SC Analyses Biologiques et Chimiques

Responsable technique : Loris Cagnacci
Responsables scientifique : Laurent Cavalli & Manuel Lebris

Présentation du Service Commun

Créé en 2018, le Service Commun Analyses Biologiques et Chimiques (SC ABC) a pour but d’apporter un support technique et logistique aux chercheurs de l’IMBE. Il met en place un réseau d’interactions entre les différentes équipes de l’IMBE par ses activités. Ce qui permettra d’acquérir de nouveaux équipements et de pouvoir proposer de nouvelles analyses.

SC ABC s’inscrit dans la complémentarité de la plateforme Analyse et Valorisation de la Biodiversité (AVB) en partenariat avec l’IMBE, qui regroupe deux plateaux techniques, l’un dédié à la culture des microorganismes, l’autre à l’analyse génétique (cf. http://www.imbe.fr/plateforme-mutualisee-avb.html).


Personnels

Personnels Fonction Spécialité Localisation
Loris CAGNACCI AI IRD Biotechnologie, Biologie Moléculaire & Cellulaire St Jérôme - 431
Auriane CASSIEN TCN IRD Chimie St Jérôme - 431
Lisa FOLI TCN AMU Microbiologie St Jérôme - 441
Martine MARTINEZ AJT IRD Microbiologie St Jérôme - TP C42

Contact : scabc@imbe.fr

Prestations

Services proposés

• Du conseil en matière d’échantillonnage, de préparation d’échantillons et de protocoles analytiques.
• Mise à disposition d’équipements et de personnels pour mener à bien des analyses environnementales de routine.
• De la formation à l’utilisation d’équipements analytiques.
• Veille technologique, mise au point et optimisation de méthodes en lien avec les thématiques/programmes de recherche.
• Une aide préliminaire aux montages de projets scientifiques et aux réponses à des appels d’offres (faisabilité technique, coûts, etc.).

Equipements/Laboratoires

Stockage
Chambre froide (+ 4°C), service 431
Stockage échantillons secs, service TP C42

Préparation d’échantillons
Lyophilisateur, service 431
Colonne de tamis, service TP D41
Broyeurs (couteaux et billes), service TP D41
Autoclaves, service TP D41
Rampe filtration, service 431

Microbiologie
Postes de Sécurité Microbiologique (PSM), service 441
Laboratoires bactéries, champignons et préparation milieux, service 441

Equipements analytiques

PNG - 1.3 Mo

Chromatographie ionique
- marque : Metrohm
- modèle : 930 Compact IC Flex et passeur d’échantillons 863
- analyses effectuées : quantification des anions (F-, Cl-, NO2-, NO3-, PO43-, SO42-), des cations (Na+, NH4+, K+, Ca2+, Mg2+) et de la silice dissoute, dans des échantillons liquides
- matrices analysées : eau douce ou saumâtre filtrée, lixiviat filtré, extraits aqueux, ...
localisation : service 431

PNG - 1.3 Mo

Chromatographie Liquide Haute Performance (HPLC)
- marque : Agilent
- modèle : 1200 series (avec passeur d’échantillons)
- détecteurs : spectrophotomètre DAD, fluorimètre, réfractomètre
- matrices analysées : extraits dans phase liquide polaire ou apolaire
localisation : service 431

PNG - 1.3 Mo

Analyseur élémentaire
- marque : ThermoScientific
- modèle : FlashEA 1112
- analyses effectuées : quantification du carbone et de l’azote total contenus dans des échantillons solides secs et pré-pesés dans des nacelles en étain
- matrices analysées : sols, sédiments, végétaux, feuilles, litière, ...
localisation : service 431

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Spectrophotomètres UV-visible double faisceau
- marque : Jasco & Shimadzu
- modèle : V 630 & UV 1700
- analyses effectuées : dosage de chlorophylles, sels nutritifs, ...
- matrices analysées : liquides
localisation : service 431

Procédures/Charte

Procédure d’utilisation du SC ABC
Cliquer ici pour télécharger la procédure au format pdf. et la renvoyer signer au SC ABC.

1- Sollicitation des personnels du SC ABC et des outils analytiques dans les projets de recherche
En amont du dépôt de projet, contacter le SC ABC afin de définir le programme de travail (nombre d’échantillons, dates/périodes éventuelles de prélèvements, préparation et analyses des échantillons) ainsi qu’une estimation du coût analytique.
Si le projet est retenu, prévenir le personnel impliqué et confirmer les dates/périodes souhaitées pour les prélèvements, la préparation et l’analyse des échantillons.

2- Demandes d’analyses
Si possible, avant d’avoir collecté les échantillons (certains devant être traités immédiatement tandis que d’autres pouvant être conservés), contacter le responsable technique et lui demander ses disponibilités ainsi que celles de l’appareil et les délais d’analyses. Les échantillons sont préparés par le demandeur selon les nécessités de l’analyse à réaliser (filtration, conditionnement, mise en nacelle, séchage, …) et seule l’analyse sera réalisée ensuite par le personnel du SC ABC. Remplir impérativement la fiche de demande d’analyse et/ou de préparation d’échantillons sans quoi les analyses ne seront pas effectuées. Lors du rendu des analyses, le SC ABC laisse un délai de 2 semaines au demandeur afin de vérifier ses résultats. Passer ce délai, le SC ABC éliminera les aliquots en sa possession.

3- Utilisation des outils analytique du SC ABC par un personnel formé
Seule une personne formée et « qualifiée » par le personnel responsable de l’appareil pourra travailler en autonomie sur cet appareil.
Réserver l’appareil en s’inscrivant sur le cahier de réservation présent à côté de l’appareil.
Le jour J, réaliser les analyses en respectant les respectant les règles d’hygiène et sécurité du laboratoire.
Ne pas oublier de remplir le fichier de suivi de l’utilisation de l’appareil (nombre d’analyses réalisées, paramètres de base, durée d’analyses, …).
Une fois les analyses effectuées, nettoyer l’appareil et le laboratoire.

4- Coût analytique
Le budget du SC ABC sert essentiellement à la maintenance et l’entretien courant des appareils analytiques. Les consommables de base (gants, embouts de micro pipettes, solvants de base, acides, milieux de culture de base, …) sont aussi fournis par le SC ABC.
Seuls les consommables spécifiques sont à la charge du demandeur (ex : nacelle en étain pour le CHN, colonnes spécifiques, milieux de culture spécifiques, …). Une participation financière plus importante peut être sollicitée auprès du demandeur si un très grand nombre d’échantillons est analysé.
Des participations financières peuvent aussi être demandées en cas de panne importante d’un appareil.

5- Reconnaissance de l’implication du SC ABC dans les analyses et/ou projets
En fonction de l’implication du SC ABC et donc de la charge de travail requis auprès du personnel. Le SC ABC demande une reconnaissance auprès des demandeurs soit en citant le SC ABC dans les remerciements ou soit en incluant le personnel en co-auteur.

Fiches de dépôt d’échantillons

fiche de demande d’analyses et de préparations des échantillons

La fiche est à renvoyer complétée au service commun.