SC Analyses Biologiques et Chimiques

Responsables techniques : Benjamin Oursel & Yoan Labrousse
Responsable scientifique : Laurent Cavalli

Présentation du Service Commun

Créé en 2018, le Service Commun Analyses Biologiques et Chimiques (SCABC) a pour finalité de rationaliser et de mutualiser les équipements et compétences scientifiques sur le site de St Jérôme. Le SCABC vise à apporter un support technique et logistique aux différentes thématiques de recherche développées à l’IMBE. Il permet la mise en place d’un réseau d’interactions entre les différentes équipes concernées par ses activités. Le SCABC est dédié à l’étude des écosystèmes continentaux, terrestres et aquatiques.
Il s’inscrit dans la complémentarité de la plateforme Analyse et Valorisation de la Biodiversité (AVB, mise en place sur le site de St Jérôme lors du précédent quinquennat et pilotée par l’UMR ISM2, en partenariat avec l’IMBE) qui regroupe deux plateaux techniques, l’un dédié à la culture des microorganismes, l’autre à l’analyse génétique (cf. http://www.imbe.fr/plateforme-mutualisee-avb.html).


Personnels

Personnels Fonction Spécialité Localisation
Virgile CALVERT TCE AMU Microbiologie St Jérôme - 441
Lisa FOLI TCN AMU Microbiologie St Jérôme - 441
Yoan LABROUSSE AI IRD Microbiologie St Jérôme - 422
Martine MARTINEZ AJT IRD Microbiologie St Jérôme - TP C42
Benjamin OURSEL IE AMU Chimie analytique St Jérôme - 431

Pour contacter un personnel : prenom.nom@imbe.fr

Prestations

Services proposés

• Du conseil en matière d’échantillonnage, de préparation d’échantillons et de protocoles analytiques.
• Mise à disposition d’équipements et de personnels pour mener à bien des analyses environnementales de routine.
• De la formation à l’utilisation d’équipements analytiques.
• Veille technologique, mise au point et optimisation de méthodes en lien avec les thématiques/programmes de recherche.
• Une aide préliminaire aux montages de projets scientifiques et aux réponses à des appels d’offres (faisabilité technique, coûts, etc.).

Equipements/Laboratoires

Stockage
Chambre froide (+ 4°C), service 431
Stockage échantillons secs, service TP C42

Préparation d’échantillons
Lyophilisateur, service TP D41
Colonne de tamis, service TP D41
Broyeurs (couteaux et billes), service TP D41
Autoclaves, service TP D41
Rampe filtration, service 431

Microbiologie
Postes de Sécurité Microbiologique (PSM), service 441
Laboratoires bactéries, champignons et préparation milieux, service 441

Equipements analytiques

PNG - 1.3 Mo

Chromatographie ionique
- marque : Metrohm
- modèle : 930 Compact IC Flex et passeur d’échantillons 863
- analyses effectuées : quantification des anions (F-, Cl-, NO2-, NO3-, PO43-, SO42-), des cations (Na+, NH4+, K+, Ca2+, Mg2+) et de la silice dissoute, dans des échantillons liquides
- matrices analysées : eau douce ou saumâtre filtrée, lixiviat filtré, extraits aqueux, ...
contact : Benjamin Oursel
localisation : service 431

PNG - 1.3 Mo

Chromatographie Liquide Haute Performance (HPLC)
- marque : Agilent
- modèle : 1200 series (avec passeur d’échantillons)
- détecteurs : spectrophotomètre DAD, fluorimètre, réfractomètre
- matrices analysées : extraits dans phase liquide polaire ou apolaire
contact : Yoan Labrousse
localisation : service 431

PNG - 1.3 Mo

Analyseur élémentaire
- marque : ThermoScientific
- modèle : FlashEA 1112
- analyses effectuées : quantification du carbone et de l’azote total contenus dans des échantillons solides secs et pré-pesés dans des nacelles en étain
- matrices analysées : sols, sédiments, végétaux, feuilles, litière, ...
contact : Benjamin Oursel
localisation : service 431

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Spectrophotomètres UV-visible double faisceau
- marque : Jasco & Shimadzu
- modèle : V 630 & UV 1700
- analyses effectuées : dosage de chlorophylles, sels nutritifs, ...
- matrices analysées : liquides
contact : Benjamin Oursel
localisation : service 431

Procédures/Charte

Procédure d’utilisation du SCABC
Cliquer ici pour télécharger la procédure au format pdf.
1- Sollicitation des personnels du SCABC et des outils analytiques dans les projets de recherche
En amont du dépôt de projet, contacter la ou les personne(s) compétente(s) dans le domaine afin de définir le programme de travail (nombre d’échantillons, dates/périodes éventuelles de prélèvements, préparation et analyses des échantillons) ainsi qu’une estimation du coût analytique.
Si le projet est retenu, prévenir les personnels impliqués et leur confirmer les dates/périodes souhaitées pour les prélèvements, la préparation et l’analyse des échantillons.

2- Demandes d’analyses (sans implication des personnels dans le projet de recherche)
Si possible, avant d’avoir collecté les échantillons (certains devant être traités immédiatement tandis que d’autres pouvant être conservés), contacter la personne référente de l’analyse souhaitée et lui demander ses disponibilités ainsi que celles de l’appareil et les délais d’analyses.
Les échantillons sont préparés par le demandeur selon les nécessités de l’analyse à réaliser (filtration, conditionnement, mise en nacelle, séchage, …) et seule l’analyse sera réalisée ensuite par le personnel du SCABC.

3- Utilisation des outils analytique du SCABC par un personnel formé
Seule une personne formée et « qualifiée » par le personnel responsable de l’appareil pourra travailler en autonomie sur cet appareil.
Réserver l’appareil en s’inscrivant sur le cahier de réservation présent à côté de l’appareil.
Le jour J, réaliser les analyses en respectant les respectant les règles d’hygiène et sécurité du laboratoire.
Ne pas oublier de remplir le fichier de suivi de l’utilisation de l’appareil (nombre d’analyses réalisées, paramètres de base, durée d’analyses, …).
Une fois les analyses effectuées, laisser l’appareil et le laboratoire propres.

4- Coût analytique
Le budget du SCABC sert essentiellement à la maintenance et l’entretien courant des appareils analytiques. Les consommables de base (gants, embouts de micro pipettes, solvants de base, acides, milieux de culture de base, …) sont aussi fournis par le SCABC.
Seuls les consommables spécifiques sont à la charge du demandeur (ex : nacelle en étain pour le CHN, colonnes spécifiques, milieux de culture spécifiques, …). Une participation financière plus importante peut être sollicitée auprès du demandeur si un très grand nombre d’échantillons est analysé.
Des participations financières peuvent aussi être demandées en cas de panne importante d’un appareil.

Fiches de dépôt d’échantillons

Cliquer sur la fiche souhaitée pour la télécharger

fiche pour des analyses de carbone et d’azote total
fiche pour des analyses de cations, d’anions ou de silice dissoute
fiche pour des analyses de chlorophylles
Les fiches sont à renvoyer complétées au référent de l’appareil correspondant.