)
- Membre du comité de pilotage du Ca-SIF (catalogue des sources d’information sur la forêt, GIP ECOFOR) depuis 2004 : http://casif.gip-ecofor.org/
- Membre du comité de direction de l’OHM BMP (Observatoire Hommes-Milieux du Bassin Minier de Provence) depuis 2014 : www.ohm-provence.org
- Membre élue du collège B au Comité Scientifique de l’INEE et secrétaire scientifique (membre du bureau)
- Membre du comité d’organisation du colloque SFE Ecologie 2016 à Marseille

Membre de plusieurs comités de thèse depuis 2006
- MNHN (soutenues) : Isabelle Le Viol (diversité des bords d’autoroute), Maelle Rambaud (chenalisation des rivières), Eric Motard (impact de l’Ailante) et Louis de Redon (diversité des bords de routes)
- CEFE / LIRMM, Montpellier (soutenue 2012) : Marie-Angélique Laporte (ontologie des traits fonctionnels de plantes)
- CEMAGREF Grenoble (soutenue 2012) : Walaa Adra (modélisation de la qualité de l’habitat de la gélinotte des bois)
- MNHN (soutenue 2013) : Jules NGUEGUIM (agroforesterie au Cameroun) rapportrice
- IMEP / Université de Lomé, Togo (soutenue 2010) : Denis Soussou (recul forestier au Togo)
- IRSTEA Nogent-sur-Vernisson (en cours) : Lisa LAURENT (interactions écologiques multiples dans la dynamique de l’écosystème forestier)

--- Responsabilités pédagogiques ---

-  Depuis 2010 : enseignant-référent pour environ vingt étudiants chaque année
-  Membre de l’équipe pédagogique de la Licence SNTE
-  Co-responsable de l’UE de Licence 1ère année « Diversité du monde vivant »

--- Responsabilités administratives ---

-  Présidente de plusieurs jurys de baccalauréat (2009, 2010, 2012)
-  depuis 2009 : correspondante Communication de l’IMEP/IMBE auprès du CNRS
-  depuis 2012 : suppléante au Comité National Universitaire (section 67)
-  depuis 2013 : membre élue de la Commission Enseignement de l’OSU Pythéas
-  depuis 2014 : création et animation de la sous-commission enseignement pour les sections CNU 67 et 68 au sein de l’OSU Pythéas